MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021909	GAC	2	6	120273	120278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834231
2502	NC_021909	CGT	2	6	120314	120319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834231
2503	NC_021909	GC	3	6	120387	120392	0 %	0 %	50 %	50 %	528834231
2504	NC_021909	AAGGT	2	10	120457	120466	40 %	20 %	40 %	0 %	528834231
2505	NC_021909	CAA	2	6	120704	120709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834231
2506	NC_021909	TCG	2	6	120744	120749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834231
2507	NC_021909	CGG	2	6	120764	120769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834231
2508	NC_021909	CTT	2	6	120773	120778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834231
2509	NC_021909	TGA	2	6	120816	120821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834231
2510	NC_021909	GCA	2	6	120977	120982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2511	NC_021909	CGA	3	9	121059	121067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2512	NC_021909	CGG	2	6	121072	121077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2513	NC_021909	GGC	2	6	121186	121191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2514	NC_021909	GCC	2	6	121208	121213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834232
2515	NC_021909	TCG	2	6	121284	121289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2516	NC_021909	CTG	2	6	121310	121315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2517	NC_021909	CGG	2	6	121348	121353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2518	NC_021909	CGA	2	6	121389	121394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2519	NC_021909	GCT	2	6	121415	121420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2520	NC_021909	CGG	2	6	121480	121485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2521	NC_021909	GCA	2	6	121567	121572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2522	NC_021909	CTC	2	6	121621	121626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834232
2523	NC_021909	CAG	2	6	121693	121698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2524	NC_021909	ATCC	2	8	121760	121767	25 %	25 %	0 %	50 %	528834232
2525	NC_021909	GTC	2	6	121853	121858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2526	NC_021909	GC	3	6	121879	121884	0 %	0 %	50 %	50 %	528834232
2527	NC_021909	CGT	2	6	121966	121971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2528	NC_021909	TGG	2	6	121992	121997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834232
2529	NC_021909	CGA	2	6	122011	122016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2530	NC_021909	TCG	2	6	122022	122027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2531	NC_021909	CGCC	2	8	122041	122048	0 %	0 %	25 %	75 %	528834232
2532	NC_021909	CGC	2	6	122077	122082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834232
2533	NC_021909	AGC	2	6	122089	122094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2534	NC_021909	TGG	2	6	122136	122141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834232
2535	NC_021909	CCT	2	6	122182	122187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834232
2536	NC_021909	GCA	2	6	122210	122215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2537	NC_021909	GC	3	6	122320	122325	0 %	0 %	50 %	50 %	528834232
2538	NC_021909	ACGG	2	8	122425	122432	25 %	0 %	50 %	25 %	528834232
2539	NC_021909	GAC	2	6	122450	122455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2540	NC_021909	GCAC	2	8	122456	122463	25 %	0 %	25 %	50 %	528834232
2541	NC_021909	AGG	2	6	122522	122527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834232
2542	NC_021909	GCG	2	6	122636	122641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2543	NC_021909	TCG	2	6	122643	122648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2544	NC_021909	TGA	2	6	122791	122796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834232
2545	NC_021909	GGA	2	6	122830	122835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834232
2546	NC_021909	CG	3	6	122920	122925	0 %	0 %	50 %	50 %	528834232
2547	NC_021909	GCA	2	6	122927	122932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2548	NC_021909	CGTG	2	8	122968	122975	0 %	25 %	50 %	25 %	528834232
2549	NC_021909	CGA	2	6	122979	122984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2550	NC_021909	TTC	2	6	122995	123000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834232
2551	NC_021909	TCG	2	6	123042	123047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2552	NC_021909	CGA	2	6	123079	123084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2553	NC_021909	GATC	2	8	123132	123139	25 %	25 %	25 %	25 %	528834232
2554	NC_021909	CGG	2	6	123154	123159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2555	NC_021909	GCC	2	6	123283	123288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834232
2556	NC_021909	TTG	2	6	123300	123305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834232
2557	NC_021909	GGC	2	6	123458	123463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2558	NC_021909	GC	3	6	123462	123467	0 %	0 %	50 %	50 %	528834232
2559	NC_021909	TGC	2	6	123468	123473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2560	NC_021909	GCCG	2	8	123505	123512	0 %	0 %	50 %	50 %	528834232
2561	NC_021909	GAA	2	6	123547	123552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834232
2562	NC_021909	TCC	2	6	123558	123563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834232
2563	NC_021909	TGCC	2	8	123625	123632	0 %	25 %	25 %	50 %	528834232
2564	NC_021909	TGC	2	6	123684	123689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2565	NC_021909	GCG	2	6	123711	123716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2566	NC_021909	GTG	2	6	123746	123751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834232
