MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021911	GAAGG	2	10	323	332	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021911	CGGCC	2	10	894	903	0 %	0 %	40 %	60 %	528837522
3	NC_021911	CGATC	2	10	4686	4695	20 %	20 %	20 %	40 %	528837525
4	NC_021911	ATTGG	2	10	6112	6121	20 %	40 %	40 %	0 %	528837526
5	NC_021911	GGCCG	2	10	7222	7231	0 %	0 %	60 %	40 %	528837527
6	NC_021911	GGAGG	2	10	7317	7326	20 %	0 %	80 %	0 %	528837527
7	NC_021911	TCATG	2	10	7872	7881	20 %	40 %	20 %	20 %	528837528
8	NC_021911	AGGGC	2	10	10737	10746	20 %	0 %	60 %	20 %	528837533
9	NC_021911	AGCCG	2	10	12640	12649	20 %	0 %	40 %	40 %	528837535
10	NC_021911	GTGCC	2	10	14056	14065	0 %	20 %	40 %	40 %	528837536
11	NC_021911	CGCGC	2	10	18624	18633	0 %	0 %	40 %	60 %	528837541
12	NC_021911	GAAGA	2	10	19117	19126	60 %	0 %	40 %	0 %	528837541
13	NC_021911	GTTCA	2	10	19544	19553	20 %	40 %	20 %	20 %	528837542
14	NC_021911	GATCG	2	10	20290	20299	20 %	20 %	40 %	20 %	528837542
15	NC_021911	TTGCC	2	10	20533	20542	0 %	40 %	20 %	40 %	528837542
16	NC_021911	GAGGG	2	10	20714	20723	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021911	TCGGC	2	10	22266	22275	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021911	ACGCA	2	10	22957	22966	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021911	CCGTC	2	10	29181	29190	0 %	20 %	20 %	60 %	528837552
20	NC_021911	GATCG	2	10	32295	32304	20 %	20 %	40 %	20 %	528837555
21	NC_021911	GAGGG	2	10	33344	33353	20 %	0 %	80 %	0 %	528837556
22	NC_021911	CCGCG	2	10	34572	34581	0 %	0 %	40 %	60 %	528837557
23	NC_021911	CGGCT	2	10	36797	36806	0 %	20 %	40 %	40 %	528837559
24	NC_021911	CATGG	2	10	37411	37420	20 %	20 %	40 %	20 %	528837559
25	NC_021911	CCGCG	2	10	37989	37998	0 %	0 %	40 %	60 %	528837559
26	NC_021911	GCGCC	2	10	39512	39521	0 %	0 %	40 %	60 %	528837561
27	NC_021911	GCGCG	2	10	40970	40979	0 %	0 %	60 %	40 %	528837563
28	NC_021911	TGCCG	2	10	41443	41452	0 %	20 %	40 %	40 %	528837564
29	NC_021911	CGGCC	2	10	41596	41605	0 %	0 %	40 %	60 %	528837564
30	NC_021911	GCGCA	2	10	45918	45927	20 %	0 %	40 %	40 %	528837568
31	NC_021911	ATCCT	2	10	46038	46047	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021911	ACGGG	2	10	47885	47894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021911	CAGGG	2	10	47956	47965	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021911	TTATC	2	10	48548	48557	20 %	60 %	0 %	20 %	528837569
35	NC_021911	GCACG	2	10	51412	51421	20 %	0 %	40 %	40 %	528837572
36	NC_021911	GTTCA	2	10	52950	52959	20 %	40 %	20 %	20 %	528837573
37	NC_021911	CCGGT	2	10	53446	53455	0 %	20 %	40 %	40 %	528837573
38	NC_021911	TTCTC	2	10	53764	53773	0 %	60 %	0 %	40 %	528837573
39	NC_021911	CGGCA	2	10	54172	54181	20 %	0 %	40 %	40 %	528837574
40	NC_021911	GCGCG	2	10	54465	54474	0 %	0 %	60 %	40 %	528837574
41	NC_021911	GATCG	2	10	55475	55484	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021911	TCGGG	2	10	57655	57664	0 %	20 %	60 %	20 %	528837579
43	NC_021911	CTTCT	2	10	60550	60559	0 %	60 %	0 %	40 %	528837583
44	NC_021911	CGATC	2	10	61814	61823	20 %	20 %	20 %	40 %	528837584
45	NC_021911	ACCGC	2	10	61984	61993	20 %	0 %	20 %	60 %	528837584
46	NC_021911	GACCG	2	10	62606	62615	20 %	0 %	40 %	40 %	528837585
47	NC_021911	CGCTG	2	10	66702	66711	0 %	20 %	40 %	40 %	528837592
48	NC_021911	GCCGG	2	10	67851	67860	0 %	0 %	60 %	40 %	528837594
49	NC_021911	GCGTC	2	10	69293	69302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_021911	CAGAT	2	10	75406	75415	40 %	20 %	20 %	20 %	528837602
