MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021909	AT	3	6	48317	48322	50 %	50 %	0 %	0 %	528834158
1002	NC_021909	AGCC	2	8	48328	48335	25 %	0 %	25 %	50 %	528834158
1003	NC_021909	CAG	2	6	48427	48432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834158
1004	NC_021909	AC	3	6	48442	48447	50 %	0 %	0 %	50 %	528834158
1005	NC_021909	GTAT	2	8	48502	48509	25 %	50 %	25 %	0 %	528834158
1006	NC_021909	TCGG	2	8	48556	48563	0 %	25 %	50 %	25 %	528834158
1007	NC_021909	CAG	2	6	48571	48576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834158
1008	NC_021909	A	6	6	48600	48605	100 %	0 %	0 %	0 %	528834158
1009	NC_021909	AGC	2	6	48608	48613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834158
1010	NC_021909	GAAA	2	8	48749	48756	75 %	0 %	25 %	0 %	528834158
1011	NC_021909	TCG	2	6	48832	48837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834158
1012	NC_021909	GA	3	6	48864	48869	50 %	0 %	50 %	0 %	528834158
1013	NC_021909	TC	3	6	48881	48886	0 %	50 %	0 %	50 %	528834158
1014	NC_021909	TAC	2	6	48951	48956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834158
1015	NC_021909	CGT	2	6	48958	48963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834158
1016	NC_021909	ATC	2	6	49045	49050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834158
1017	NC_021909	GCCA	2	8	49067	49074	25 %	0 %	25 %	50 %	528834158
1018	NC_021909	GAC	2	6	49233	49238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834158
1019	NC_021909	CACC	2	8	49242	49249	25 %	0 %	0 %	75 %	528834158
1020	NC_021909	GGGCG	2	10	49294	49303	0 %	0 %	80 %	20 %	528834158
1021	NC_021909	CGTC	2	8	49472	49479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_021909	GAA	2	6	49533	49538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021909	A	7	7	49537	49543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021909	ATAA	2	8	49588	49595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021909	TAA	2	6	49605	49610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021909	GGA	2	6	49625	49630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021909	CGC	2	6	49635	49640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_021909	GTT	2	6	49653	49658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021909	CGG	2	6	49660	49665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_021909	G	7	7	49796	49802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021909	CTCA	2	8	49849	49856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_021909	ACA	2	6	49886	49891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021909	TTC	2	6	49961	49966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021909	TGC	2	6	49974	49979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021909	CGA	2	6	50029	50034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_021909	GC	3	6	50054	50059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_021909	TAACC	2	10	50079	50088	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_021909	CTT	2	6	50106	50111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021909	CAT	2	6	50251	50256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_021909	CGA	2	6	50257	50262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021909	CGC	2	6	50284	50289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_021909	CGC	2	6	50348	50353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_021909	TGA	2	6	50363	50368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021909	CCG	2	6	50374	50379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_021909	GGCC	2	8	50400	50407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_021909	CG	3	6	50433	50438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_021909	GCC	2	6	50474	50479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_021909	GTT	2	6	50554	50559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021909	CGC	2	6	50593	50598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_021909	GCC	2	6	50625	50630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_021909	GCTC	2	8	50640	50647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_021909	ACC	2	6	50669	50674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_021909	CCGG	2	8	50680	50687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_021909	CGCT	2	8	50726	50733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_021909	TGG	2	6	50851	50856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021909	AAG	2	6	50861	50866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021909	TCG	2	6	50883	50888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021909	TTGG	2	8	50952	50959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021909	GAC	2	6	51029	51034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021909	GAA	2	6	51087	51092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021909	TCCA	2	8	51124	51131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_021909	GGC	2	6	51135	51140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021909	TC	3	6	51251	51256	0 %	50 %	0 %	50 %	528834159
1064	NC_021909	AGC	2	6	51278	51283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834159
1065	NC_021909	GCA	2	6	51333	51338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834159
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1067	NC_021909	TCG	2	6	51400	51405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834159
1068	NC_021909	TGC	2	6	51422	51427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834159
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1070	NC_021909	GCG	2	6	51494	51499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834159
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1082	NC_021909	CAGC	2	8	51862	51869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_021909	CGAG	2	8	51880	51887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_021909	GCCGGA	2	12	51939	51950	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_021909	CCA	2	6	51961	51966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_021909	ACC	2	6	52005	52010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_021909	ACC	2	6	52039	52044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834160
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1093	NC_021909	GC	3	6	52387	52392	0 %	0 %	50 %	50 %	528834160
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1101	NC_021909	TCC	2	6	52775	52780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834160
1102	NC_021909	AAT	2	6	53181	53186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834161
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1109	NC_021909	GCT	2	6	53457	53462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834161
1110	NC_021909	CGG	2	6	53479	53484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834161
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1112	NC_021909	TC	3	6	53790	53795	0 %	50 %	0 %	50 %	528834161
1113	NC_021909	CGC	2	6	53849	53854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834161
1114	NC_021909	T	6	6	53961	53966	0 %	100 %	0 %	0 %	528834162
1115	NC_021909	GCC	2	6	54159	54164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834162
1116	NC_021909	GC	3	6	54179	54184	0 %	0 %	50 %	50 %	528834162
1117	NC_021909	CTT	2	6	54210	54215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834162
1118	NC_021909	ACCT	2	8	54294	54301	25 %	25 %	0 %	50 %	528834162
1119	NC_021909	GC	3	6	54317	54322	0 %	0 %	50 %	50 %	528834162
1120	NC_021909	ATC	2	6	54324	54329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834162
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1122	NC_021909	AGCGA	2	10	54411	54420	40 %	0 %	40 %	20 %	528834162
1123	NC_021909	TAT	2	6	54427	54432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528834162
1124	NC_021909	TGC	2	6	54557	54562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834162
1125	NC_021909	TGC	2	6	54641	54646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834162
1126	NC_021909	TCAC	2	8	54652	54659	25 %	25 %	0 %	50 %	528834162
1127	NC_021909	CTG	2	6	54726	54731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834162
1128	NC_021909	CCA	3	9	54787	54795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834162
1129	NC_021909	CTTT	2	8	54909	54916	0 %	75 %	0 %	25 %	528834162
1130	NC_021909	CGC	2	6	55055	55060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_021909	ACG	2	6	55068	55073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021909	TCA	2	6	55074	55079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_021909	CGA	2	6	55102	55107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_021909	GAC	2	6	55169	55174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021909	GCA	2	6	55307	55312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021909	CGA	2	6	55327	55332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_021909	A	6	6	55396	55401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_021909	CAT	2	6	55447	55452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_021909	ACCT	2	8	55487	55494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1142	NC_021909	CAG	2	6	55569	55574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1154	NC_021909	GC	3	6	56295	56300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1164	NC_021909	CGA	2	6	56802	56807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1166	NC_021909	CGA	2	6	56933	56938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1176	NC_021909	GCC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1258	NC_021909	GAC	2	6	61618	61623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_021909	GGT	2	6	61634	61639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_021909	ACC	2	6	61663	61668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1261	NC_021909	CGAG	2	8	61673	61680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1262	NC_021909	AGA	2	6	61692	61697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_021909	CGT	2	6	61711	61716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1265	NC_021909	CG	3	6	61808	61813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1267	NC_021909	CGA	2	6	61860	61865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_021909	CGGC	2	8	62042	62049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1274	NC_021909	TG	3	6	62245	62250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_021909	CG	3	6	71587	71592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1496	NC_021909	CG	3	6	73897	73902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1497	NC_021909	GAC	2	6	73926	73931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834180
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