MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 24116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021911	ATC	2	6	250994	250999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837756
5502	NC_021911	CGTT	2	8	251027	251034	0 %	50 %	25 %	25 %	528837756
5503	NC_021911	CGGG	2	8	251096	251103	0 %	0 %	75 %	25 %	528837756
5504	NC_021911	GGC	2	6	251157	251162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837756
5505	NC_021911	CGGG	2	8	251196	251203	0 %	0 %	75 %	25 %	528837756
5506	NC_021911	GC	3	6	251236	251241	0 %	0 %	50 %	50 %	528837756
5507	NC_021911	GAT	2	6	251269	251274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837756
5508	NC_021911	TTC	2	6	251320	251325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_021911	GAAG	2	8	251427	251434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021911	TCGC	2	8	251435	251442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_021911	CTGG	2	8	251463	251470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_021911	CTTC	2	8	251488	251495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_021911	CCAG	2	8	251538	251545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_021911	CGA	2	6	251548	251553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_021911	CCTG	2	8	251593	251600	0 %	25 %	25 %	50 %	528837757
5516	NC_021911	GC	3	6	251616	251621	0 %	0 %	50 %	50 %	528837757
5517	NC_021911	GGCCG	2	10	251683	251692	0 %	0 %	60 %	40 %	528837757
5518	NC_021911	CTG	2	6	251735	251740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837757
5519	NC_021911	AAT	2	6	251809	251814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_021911	GAC	2	6	251900	251905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837758
5521	NC_021911	GAT	2	6	251912	251917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837758
5522	NC_021911	GATC	2	8	251942	251949	25 %	25 %	25 %	25 %	528837758
5523	NC_021911	GCC	2	6	252042	252047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837758
5524	NC_021911	TGA	2	6	252146	252151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021911	CG	3	6	252154	252159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_021911	GA	3	6	252314	252319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021911	ATG	2	6	252325	252330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837759
5528	NC_021911	GCC	2	6	252348	252353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837759
5529	NC_021911	CGAC	2	8	252374	252381	25 %	0 %	25 %	50 %	528837759
5530	NC_021911	CCA	2	6	252404	252409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837759
5531	NC_021911	GTT	2	6	252419	252424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837759
5532	NC_021911	GC	3	6	252468	252473	0 %	0 %	50 %	50 %	528837759
5533	NC_021911	TGA	2	6	252577	252582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837760
5534	NC_021911	CTG	3	9	252700	252708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837761
5535	NC_021911	ATC	2	6	252717	252722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837761
5536	NC_021911	GAT	2	6	252740	252745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837761
5537	NC_021911	TGG	2	6	252787	252792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837761
5538	NC_021911	GCCC	2	8	252829	252836	0 %	0 %	25 %	75 %	528837761
5539	NC_021911	AAG	2	6	252867	252872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837761
5540	NC_021911	CAA	2	6	252982	252987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837761
5541	NC_021911	GA	4	8	252988	252995	50 %	0 %	50 %	0 %	528837761
5542	NC_021911	GCC	2	6	253034	253039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837761
5543	NC_021911	GCA	2	6	253056	253061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837761
5544	NC_021911	GGC	2	6	253100	253105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837761
5545	NC_021911	GATA	2	8	253122	253129	50 %	25 %	25 %	0 %	528837761
5546	NC_021911	GAT	2	6	253292	253297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837761
5547	NC_021911	GGC	2	6	253313	253318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837761
5548	NC_021911	GCCA	2	8	253339	253346	25 %	0 %	25 %	50 %	528837761
5549	NC_021911	GC	3	6	253425	253430	0 %	0 %	50 %	50 %	528837761
5550	NC_021911	CGG	2	6	253492	253497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837761
5551	NC_021911	GGC	2	6	253550	253555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837761
5552	NC_021911	AGC	2	6	253590	253595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837761
5553	NC_021911	CCG	2	6	253604	253609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837761
5554	NC_021911	GCA	2	6	253798	253803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837761
5555	NC_021911	CCG	2	6	253830	253835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_021911	GCA	2	6	253870	253875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_021911	CAGC	2	8	253925	253932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_021911	TCT	2	6	254077	254082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837762
5559	NC_021911	CTT	2	6	254123	254128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837762
5560	NC_021911	GGC	2	6	254151	254156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837762
5561	NC_021911	GCC	2	6	254226	254231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837762
5562	NC_021911	TGG	2	6	254233	254238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837762
5563	NC_021911	CGG	2	6	254248	254253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837762
5564	NC_021911	TGG	2	6	254254	254259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837762
5565	NC_021911	GAT	2	6	254294	254299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837762
5566	NC_021911	GGT	2	6	254323	254328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837762
5567	NC_021911	GAT	2	6	254375	254380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837762
5568	NC_021911	CCG	2	6	254381	254386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837762
5569	NC_021911	CGT	2	6	254416	254421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837762
5570	NC_021911	ATG	2	6	254430	254435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837762
5571	NC_021911	TTG	2	6	254442	254447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837762
5572	NC_021911	TGC	2	6	254486	254491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837762
5573	NC_021911	CTG	2	6	254506	254511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837762
5574	NC_021911	TCG	2	6	254565	254570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837762
5575	NC_021911	GCG	2	6	254582	254587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837762
