MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 5325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021910	CAAG	2	8	50931	50938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_021910	TC	3	6	50975	50980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_021910	TCC	2	6	51121	51126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_021910	GC	3	6	51142	51147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_021910	C	7	7	51180	51186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1006	NC_021910	CGGCG	2	10	51216	51225	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1007	NC_021910	ACG	3	9	51291	51299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021910	AGC	2	6	51336	51341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021910	GGC	2	6	51358	51363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021910	TCA	2	6	51372	51377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021910	CGAT	2	8	51462	51469	25 %	25 %	25 %	25 %	528835365
1012	NC_021910	CGC	2	6	51508	51513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835365
1013	NC_021910	GCCGA	2	10	51530	51539	20 %	0 %	40 %	40 %	528835365
1014	NC_021910	GCGA	2	8	51602	51609	25 %	0 %	50 %	25 %	528835365
1015	NC_021910	TGT	2	6	51703	51708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835365
1016	NC_021910	TGT	2	6	51809	51814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835365
1017	NC_021910	GGC	2	6	51854	51859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835365
1018	NC_021910	TCG	2	6	51886	51891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835365
1019	NC_021910	AAG	2	6	51980	51985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835365
1020	NC_021910	AGCCG	2	10	52036	52045	20 %	0 %	40 %	40 %	528835365
1021	NC_021910	GTT	2	6	52139	52144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835365
1022	NC_021910	TTGC	2	8	52161	52168	0 %	50 %	25 %	25 %	528835365
1023	NC_021910	CGA	2	6	52180	52185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835365
1024	NC_021910	TGA	2	6	52201	52206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835365
1025	NC_021910	TCG	2	6	52218	52223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835365
1026	NC_021910	TCT	2	6	52281	52286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835365
1027	NC_021910	CGT	2	6	52315	52320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835365
1028	NC_021910	TCG	2	6	52344	52349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835365
1029	NC_021910	CAG	2	6	52358	52363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835365
1030	NC_021910	TGC	2	6	52372	52377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835365
1031	NC_021910	A	6	6	52415	52420	100 %	0 %	0 %	0 %	528835365
1032	NC_021910	CCG	2	6	52456	52461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835365
1033	NC_021910	C	6	6	52514	52519	0 %	0 %	0 %	100 %	528835365
1034	NC_021910	ATC	2	6	52539	52544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835365
1035	NC_021910	GGC	2	6	52571	52576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835365
1036	NC_021910	CGG	2	6	52588	52593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835365
1037	NC_021910	CTG	2	6	52613	52618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835365
1038	NC_021910	T	7	7	52623	52629	0 %	100 %	0 %	0 %	528835365
1039	NC_021910	GAC	2	6	52716	52721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_021910	GGC	2	6	52728	52733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021910	GGC	2	6	52750	52755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835366
1042	NC_021910	GGA	2	6	52847	52852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835366
1043	NC_021910	CCG	3	9	52942	52950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835366
1044	NC_021910	GCC	2	6	52951	52956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835366
1045	NC_021910	AGA	2	6	52978	52983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835366
1046	NC_021910	TCC	2	6	53098	53103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835366
1047	NC_021910	AAC	2	6	53116	53121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835366
1048	NC_021910	GCGA	2	8	53180	53187	25 %	0 %	50 %	25 %	528835366
1049	NC_021910	GA	3	6	53203	53208	50 %	0 %	50 %	0 %	528835366
1050	NC_021910	TCT	2	6	53228	53233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835366
1051	NC_021910	GGC	2	6	53349	53354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835367
1052	NC_021910	ATC	2	6	53458	53463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835367
1053	NC_021910	CGG	2	6	53477	53482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835367
1054	NC_021910	CGT	2	6	53495	53500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835367
1055	NC_021910	CGC	2	6	53547	53552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835367
1056	NC_021910	AGC	2	6	53668	53673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835367
1057	NC_021910	CGC	2	6	53844	53849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835367
1058	NC_021910	GTC	2	6	53881	53886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835367
1059	NC_021910	CGA	2	6	53948	53953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835367
1060	NC_021910	GTA	2	6	54072	54077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835367
1061	NC_021910	TCG	2	6	54109	54114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835367
1062	NC_021910	CGA	2	6	54131	54136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835367
1063	NC_021910	CGT	2	6	54230	54235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835367
1064	NC_021910	CGG	2	6	54332	54337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835367
1065	NC_021910	ATC	2	6	54342	54347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835367
1066	NC_021910	GCCG	2	8	54405	54412	0 %	0 %	50 %	50 %	528835367
1067	NC_021910	CGTC	2	8	54455	54462	0 %	25 %	25 %	50 %	528835367
1068	NC_021910	GGC	2	6	54470	54475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835367
