MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 5325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021910	GCG	2	6	75384	75389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835392
1502	NC_021910	TCG	2	6	75473	75478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835392
1503	NC_021910	CGC	2	6	75513	75518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835392
1504	NC_021910	GC	3	6	75587	75592	0 %	0 %	50 %	50 %	528835392
1505	NC_021910	GCG	2	6	75602	75607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835392
1506	NC_021910	CCG	2	6	75629	75634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835392
1507	NC_021910	CAT	2	6	75661	75666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835392
1508	NC_021910	AAAG	2	8	75740	75747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021910	CGC	2	6	75863	75868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835393
1510	NC_021910	CCG	2	6	75869	75874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835393
1511	NC_021910	GGA	2	6	75897	75902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835393
1512	NC_021910	TGGG	2	8	75904	75911	0 %	25 %	75 %	0 %	528835393
1513	NC_021910	CGA	2	6	75963	75968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1514	NC_021910	GGA	2	6	75984	75989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835393
1515	NC_021910	CTG	2	6	76009	76014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1516	NC_021910	GGCT	2	8	76017	76024	0 %	25 %	50 %	25 %	528835393
1517	NC_021910	CGT	3	9	76056	76064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1518	NC_021910	GCT	2	6	76098	76103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1519	NC_021910	GC	3	6	76105	76110	0 %	0 %	50 %	50 %	528835393
1520	NC_021910	CGA	2	6	76113	76118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1521	NC_021910	GAG	2	6	76261	76266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835393
1522	NC_021910	ATC	2	6	76267	76272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835393
1523	NC_021910	GCT	2	6	76290	76295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1524	NC_021910	CCG	2	6	76316	76321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835393
1525	NC_021910	ACG	2	6	76349	76354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1526	NC_021910	CGC	2	6	76358	76363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835393
1527	NC_021910	GCG	2	6	76370	76375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835393
1528	NC_021910	CAT	2	6	76382	76387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835393
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1530	NC_021910	CCG	2	6	76457	76462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835393
1531	NC_021910	GGC	2	6	76473	76478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835393
1532	NC_021910	CGC	2	6	76482	76487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835393
1533	NC_021910	GC	3	6	76486	76491	0 %	0 %	50 %	50 %	528835393
1534	NC_021910	GCC	2	6	76541	76546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835393
1535	NC_021910	CTG	2	6	76555	76560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1536	NC_021910	TCG	2	6	76598	76603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1537	NC_021910	GCG	2	6	76620	76625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835393
1538	NC_021910	ACG	2	6	76628	76633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835393
1539	NC_021910	ACA	2	6	76724	76729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_021910	CGC	2	6	76737	76742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_021910	CCG	2	6	76799	76804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_021910	TGC	2	6	76856	76861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021910	ATG	2	6	76898	76903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021910	CTG	2	6	76943	76948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835394
1545	NC_021910	GCG	2	6	77000	77005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835394
1546	NC_021910	GC	3	6	77008	77013	0 %	0 %	50 %	50 %	528835394
1547	NC_021910	TGC	2	6	77023	77028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835394
1548	NC_021910	CGG	2	6	77106	77111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835394
1549	NC_021910	CGCA	2	8	77166	77173	25 %	0 %	25 %	50 %	528835394
1550	NC_021910	GGA	2	6	77304	77309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835394
1551	NC_021910	GTC	2	6	77338	77343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835394
1552	NC_021910	GCG	2	6	77427	77432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835394
1553	NC_021910	GGC	2	6	77540	77545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835394
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1556	NC_021910	CGA	2	6	77755	77760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835395
1557	NC_021910	GCCG	2	8	77794	77801	0 %	0 %	50 %	50 %	528835395
1558	NC_021910	CGT	2	6	77911	77916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835395
1559	NC_021910	GATG	2	8	77920	77927	25 %	25 %	50 %	0 %	528835395
1560	NC_021910	GCG	2	6	77976	77981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835395
1561	NC_021910	GGCA	2	8	78085	78092	25 %	0 %	50 %	25 %	528835395
1562	NC_021910	CG	3	6	78114	78119	0 %	0 %	50 %	50 %	528835395
1563	NC_021910	TCG	2	6	78135	78140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835395
