MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 24116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021911	TCG	2	6	276062	276067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837782
6002	NC_021911	CGC	2	6	276143	276148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837782
6003	NC_021911	GCT	2	6	276243	276248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837783
6004	NC_021911	CGG	2	6	276277	276282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837783
6005	NC_021911	GTC	2	6	276325	276330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837783
6006	NC_021911	GCTC	2	8	276372	276379	0 %	25 %	25 %	50 %	528837783
6007	NC_021911	TCG	2	6	276386	276391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837783
6008	NC_021911	CCTC	2	8	276422	276429	0 %	25 %	0 %	75 %	528837783
6009	NC_021911	CGT	2	6	276561	276566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837783
6010	NC_021911	GC	3	6	276567	276572	0 %	0 %	50 %	50 %	528837783
6011	NC_021911	TC	3	6	276616	276621	0 %	50 %	0 %	50 %	528837783
6012	NC_021911	GC	4	8	276656	276663	0 %	0 %	50 %	50 %	528837783
6013	NC_021911	ATC	2	6	276667	276672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837783
6014	NC_021911	GCCT	2	8	276683	276690	0 %	25 %	25 %	50 %	528837783
6015	NC_021911	GGATGT	2	12	276696	276707	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	528837783
6016	NC_021911	GCC	2	6	276715	276720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837783
6017	NC_021911	GCC	2	6	276754	276759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837783
6018	NC_021911	GAA	2	6	276771	276776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837783
6019	NC_021911	AGC	2	6	276787	276792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_021911	TAG	2	6	276878	276883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_021911	TTG	2	6	276901	276906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_021911	GAA	2	6	276913	276918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021911	TGA	2	6	276971	276976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_021911	GCG	2	6	277021	277026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_021911	AACC	2	8	277127	277134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_021911	T	7	7	277136	277142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_021911	GCG	2	6	277215	277220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_021911	ATA	2	6	277259	277264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_021911	GC	3	6	277277	277282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_021911	TCAA	2	8	277392	277399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_021911	GCCC	2	8	277441	277448	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6032	NC_021911	ATG	2	6	277552	277557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021911	TGG	2	6	277716	277721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021911	CGG	2	6	277816	277821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_021911	GCCA	2	8	277892	277899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_021911	GCTC	2	8	278027	278034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_021911	ATT	2	6	278041	278046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_021911	ATG	2	6	278076	278081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_021911	ATC	2	6	278179	278184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_021911	TC	3	6	278201	278206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_021911	CGGCG	2	10	278311	278320	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6042	NC_021911	GAA	2	6	278362	278367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021911	CGC	2	6	278372	278377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_021911	CAA	2	6	278387	278392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_021911	GCCT	2	8	278396	278403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_021911	GCC	2	6	278446	278451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_021911	GCC	2	6	278540	278545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_021911	GA	3	6	278550	278555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021911	GTCGT	2	10	278636	278645	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6050	NC_021911	GCA	2	6	278663	278668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_021911	CGC	2	6	278707	278712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_021911	GCTC	2	8	278778	278785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_021911	ATC	2	6	278828	278833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_021911	CAG	2	6	278836	278841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_021911	TCT	2	6	278898	278903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_021911	GCG	2	6	279041	279046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_021911	ACG	2	6	279050	279055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_021911	GACG	2	8	279092	279099	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_021911	CCG	2	6	279144	279149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_021911	CTC	2	6	279181	279186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_021911	CG	3	6	279281	279286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_021911	GGC	2	6	279325	279330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_021911	GCT	2	6	279347	279352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_021911	CAG	2	6	279391	279396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_021911	GTC	2	6	279415	279420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_021911	GCC	2	6	279510	279515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_021911	CAG	2	6	279550	279555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_021911	CAC	2	6	279580	279585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_021911	CTT	2	6	279631	279636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_021911	GAC	2	6	279737	279742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837784
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6073	NC_021911	CCG	2	6	279934	279939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837784
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6080	NC_021911	TG	3	6	280193	280198	0 %	50 %	50 %	0 %	528837784
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6091	NC_021911	CGCAT	2	10	280804	280813	20 %	20 %	20 %	40 %	528837784
