MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 24116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021911	CG	3	6	22061	22066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_021911	TGA	2	6	22101	22106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021911	CGC	2	6	22149	22154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_021911	AGG	2	6	22204	22209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021911	CCT	2	6	22239	22244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_021911	TCGGC	2	10	22266	22275	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
507	NC_021911	CTG	2	6	22288	22293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021911	GCC	2	6	22366	22371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_021911	TGC	2	6	22385	22390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021911	ATC	2	6	22426	22431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021911	CGCT	2	8	22481	22488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
512	NC_021911	CGTT	2	8	22508	22515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_021911	CGC	2	6	22613	22618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_021911	CAT	2	6	22750	22755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021911	ACG	2	6	22764	22769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021911	CTC	2	6	22814	22819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_021911	CGG	2	6	22826	22831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021911	CCG	2	6	22898	22903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_021911	GAGG	2	8	22912	22919	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021911	GCA	2	6	22935	22940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021911	ACGCA	2	10	22957	22966	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
522	NC_021911	GCCG	2	8	23020	23027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_021911	CGC	2	6	23092	23097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_021911	ATC	2	6	23104	23109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021911	CGC	2	6	23123	23128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_021911	CGC	2	6	23143	23148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_021911	CGT	2	6	23161	23166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837543
528	NC_021911	TTC	2	6	23186	23191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837543
529	NC_021911	CTC	3	9	23219	23227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837543
530	NC_021911	GCC	2	6	23317	23322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837543
531	NC_021911	CCA	2	6	23363	23368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837543
532	NC_021911	CAC	2	6	23418	23423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_021911	CGC	2	6	23471	23476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_021911	CTT	2	6	23484	23489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_021911	TCG	2	6	23498	23503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021911	CCT	2	6	23554	23559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_021911	CGT	2	6	23905	23910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837544
538	NC_021911	GAG	2	6	23966	23971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837544
539	NC_021911	TGG	2	6	24077	24082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021911	CTC	3	9	24102	24110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_021911	GCT	2	6	24141	24146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021911	CT	3	6	24211	24216	0 %	50 %	0 %	50 %	528837545
543	NC_021911	ATC	2	6	24260	24265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837545
544	NC_021911	CCG	2	6	24318	24323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837545
545	NC_021911	CGC	2	6	24346	24351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837545
546	NC_021911	TCAA	2	8	24369	24376	50 %	25 %	0 %	25 %	528837545
547	NC_021911	GC	3	6	24382	24387	0 %	0 %	50 %	50 %	528837545
548	NC_021911	GCT	2	6	24390	24395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837545
549	NC_021911	GCA	2	6	24432	24437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837545
550	NC_021911	GCC	2	6	24438	24443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837545
551	NC_021911	TCA	2	6	24446	24451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837545
552	NC_021911	TCG	2	6	24469	24474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837545
553	NC_021911	CA	3	6	24478	24483	50 %	0 %	0 %	50 %	528837545
554	NC_021911	CCT	2	6	24607	24612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_021911	CAC	2	6	24629	24634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_021911	CGG	2	6	24752	24757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837546
557	NC_021911	CTT	2	6	24840	24845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837546
558	NC_021911	TCG	2	6	24886	24891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837546
559	NC_021911	CAG	2	6	24920	24925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837546
560	NC_021911	ATTC	2	8	24953	24960	25 %	50 %	0 %	25 %	528837546
561	NC_021911	GA	3	6	25001	25006	50 %	0 %	50 %	0 %	528837547
562	NC_021911	CAA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837547
563	NC_021911	GAC	3	9	25077	25085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837547
564	NC_021911	TCG	2	6	25156	25161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837547
565	NC_021911	CCT	2	6	25170	25175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837547
566	NC_021911	TGA	2	6	25214	25219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837547
567	NC_021911	GCA	2	6	25222	25227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837547
568	NC_021911	CAG	2	6	25239	25244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837547
569	NC_021911	CTG	2	6	25275	25280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837547
570	NC_021911	CGA	2	6	25301	25306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837547
571	NC_021911	GGA	2	6	25307	25312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837547
572	NC_021911	CGT	2	6	25341	25346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837547
573	NC_021911	AGA	2	6	25392	25397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837547
574	NC_021911	CGG	2	6	25456	25461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837547
575	NC_021911	AAGC	2	8	25462	25469	50 %	0 %	25 %	25 %	528837547
576	NC_021911	GCA	2	6	25470	25475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837547
577	NC_021911	ACC	2	6	25556	25561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837547
578	NC_021911	ACC	2	6	25581	25586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837548
579	NC_021911	CCGC	2	8	25618	25625	0 %	0 %	25 %	75 %	528837548
580	NC_021911	GA	3	6	25723	25728	50 %	0 %	50 %	0 %	528837548
581	NC_021911	TGG	2	6	25744	25749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837548
582	NC_021911	GGT	2	6	25754	25759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837548
583	NC_021911	TCC	2	6	25828	25833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837548
584	NC_021911	GGCT	2	8	25838	25845	0 %	25 %	50 %	25 %	528837548
585	NC_021911	GC	3	6	25855	25860	0 %	0 %	50 %	50 %	528837548
