MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021909	ATG	2	6	270408	270413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834345
5502	NC_021909	CGC	2	6	270489	270494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834345
5503	NC_021909	TGC	2	6	270517	270522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5504	NC_021909	ATTC	2	8	270533	270540	25 %	50 %	0 %	25 %	528834345
5505	NC_021909	GAT	2	6	270569	270574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834345
5506	NC_021909	GAC	2	6	270620	270625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5507	NC_021909	TGC	2	6	270626	270631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5508	NC_021909	CGA	2	6	270662	270667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5509	NC_021909	GC	3	6	270668	270673	0 %	0 %	50 %	50 %	528834345
5510	NC_021909	AGA	2	6	270715	270720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834345
5511	NC_021909	GCCA	2	8	270768	270775	25 %	0 %	25 %	50 %	528834345
5512	NC_021909	TTCA	2	8	270899	270906	25 %	50 %	0 %	25 %	528834345
5513	NC_021909	ACG	2	6	270943	270948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5514	NC_021909	TTGCC	2	10	270964	270973	0 %	40 %	20 %	40 %	528834345
5515	NC_021909	TTA	2	6	271018	271023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528834345
5516	NC_021909	CTC	2	6	271047	271052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834345
5517	NC_021909	TCT	2	6	271073	271078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834345
5518	NC_021909	GCC	2	6	271088	271093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834345
5519	NC_021909	CTG	2	6	271107	271112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5520	NC_021909	CTG	2	6	271125	271130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5521	NC_021909	CTG	2	6	271149	271154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5522	NC_021909	TGA	2	6	271324	271329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834345
5523	NC_021909	CGCGC	2	10	271353	271362	0 %	0 %	40 %	60 %	528834345
5524	NC_021909	CGC	2	6	271430	271435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834345
5525	NC_021909	TAT	2	6	271470	271475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528834345
5526	NC_021909	GAT	2	6	271511	271516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834345
5527	NC_021909	GGCAT	2	10	271560	271569	20 %	20 %	40 %	20 %	528834345
5528	NC_021909	CTG	2	6	271602	271607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834345
5529	NC_021909	GGTT	2	8	271702	271709	0 %	50 %	50 %	0 %	528834346
5530	NC_021909	GCG	2	6	271730	271735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834346
5531	NC_021909	CTTT	2	8	271780	271787	0 %	75 %	0 %	25 %	528834346
5532	NC_021909	T	6	6	271801	271806	0 %	100 %	0 %	0 %	528834346
5533	NC_021909	GGT	2	6	271835	271840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834346
5534	NC_021909	ACTC	2	8	271886	271893	25 %	25 %	0 %	50 %	528834346
5535	NC_021909	AGC	2	6	271941	271946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834346
5536	NC_021909	GGC	2	6	271976	271981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834346
5537	NC_021909	TGA	2	6	271988	271993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834346
5538	NC_021909	TCA	2	6	272027	272032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834346
5539	NC_021909	TCT	2	6	272051	272056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834346
5540	NC_021909	GTC	2	6	272128	272133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834346
5541	NC_021909	TTACAG	2	12	272135	272146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	528834346
5542	NC_021909	GCC	2	6	272202	272207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834346
5543	NC_021909	CTT	2	6	272217	272222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834346
5544	NC_021909	TTC	2	6	272278	272283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834346
5545	NC_021909	GGT	3	9	272298	272306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834346
5546	NC_021909	CAT	2	6	272424	272429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834346
5547	NC_021909	GCC	2	6	272456	272461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834346
5548	NC_021909	TGT	2	6	272497	272502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021909	ACC	2	6	272519	272524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_021909	GCTG	2	8	272525	272532	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_021909	TCGA	2	8	272655	272662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_021909	GTG	2	6	272671	272676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_021909	GCA	2	6	272688	272693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_021909	AGG	2	6	272723	272728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021909	CGG	2	6	272744	272749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_021909	TCA	2	6	272785	272790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834347
5557	NC_021909	GCACG	2	10	272794	272803	20 %	0 %	40 %	40 %	528834347
5558	NC_021909	GC	3	6	272834	272839	0 %	0 %	50 %	50 %	528834347
5559	NC_021909	TGC	2	6	272848	272853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834347
5560	NC_021909	AGC	2	6	272868	272873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834347
5561	NC_021909	CAG	2	6	272941	272946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834347
5562	NC_021909	GCG	2	6	272968	272973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_021909	TCT	2	6	272979	272984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_021909	GCC	2	6	272986	272991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_021909	CCA	2	6	273039	273044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_021909	TAA	2	6	273177	273182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834348