1069	NC_021910	GGC	2	6	54533	54538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835367
1070	NC_021910	GCC	2	6	54923	54928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835368
1071	NC_021910	CTC	2	6	55016	55021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835368
1072	NC_021910	GC	3	6	55030	55035	0 %	0 %	50 %	50 %	528835368
1073	NC_021910	CAA	2	6	55102	55107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835368
1074	NC_021910	GCG	2	6	55191	55196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835368
1075	NC_021910	GAG	2	6	55290	55295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835368
1076	NC_021910	AGGA	2	8	55397	55404	50 %	0 %	50 %	0 %	528835368
1077	NC_021910	GCG	2	6	55468	55473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835368
1078	NC_021910	CGG	2	6	55480	55485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835368
1079	NC_021910	CGC	2	6	55508	55513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835368
1080	NC_021910	GC	3	6	55522	55527	0 %	0 %	50 %	50 %	528835368
1081	NC_021910	GAC	2	6	55565	55570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835368
1082	NC_021910	CGA	2	6	55576	55581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835368
1083	NC_021910	TCG	2	6	55638	55643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835368
1084	NC_021910	GAG	2	6	55748	55753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835368
1085	NC_021910	TGC	2	6	55770	55775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835368
1086	NC_021910	CGG	2	6	55816	55821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835368
1087	NC_021910	GC	3	6	55859	55864	0 %	0 %	50 %	50 %	528835368
1088	NC_021910	CAT	2	6	55894	55899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835368
1089	NC_021910	CGG	2	6	55909	55914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835368
1090	NC_021910	TCC	2	6	56075	56080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_021910	GGA	2	6	56108	56113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021910	CAA	2	6	56195	56200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021910	TAG	2	6	56244	56249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021910	AGG	2	6	56300	56305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021910	CGA	2	6	56332	56337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835369
1096	NC_021910	CAC	2	6	56399	56404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835369
1097	NC_021910	TCG	2	6	56427	56432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835369
1098	NC_021910	CGG	2	6	56502	56507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835369
1099	NC_021910	GGT	2	6	56557	56562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835369
1100	NC_021910	TC	3	6	56609	56614	0 %	50 %	0 %	50 %	528835369
1101	NC_021910	GGC	2	6	56635	56640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835369
1102	NC_021910	ACG	2	6	56702	56707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835369
1103	NC_021910	AGG	2	6	56709	56714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835369
1104	NC_021910	CCG	2	6	56722	56727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835369
1105	NC_021910	GGA	2	6	56731	56736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835369
1106	NC_021910	TGG	2	6	56748	56753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835369
1107	NC_021910	CGA	2	6	56807	56812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835369
1108	NC_021910	CGA	2	6	56860	56865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835369
1109	NC_021910	GCCG	2	8	56866	56873	0 %	0 %	50 %	50 %	528835369
1110	NC_021910	GTC	2	6	56948	56953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835369
1111	NC_021910	GCT	2	6	57011	57016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835369
1112	NC_021910	AAG	2	6	57045	57050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835369
1113	NC_021910	GAGG	2	8	57070	57077	25 %	0 %	75 %	0 %	528835369
1114	NC_021910	CTG	2	6	57111	57116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835370
1115	NC_021910	CG	3	6	57153	57158	0 %	0 %	50 %	50 %	528835370
1116	NC_021910	GTC	2	6	57195	57200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835370
1117	NC_021910	GTT	2	6	57203	57208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835370
1118	NC_021910	TCG	2	6	57304	57309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835370
1119	NC_021910	GGAA	2	8	57356	57363	50 %	0 %	50 %	0 %	528835370
1120	NC_021910	GGC	2	6	57364	57369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835370
1121	NC_021910	GGC	2	6	57375	57380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835370
1122	NC_021910	TCA	2	6	57431	57436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835370
1123	NC_021910	ATC	2	6	57477	57482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835370
1124	NC_021910	AGC	2	6	57484	57489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835370
1125	NC_021910	GGCA	2	8	57503	57510	25 %	0 %	50 %	25 %	528835370
1126	NC_021910	CAA	2	6	57531	57536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835370
1127	NC_021910	GCTTCT	2	12	57572	57583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	528835370
1128	NC_021910	CAC	2	6	57607	57612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835370
1129	NC_021910	TTC	2	6	57727	57732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835370
1130	NC_021910	CGC	2	6	57758	57763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835370
1131	NC_021910	TCGGG	2	10	57773	57782	0 %	20 %	60 %	20 %	528835370
1132	NC_021910	TCG	2	6	57885	57890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835371
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1135	NC_021910	CTG	2	6	58109	58114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835371
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1144	NC_021910	GCT	2	6	58495	58500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835371