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6097	NC_021911	GTC	2	6	281191	281196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837784
6098	NC_021911	TCGATC	2	12	281262	281273	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528837784
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6104	NC_021911	GC	3	6	281522	281527	0 %	0 %	50 %	50 %	528837784
6105	NC_021911	TGC	2	6	281614	281619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837784
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6109	NC_021911	CAG	2	6	281853	281858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837785
6110	NC_021911	CCA	2	6	281876	281881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837785
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6112	NC_021911	CAT	2	6	281973	281978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837785
6113	NC_021911	CCTTCT	2	12	281979	281990	0 %	50 %	0 %	50 %	528837785
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6116	NC_021911	TCG	2	6	282255	282260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837785
6117	NC_021911	CCGCGG	2	12	282300	282311	0 %	0 %	50 %	50 %	528837785
6118	NC_021911	CA	3	6	282328	282333	50 %	0 %	0 %	50 %	528837785
6119	NC_021911	CCT	2	6	282352	282357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_021911	GCCA	2	8	282411	282418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_021911	ATC	2	6	282444	282449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_021911	CACGCG	2	12	282508	282519	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_021911	CGA	2	6	282560	282565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_021911	TGG	2	6	282576	282581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_021911	GA	3	6	282600	282605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_021911	CTC	2	6	282664	282669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_021911	AAC	2	6	282698	282703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_021911	GCCG	2	8	282718	282725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_021911	CG	3	6	282724	282729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_021911	ACT	2	6	282856	282861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6142	NC_021911	GGT	2	6	283906	283911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6147	NC_021911	TAT	2	6	284055	284060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6159	NC_021911	CG	3	6	284553	284558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6161	NC_021911	TTG	2	6	284684	284689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6181	NC_021911	CTG	2	6	285604	285609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837787
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6222	NC_021911	CTG	2	6	287498	287503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837789
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6227	NC_021911	TCG	2	6	287826	287831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837789
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6233	NC_021911	CAT	3	9	288004	288012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837789
6234	NC_021911	GC	3	6	288053	288058	0 %	0 %	50 %	50 %	528837789
6235	NC_021911	ATC	2	6	288113	288118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837789
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6240	NC_021911	GCC	2	6	288274	288279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837790
6241	NC_021911	GAC	2	6	288292	288297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
6242	NC_021911	TGC	2	6	288354	288359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
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6244	NC_021911	GAT	2	6	288405	288410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837790
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6246	NC_021911	GC	3	6	288427	288432	0 %	0 %	50 %	50 %	528837790
6247	NC_021911	GAC	2	6	288453	288458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
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6249	NC_021911	GAC	2	6	288558	288563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
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6251	NC_021911	TCG	2	6	288632	288637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
6252	NC_021911	TGCGA	2	10	288643	288652	20 %	20 %	40 %	20 %	528837790
6253	NC_021911	CGC	2	6	288681	288686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837790
6254	NC_021911	CTG	2	6	288712	288717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
6255	NC_021911	GGA	2	6	288741	288746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837790
6256	NC_021911	CTC	2	6	288781	288786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837790
6257	NC_021911	TCG	2	6	288814	288819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
6258	NC_021911	TGA	2	6	288824	288829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837790
6259	NC_021911	GC	4	8	288834	288841	0 %	0 %	50 %	50 %	528837790
6260	NC_021911	AGC	2	6	288854	288859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
6261	NC_021911	ACG	2	6	288866	288871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
6262	NC_021911	CGA	2	6	288923	288928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837790
6263	NC_021911	TCG	2	6	288929	288934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837790
6264	NC_021911	TCGTGG	2	12	288959	288970	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528837790
6265	NC_021911	GGC	2	6	288991	288996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837790
6266	NC_021911	GTT	2	6	289020	289025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837790
6267	NC_021911	CCG	2	6	289042	289047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837790
6268	NC_021911	GGCG	2	8	289086	289093	0 %	0 %	75 %	25 %	528837790
6269	NC_021911	GAG	2	6	289189	289194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6270	NC_021911	GTC	2	6	289201	289206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6271	NC_021911	GGA	2	6	289223	289228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837791
6272	NC_021911	AGA	2	6	289251	289256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837791
6273	NC_021911	CTG	2	6	289276	289281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837791