1564	NC_021910	GTT	2	6	78157	78162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835395
1565	NC_021910	GGC	2	6	78223	78228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835395
1566	NC_021910	CGC	2	6	78231	78236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835395
1567	NC_021910	GCC	3	9	78273	78281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835395
1568	NC_021910	GGC	2	6	78297	78302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835395
1569	NC_021910	CGAT	2	8	78330	78337	25 %	25 %	25 %	25 %	528835395
1570	NC_021910	GCCGA	2	10	78362	78371	20 %	0 %	40 %	40 %	528835395
1571	NC_021910	GC	3	6	78375	78380	0 %	0 %	50 %	50 %	528835395
1572	NC_021910	GCG	2	6	78426	78431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835395
1573	NC_021910	TCT	2	6	78469	78474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835395
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1575	NC_021910	CGGCA	2	10	78514	78523	20 %	0 %	40 %	40 %	528835395
1576	NC_021910	CCCG	2	8	78527	78534	0 %	0 %	25 %	75 %	528835395
1577	NC_021910	CTCG	2	8	78610	78617	0 %	25 %	25 %	50 %	528835395
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1583	NC_021910	ATC	2	6	78894	78899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835395
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1585	NC_021910	ACT	2	6	79014	79019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835395
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1587	NC_021910	CATG	2	8	79108	79115	25 %	25 %	25 %	25 %	528835395
1588	NC_021910	TCCT	2	8	79162	79169	0 %	50 %	0 %	50 %	528835396
1589	NC_021910	GCG	2	6	79172	79177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835396
1590	NC_021910	TCG	2	6	79180	79185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835396
1591	NC_021910	CGA	2	6	79188	79193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835396
1592	NC_021910	TCG	2	6	79238	79243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835396
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1594	NC_021910	CG	3	6	79286	79291	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
1595	NC_021910	TCG	3	9	79307	79315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835396
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1597	NC_021910	GC	3	6	79381	79386	0 %	0 %	50 %	50 %	528835396
1598	NC_021910	GGCAAG	2	12	79423	79434	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	528835396
1599	NC_021910	CCG	2	6	79581	79586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835396
1600	NC_021910	CGT	2	6	79653	79658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835396
1601	NC_021910	ACG	2	6	79664	79669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835396
1602	NC_021910	CGC	2	6	79690	79695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835396
1603	NC_021910	CAC	2	6	79731	79736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835396
1604	NC_021910	CGA	2	6	79740	79745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835396
1605	NC_021910	ACGCC	2	10	79764	79773	20 %	0 %	20 %	60 %	528835396
1606	NC_021910	GCC	2	6	79788	79793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835396
1607	NC_021910	TCG	2	6	79853	79858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835396
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1609	NC_021910	GGA	2	6	79902	79907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835396
1610	NC_021910	TG	3	6	79953	79958	0 %	50 %	50 %	0 %	528835396
1611	NC_021910	TCGT	2	8	80081	80088	0 %	50 %	25 %	25 %	528835396
1612	NC_021910	CAGGG	2	10	80116	80125	20 %	0 %	60 %	20 %	528835396
1613	NC_021910	GCC	2	6	80131	80136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835396
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1615	NC_021910	CCT	2	6	80193	80198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835396
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1617	NC_021910	GCG	2	6	80265	80270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835396
1618	NC_021910	GGA	2	6	80394	80399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835396
1619	NC_021910	GTC	2	6	80415	80420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835396
1620	NC_021910	TGGTCG	2	12	80428	80439	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528835396
1621	NC_021910	CGAA	2	8	80454	80461	50 %	0 %	25 %	25 %	528835396
1622	NC_021910	CTCAAT	2	12	80473	80484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835396
1623	NC_021910	CCG	2	6	80493	80498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835396
1624	NC_021910	CAG	2	6	80524	80529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835396
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1626	NC_021910	GAC	2	6	80659	80664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835396
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1657	NC_021910	CGA	2	6	82257	82262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835396
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1751	NC_021910	AAAC	2	8	87780	87787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1882	NC_021910	C	6	6	94822	94827	0 %	0 %	0 %	100 %	528835409
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1994	NC_021910	TCCC	2	8	100711	100718	0 %	25 %	0 %	75 %	528835413
1995	NC_021910	AG	3	6	100742	100747	50 %	0 %	50 %	0 %	528835413
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