2567	NC_021909	CGG	2	6	123754	123759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834232
2568	NC_021909	TGA	2	6	123762	123767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834232
2569	NC_021909	TCA	2	6	123777	123782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834232
2570	NC_021909	TCG	2	6	123813	123818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834232
2571	NC_021909	GCC	2	6	123849	123854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834232
2572	NC_021909	CAT	2	6	123967	123972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834232
2573	NC_021909	TGA	2	6	124002	124007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834233
2574	NC_021909	CTAT	2	8	124104	124111	25 %	50 %	0 %	25 %	528834233
2575	NC_021909	GC	4	8	124125	124132	0 %	0 %	50 %	50 %	528834233
2576	NC_021909	CTGC	2	8	124142	124149	0 %	25 %	25 %	50 %	528834233
2577	NC_021909	GCCT	2	8	124157	124164	0 %	25 %	25 %	50 %	528834233
2578	NC_021909	CAAA	2	8	124268	124275	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2579	NC_021909	C	6	6	124473	124478	0 %	0 %	0 %	100 %	528834234
2580	NC_021909	TGA	2	6	124482	124487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834234
2581	NC_021909	ATC	2	6	124541	124546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834234
2582	NC_021909	CG	3	6	124558	124563	0 %	0 %	50 %	50 %	528834234
2583	NC_021909	GTG	2	6	124574	124579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834234
2584	NC_021909	GAC	2	6	124914	124919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834234
2585	NC_021909	TGA	2	6	124992	124997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834234
2586	NC_021909	CGT	2	6	124998	125003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834234
2587	NC_021909	CGA	2	6	125097	125102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834234
2588	NC_021909	GTC	2	6	125171	125176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834234
2589	NC_021909	CGC	2	6	125181	125186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834234
2590	NC_021909	CGT	2	6	125205	125210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834234
2591	NC_021909	TCAT	2	8	125272	125279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2592	NC_021909	AAC	2	6	125338	125343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834235
2593	NC_021909	CCA	2	6	125355	125360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834235
2594	NC_021909	CGGC	2	8	125365	125372	0 %	0 %	50 %	50 %	528834235
2595	NC_021909	CGG	2	6	125405	125410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834235
2596	NC_021909	CTT	2	6	125415	125420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834235
2597	NC_021909	CA	3	6	125542	125547	50 %	0 %	0 %	50 %	528834235
2598	NC_021909	GGC	2	6	125567	125572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834235
2599	NC_021909	CG	4	8	125699	125706	0 %	0 %	50 %	50 %	528834235
2600	NC_021909	GC	3	6	125761	125766	0 %	0 %	50 %	50 %	528834235
2601	NC_021909	TGC	2	6	125840	125845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834235
2602	NC_021909	GGC	2	6	125933	125938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834235
2603	NC_021909	TGA	2	6	125956	125961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834235
2604	NC_021909	A	9	9	126069	126077	100 %	0 %	0 %	0 %	528834236
2605	NC_021909	AGCC	2	8	126127	126134	25 %	0 %	25 %	50 %	528834236
2606	NC_021909	CGG	2	6	126144	126149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834236
2607	NC_021909	GTCA	2	8	126199	126206	25 %	25 %	25 %	25 %	528834236
2608	NC_021909	CGT	2	6	126244	126249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834236
2609	NC_021909	CAA	2	6	126260	126265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834236
2610	NC_021909	CAG	2	6	126284	126289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834236
2611	NC_021909	GC	3	6	126305	126310	0 %	0 %	50 %	50 %	528834236
2612	NC_021909	ACG	2	6	126357	126362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834236
2613	NC_021909	GCCGT	2	10	126450	126459	0 %	20 %	40 %	40 %	528834236
2614	NC_021909	AGA	2	6	126523	126528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834236
2615	NC_021909	GCT	2	6	126541	126546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834236
2616	NC_021909	CG	3	6	126564	126569	0 %	0 %	50 %	50 %	528834236
2617	NC_021909	CGC	2	6	126615	126620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834236
2618	NC_021909	CGA	3	9	126702	126710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834236
2619	NC_021909	TCA	3	9	126711	126719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834236
2620	NC_021909	GA	3	6	126780	126785	50 %	0 %	50 %	0 %	528834236
2621	NC_021909	CGGA	2	8	126794	126801	25 %	0 %	50 %	25 %	528834236
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2992	NC_021909	ATGCCA	2	12	145743	145754	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528834257
2993	NC_021909	GA	4	8	145757	145764	50 %	0 %	50 %	0 %	528834257
2994	NC_021909	CAGC	2	8	145789	145796	25 %	0 %	25 %	50 %	528834257
2995	NC_021909	GCC	2	6	145810	145815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834257
2996	NC_021909	AGATGG	2	12	145833	145844	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	528834257
2997	NC_021909	CGAC	2	8	145847	145854	25 %	0 %	25 %	50 %	528834257
2998	NC_021909	ACC	2	6	145899	145904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834257
2999	NC_021909	CGC	2	6	145987	145992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834257
3000	NC_021909	AGGC	2	8	146000	146007	25 %	0 %	50 %	25 %	528834257

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