MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_021909	A	7	7	96385	96391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_021909	GCT	2	6	96452	96457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_021909	GCG	2	6	96458	96463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_021909	GAG	2	6	96471	96476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_021909	GCC	2	6	96479	96484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_021909	TGC	2	6	96562	96567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_021909	GCCT	2	8	96593	96600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_021909	CCG	2	6	96627	96632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_021909	TCC	2	6	96635	96640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_021909	TCC	2	6	96659	96664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_021909	CGC	2	6	96720	96725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2013	NC_021909	CG	3	6	96729	96734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2014	NC_021909	CGC	2	6	96752	96757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2015	NC_021909	CCT	2	6	96870	96875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_021909	GGA	2	6	96894	96899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_021909	AGATC	2	10	96948	96957	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2054	NC_021909	CAG	2	6	98696	98701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2130	NC_021909	CTG	2	6	102769	102774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834211
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2248	NC_021909	TCT	2	6	107816	107821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834214
2249	NC_021909	TCCG	2	8	107874	107881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2250	NC_021909	GGC	2	6	107890	107895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_021909	GCC	2	6	108013	108018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2252	NC_021909	TCG	3	9	108059	108067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834215
2253	NC_021909	TCG	2	6	108077	108082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834215
2254	NC_021909	CGA	2	6	108108	108113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834215
2255	NC_021909	GCGA	2	8	108170	108177	25 %	0 %	50 %	25 %	528834215
2256	NC_021909	CTC	2	6	108234	108239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2257	NC_021909	GAAGCG	2	12	108274	108285	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2258	NC_021909	AG	3	6	108358	108363	50 %	0 %	50 %	0 %	528834216
2259	NC_021909	GCT	2	6	108373	108378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834216
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2275	NC_021909	ATCG	2	8	108909	108916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2277	NC_021909	CTT	2	6	109012	109017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2359	NC_021909	CCAT	2	8	113305	113312	25 %	25 %	0 %	50 %	528834222
2360	NC_021909	GCC	2	6	113352	113357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834222
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2362	NC_021909	GTC	2	6	113490	113495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834222
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2365	NC_021909	GCA	2	6	113624	113629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834222
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2367	NC_021909	CGC	2	6	113682	113687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834222
2368	NC_021909	GCG	2	6	113750	113755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834222
2369	NC_021909	GCCG	2	8	113906	113913	0 %	0 %	50 %	50 %	528834223
2370	NC_021909	CAG	2	6	113915	113920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834223
2371	NC_021909	GAA	2	6	113954	113959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834223
2372	NC_021909	CGGC	2	8	113994	114001	0 %	0 %	50 %	50 %	528834223
2373	NC_021909	ATCG	2	8	114062	114069	25 %	25 %	25 %	25 %	528834223
2374	NC_021909	CGGGAT	2	12	114104	114115	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528834223
2375	NC_021909	CGG	2	6	114140	114145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834223
2376	NC_021909	GCC	2	6	114215	114220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834223
2377	NC_021909	CAT	2	6	114238	114243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834223
2378	NC_021909	TGA	2	6	114292	114297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834223
2379	NC_021909	AAT	2	6	114304	114309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834223
2380	NC_021909	CCG	2	6	114379	114384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834223
2381	NC_021909	CCA	2	6	114445	114450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834223
2382	NC_021909	CGC	2	6	114485	114490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834223
2383	NC_021909	CGC	2	6	114511	114516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834223
2384	NC_021909	GC	3	6	114530	114535	0 %	0 %	50 %	50 %	528834223
2385	NC_021909	GC	3	6	114593	114598	0 %	0 %	50 %	50 %	528834223
2386	NC_021909	TCC	2	6	114621	114626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834223