586	NC_021911	GCT	2	6	25863	25868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837548
587	NC_021911	AGCC	2	8	25872	25879	25 %	0 %	25 %	50 %	528837548
588	NC_021911	CAGC	2	8	25895	25902	25 %	0 %	25 %	50 %	528837548
589	NC_021911	ATG	2	6	25929	25934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837548
590	NC_021911	CTC	2	6	25961	25966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837548
591	NC_021911	GC	3	6	25982	25987	0 %	0 %	50 %	50 %	528837548
592	NC_021911	GCA	2	6	26143	26148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837548
593	NC_021911	ACG	3	9	26247	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837548
594	NC_021911	TCG	2	6	26259	26264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837548
595	NC_021911	CGG	2	6	26292	26297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837548
596	NC_021911	GCTT	2	8	26330	26337	0 %	50 %	25 %	25 %	528837548
597	NC_021911	TCT	2	6	26368	26373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837548
598	NC_021911	CTG	2	6	26426	26431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837548
599	NC_021911	TCG	2	6	26457	26462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837548
600	NC_021911	GAC	2	6	26477	26482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837548
601	NC_021911	GAT	2	6	26486	26491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837548
602	NC_021911	CCT	2	6	26525	26530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837549
603	NC_021911	TCG	2	6	26585	26590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837549
604	NC_021911	CCGA	2	8	26644	26651	25 %	0 %	25 %	50 %	528837549
605	NC_021911	TCA	2	6	26696	26701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837549
606	NC_021911	TCGGCC	2	12	26728	26739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528837549
607	NC_021911	CGC	2	6	26751	26756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837549
608	NC_021911	CGG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837549
609	NC_021911	TCG	2	6	26977	26982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837549
610	NC_021911	GCA	2	6	26990	26995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837549
611	NC_021911	AGC	2	6	27055	27060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837549
612	NC_021911	CGA	2	6	27131	27136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837549
613	NC_021911	CCT	2	6	27158	27163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837549
614	NC_021911	GC	3	6	27187	27192	0 %	0 %	50 %	50 %	528837549
615	NC_021911	CGAT	2	8	27208	27215	25 %	25 %	25 %	25 %	528837549
616	NC_021911	TCC	2	6	27241	27246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837549
617	NC_021911	GCC	2	6	27289	27294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837549
618	NC_021911	GCG	2	6	27297	27302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837549
619	NC_021911	GCACGA	2	12	27404	27415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837549
620	NC_021911	GA	3	6	27414	27419	50 %	0 %	50 %	0 %	528837549
621	NC_021911	TGA	2	6	27515	27520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837549
622	NC_021911	CTCG	2	8	27566	27573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_021911	GAA	2	6	27578	27583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021911	AACT	2	8	27612	27619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_021911	ACA	2	6	27668	27673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837550
626	NC_021911	TGC	2	6	27750	27755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837550
627	NC_021911	GC	3	6	27771	27776	0 %	0 %	50 %	50 %	528837550
628	NC_021911	CGG	2	6	27802	27807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837550
629	NC_021911	GCG	2	6	27845	27850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837550
630	NC_021911	ACG	2	6	27908	27913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837550
631	NC_021911	AGCATC	2	12	27944	27955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528837550
632	NC_021911	CGA	2	6	27979	27984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837550
633	NC_021911	GGC	2	6	28026	28031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837550
634	NC_021911	CTC	2	6	28082	28087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837550
635	NC_021911	AGG	2	6	28089	28094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837550
636	NC_021911	CTG	2	6	28145	28150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837550
637	NC_021911	GAGC	2	8	28168	28175	25 %	0 %	50 %	25 %	528837550
638	NC_021911	CCT	2	6	28195	28200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837550
639	NC_021911	GCCC	2	8	28297	28304	0 %	0 %	25 %	75 %	528837550
640	NC_021911	CTG	2	6	28394	28399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837551
641	NC_021911	T	6	6	28520	28525	0 %	100 %	0 %	0 %	528837551
642	NC_021911	GCG	2	6	28551	28556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_021911	CAT	2	6	28607	28612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_021911	ACC	2	6	28841	28846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837552
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646	NC_021911	CGA	2	6	28891	28896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837552
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648	NC_021911	CTG	2	6	28973	28978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
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650	NC_021911	TGC	2	6	29014	29019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
651	NC_021911	GCCT	2	8	29085	29092	0 %	25 %	25 %	50 %	528837552
652	NC_021911	GGCGCC	2	12	29108	29119	0 %	0 %	50 %	50 %	528837552
653	NC_021911	CCGTC	2	10	29181	29190	0 %	20 %	20 %	60 %	528837552
654	NC_021911	TTGC	2	8	29207	29214	0 %	50 %	25 %	25 %	528837552
655	NC_021911	TGCT	2	8	29311	29318	0 %	50 %	25 %	25 %	528837552
656	NC_021911	CG	3	6	29320	29325	0 %	0 %	50 %	50 %	528837552
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661	NC_021911	GCT	2	6	29494	29499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
662	NC_021911	TCG	2	6	29555	29560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
663	NC_021911	GAAG	2	8	29603	29610	50 %	0 %	50 %	0 %	528837552
664	NC_021911	GCT	2	6	29685	29690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837552
665	NC_021911	ATC	2	6	29716	29721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_021911	TAG	2	6	29731	29736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
667	NC_021911	CGC	2	6	29748	29753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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694	NC_021911	GGC	2	6	30779	30784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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748	NC_021911	CGGG	2	8	32606	32613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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756	NC_021911	CGGA	2	8	33132	33139	25 %	0 %	50 %	25 %	528837556
757	NC_021911	TGA	2	6	33145	33150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837556
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881	NC_021911	GGC	2	6	38229	38234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837560
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