MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 5325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021910	TG	3	6	181531	181536	0 %	50 %	50 %	0 %	528835479
3502	NC_021910	TCT	2	6	181550	181555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835479
3503	NC_021910	TTCG	2	8	181573	181580	0 %	50 %	25 %	25 %	528835479
3504	NC_021910	AGC	2	6	181627	181632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835479
3505	NC_021910	CGC	2	6	181634	181639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835479
3506	NC_021910	ACA	2	6	181652	181657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835479
3507	NC_021910	AG	3	6	181659	181664	50 %	0 %	50 %	0 %	528835479
3508	NC_021910	GATT	2	8	181671	181678	25 %	50 %	25 %	0 %	528835479
3509	NC_021910	CTC	2	6	181762	181767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835479
3510	NC_021910	CGA	2	6	181794	181799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835479
3511	NC_021910	CCG	2	6	181813	181818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835479
3512	NC_021910	ATG	2	6	181826	181831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835479
3513	NC_021910	TCGC	2	8	181921	181928	0 %	25 %	25 %	50 %	528835479
3514	NC_021910	ATTT	2	8	181947	181954	25 %	75 %	0 %	0 %	528835479
3515	NC_021910	TCGG	2	8	182041	182048	0 %	25 %	50 %	25 %	528835479
3516	NC_021910	TGTTCT	2	12	182136	182147	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	528835479
3517	NC_021910	GCC	2	6	182188	182193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835479
3518	NC_021910	CTC	2	6	182245	182250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835479
3519	NC_021910	TGG	2	6	182261	182266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835479
3520	NC_021910	TGG	2	6	182268	182273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835479
3521	NC_021910	GTT	2	6	182410	182415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835479
3522	NC_021910	GAC	2	6	182482	182487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835479
3523	NC_021910	GCT	2	6	182609	182614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835480
3524	NC_021910	TCG	2	6	182665	182670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835480
3525	NC_021910	GCAG	2	8	182679	182686	25 %	0 %	50 %	25 %	528835480
3526	NC_021910	GCT	2	6	182856	182861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835480
3527	NC_021910	GGC	2	6	182919	182924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835480
3528	NC_021910	ACC	2	6	183066	183071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835480
3529	NC_021910	AGG	2	6	183094	183099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835480
3530	NC_021910	TGCT	2	8	183109	183116	0 %	50 %	25 %	25 %	528835480
3531	NC_021910	ATCGT	2	10	183118	183127	20 %	40 %	20 %	20 %	528835480
3532	NC_021910	GC	3	6	183229	183234	0 %	0 %	50 %	50 %	528835480
3533	NC_021910	GCA	3	9	183385	183393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835480
3534	NC_021910	ATT	2	6	183411	183416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835480
3535	NC_021910	AGAGC	2	10	183444	183453	40 %	0 %	40 %	20 %	528835480
3536	NC_021910	GAC	2	6	183465	183470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835480
3537	NC_021910	AAC	2	6	183517	183522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835480
3538	NC_021910	GCA	2	6	183611	183616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_021910	TCA	2	6	183721	183726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_021910	TTG	2	6	183843	183848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021910	CTTT	2	8	183985	183992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_021910	GCGT	2	8	184051	184058	0 %	25 %	50 %	25 %	528835481
3543	NC_021910	CGA	2	6	184082	184087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835481
3544	NC_021910	GGC	2	6	184234	184239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835481
3545	NC_021910	CCG	2	6	184347	184352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835481
3546	NC_021910	GCT	2	6	184353	184358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835481
3547	NC_021910	ACT	2	6	184385	184390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835481
3548	NC_021910	GCC	2	6	184442	184447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835481
3549	NC_021910	ACG	2	6	184457	184462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835481
3550	NC_021910	TTG	2	6	184474	184479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835481
3551	NC_021910	CTC	2	6	184491	184496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835481
3552	NC_021910	GCG	2	6	184562	184567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835481
3553	NC_021910	ATCAA	2	10	184584	184593	60 %	20 %	0 %	20 %	528835481
3554	NC_021910	CT	3	6	184612	184617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_021910	CCT	2	6	184629	184634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_021910	GACAGT	2	12	184635	184646	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3557	NC_021910	GCA	2	6	184694	184699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021910	A	6	6	184761	184766	100 %	0 %	0 %	0 %	528835482
3559	NC_021910	CAG	2	6	184805	184810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835482
3560	NC_021910	GGC	2	6	184811	184816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835482
3561	NC_021910	CGG	2	6	184844	184849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835482
3562	NC_021910	CGG	2	6	184870	184875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835482
3563	NC_021910	GTG	2	6	184924	184929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835482
3564	NC_021910	GAT	2	6	184934	184939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835482
3565	NC_021910	TGA	2	6	185075	185080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835482
3566	NC_021910	G	6	6	185092	185097	0 %	0 %	100 %	0 %	528835482
3567	NC_021910	CTG	2	6	185101	185106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835482
3568	NC_021910	GCA	2	6	185158	185163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835482
