MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021909	TGGAAC	2	12	168968	168979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3502	NC_021909	CCG	2	6	169001	169006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_021909	AG	3	6	169010	169015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021909	GCC	2	6	169054	169059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834282
3505	NC_021909	TCG	2	6	169146	169151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834282
3506	NC_021909	GCCG	2	8	169202	169209	0 %	0 %	50 %	50 %	528834282
3507	NC_021909	ACC	2	6	169229	169234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834282
3508	NC_021909	TCA	2	6	169272	169277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834282
3509	NC_021909	TTG	2	6	169296	169301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834282
3510	NC_021909	T	6	6	169324	169329	0 %	100 %	0 %	0 %	528834282
3511	NC_021909	CTC	2	6	169342	169347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_021909	AGGGC	2	10	169505	169514	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3513	NC_021909	TGG	2	6	169649	169654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021909	CGG	2	6	169663	169668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021909	CGG	2	6	169687	169692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_021909	ATG	2	6	169700	169705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834283
3517	NC_021909	ACG	2	6	169776	169781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834283
3518	NC_021909	TGC	2	6	169890	169895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_021909	GC	3	6	169894	169899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_021909	TCC	2	6	169912	169917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_021909	GAA	2	6	169934	169939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021909	GTGC	2	8	169982	169989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_021909	AAC	2	6	169993	169998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021909	CTC	2	6	170054	170059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_021909	GGC	2	6	170063	170068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_021909	GCG	2	6	170173	170178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_021909	CGC	2	6	170336	170341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_021909	CGGG	2	8	170361	170368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3529	NC_021909	GCA	2	6	170531	170536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_021909	GTT	2	6	170607	170612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021909	TGG	2	6	170712	170717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021909	GTT	2	6	170787	170792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021909	TTG	2	6	170797	170802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021909	CTG	2	6	170908	170913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021909	TGG	2	6	170945	170950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021909	GCTGT	2	10	171006	171015	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3537	NC_021909	GCC	2	6	171024	171029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_021909	CAG	2	6	171086	171091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_021909	GCAG	2	8	171279	171286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_021909	GCAA	2	8	171289	171296	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_021909	GTC	2	6	171304	171309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_021909	CGAA	2	8	171362	171369	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_021909	GATT	2	8	171378	171385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021909	AGC	2	6	171428	171433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021909	GAT	2	6	171519	171524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834284
3546	NC_021909	GTC	2	6	171525	171530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834284
3547	NC_021909	TCT	2	6	171588	171593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834284
3548	NC_021909	CAA	2	6	171600	171605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834284
3549	NC_021909	CGAAG	2	10	171804	171813	40 %	0 %	40 %	20 %	528834284
3550	NC_021909	TTG	2	6	171848	171853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834284
3551	NC_021909	AC	3	6	171905	171910	50 %	0 %	0 %	50 %	528834284
3552	NC_021909	TAG	2	6	171938	171943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834284
3553	NC_021909	TCC	2	6	171983	171988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834284
3554	NC_021909	CGACG	2	10	172018	172027	20 %	0 %	40 %	40 %	528834284
3555	NC_021909	CGAT	2	8	172108	172115	25 %	25 %	25 %	25 %	528834284
3556	NC_021909	GAT	2	6	172146	172151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834284
3557	NC_021909	GGC	2	6	172153	172158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834284
3558	NC_021909	T	6	6	172174	172179	0 %	100 %	0 %	0 %	528834284
3559	NC_021909	CGG	2	6	172185	172190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834284
3560	NC_021909	CGGT	2	8	172220	172227	0 %	25 %	50 %	25 %	528834284
3561	NC_021909	ATC	2	6	172231	172236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834284
3562	NC_021909	ATC	2	6	172259	172264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834284
3563	NC_021909	AGA	2	6	172304	172309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834284
3564	NC_021909	TGCGT	2	10	172314	172323	0 %	40 %	40 %	20 %	528834284
3565	NC_021909	A	6	6	172325	172330	100 %	0 %	0 %	0 %	528834284
