MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 17582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021911	AGA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021911	GCG	2	6	27	32	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021911	TGT	2	6	181	186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021911	ATA	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021911	CGT	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021911	CGC	2	6	422	427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021911	TCC	2	6	467	472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021911	CGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021911	CTT	2	6	663	668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021911	CGA	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837522
11	NC_021911	TCG	3	9	857	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
12	NC_021911	GCC	2	6	943	948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837522
13	NC_021911	CGT	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
14	NC_021911	CGT	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
15	NC_021911	CAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837522
16	NC_021911	GTC	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
17	NC_021911	TGG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837522
18	NC_021911	GTC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
19	NC_021911	GGA	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837522
20	NC_021911	GCG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837522
21	NC_021911	CGA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837522
22	NC_021911	GTC	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837522
23	NC_021911	ACG	2	6	1450	1455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837522
24	NC_021911	CGG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837522
25	NC_021911	ACA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837522
26	NC_021911	CGC	2	6	1630	1635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837523
27	NC_021911	GGC	2	6	1656	1661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837523
28	NC_021911	GCT	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837523
29	NC_021911	CTG	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837523
30	NC_021911	ACC	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837523
31	NC_021911	ATG	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837523
32	NC_021911	CGT	3	9	1850	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837523
33	NC_021911	GGC	2	6	1959	1964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837523
34	NC_021911	GAG	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837523
35	NC_021911	GCA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837523
36	NC_021911	CGG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837523
37	NC_021911	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837523
38	NC_021911	CGT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837523
39	NC_021911	CCG	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837523
40	NC_021911	ACG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837523
41	NC_021911	CTC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021911	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837524
43	NC_021911	CCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837524
44	NC_021911	CCT	2	6	2565	2570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837524
45	NC_021911	GCG	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837524
46	NC_021911	AGC	4	12	2837	2848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837524
47	NC_021911	CGA	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837524
48	NC_021911	GCA	2	6	3093	3098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837524
49	NC_021911	TCG	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837524
50	NC_021911	GAT	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837524
51	NC_021911	TCG	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837524
52	NC_021911	CGG	2	6	3345	3350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837524
53	NC_021911	GCA	2	6	3435	3440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021911	ATT	2	6	3461	3466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021911	CAA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837525
56	NC_021911	TGG	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837525
57	NC_021911	TTC	2	6	3671	3676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837525
58	NC_021911	AAG	2	6	3736	3741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
59	NC_021911	GAA	2	6	3759	3764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
60	NC_021911	TGA	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837525
61	NC_021911	TGG	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837525
62	NC_021911	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
63	NC_021911	GCG	3	9	3887	3895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
64	NC_021911	CAG	2	6	3907	3912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837525
65	NC_021911	CGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
66	NC_021911	CCG	2	6	3963	3968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
67	NC_021911	CGG	2	6	4083	4088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
68	NC_021911	CGA	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837525
69	NC_021911	GCG	2	6	4163	4168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
70	NC_021911	ACG	2	6	4304	4309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837525
71	NC_021911	CGG	2	6	4332	4337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
72	NC_021911	GGC	2	6	4399	4404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
73	NC_021911	CCG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
74	NC_021911	ACT	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837525
75	NC_021911	GAA	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
76	NC_021911	CGC	2	6	4711	4716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
77	NC_021911	CCG	2	6	4856	4861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
78	NC_021911	TCG	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837525
79	NC_021911	GCG	3	9	4994	5002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
80	NC_021911	CGC	2	6	5112	5117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
81	NC_021911	AAG	2	6	5131	5136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
82	NC_021911	GCC	2	6	5170	5175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
83	NC_021911	GGC	3	9	5187	5195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
84	NC_021911	CGG	2	6	5199	5204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837525
85	NC_021911	CGC	2	6	5279	5284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
86	NC_021911	GAA	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837525
87	NC_021911	TCG	2	6	5360	5365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837525
88	NC_021911	TCG	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837525
89	NC_021911	CTT	2	6	5493	5498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837525
90	NC_021911	GCC	2	6	5536	5541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837525
91	NC_021911	TCG	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837525
