MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021909	AAC	2	6	293351	293356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021909	ATG	2	6	293400	293405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021909	CG	3	6	293452	293457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_021909	TCG	2	6	293458	293463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_021909	GAT	2	6	293465	293470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021909	GTC	2	6	293525	293530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_021909	ATG	2	6	293541	293546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_021909	CG	3	6	293618	293623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_021909	GCT	2	6	293744	293749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_021909	CTC	2	6	293792	293797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_021909	AAAG	2	8	293799	293806	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_021909	GCC	2	6	293835	293840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_021909	GCC	2	6	293922	293927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_021909	CCTTC	2	10	294013	294022	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6015	NC_021909	GGC	2	6	294037	294042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_021909	TGC	2	6	294141	294146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_021909	CCG	2	6	294194	294199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_021909	TTC	2	6	294233	294238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_021909	CCG	2	6	294351	294356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_021909	GTC	2	6	294367	294372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_021909	CAG	2	6	294394	294399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_021909	TGT	2	6	294438	294443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021909	ACG	2	6	294485	294490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_021909	TCGG	2	8	294515	294522	0 %	25 %	50 %	25 %	528834363
6025	NC_021909	TCA	2	6	294566	294571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834363
6026	NC_021909	CGG	2	6	294638	294643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834363
6027	NC_021909	CGG	2	6	294677	294682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834363
6028	NC_021909	GCC	2	6	294794	294799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834363
6029	NC_021909	CGG	2	6	294806	294811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834363
6030	NC_021909	TCG	2	6	294883	294888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834363
6031	NC_021909	CCG	2	6	294991	294996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834363
6032	NC_021909	TTC	2	6	294997	295002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834363
6033	NC_021909	CGC	2	6	295020	295025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834363
6034	NC_021909	AAG	2	6	295053	295058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834363
6035	NC_021909	GA	3	6	295066	295071	50 %	0 %	50 %	0 %	528834363
6036	NC_021909	TCC	2	6	295093	295098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834363
6037	NC_021909	CGC	2	6	295103	295108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834363
6038	NC_021909	CGCCAG	2	12	295154	295165	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528834364
6039	NC_021909	CCA	2	6	295227	295232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834364
6040	NC_021909	CGC	3	9	295240	295248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834364
6041	NC_021909	AG	3	6	295307	295312	50 %	0 %	50 %	0 %	528834364
6042	NC_021909	AGCA	2	8	295418	295425	50 %	0 %	25 %	25 %	528834364
6043	NC_021909	GAA	2	6	295529	295534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834364
6044	NC_021909	TCG	2	6	295563	295568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834364
6045	NC_021909	G	6	6	295709	295714	0 %	0 %	100 %	0 %	528834364
6046	NC_021909	AGG	2	6	295728	295733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834364
6047	NC_021909	AGG	2	6	295755	295760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834364
6048	NC_021909	CGCC	2	8	295787	295794	0 %	0 %	25 %	75 %	528834364
6049	NC_021909	GCC	2	6	295856	295861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834364
6050	NC_021909	CAG	2	6	295915	295920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834364
6051	NC_021909	GCG	2	6	295930	295935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834364
6052	NC_021909	CAAGG	2	10	295973	295982	40 %	0 %	40 %	20 %	528834364
6053	NC_021909	GCC	2	6	296019	296024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834364
6054	NC_021909	ACC	2	6	296031	296036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834364
6055	NC_021909	CAGT	2	8	296041	296048	25 %	25 %	25 %	25 %	528834364
6056	NC_021909	ATCG	2	8	296052	296059	25 %	25 %	25 %	25 %	528834364
6057	NC_021909	GCCGAG	2	12	296228	296239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528834364
6058	NC_021909	CGT	2	6	296305	296310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834365
6059	NC_021909	GGC	2	6	296371	296376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834365
6060	NC_021909	TCG	2	6	296453	296458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834365
6061	NC_021909	TCGA	2	8	296481	296488	25 %	25 %	25 %	25 %	528834365
6062	NC_021909	GTC	2	6	296524	296529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834365
6063	NC_021909	GCT	2	6	296642	296647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834365
6064	NC_021909	CGA	2	6	296649	296654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834365
6065	NC_021909	CGA	2	6	296665	296670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834365
6066	NC_021909	CGA	2	6	296712	296717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834365
6067	NC_021909	GCC	2	6	296740	296745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834365
6068	NC_021909	C	6	6	296771	296776	0 %	0 %	0 %	100 %	528834365
6069	NC_021909	GAT	2	6	296779	296784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834365
6070	NC_021909	TCC	2	6	296810	296815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834365
6071	NC_021909	GCCG	2	8	296845	296852	0 %	0 %	50 %	50 %	528834365
6072	NC_021909	TCC	2	6	296909	296914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834365
6073	NC_021909	CCAT	2	8	296930	296937	25 %	25 %	0 %	50 %	528834365
6074	NC_021909	CTC	2	6	296998	297003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834365
6075	NC_021909	TCT	3	9	297033	297041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834365
6076	NC_021909	ATC	2	6	297068	297073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834365
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6079	NC_021909	TGC	2	6	297249	297254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834365
6080	NC_021909	GC	4	8	297253	297260	0 %	0 %	50 %	50 %	528834365
6081	NC_021909	CCGA	2	8	297275	297282	25 %	0 %	25 %	50 %	528834365
6082	NC_021909	CCG	2	6	297312	297317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834365
6083	NC_021909	CAAG	2	8	297507	297514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_021909	ACG	2	6	297515	297520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_021909	GCT	2	6	297630	297635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_021909	AATG	2	8	297650	297657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_021909	AAG	2	6	297662	297667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_021909	GAT	2	6	297828	297833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_021909	CGA	2	6	297843	297848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_021909	CTG	2	6	297886	297891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_021909	TAT	2	6	297910	297915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_021909	GGC	2	6	298043	298048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_021909	ATG	2	6	298105	298110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_021909	CAT	2	6	298122	298127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_021909	ACC	2	6	298147	298152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_021909	TCG	2	6	298302	298307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_021909	GGCG	2	8	298319	298326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_021909	CATC	2	8	298556	298563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_021909	CAA	2	6	298628	298633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_021909	GCT	2	6	298640	298645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_021909	AGCCGA	2	12	298670	298681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_021909	GCA	2	6	298719	298724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_021909	GGAT	2	8	298800	298807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_021909	GC	3	6	298896	298901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_021909	GC	3	6	298978	298983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_021909	GTC	2	6	299011	299016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_021909	GC	3	6	299017	299022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_021909	GAT	2	6	299029	299034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_021909	CGG	2	6	299073	299078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_021909	CAA	2	6	299088	299093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_021909	GGT	2	6	299147	299152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_021909	CAGC	2	8	299169	299176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_021909	CGGG	2	8	299230	299237	0 %	0 %	75 %	25 %	528834366
6114	NC_021909	GC	3	6	299272	299277	0 %	0 %	50 %	50 %	528834366
6115	NC_021909	CGTC	2	8	299442	299449	0 %	25 %	25 %	50 %	528834366
6116	NC_021909	AGG	3	9	299457	299465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834366
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6121	NC_021909	GCT	2	6	299662	299667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834366
6122	NC_021909	CG	4	8	299692	299699	0 %	0 %	50 %	50 %	528834366
6123	NC_021909	GACC	2	8	299755	299762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_021909	TCT	2	6	299775	299780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_021909	CAA	2	6	299812	299817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_021909	TGGT	2	8	299843	299850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_021909	CTC	2	6	299981	299986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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