3566	NC_021909	GCA	2	6	172421	172426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834284
3567	NC_021909	GCT	2	6	172612	172617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834284
3568	NC_021909	AT	3	6	172635	172640	50 %	50 %	0 %	0 %	528834284
3569	NC_021909	GAA	2	6	172740	172745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834285
3570	NC_021909	GGT	2	6	172773	172778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834285
3571	NC_021909	TCG	2	6	172781	172786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834285
3572	NC_021909	AAT	2	6	172876	172881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834285
3573	NC_021909	GA	3	6	172908	172913	50 %	0 %	50 %	0 %	528834285
3574	NC_021909	CCTCA	2	10	172953	172962	20 %	20 %	0 %	60 %	528834285
3575	NC_021909	CGA	2	6	173021	173026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834285
3576	NC_021909	TTC	2	6	173041	173046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834285
3577	NC_021909	GAA	2	6	173127	173132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834285
3578	NC_021909	AAG	2	6	173158	173163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834285
3579	NC_021909	GAA	2	6	173309	173314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834285
3580	NC_021909	CT	3	6	173381	173386	0 %	50 %	0 %	50 %	528834285
3581	NC_021909	CTT	2	6	173415	173420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834285
3582	NC_021909	TGGA	2	8	173593	173600	25 %	25 %	50 %	0 %	528834285
3583	NC_021909	GCGAGA	2	12	173651	173662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	528834285
3584	NC_021909	GA	3	6	173763	173768	50 %	0 %	50 %	0 %	528834285
3585	NC_021909	ATC	2	6	173827	173832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834285
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3587	NC_021909	CGG	2	6	173946	173951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834286
3588	NC_021909	AAG	2	6	174003	174008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834286
3589	NC_021909	CTT	2	6	174088	174093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834286
3590	NC_021909	CCG	2	6	174138	174143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834286
3591	NC_021909	CAA	2	6	174170	174175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834286
3592	NC_021909	TTC	2	6	174182	174187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834286
3593	NC_021909	CCT	2	6	174263	174268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834286
3594	NC_021909	CGT	2	6	174271	174276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834286
3595	NC_021909	TTGT	2	8	174278	174285	0 %	75 %	25 %	0 %	528834286
3596	NC_021909	CA	3	6	174293	174298	50 %	0 %	0 %	50 %	528834286
3597	NC_021909	TCG	2	6	174510	174515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834286
3598	NC_021909	AGTG	2	8	174560	174567	25 %	25 %	50 %	0 %	528834286
3599	NC_021909	ATCGAA	2	12	174584	174595	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	528834286
3600	NC_021909	CAA	2	6	174640	174645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834286
3601	NC_021909	AAG	2	6	174708	174713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834286
3602	NC_021909	GATC	2	8	174745	174752	25 %	25 %	25 %	25 %	528834286
3603	NC_021909	AGA	2	6	174756	174761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834286
3604	NC_021909	TTG	2	6	174796	174801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834287
3605	NC_021909	CCG	2	6	174828	174833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834287
3606	NC_021909	TCGT	2	8	174902	174909	0 %	50 %	25 %	25 %	528834287
3607	NC_021909	CGG	2	6	174926	174931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834287
3608	NC_021909	ACA	2	6	174955	174960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834287
3609	NC_021909	GGA	2	6	175065	175070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834287
3610	NC_021909	TCG	2	6	175126	175131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834287
3611	NC_021909	TG	3	6	175214	175219	0 %	50 %	50 %	0 %	528834287
3612	NC_021909	ATG	2	6	175288	175293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834287
3613	NC_021909	GCG	2	6	175301	175306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834287
3614	NC_021909	TCAAAA	2	12	175374	175385	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	528834287
3615	NC_021909	CGA	3	9	175499	175507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834287
3616	NC_021909	TCC	2	6	175539	175544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834287
3617	NC_021909	CGAGG	2	10	175650	175659	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3618	NC_021909	ATGA	2	8	175662	175669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021909	GCG	2	6	175679	175684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_021909	CGAT	2	8	175737	175744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_021909	GCG	2	6	175798	175803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834288
3622	NC_021909	GAC	2	6	175808	175813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834288
3623	NC_021909	GCA	2	6	175843	175848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834288
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3625	NC_021909	ACC	2	6	175993	175998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834288
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3751	NC_021909	CCA	2	6	183251	183256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3754	NC_021909	TGC	2	6	183426	183431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834293
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