3569	NC_021910	TGCT	2	8	185179	185186	0 %	50 %	25 %	25 %	528835482
3570	NC_021910	CCG	2	6	185188	185193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835482
3571	NC_021910	GAAG	2	8	185204	185211	50 %	0 %	50 %	0 %	528835482
3572	NC_021910	TGC	2	6	185231	185236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835482
3573	NC_021910	GCG	2	6	185286	185291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835482
3574	NC_021910	GAG	2	6	185301	185306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835482
3575	NC_021910	TGGA	2	8	185327	185334	25 %	25 %	50 %	0 %	528835482
3576	NC_021910	CT	4	8	185380	185387	0 %	50 %	0 %	50 %	528835482
3577	NC_021910	AG	3	6	185409	185414	50 %	0 %	50 %	0 %	528835482
3578	NC_021910	CGTG	2	8	185453	185460	0 %	25 %	50 %	25 %	528835482
3579	NC_021910	GGC	2	6	185466	185471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835482
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3581	NC_021910	CTA	2	6	185581	185586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835482
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3583	NC_021910	GAT	2	6	185706	185711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835482
3584	NC_021910	CGT	2	6	185753	185758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835482
3585	NC_021910	CAA	2	6	185849	185854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835482
3586	NC_021910	GCC	2	6	185908	185913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835482
3587	NC_021910	TGA	2	6	185920	185925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835482
3588	NC_021910	CGC	2	6	185958	185963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835482
3589	NC_021910	TCA	2	6	186062	186067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835482
3590	NC_021910	ATA	2	6	186099	186104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528835482
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3592	NC_021910	CGT	2	6	186158	186163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835482
3593	NC_021910	CGC	2	6	186171	186176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835482
3594	NC_021910	TGCC	2	8	186197	186204	0 %	25 %	25 %	50 %	528835482
3595	NC_021910	GAA	2	6	186282	186287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835482
3596	NC_021910	TCG	2	6	186353	186358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_021910	GGA	2	6	186387	186392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021910	GCC	2	6	186452	186457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_021910	GTT	2	6	186500	186505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021910	ACG	2	6	186640	186645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_021910	GGA	2	6	186663	186668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021910	GACC	2	8	186690	186697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_021910	TGC	2	6	186715	186720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_021910	GCC	2	6	186785	186790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_021910	TCGT	2	8	186810	186817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_021910	AAC	2	6	186907	186912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_021910	TGAGGA	2	12	186944	186955	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021910	GGA	2	6	187064	187069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021910	TTCTG	2	10	187251	187260	0 %	60 %	20 %	20 %	528835483
3610	NC_021910	GCC	2	6	187282	187287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835483
3611	NC_021910	GT	3	6	187322	187327	0 %	50 %	50 %	0 %	528835483
3612	NC_021910	GCG	2	6	187372	187377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835483
3613	NC_021910	GCCGCA	2	12	187416	187427	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528835483
3614	NC_021910	TGG	2	6	187430	187435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835483
3615	NC_021910	CGA	2	6	187452	187457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835483
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3617	NC_021910	G	6	6	187570	187575	0 %	0 %	100 %	0 %	528835483
3618	NC_021910	GCCAGC	2	12	187588	187599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528835483
3619	NC_021910	GAC	2	6	187615	187620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835483
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3621	NC_021910	TCA	2	6	187700	187705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835483
3622	NC_021910	GGCG	2	8	187866	187873	0 %	0 %	75 %	25 %	528835483
3623	NC_021910	TCGA	2	8	187889	187896	25 %	25 %	25 %	25 %	528835483
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3746	NC_021910	GC	3	6	194513	194518	0 %	0 %	50 %	50 %	528835490
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3834	NC_021910	ATT	2	6	199058	199063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3988	NC_021910	CGCT	2	8	206850	206857	0 %	25 %	25 %	50 %	528835502
3989	NC_021910	CAA	2	6	206864	206869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835502
3990	NC_021910	TCGC	2	8	206987	206994	0 %	25 %	25 %	50 %	528835502
3991	NC_021910	TGA	2	6	207004	207009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835502
3992	NC_021910	GCGA	2	8	207090	207097	25 %	0 %	50 %	25 %	528835502
3993	NC_021910	ACG	2	6	207192	207197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835502
3994	NC_021910	TCG	2	6	207246	207251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835502
3995	NC_021910	AGC	2	6	207306	207311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835502
3996	NC_021910	CGC	2	6	207360	207365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835502
3997	NC_021910	TCGTCA	2	12	207387	207398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528835502
3998	NC_021910	AACC	2	8	207405	207412	50 %	0 %	0 %	50 %	528835502
3999	NC_021910	GCC	2	6	207427	207432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835502
4000	NC_021910	CGTCGC	2	12	207478	207489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528835502

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