51	NC_021911	GCCGG	2	10	75507	75516	0 %	0 %	60 %	40 %	528837602
52	NC_021911	TGCCG	2	10	75970	75979	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_021911	GCACC	2	10	77945	77954	20 %	0 %	20 %	60 %	528837603
54	NC_021911	CGCTT	2	10	80532	80541	0 %	40 %	20 %	40 %	528837605
55	NC_021911	ACGCC	2	10	81363	81372	20 %	0 %	20 %	60 %	528837607
56	NC_021911	CGAGA	2	10	81523	81532	40 %	0 %	40 %	20 %	528837607
57	NC_021911	GCCTT	2	10	83391	83400	0 %	40 %	20 %	40 %	528837608
58	NC_021911	ACCGC	2	10	87485	87494	20 %	0 %	20 %	60 %	528837614
59	NC_021911	CGAAA	2	10	87525	87534	60 %	0 %	20 %	20 %	528837614
60	NC_021911	TCGCG	2	10	89585	89594	0 %	20 %	40 %	40 %	528837617
61	NC_021911	GGGCC	2	10	91936	91945	0 %	0 %	60 %	40 %	528837620
62	NC_021911	TCGCG	2	10	92503	92512	0 %	20 %	40 %	40 %	528837620
63	NC_021911	TCCGG	2	10	93029	93038	0 %	20 %	40 %	40 %	528837621
64	NC_021911	GGCGC	2	10	96197	96206	0 %	0 %	60 %	40 %	528837624
65	NC_021911	ACGGA	2	10	97025	97034	40 %	0 %	40 %	20 %	528837625
66	NC_021911	ACGTG	2	10	97092	97101	20 %	20 %	40 %	20 %	528837625
67	NC_021911	GACGA	2	10	97330	97339	40 %	0 %	40 %	20 %	528837625
68	NC_021911	CGCGG	2	10	97757	97766	0 %	0 %	60 %	40 %	528837626
69	NC_021911	GAGCT	2	10	97999	98008	20 %	20 %	40 %	20 %	528837626
70	NC_021911	GTTCC	2	10	98809	98818	0 %	40 %	20 %	40 %	528837626
71	NC_021911	TCTCC	2	10	99518	99527	0 %	40 %	0 %	60 %	528837627
72	NC_021911	CAGCG	2	10	99564	99573	20 %	0 %	40 %	40 %	528837627
73	NC_021911	CGGCA	2	10	99827	99836	20 %	0 %	40 %	40 %	528837627
74	NC_021911	CGGCG	2	10	100892	100901	0 %	0 %	60 %	40 %	528837629
75	NC_021911	GTGGC	2	10	103353	103362	0 %	20 %	60 %	20 %	528837630
76	NC_021911	GAAAT	2	10	103941	103950	60 %	20 %	20 %	0 %	528837631
77	NC_021911	CTTCG	2	10	104371	104380	0 %	40 %	20 %	40 %	528837631
78	NC_021911	TCATT	2	10	104759	104768	20 %	60 %	0 %	20 %	528837631
79	NC_021911	AGGGG	2	10	108191	108200	20 %	0 %	80 %	0 %	528837633
80	NC_021911	TCCGT	2	10	108577	108586	0 %	40 %	20 %	40 %	528837633
81	NC_021911	CGATC	2	10	108598	108607	20 %	20 %	20 %	40 %	528837633
82	NC_021911	GGGCG	2	10	108986	108995	0 %	0 %	80 %	20 %	528837633
83	NC_021911	GCTGA	2	10	109487	109496	20 %	20 %	40 %	20 %	528837633
84	NC_021911	GCATC	2	10	113398	113407	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021911	CCGCA	2	10	115777	115786	20 %	0 %	20 %	60 %	528837639
86	NC_021911	AAACC	2	10	118662	118671	60 %	0 %	0 %	40 %	528837640
87	NC_021911	AAAGC	2	10	119462	119471	60 %	0 %	20 %	20 %	528837641
88	NC_021911	GCGCC	2	10	121132	121141	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_021911	GCAGG	2	10	121511	121520	20 %	0 %	60 %	20 %	528837642
90	NC_021911	GGCCT	2	10	123163	123172	0 %	20 %	40 %	40 %	528837643
91	NC_021911	AGGCG	2	10	123459	123468	20 %	0 %	60 %	20 %	528837643
92	NC_021911	GATCC	2	10	124750	124759	20 %	20 %	20 %	40 %	528837644
93	NC_021911	GGGCA	2	10	124986	124995	20 %	0 %	60 %	20 %	528837644
94	NC_021911	CTGAT	2	10	125603	125612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021911	CGAAG	2	10	125647	125656	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021911	TCGGC	2	10	128148	128157	0 %	20 %	40 %	40 %	528837645
97	NC_021911	GCGTC	2	10	128521	128530	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_021911	GCGAC	2	10	130572	130581	20 %	0 %	40 %	40 %	528837646
99	NC_021911	GCTGC	2	10	131933	131942	0 %	20 %	40 %	40 %	528837647
100	NC_021911	GCGCA	2	10	132874	132883	20 %	0 %	40 %	40 %	528837648
101	NC_021911	AGATC	2	10	132912	132921	40 %	20 %	20 %	20 %	528837648
