MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 24116

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_021911	GCG	2	6	1077962	1077967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838526
24002	NC_021911	AGC	2	6	1078008	1078013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838526
24003	NC_021911	GGC	2	6	1078019	1078024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838526
24004	NC_021911	CCG	2	6	1078068	1078073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838526
24005	NC_021911	GAC	3	9	1078165	1078173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838526
24006	NC_021911	TCG	2	6	1078224	1078229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838526
24007	NC_021911	CGC	2	6	1078263	1078268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838526
24008	NC_021911	AAC	2	6	1078289	1078294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838526
24009	NC_021911	TCG	2	6	1078299	1078304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838526
24010	NC_021911	TCA	2	6	1078335	1078340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838526
24011	NC_021911	CGAG	2	8	1078392	1078399	25 %	0 %	50 %	25 %	528838526
24012	NC_021911	GAC	2	6	1078474	1078479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838526
24013	NC_021911	GTC	3	9	1078481	1078489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838526
24014	NC_021911	TGC	2	6	1078587	1078592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838526
24015	NC_021911	CCG	2	6	1078678	1078683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24016	NC_021911	TCCCC	2	10	1078688	1078697	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24017	NC_021911	GCC	2	6	1078709	1078714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24018	NC_021911	CGC	2	6	1078726	1078731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24019	NC_021911	ATA	2	6	1078856	1078861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24020	NC_021911	CGC	2	6	1078946	1078951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838527
24021	NC_021911	GAA	2	6	1078995	1079000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838527
24022	NC_021911	CCG	2	6	1079029	1079034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838527
24023	NC_021911	AGA	2	6	1079042	1079047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838527
24024	NC_021911	TCGC	2	8	1079062	1079069	0 %	25 %	25 %	50 %	528838527
24025	NC_021911	GAA	2	6	1079109	1079114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838527
24026	NC_021911	GCG	2	6	1079163	1079168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838527
24027	NC_021911	ATGT	2	8	1079239	1079246	25 %	50 %	25 %	0 %	528838527
24028	NC_021911	CGC	2	6	1079254	1079259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838527
24029	NC_021911	CGT	2	6	1079286	1079291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838527
24030	NC_021911	GGC	2	6	1079302	1079307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838527
24031	NC_021911	GAC	3	9	1079316	1079324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838527
24032	NC_021911	TCGATC	2	12	1079378	1079389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528838527
24033	NC_021911	CT	3	6	1079401	1079406	0 %	50 %	0 %	50 %	528838527
24034	NC_021911	CCT	2	6	1079441	1079446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838527
24035	NC_021911	CT	3	6	1079488	1079493	0 %	50 %	0 %	50 %	528838527
24036	NC_021911	ATC	2	6	1079497	1079502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838527
24037	NC_021911	CGC	2	6	1079573	1079578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838527
24038	NC_021911	CTT	2	6	1079616	1079621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838527
24039	NC_021911	GAT	2	6	1079653	1079658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838527
24040	NC_021911	ACG	2	6	1079663	1079668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838527
24041	NC_021911	TCG	2	6	1079669	1079674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838527
24042	NC_021911	CGC	2	6	1079687	1079692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838527
24043	NC_021911	CGG	2	6	1079723	1079728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838527
24044	NC_021911	CCAT	2	8	1079747	1079754	25 %	25 %	0 %	50 %	528838527
24045	NC_021911	CGG	2	6	1079802	1079807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838527
24046	NC_021911	GCC	2	6	1079827	1079832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838527
24047	NC_021911	CCGA	2	8	1079884	1079891	25 %	0 %	25 %	50 %	528838527
24048	NC_021911	CGA	2	6	1079924	1079929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838527
24049	NC_021911	GAA	2	6	1079949	1079954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838527
24050	NC_021911	GC	3	6	1080021	1080026	0 %	0 %	50 %	50 %	528838527
24051	NC_021911	CG	3	6	1080052	1080057	0 %	0 %	50 %	50 %	528838527
24052	NC_021911	GGA	2	6	1080183	1080188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24053	NC_021911	CTG	2	6	1080208	1080213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838528
24054	NC_021911	GC	3	6	1080248	1080253	0 %	0 %	50 %	50 %	528838528
24055	NC_021911	CGCT	2	8	1080292	1080299	0 %	25 %	25 %	50 %	528838528
24056	NC_021911	CGT	2	6	1080345	1080350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838528
24057	NC_021911	TTG	2	6	1080368	1080373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838528
