MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021909	TGA	2	6	571211	571216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834644
11502	NC_021909	CGA	2	6	571260	571265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_021909	GATCG	2	10	571321	571330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11504	NC_021909	AGA	2	6	571347	571352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_021909	CG	3	6	571528	571533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11506	NC_021909	CGT	2	6	571579	571584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_021909	GCTC	2	8	571624	571631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_021909	GGC	2	6	571652	571657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_021909	TGAT	2	8	571663	571670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_021909	GC	3	6	571702	571707	0 %	0 %	50 %	50 %	528834645
11511	NC_021909	TCC	2	6	571725	571730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834645
11512	NC_021909	CGGCG	2	10	571787	571796	0 %	0 %	60 %	40 %	528834645
11513	NC_021909	TCC	2	6	571873	571878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834646
11514	NC_021909	TGTC	2	8	571891	571898	0 %	50 %	25 %	25 %	528834646
11515	NC_021909	TCC	2	6	571900	571905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834646
11516	NC_021909	TCG	2	6	571918	571923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834646
11517	NC_021909	AG	3	6	571994	571999	50 %	0 %	50 %	0 %	528834646
11518	NC_021909	CTT	2	6	572010	572015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834646
11519	NC_021909	AGAT	2	8	572152	572159	50 %	25 %	25 %	0 %	528834646
11520	NC_021909	CAG	2	6	572187	572192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834646
11521	NC_021909	CGA	2	6	572276	572281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834646
11522	NC_021909	GAAT	2	8	572293	572300	50 %	25 %	25 %	0 %	528834646
11523	NC_021909	GAA	2	6	572301	572306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834646
11524	NC_021909	TTC	2	6	572337	572342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834646
11525	NC_021909	TGA	2	6	572417	572422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834646
11526	NC_021909	CCT	2	6	572483	572488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834646
11527	NC_021909	TGT	2	6	572645	572650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834646
11528	NC_021909	A	7	7	572666	572672	100 %	0 %	0 %	0 %	528834646
11529	NC_021909	GTT	2	6	572722	572727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834646
11530	NC_021909	TGAG	2	8	572749	572756	25 %	25 %	50 %	0 %	528834646
11531	NC_021909	TCGG	2	8	572790	572797	0 %	25 %	50 %	25 %	528834646
11532	NC_021909	CAA	2	6	572813	572818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834646
11533	NC_021909	GAA	2	6	572841	572846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834646
11534	NC_021909	CTT	2	6	572966	572971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834646
11535	NC_021909	C	7	7	572972	572978	0 %	0 %	0 %	100 %	528834646
11536	NC_021909	CCT	2	6	573038	573043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834646
11537	NC_021909	CGC	2	6	573074	573079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834646
11538	NC_021909	AGGCA	2	10	573176	573185	40 %	0 %	40 %	20 %	528834646
11539	NC_021909	ACC	2	6	573217	573222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834646
11540	NC_021909	TTC	2	6	573226	573231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834646
11541	NC_021909	GCCC	2	8	573237	573244	0 %	0 %	25 %	75 %	528834646
11542	NC_021909	CAT	2	6	573251	573256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834646
11543	NC_021909	TCC	2	6	573397	573402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834646
11544	NC_021909	GCC	2	6	573405	573410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834646
11545	NC_021909	CCA	2	6	573428	573433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834646
11546	NC_021909	TGCC	2	8	573447	573454	0 %	25 %	25 %	50 %	528834646
11547	NC_021909	GCT	2	6	573497	573502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834646
11548	NC_021909	GGA	2	6	573507	573512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834646
11549	NC_021909	TGA	3	9	573536	573544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834646
11550	NC_021909	GCGG	2	8	573576	573583	0 %	0 %	75 %	25 %	528834646
11551	NC_021909	GCC	2	6	573590	573595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834646
11552	NC_021909	GTT	2	6	573630	573635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834646
11553	NC_021909	ACA	2	6	573670	573675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834646
11554	NC_021909	T	6	6	573743	573748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_021909	CAG	2	6	573749	573754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_021909	GAAT	2	8	574172	574179	50 %	25 %	25 %	0 %	528834647
11557	NC_021909	GA	3	6	574230	574235	50 %	0 %	50 %	0 %	528834647
11558	NC_021909	ATC	2	6	574259	574264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834647
11559	NC_021909	TGC	2	6	574319	574324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834647
11560	NC_021909	TCA	2	6	574384	574389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834647
11561	NC_021909	GCC	2	6	574518	574523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834648
11562	NC_021909	C	6	6	574522	574527	0 %	0 %	0 %	100 %	528834648
11563	NC_021909	C	6	6	574529	574534	0 %	0 %	0 %	100 %	528834648
11564	NC_021909	CGC	2	6	574551	574556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834648
11565	NC_021909	A	6	6	574586	574591	100 %	0 %	0 %	0 %	528834648
11566	NC_021909	AG	3	6	574604	574609	50 %	0 %	50 %	0 %	528834648
11567	NC_021909	TGA	2	6	574656	574661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834648