6274	NC_021911	GCC	2	6	289329	289334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837791
6275	NC_021911	GACCCT	2	12	289337	289348	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528837791
6276	NC_021911	AGA	2	6	289417	289422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837791
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6278	NC_021911	GC	3	6	289564	289569	0 %	0 %	50 %	50 %	528837791
6279	NC_021911	TGG	2	6	289683	289688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837791
6280	NC_021911	GCCG	2	8	289769	289776	0 %	0 %	50 %	50 %	528837791
6281	NC_021911	GCA	2	6	289856	289861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837791
6282	NC_021911	CAA	2	6	289925	289930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837791
6283	NC_021911	TCA	2	6	289933	289938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837791
6284	NC_021911	AGG	2	6	290038	290043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837791
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6286	NC_021911	CGC	2	6	290111	290116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837791
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6288	NC_021911	GCG	3	9	290223	290231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837791
6289	NC_021911	CTC	2	6	290243	290248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6290	NC_021911	ATC	2	6	290307	290312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837792
6291	NC_021911	GGTC	2	8	290326	290333	0 %	25 %	50 %	25 %	528837792
6292	NC_021911	ATC	2	6	290334	290339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837792
6293	NC_021911	GGT	2	6	290360	290365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837792
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6298	NC_021911	GAC	2	6	290543	290548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837792
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6319	NC_021911	GCT	3	9	291538	291546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837793
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6323	NC_021911	GTC	2	6	291623	291628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837793
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6333	NC_021911	TCG	3	9	291935	291943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837793
6334	NC_021911	ACG	2	6	291965	291970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837793
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6338	NC_021911	GCT	2	6	292178	292183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837794
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6354	NC_021911	GACG	2	8	292769	292776	25 %	0 %	50 %	25 %	528837794
6355	NC_021911	CAT	2	6	292781	292786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837794
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6361	NC_021911	GCC	2	6	293055	293060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837794
6362	NC_021911	TCC	2	6	293107	293112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837794
6363	NC_021911	ATC	2	6	293124	293129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837794
6364	NC_021911	CCG	2	6	293147	293152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837794
6365	NC_021911	GC	3	6	293164	293169	0 %	0 %	50 %	50 %	528837794
6366	NC_021911	CGG	2	6	293177	293182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837794
6367	NC_021911	CTG	2	6	293208	293213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837794
6368	NC_021911	TGAAGG	2	12	293221	293232	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	528837794
6369	NC_021911	GCA	2	6	293276	293281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837794
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6371	NC_021911	GCTG	2	8	293299	293306	0 %	25 %	50 %	25 %	528837794
6372	NC_021911	GCT	2	6	293321	293326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837794
6373	NC_021911	TCA	2	6	293386	293391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837794
6374	NC_021911	TGG	2	6	293424	293429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837794
6375	NC_021911	CTG	2	6	293448	293453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837794
6376	NC_021911	CGA	2	6	293516	293521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837794
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6378	NC_021911	CAGA	2	8	293617	293624	50 %	0 %	25 %	25 %	528837795
6379	NC_021911	TGC	2	6	293679	293684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837795
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6401	NC_021911	TGA	2	6	294438	294443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837795
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6403	NC_021911	CGG	2	6	294557	294562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837795
6404	NC_021911	G	6	6	294561	294566	0 %	0 %	100 %	0 %	528837795
6405	NC_021911	GGA	3	9	294600	294608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6406	NC_021911	GTT	2	6	294641	294646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837796
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6430	NC_021911	TCG	2	6	295934	295939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837797
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6443	NC_021911	TTCA	2	8	296880	296887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6474	NC_021911	CA	3	6	298172	298177	50 %	0 %	0 %	50 %	528837800
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6489	NC_021911	TGAA	2	8	299070	299077	50 %	25 %	25 %	0 %	528837801
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6491	NC_021911	CGC	2	6	299206	299211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837801
6492	NC_021911	GCAA	2	8	299218	299225	50 %	0 %	25 %	25 %	528837801
6493	NC_021911	TCAA	2	8	299274	299281	50 %	25 %	0 %	25 %	528837801
6494	NC_021911	CTC	2	6	299307	299312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837802
6495	NC_021911	GAA	2	6	299313	299318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837802
6496	NC_021911	CGG	2	6	299340	299345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837802
6497	NC_021911	ATA	2	6	299364	299369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837802
6498	NC_021911	CGG	2	6	299388	299393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837802
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