24058	NC_021911	TCGT	2	8	1080379	1080386	0 %	50 %	25 %	25 %	528838528
24059	NC_021911	GGA	2	6	1080402	1080407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838528
24060	NC_021911	GACG	2	8	1080493	1080500	25 %	0 %	50 %	25 %	528838528
24061	NC_021911	GGT	2	6	1080507	1080512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838528
24062	NC_021911	CGG	2	6	1080523	1080528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838528
24063	NC_021911	GCC	2	6	1080535	1080540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838528
24064	NC_021911	CGT	2	6	1080567	1080572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838528
24065	NC_021911	CGA	2	6	1080582	1080587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838528
24066	NC_021911	GC	4	8	1080625	1080632	0 %	0 %	50 %	50 %	528838528
24067	NC_021911	GGA	2	6	1080675	1080680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838528
24068	NC_021911	CGC	2	6	1080717	1080722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838528
24069	NC_021911	GAT	2	6	1080744	1080749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838528
24070	NC_021911	GTC	2	6	1080778	1080783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838528
24071	NC_021911	CGGCC	2	10	1080792	1080801	0 %	0 %	40 %	60 %	528838528
24072	NC_021911	GCT	2	6	1080837	1080842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838528
24073	NC_021911	GAC	2	6	1080889	1080894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838528
24074	NC_021911	TCA	2	6	1080900	1080905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838528
24075	NC_021911	GCG	2	6	1080940	1080945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838528
24076	NC_021911	GC	3	6	1080956	1080961	0 %	0 %	50 %	50 %	528838528
24077	NC_021911	GAA	2	6	1080969	1080974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838528
24078	NC_021911	AAG	2	6	1080988	1080993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838528
24079	NC_021911	GCCG	2	8	1081081	1081088	0 %	0 %	50 %	50 %	528838528
24080	NC_021911	TC	3	6	1081101	1081106	0 %	50 %	0 %	50 %	528838528
24081	NC_021911	GAG	2	6	1081144	1081149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838528
24082	NC_021911	A	6	6	1081153	1081158	100 %	0 %	0 %	0 %	528838528
24083	NC_021911	ACGA	2	8	1081193	1081200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24084	NC_021911	TCC	2	6	1081322	1081327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24085	NC_021911	GAC	2	6	1081396	1081401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24086	NC_021911	GCG	2	6	1081411	1081416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838529
24087	NC_021911	CTG	3	9	1081433	1081441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24088	NC_021911	GAC	2	6	1081474	1081479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24089	NC_021911	GCA	2	6	1081482	1081487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24090	NC_021911	GACC	2	8	1081537	1081544	25 %	0 %	25 %	50 %	528838529
24091	NC_021911	GCT	2	6	1081567	1081572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24092	NC_021911	TGG	2	6	1081614	1081619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838529
24093	NC_021911	GCC	2	6	1081664	1081669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24094	NC_021911	CCG	2	6	1081678	1081683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24095	NC_021911	TCG	2	6	1081698	1081703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24096	NC_021911	CCG	2	6	1081753	1081758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24097	NC_021911	GGCAG	2	10	1081760	1081769	20 %	0 %	60 %	20 %	528838529
24098	NC_021911	CGA	2	6	1081777	1081782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24099	NC_021911	GCC	2	6	1081841	1081846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24100	NC_021911	CGC	2	6	1081852	1081857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24101	NC_021911	TGC	2	6	1081869	1081874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24102	NC_021911	CGC	3	9	1081927	1081935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24103	NC_021911	TTC	2	6	1081972	1081977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838529
24104	NC_021911	GCT	2	6	1081990	1081995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24105	NC_021911	GCC	2	6	1082032	1082037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24106	NC_021911	ATC	2	6	1082072	1082077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838529
24107	NC_021911	ATCTGA	2	12	1082170	1082181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	528838529
24108	NC_021911	AGG	2	6	1082202	1082207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838529
24109	NC_021911	GAT	2	6	1082246	1082251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838529
24110	NC_021911	AGGC	2	8	1082254	1082261	25 %	0 %	50 %	25 %	528838529
24111	NC_021911	CGGA	2	8	1082294	1082301	25 %	0 %	50 %	25 %	528838529
24112	NC_021911	CGG	2	6	1082409	1082414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838529
24113	NC_021911	TGC	2	6	1082433	1082438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838529
24114	NC_021911	CCG	2	6	1082447	1082452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24115	NC_021911	GCC	2	6	1082492	1082497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529
24116	NC_021911	CCG	2	6	1082541	1082546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838529

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.