11568	NC_021909	GGC	2	6	574695	574700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834648
11569	NC_021909	ATC	2	6	574705	574710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834648
11570	NC_021909	GT	3	6	574734	574739	0 %	50 %	50 %	0 %	528834648
11571	NC_021909	ACC	2	6	574744	574749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834648
11572	NC_021909	CAG	2	6	574752	574757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834648
11573	NC_021909	GTC	2	6	574762	574767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834648
11574	NC_021909	AAG	2	6	574773	574778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834648
11575	NC_021909	GAT	2	6	574830	574835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834648
11576	NC_021909	GGC	2	6	574836	574841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834648
11577	NC_021909	GCT	2	6	574843	574848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834648
11578	NC_021909	GCCG	2	8	574863	574870	0 %	0 %	50 %	50 %	528834648
11579	NC_021909	ACA	2	6	574897	574902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834648
11580	NC_021909	CA	3	6	574964	574969	50 %	0 %	0 %	50 %	528834648
11581	NC_021909	AAG	2	6	575035	575040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834648
11582	NC_021909	TCCCG	2	10	575049	575058	0 %	20 %	20 %	60 %	528834648
11583	NC_021909	CAG	2	6	575157	575162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834648
11584	NC_021909	ATG	2	6	575167	575172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834648
11585	NC_021909	GAC	2	6	575212	575217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834648
11586	NC_021909	ACG	2	6	575248	575253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834648
11587	NC_021909	GGC	2	6	575376	575381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834648
11588	NC_021909	AGCC	2	8	575451	575458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11589	NC_021909	GC	3	6	575556	575561	0 %	0 %	50 %	50 %	528834649
11590	NC_021909	TGA	2	6	575618	575623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834649
11591	NC_021909	GCC	2	6	575625	575630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834649
11592	NC_021909	TTG	2	6	575632	575637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834649
11593	NC_021909	GGC	2	6	575673	575678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834649
11594	NC_021909	CGCAT	2	10	575704	575713	20 %	20 %	20 %	40 %	528834649
11595	NC_021909	TCT	2	6	575714	575719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834649
11596	NC_021909	CGG	2	6	575762	575767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834649
11597	NC_021909	AGC	2	6	575773	575778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834649
11598	NC_021909	GCTGT	2	10	575930	575939	0 %	40 %	40 %	20 %	528834649
11599	NC_021909	GTC	2	6	575943	575948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834649
11600	NC_021909	ATC	2	6	576019	576024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834649
11601	NC_021909	CCA	2	6	576025	576030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834649
11602	NC_021909	TCC	2	6	576049	576054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834649
11603	NC_021909	TGT	2	6	576058	576063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834649
11604	NC_021909	CCT	2	6	576182	576187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834649
11605	NC_021909	GACA	2	8	576252	576259	50 %	0 %	25 %	25 %	528834649
11606	NC_021909	TGC	2	6	576296	576301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834649
11607	NC_021909	CTT	2	6	576353	576358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834649
11608	NC_021909	GAT	2	6	576378	576383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834649
11609	NC_021909	ACCTGA	2	12	576481	576492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528834649
11610	NC_021909	GTT	2	6	576522	576527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834649
11611	NC_021909	AAT	2	6	576551	576556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834649
11612	NC_021909	CGA	2	6	576605	576610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_021909	ACT	2	6	576965	576970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_021909	AACG	2	8	576998	577005	50 %	0 %	25 %	25 %	528834650
11615	NC_021909	TCT	2	6	577063	577068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834650
11616	NC_021909	CAA	2	6	577076	577081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834650
11617	NC_021909	AGG	2	6	577146	577151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834650
11618	NC_021909	GCT	2	6	577193	577198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834651
11619	NC_021909	GAC	2	6	577235	577240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834651
11620	NC_021909	GTC	2	6	577275	577280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834651
11621	NC_021909	CGA	2	6	577325	577330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834651
11622	NC_021909	TCG	2	6	577392	577397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834651
11623	NC_021909	TCG	2	6	577489	577494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834651
11624	NC_021909	TCAG	2	8	577495	577502	25 %	25 %	25 %	25 %	528834651
11625	NC_021909	CGCTC	2	10	577556	577565	0 %	20 %	20 %	60 %	528834651
11626	NC_021909	CG	4	8	577582	577589	0 %	0 %	50 %	50 %	528834651
11627	NC_021909	ACG	2	6	577673	577678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834651
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11630	NC_021909	CGG	2	6	577760	577765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834651
11631	NC_021909	CCG	2	6	577825	577830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834651
11632	NC_021909	TGAT	2	8	577909	577916	25 %	50 %	25 %	0 %	528834651