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1153	NC_021910	CCT	2	6	58818	58823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835372
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1162	NC_021910	TCA	2	6	59129	59134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835372
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1164	NC_021910	GC	3	6	59179	59184	0 %	0 %	50 %	50 %	528835372
1165	NC_021910	GTCC	2	8	59298	59305	0 %	25 %	25 %	50 %	528835372
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1211	NC_021910	TGG	2	6	61785	61790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1214	NC_021910	GGA	2	6	61927	61932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1223	NC_021910	CGTT	2	8	62414	62421	0 %	50 %	25 %	25 %	528835375
1224	NC_021910	CGGGC	2	10	62456	62465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1225	NC_021910	TGCG	2	8	62494	62501	0 %	25 %	50 %	25 %	528835376
1226	NC_021910	CAA	2	6	62503	62508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835376
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1230	NC_021910	TCC	2	6	62695	62700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1231	NC_021910	GAG	2	6	62703	62708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1232	NC_021910	GAT	2	6	62812	62817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835377
1233	NC_021910	CGA	2	6	62896	62901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835377
1234	NC_021910	GGAG	2	8	62926	62933	25 %	0 %	75 %	0 %	528835377
1235	NC_021910	AAAGC	2	10	63014	63023	60 %	0 %	20 %	20 %	528835377
1236	NC_021910	ATGG	2	8	63098	63105	25 %	25 %	50 %	0 %	528835377
1237	NC_021910	GA	3	6	63122	63127	50 %	0 %	50 %	0 %	528835377
1238	NC_021910	AAG	2	6	63128	63133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835377
1239	NC_021910	TGAA	2	8	63201	63208	50 %	25 %	25 %	0 %	528835377
1240	NC_021910	TGA	2	6	63238	63243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835377
1241	NC_021910	TTCA	2	8	63347	63354	25 %	50 %	0 %	25 %	528835377
1242	NC_021910	C	6	6	63398	63403	0 %	0 %	0 %	100 %	528835377
1243	NC_021910	GAT	2	6	63449	63454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835377
1244	NC_021910	TGG	2	6	63523	63528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835377
1245	NC_021910	GCG	2	6	63540	63545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835377
1246	NC_021910	GGCTTT	2	12	63550	63561	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	528835377
1247	NC_021910	CTTG	2	8	63746	63753	0 %	50 %	25 %	25 %	528835378
1248	NC_021910	GGC	2	6	63765	63770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835378
1249	NC_021910	TGC	2	6	63781	63786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835378
1250	NC_021910	ATG	2	6	63798	63803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835378
1251	NC_021910	GC	3	6	63850	63855	0 %	0 %	50 %	50 %	528835378
1252	NC_021910	CGT	2	6	63917	63922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835378
1253	NC_021910	ATC	2	6	63948	63953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835378
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1256	NC_021910	GCG	2	6	64006	64011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835378
1257	NC_021910	TGC	2	6	64073	64078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835378
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1260	NC_021910	ACC	2	6	64296	64301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835378
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1265	NC_021910	CCT	2	6	64492	64497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835379
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1282	NC_021910	CGG	2	6	65384	65389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835380
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1342	NC_021910	CCGA	2	8	68844	68851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1343	NC_021910	ATG	2	6	68869	68874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1344	NC_021910	GAG	2	6	68954	68959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1364	NC_021910	CGG	2	6	69667	69672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835385
1365	NC_021910	GGC	2	6	69696	69701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1366	NC_021910	CCGGC	2	10	69719	69728	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1367	NC_021910	CGG	2	6	69869	69874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835386
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1371	NC_021910	AGC	2	6	70126	70131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835386
1372	NC_021910	CGA	2	6	70175	70180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835386
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1374	NC_021910	TCC	2	6	70375	70380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835386
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1376	NC_021910	AGA	2	6	70438	70443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835386
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1378	NC_021910	GCC	2	6	70482	70487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835386
1379	NC_021910	AGCG	2	8	70498	70505	25 %	0 %	50 %	25 %	528835386
1380	NC_021910	GC	3	6	70511	70516	0 %	0 %	50 %	50 %	528835386
1381	NC_021910	CGC	2	6	70593	70598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835386
1382	NC_021910	GCC	2	6	70635	70640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835386
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1385	NC_021910	GCG	2	6	70733	70738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835386
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1403	NC_021910	GC	3	6	71259	71264	0 %	0 %	50 %	50 %	528835387
1404	NC_021910	CGC	2	6	71268	71273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835387
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1413	NC_021910	CCGGC	2	10	71730	71739	0 %	0 %	40 %	60 %	528835388
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