102	NC_021911	CTTTG	2	10	133646	133655	0 %	60 %	20 %	20 %	528837650
103	NC_021911	GCTTT	2	10	134503	134512	0 %	60 %	20 %	20 %	528837653
104	NC_021911	GCTCG	2	10	140538	140547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_021911	CCGGC	2	10	141703	141712	0 %	0 %	40 %	60 %	528837657
106	NC_021911	CACGG	2	10	144052	144061	20 %	0 %	40 %	40 %	528837659
107	NC_021911	AGCGC	2	10	145121	145130	20 %	0 %	40 %	40 %	528837659
108	NC_021911	GGTCG	2	10	145816	145825	0 %	20 %	60 %	20 %	528837660
109	NC_021911	CGCGA	2	10	147821	147830	20 %	0 %	40 %	40 %	528837661
110	NC_021911	AGAAA	2	10	149378	149387	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021911	CCGCA	2	10	150081	150090	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_021911	GTTTC	2	10	150333	150342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021911	TATAC	2	10	150479	150488	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021911	CGCGG	2	10	151722	151731	0 %	0 %	60 %	40 %	528837663
115	NC_021911	CCTTG	2	10	152911	152920	0 %	40 %	20 %	40 %	528837664
116	NC_021911	CGATC	2	10	152939	152948	20 %	20 %	20 %	40 %	528837664
117	NC_021911	GGCCG	2	10	154802	154811	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_021911	CCATG	2	10	156459	156468	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_021911	TGACG	2	10	157883	157892	20 %	20 %	40 %	20 %	528837666
120	NC_021911	GCGCG	2	10	158447	158456	0 %	0 %	60 %	40 %	528837666
121	NC_021911	CCGTA	2	10	159104	159113	20 %	20 %	20 %	40 %	528837666
122	NC_021911	GACGG	2	10	160605	160614	20 %	0 %	60 %	20 %	528837666
123	NC_021911	AAGCG	2	10	161505	161514	40 %	0 %	40 %	20 %	528837666
124	NC_021911	AAGCG	2	10	162434	162443	40 %	0 %	40 %	20 %	528837666
125	NC_021911	CCGGG	2	10	167837	167846	0 %	0 %	60 %	40 %	528837667
126	NC_021911	TCCGA	2	10	169495	169504	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021911	GCCCG	2	10	170424	170433	0 %	0 %	40 %	60 %	528837670
128	NC_021911	CCTTT	2	10	172667	172676	0 %	60 %	0 %	40 %	528837673
129	NC_021911	GCAGG	2	10	172783	172792	20 %	0 %	60 %	20 %	528837673
130	NC_021911	GATCG	2	10	172939	172948	20 %	20 %	40 %	20 %	528837673
131	NC_021911	GTCGT	2	10	173592	173601	0 %	40 %	40 %	20 %	528837674
132	NC_021911	GGTGA	2	10	176102	176111	20 %	20 %	60 %	0 %	528837676
133	NC_021911	CCCGC	2	10	176203	176212	0 %	0 %	20 %	80 %	528837676
134	NC_021911	CCAAC	2	10	176684	176693	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_021911	GCCAG	2	10	177435	177444	20 %	0 %	40 %	40 %	528837677
136	NC_021911	GCCTC	2	10	180170	180179	0 %	20 %	20 %	60 %	528837681
137	NC_021911	TGCGC	2	10	182785	182794	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_021911	TCTGC	2	10	182967	182976	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_021911	GCGCT	2	10	184723	184732	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_021911	TCGCC	2	10	186254	186263	0 %	20 %	20 %	60 %	528837683
141	NC_021911	TGCCA	2	10	186266	186275	20 %	20 %	20 %	40 %	528837683
142	NC_021911	CGTCG	2	10	186440	186449	0 %	20 %	40 %	40 %	528837683
143	NC_021911	TGTTC	2	10	187489	187498	0 %	60 %	20 %	20 %	528837684
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145	NC_021911	TCGAC	2	10	190838	190847	20 %	20 %	20 %	40 %	528837688
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147	NC_021911	CTGAG	2	10	191644	191653	20 %	20 %	40 %	20 %	528837689
148	NC_021911	ACCGA	2	10	192178	192187	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_021911	TTGGA	2	10	194625	194634	20 %	40 %	40 %	0 %	528837693