11633	NC_021909	GAGG	2	8	577928	577935	25 %	0 %	75 %	0 %	528834651
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11638	NC_021909	CTGC	2	8	578028	578035	0 %	25 %	25 %	50 %	528834651
11639	NC_021909	GCT	2	6	578038	578043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834651
11640	NC_021909	G	6	6	578045	578050	0 %	0 %	100 %	0 %	528834651
11641	NC_021909	GAA	2	6	578145	578150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11642	NC_021909	GAC	2	6	578156	578161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11643	NC_021909	GGAT	2	8	578163	578170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11644	NC_021909	GAA	2	6	578189	578194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11645	NC_021909	CCG	2	6	578196	578201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11646	NC_021909	G	7	7	578206	578212	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11647	NC_021909	CG	3	6	578238	578243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11648	NC_021909	TCG	2	6	578277	578282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11649	NC_021909	CATGG	2	10	578288	578297	20 %	20 %	40 %	20 %	528834652
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11652	NC_021909	ACTC	2	8	578424	578431	25 %	25 %	0 %	50 %	528834652
11653	NC_021909	ACG	2	6	578447	578452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834652
11654	NC_021909	CG	3	6	578451	578456	0 %	0 %	50 %	50 %	528834652
11655	NC_021909	TTC	2	6	578504	578509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834652
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11658	NC_021909	CTT	2	6	578579	578584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834652
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11663	NC_021909	CGT	2	6	578812	578817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834652
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11666	NC_021909	CTT	2	6	578885	578890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834652
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11682	NC_021909	GAG	2	6	579692	579697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834652
11683	NC_021909	CGCGGG	2	12	579775	579786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11684	NC_021909	GC	3	6	579787	579792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11685	NC_021909	AAT	2	6	579825	579830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11686	NC_021909	GAT	2	6	579867	579872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11687	NC_021909	AT	3	6	580016	580021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11688	NC_021909	GAC	2	6	580166	580171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834653
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11716	NC_021909	CGA	2	6	581267	581272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834654
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11719	NC_021909	GTTC	2	8	581849	581856	0 %	50 %	25 %	25 %	528834654
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11729	NC_021909	ACG	2	6	582187	582192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834654
11730	NC_021909	GTT	2	6	582296	582301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834654
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11732	NC_021909	TGGA	2	8	582392	582399	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11733	NC_021909	AC	3	6	582403	582408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11734	NC_021909	TGC	2	6	582410	582415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11735	NC_021909	GA	3	6	582503	582508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11736	NC_021909	CGC	2	6	582596	582601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11737	NC_021909	GCA	2	6	582788	582793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834655
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11739	NC_021909	GGC	2	6	582840	582845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834655
11740	NC_021909	GCTG	2	8	582982	582989	0 %	25 %	50 %	25 %	528834655
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11982	NC_021909	ACGT	2	8	595563	595570	25 %	25 %	25 %	25 %	528834667
11983	NC_021909	TCC	2	6	595605	595610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834667
11984	NC_021909	GGA	2	6	595624	595629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834667
11985	NC_021909	CGC	2	6	595703	595708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834667
11986	NC_021909	CCA	2	6	595735	595740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834667
11987	NC_021909	TTC	2	6	595793	595798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834667
11988	NC_021909	ACGAT	2	10	595855	595864	40 %	20 %	20 %	20 %	528834667
11989	NC_021909	ACCT	2	8	596078	596085	25 %	25 %	0 %	50 %	528834667
11990	NC_021909	CGAT	2	8	596134	596141	25 %	25 %	25 %	25 %	528834667
11991	NC_021909	TCG	2	6	596151	596156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834667
11992	NC_021909	TGG	2	6	596317	596322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834667
11993	NC_021909	TGAA	2	8	596364	596371	50 %	25 %	25 %	0 %	528834667
11994	NC_021909	GC	3	6	596559	596564	0 %	0 %	50 %	50 %	528834667
11995	NC_021909	CGA	2	6	596722	596727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834667
11996	NC_021909	GCT	2	6	596741	596746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834667
11997	NC_021909	GCG	2	6	596851	596856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834667
11998	NC_021909	GCTT	2	8	596968	596975	0 %	50 %	25 %	25 %	528834667
11999	NC_021909	GTG	2	6	596988	596993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834667
12000	NC_021909	CTG	2	6	597069	597074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834667

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