92	NC_021911	CGA	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021911	TCC	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021911	GCG	2	6	5862	5867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021911	GAG	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021911	GCA	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021911	GGA	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021911	ATC	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837526
99	NC_021911	GCG	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837526
100	NC_021911	CGT	2	6	6156	6161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837526
101	NC_021911	GAT	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837526
102	NC_021911	GGC	2	6	6180	6185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837526
103	NC_021911	CGG	2	6	6336	6341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837526
104	NC_021911	TGG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837526
105	NC_021911	ATC	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837526
106	NC_021911	GCG	2	6	6558	6563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837526
107	NC_021911	CAG	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837526
108	NC_021911	GCT	2	6	6624	6629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837526
109	NC_021911	GGA	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837526
110	NC_021911	GAA	2	6	6913	6918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021911	CGC	2	6	6929	6934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021911	GCC	2	6	6956	6961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021911	GCG	2	6	6965	6970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021911	ACG	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021911	CAA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021911	CAG	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837527
117	NC_021911	ATC	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837527
118	NC_021911	GAA	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837527
119	NC_021911	TCA	2	6	7434	7439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837527
120	NC_021911	TCA	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837527
121	NC_021911	CCG	2	6	7712	7717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837528
122	NC_021911	AGC	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837528
123	NC_021911	CGG	2	6	7764	7769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837528
124	NC_021911	CGG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837528
125	NC_021911	CGC	2	6	7844	7849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837528
126	NC_021911	AAC	2	6	7887	7892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021911	CTG	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837529
128	NC_021911	TCG	2	6	8063	8068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837529
129	NC_021911	CGG	2	6	8116	8121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837529
130	NC_021911	CCG	2	6	8123	8128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837529
131	NC_021911	CCG	2	6	8343	8348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837529
132	NC_021911	ACC	2	6	8357	8362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837529
133	NC_021911	CGG	2	6	8491	8496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_021911	CGC	2	6	14597	14602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837536
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242	NC_021911	GGC	3	9	14790	14798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837536
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246	NC_021911	CTG	2	6	15214	15219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837537
247	NC_021911	AGA	2	6	15254	15259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837537
248	NC_021911	CCG	2	6	15263	15268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837537
249	NC_021911	TAA	2	6	15362	15367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837537
250	NC_021911	GCA	2	6	15422	15427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837537
251	NC_021911	GAG	2	6	15523	15528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837537
252	NC_021911	AGT	2	6	15530	15535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837537
253	NC_021911	GTG	2	6	15568	15573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837537
254	NC_021911	TCG	2	6	15590	15595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837537
255	NC_021911	CAT	2	6	15666	15671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837537
256	NC_021911	AAT	2	6	15691	15696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021911	CAT	2	6	15795	15800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_021911	GCA	2	6	15815	15820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_021911	GCT	2	6	15889	15894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_021911	GCG	2	6	15896	15901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_021911	GCG	2	6	16038	16043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837538
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270	NC_021911	CCG	2	6	16556	16561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_021911	CGG	2	6	16626	16631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_021911	CGG	2	6	16750	16755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_021911	CGG	3	9	17705	17713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837540
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297	NC_021911	ATC	2	6	18189	18194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837541
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385	NC_021911	CGC	2	6	23471	23476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
386	NC_021911	CTT	2	6	23484	23489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
387	NC_021911	TCG	2	6	23498	23503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_021911	CCT	2	6	23554	23559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
389	NC_021911	CGT	2	6	23905	23910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837544
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392	NC_021911	CTC	3	9	24102	24110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
393	NC_021911	GCT	2	6	24141	24146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_021911	ATC	2	6	24260	24265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837545
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403	NC_021911	CAC	2	6	24629	24634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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411	NC_021911	CCT	2	6	25170	25175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837547
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484	NC_021911	TCA	3	9	29814	29822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837553
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497	NC_021911	GCA	2	6	30447	30452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837553
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499	NC_021911	GGC	2	6	30511	30516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837553
500	NC_021911	TGC	2	6	30522	30527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837553

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