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151	NC_021911	GCCTG	2	10	198335	198344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_021911	GGCCG	2	10	199125	199134	0 %	0 %	60 %	40 %	528837700
153	NC_021911	GAGGG	2	10	199137	199146	20 %	0 %	80 %	0 %	528837700
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155	NC_021911	GATCT	2	10	201112	201121	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_021911	AGGCG	2	10	206598	206607	20 %	0 %	60 %	20 %	528837707
160	NC_021911	ATGGA	2	10	207521	207530	40 %	20 %	40 %	0 %	528837708
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162	NC_021911	TGCCG	2	10	209480	209489	0 %	20 %	40 %	40 %	528837711
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176	NC_021911	TCGCC	2	10	227064	227073	0 %	20 %	20 %	60 %	528837729
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179	NC_021911	GGCCG	2	10	228159	228168	0 %	0 %	60 %	40 %	528837730
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181	NC_021911	TGATC	2	10	231562	231571	20 %	40 %	20 %	20 %	528837734
182	NC_021911	TGCCG	2	10	236597	236606	0 %	20 %	40 %	40 %	528837738
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184	NC_021911	GGCGG	2	10	238497	238506	0 %	0 %	80 %	20 %	528837741
185	NC_021911	ACCAA	2	10	240706	240715	60 %	0 %	0 %	40 %	528837744
186	NC_021911	GACCA	2	10	242858	242867	40 %	0 %	20 %	40 %	528837748
187	NC_021911	ATGCG	2	10	249500	249509	20 %	20 %	40 %	20 %	528837754
188	NC_021911	GGCCG	2	10	251683	251692	0 %	0 %	60 %	40 %	528837757
189	NC_021911	TCGGA	2	10	255049	255058	20 %	20 %	40 %	20 %	528837763
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193	NC_021911	GCGTG	2	10	256796	256805	0 %	20 %	60 %	20 %	528837765
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195	NC_021911	TTGGC	2	10	258593	258602	0 %	40 %	40 %	20 %	528837768
196	NC_021911	AGGCC	2	10	260773	260782	20 %	0 %	40 %	40 %	528837769
197	NC_021911	CATGG	2	10	261351	261360	20 %	20 %	40 %	20 %	528837770
198	NC_021911	TAAGG	2	10	262412	262421	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021911	GCGAT	2	10	265959	265968	20 %	20 %	40 %	20 %	528837772
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202	NC_021911	CGCGG	2	10	269819	269828	0 %	0 %	60 %	40 %	528837777
203	NC_021911	GGGCG	2	10	270807	270816	0 %	0 %	80 %	20 %	528837777
204	NC_021911	GACCA	2	10	271032	271041	40 %	0 %	20 %	40 %	528837777
205	NC_021911	CCTGA	2	10	273047	273056	20 %	20 %	20 %	40 %	528837779
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207	NC_021911	CGGCG	2	10	278311	278320	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
208	NC_021911	GTCGT	2	10	278636	278645	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
209	NC_021911	CGCAT	2	10	280804	280813	20 %	20 %	20 %	40 %	528837784
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211	NC_021911	GTGAC	2	10	283456	283465	20 %	20 %	40 %	20 %	528837786
212	NC_021911	ATCGC	2	10	283522	283531	20 %	20 %	20 %	40 %	528837786
213	NC_021911	ATGTG	2	10	283570	283579	20 %	40 %	40 %	0 %	528837786
214	NC_021911	GAAAG	2	10	284520	284529	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
215	NC_021911	TGGCT	2	10	284800	284809	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
216	NC_021911	ACAGC	2	10	286580	286589	40 %	0 %	20 %	40 %	528837788
217	NC_021911	GCCTG	2	10	287077	287086	0 %	20 %	40 %	40 %	528837788
218	NC_021911	CCACG	2	10	287443	287452	20 %	0 %	20 %	60 %	528837789