2387	NC_021909	CTG	2	6	114701	114706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834223
2388	NC_021909	GAAGA	2	10	114713	114722	60 %	0 %	40 %	0 %	528834223
2389	NC_021909	ATC	2	6	114767	114772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834223
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2391	NC_021909	ATAG	2	8	114836	114843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2392	NC_021909	GCC	2	6	114911	114916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2393	NC_021909	CGGC	2	8	114945	114952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2394	NC_021909	TGAC	2	8	115039	115046	25 %	25 %	25 %	25 %	528834224
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2397	NC_021909	CG	3	6	115152	115157	0 %	0 %	50 %	50 %	528834224
2398	NC_021909	CAAA	2	8	115166	115173	75 %	0 %	0 %	25 %	528834224
2399	NC_021909	AGC	2	6	115213	115218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834224
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2404	NC_021909	CTC	2	6	115530	115535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834224
2405	NC_021909	TGC	2	6	115559	115564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834224
2406	NC_021909	ATG	2	6	115585	115590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834224
2407	NC_021909	TCT	2	6	115630	115635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834224
2408	NC_021909	GAA	3	9	115734	115742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2409	NC_021909	GAA	2	6	115759	115764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2410	NC_021909	TCGA	2	8	115823	115830	25 %	25 %	25 %	25 %	528834225
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2423	NC_021909	TCA	2	6	116439	116444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834225
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2449	NC_021909	TA	3	6	117617	117622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2450	NC_021909	CGA	2	6	117641	117646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2451	NC_021909	AT	4	8	117693	117700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2452	NC_021909	AG	3	6	117718	117723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2453	NC_021909	CCG	2	6	117772	117777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834227
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2456	NC_021909	A	6	6	118073	118078	100 %	0 %	0 %	0 %	528834228
2457	NC_021909	TGA	2	6	118124	118129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834228
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2459	NC_021909	GCTC	3	12	118215	118226	0 %	25 %	25 %	50 %	528834228
2460	NC_021909	GGGA	2	8	118267	118274	25 %	0 %	75 %	0 %	528834229
2461	NC_021909	TGGC	2	8	118327	118334	0 %	25 %	50 %	25 %	528834229
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2463	NC_021909	CGGA	2	8	118450	118457	25 %	0 %	50 %	25 %	528834229
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2476	NC_021909	GCT	2	6	118832	118837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2477	NC_021909	TCCA	2	8	118900	118907	25 %	25 %	0 %	50 %	528834230
2478	NC_021909	TCG	2	6	118920	118925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834230
2479	NC_021909	GTCGAT	2	12	118976	118987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	528834230
2480	NC_021909	GAC	2	6	119024	119029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834230
2481	NC_021909	GC	3	6	119042	119047	0 %	0 %	50 %	50 %	528834230
2482	NC_021909	CACC	2	8	119094	119101	25 %	0 %	0 %	75 %	528834230
2483	NC_021909	CGACC	2	10	119149	119158	20 %	0 %	20 %	60 %	528834230
2484	NC_021909	ATC	3	9	119177	119185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834230
2485	NC_021909	TTG	2	6	119217	119222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834230
2486	NC_021909	GGA	2	6	119359	119364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834230
2487	NC_021909	GCA	2	6	119393	119398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2488	NC_021909	CGC	2	6	119401	119406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2489	NC_021909	TCG	2	6	119436	119441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2490	NC_021909	AG	3	6	119463	119468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_021909	ATCCA	2	10	119490	119499	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2492	NC_021909	TAC	2	6	119761	119766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2493	NC_021909	CGC	2	6	119768	119773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2494	NC_021909	GCA	2	6	119787	119792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2495	NC_021909	TC	3	6	119851	119856	0 %	50 %	0 %	50 %	528834231
2496	NC_021909	GAC	2	6	119858	119863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834231
2497	NC_021909	GGCT	2	8	119904	119911	0 %	25 %	50 %	25 %	528834231
2498	NC_021909	AGG	2	6	120058	120063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834231
2499	NC_021909	GACGGC	2	12	120188	120199	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528834231
2500	NC_021909	GAA	2	6	120213	120218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834231

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