5567	NC_021909	TCG	2	6	273197	273202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834348
5568	NC_021909	CAT	2	6	273435	273440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834348
5569	NC_021909	GC	3	6	273465	273470	0 %	0 %	50 %	50 %	528834348
5570	NC_021909	GAA	2	6	273497	273502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834348
5571	NC_021909	TCCC	2	8	273544	273551	0 %	25 %	0 %	75 %	528834348
5572	NC_021909	CGTG	2	8	273589	273596	0 %	25 %	50 %	25 %	528834348
5573	NC_021909	GGC	2	6	273664	273669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834348
5574	NC_021909	CGG	2	6	273717	273722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834348
5575	NC_021909	GGC	2	6	273748	273753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834348
5576	NC_021909	TAA	2	6	273789	273794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834348
5577	NC_021909	ACG	2	6	273866	273871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834348
5578	NC_021909	ATCC	2	8	273954	273961	25 %	25 %	0 %	50 %	528834348
5579	NC_021909	TCC	2	6	273983	273988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834348
5580	NC_021909	CCAT	2	8	274043	274050	25 %	25 %	0 %	50 %	528834348
5581	NC_021909	CTT	2	6	274074	274079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834348
5582	NC_021909	GAGC	2	8	274118	274125	25 %	0 %	50 %	25 %	528834348
5583	NC_021909	TGT	2	6	274149	274154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834348
5584	NC_021909	GCC	2	6	274218	274223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834348
5585	NC_021909	TCC	2	6	274281	274286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_021909	CGC	2	6	274305	274310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_021909	GCA	2	6	274451	274456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_021909	A	6	6	274479	274484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021909	ACC	2	6	274521	274526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_021909	TGT	2	6	274561	274566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_021909	TGCT	2	8	274638	274645	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5592	NC_021909	GGC	2	6	274699	274704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834349
5593	NC_021909	AAGGC	2	10	274746	274755	40 %	0 %	40 %	20 %	528834349
5594	NC_021909	CGT	2	6	274758	274763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834349
5595	NC_021909	GGCCT	2	10	274829	274838	0 %	20 %	40 %	40 %	528834349
5596	NC_021909	GCA	2	6	274839	274844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834349
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5602	NC_021909	GC	3	6	275220	275225	0 %	0 %	50 %	50 %	528834349
5603	NC_021909	ATG	2	6	275248	275253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834349
5604	NC_021909	GATCA	2	10	275287	275296	40 %	20 %	20 %	20 %	528834349
5605	NC_021909	CCT	2	6	275309	275314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834349
5606	NC_021909	CTT	2	6	275412	275417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834349
5607	NC_021909	CCA	2	6	275418	275423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834349
5608	NC_021909	CGC	2	6	275439	275444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834349
5609	NC_021909	TTC	2	6	275446	275451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834349
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5612	NC_021909	GAC	2	6	275579	275584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834349
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5618	NC_021909	GGACG	2	10	275896	275905	20 %	0 %	60 %	20 %	528834350
5619	NC_021909	CGG	2	6	275917	275922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834350
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5622	NC_021909	AT	3	6	275995	276000	50 %	50 %	0 %	0 %	528834350
5623	NC_021909	ATTT	2	8	276002	276009	25 %	75 %	0 %	0 %	528834350
5624	NC_021909	TTC	2	6	276024	276029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834350
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5737	NC_021909	ATGCC	2	10	280984	280993	20 %	20 %	20 %	40 %	528834353
5738	NC_021909	CGG	2	6	280997	281002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834353
5739	NC_021909	GCA	2	6	281014	281019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834353
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5741	NC_021909	AGG	2	6	281108	281113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5742	NC_021909	CGCCA	2	10	281203	281212	20 %	0 %	20 %	60 %	528834354
5743	NC_021909	GGC	2	6	281365	281370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834354
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5745	NC_021909	TGA	2	6	281423	281428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834354
5746	NC_021909	CGG	2	6	281460	281465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834354
5747	NC_021909	GC	3	6	281474	281479	0 %	0 %	50 %	50 %	528834354
5748	NC_021909	GATC	2	8	281484	281491	25 %	25 %	25 %	25 %	528834354
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5996	NC_021909	GCT	2	6	293217	293222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5997	NC_021909	ACG	2	6	293274	293279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5998	NC_021909	GCG	2	6	293329	293334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5999	NC_021909	GTC	2	6	293337	293342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6000	NC_021909	GCC	2	6	293343	293348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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