5576	NC_021911	AAT	2	6	254594	254599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837762
5577	NC_021911	GCC	2	6	254657	254662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837762
5578	NC_021911	TGA	2	6	254665	254670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837762
5579	NC_021911	TTG	2	6	254886	254891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837763
5580	NC_021911	GCC	2	6	254970	254975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837763
5581	NC_021911	TCGGA	2	10	255049	255058	20 %	20 %	40 %	20 %	528837763
5582	NC_021911	GCG	2	6	255129	255134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837763
5583	NC_021911	ATGGCG	2	12	255165	255176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528837763
5584	NC_021911	TGC	2	6	255226	255231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837763
5585	NC_021911	GAG	2	6	255412	255417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021911	GATCG	2	10	255490	255499	20 %	20 %	40 %	20 %	528837764
5587	NC_021911	GGC	2	6	255515	255520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837764
5588	NC_021911	TTC	2	6	255524	255529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837764
5589	NC_021911	CGA	2	6	255561	255566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837764
5590	NC_021911	TGG	2	6	255575	255580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837764
5591	NC_021911	GAA	2	6	255587	255592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837764
5592	NC_021911	ACG	2	6	255848	255853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837764
5593	NC_021911	C	6	6	255906	255911	0 %	0 %	0 %	100 %	528837764
5594	NC_021911	GAT	2	6	255919	255924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837764
5595	NC_021911	ATC	2	6	255971	255976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837764
5596	NC_021911	CAG	2	6	256018	256023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837764
5597	NC_021911	CGTG	2	8	256097	256104	0 %	25 %	50 %	25 %	528837764
5598	NC_021911	AAAG	2	8	256159	256166	75 %	0 %	25 %	0 %	528837764
5599	NC_021911	GCGAC	3	15	256185	256199	20 %	0 %	40 %	40 %	528837764
5600	NC_021911	ACC	2	6	256266	256271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837764
5601	NC_021911	GCC	2	6	256340	256345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837764
5602	NC_021911	TTA	2	6	256496	256501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_021911	ACGG	2	8	256502	256509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_021911	ATAG	2	8	256541	256548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_021911	CTTCG	2	10	256573	256582	0 %	40 %	20 %	40 %	528837765
5606	NC_021911	TC	3	6	256597	256602	0 %	50 %	0 %	50 %	528837765
5607	NC_021911	CG	3	6	256615	256620	0 %	0 %	50 %	50 %	528837765
5608	NC_021911	TGC	2	6	256684	256689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837765
5609	NC_021911	TCC	2	6	256764	256769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837765
5610	NC_021911	ATTG	2	8	256780	256787	25 %	50 %	25 %	0 %	528837765
5611	NC_021911	GCGTG	2	10	256796	256805	0 %	20 %	60 %	20 %	528837765
5612	NC_021911	AGG	2	6	256854	256859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837765
5613	NC_021911	ACC	2	6	256869	256874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837765
5614	NC_021911	ATTTCC	2	12	256876	256887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	528837765
5615	NC_021911	CGC	2	6	256904	256909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837765
5616	NC_021911	AGC	2	6	256918	256923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837765
5617	NC_021911	TAC	2	6	256981	256986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_021911	TTGT	2	8	256992	256999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_021911	TCA	2	6	257062	257067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_021911	CGA	2	6	257121	257126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837766
5621	NC_021911	TCG	2	6	257180	257185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837766
5622	NC_021911	TCG	2	6	257390	257395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837766
5623	NC_021911	AGC	2	6	257442	257447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837766
5624	NC_021911	ATC	2	6	257542	257547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837766
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5626	NC_021911	CGG	2	6	257556	257561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837766
5627	NC_021911	CGC	2	6	257709	257714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837766
5628	NC_021911	GC	3	6	257726	257731	0 %	0 %	50 %	50 %	528837766
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5635	NC_021911	AGC	2	6	258239	258244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837767
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5638	NC_021911	CGA	2	6	258333	258338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837767
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5643	NC_021911	TGAG	2	8	258516	258523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5659	NC_021911	TGGT	2	8	259296	259303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5660	NC_021911	GATA	2	8	259306	259313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5661	NC_021911	CAT	2	6	259407	259412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5698	NC_021911	TAGT	2	8	261017	261024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5699	NC_021911	G	6	6	261039	261044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5719	NC_021911	TAAGG	2	10	262412	262421	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5990	NC_021911	GCG	2	6	275581	275586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837782
5991	NC_021911	CGC	2	6	275719	275724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837782
5992	NC_021911	GTC	2	6	275781	275786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837782
5993	NC_021911	ATC	2	6	275853	275858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837782
5994	NC_021911	GCC	2	6	275877	275882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837782
5995	NC_021911	CCG	2	6	275902	275907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837782
5996	NC_021911	CAT	2	6	275919	275924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837782
5997	NC_021911	GC	3	6	275986	275991	0 %	0 %	50 %	50 %	528837782
5998	NC_021911	GCA	2	6	275995	276000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837782
5999	NC_021911	TCG	2	6	276011	276016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837782
6000	NC_021911	GAC	2	6	276054	276059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837782

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