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220	NC_021911	TGCGA	2	10	288643	288652	20 %	20 %	40 %	20 %	528837790
221	NC_021911	TGACC	2	10	291565	291574	20 %	20 %	20 %	40 %	528837793
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223	NC_021911	TCCGC	2	10	297493	297502	0 %	20 %	20 %	60 %	528837799
224	NC_021911	AGGCA	2	10	299603	299612	40 %	0 %	40 %	20 %	528837802
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226	NC_021911	TTCAC	2	10	300246	300255	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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229	NC_021911	CCTGC	2	10	304781	304790	0 %	20 %	20 %	60 %	528837807
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232	NC_021911	TGCAA	2	10	306870	306879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
233	NC_021911	TTCGA	2	10	307008	307017	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
234	NC_021911	CATCG	2	10	310651	310660	20 %	20 %	20 %	40 %	528837813
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236	NC_021911	GCGCC	2	10	313136	313145	0 %	0 %	40 %	60 %	528837815
237	NC_021911	GAGAT	2	10	314550	314559	40 %	20 %	40 %	0 %	528837817
238	NC_021911	AAGCC	2	10	316709	316718	40 %	0 %	20 %	40 %	528837818
239	NC_021911	CAGCC	2	10	321083	321092	20 %	0 %	20 %	60 %	528837822
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241	NC_021911	TGCCT	2	10	323706	323715	0 %	40 %	20 %	40 %	528837823
242	NC_021911	GACGC	2	10	324191	324200	20 %	0 %	40 %	40 %	528837823
243	NC_021911	ACGCG	2	10	325946	325955	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
244	NC_021911	CTGTC	2	10	326028	326037	0 %	40 %	20 %	40 %	528837825
245	NC_021911	CAGCG	2	10	328892	328901	20 %	0 %	40 %	40 %	528837827
246	NC_021911	TCAAA	2	10	329478	329487	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
247	NC_021911	AAGGC	2	10	330123	330132	40 %	0 %	40 %	20 %	528837829
248	NC_021911	GCTGG	2	10	330736	330745	0 %	20 %	60 %	20 %	528837831
249	NC_021911	GCGCG	2	10	330802	330811	0 %	0 %	60 %	40 %	528837831
250	NC_021911	GCGCG	2	10	332671	332680	0 %	0 %	60 %	40 %	528837832
251	NC_021911	CTTCG	2	10	336199	336208	0 %	40 %	20 %	40 %	528837836
252	NC_021911	GCGAA	2	10	337005	337014	40 %	0 %	40 %	20 %	528837837
253	NC_021911	ATTGG	2	10	337744	337753	20 %	40 %	40 %	0 %	528837837
254	NC_021911	AATTC	2	10	338551	338560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
255	NC_021911	GACGA	2	10	340932	340941	40 %	0 %	40 %	20 %	528837839
256	NC_021911	CGCGC	2	10	341349	341358	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
257	NC_021911	ATCTT	2	10	342020	342029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
258	NC_021911	GCCGT	2	10	342855	342864	0 %	20 %	40 %	40 %	528837841
259	NC_021911	CGTGC	2	10	346034	346043	0 %	20 %	40 %	40 %	528837844
260	NC_021911	TGGCT	2	10	346426	346435	0 %	40 %	40 %	20 %	528837844
261	NC_021911	GCCGC	2	10	351536	351545	0 %	0 %	40 %	60 %	528837849
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263	NC_021911	CGCGC	2	10	353515	353524	0 %	0 %	40 %	60 %	528837852
264	NC_021911	CGACC	2	10	354614	354623	20 %	0 %	20 %	60 %	528837852
265	NC_021911	CGGCG	2	10	355406	355415	0 %	0 %	60 %	40 %	528837853
266	NC_021911	TTCCA	2	10	356551	356560	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
267	NC_021911	CGGCG	2	10	356857	356866	0 %	0 %	60 %	40 %	528837854
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269	NC_021911	CCATC	2	10	361150	361159	20 %	20 %	0 %	60 %	528837857
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