MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021909	CCA	2	6	222210	222215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_021909	GGT	2	6	222271	222276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021909	GAT	2	6	222388	222393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_021909	ACGG	2	8	222429	222436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_021909	GGT	2	6	222444	222449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021909	ACC	2	6	222450	222455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_021909	CT	3	6	222485	222490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_021909	CGC	2	6	222491	222496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_021909	GGGGC	2	10	222652	222661	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4510	NC_021909	GCCT	2	8	222692	222699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_021909	GCC	2	6	222742	222747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_021909	GCC	2	6	222836	222841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_021909	GA	3	6	222846	222851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021909	GTCGT	2	10	222932	222941	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4515	NC_021909	GCA	2	6	222959	222964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_021909	CGC	2	6	223003	223008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_021909	GCTC	2	8	223074	223081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_021909	ATC	2	6	223124	223129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_021909	CAG	2	6	223132	223137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_021909	TCT	2	6	223194	223199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_021909	GCG	2	6	223337	223342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_021909	ACG	2	6	223346	223351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_021909	GACG	2	8	223384	223391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_021909	CCG	2	6	223436	223441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_021909	CTC	2	6	223473	223478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_021909	CG	3	6	223573	223578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_021909	GGC	2	6	223617	223622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_021909	GCT	2	6	223639	223644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_021909	CAG	2	6	223683	223688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_021909	GTC	2	6	223707	223712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_021909	GCC	2	6	223802	223807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_021909	CAG	2	6	223842	223847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_021909	CAC	2	6	223872	223877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_021909	CTT	2	6	223923	223928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_021909	GAC	2	6	224029	224034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4536	NC_021909	TCGA	2	8	224071	224078	25 %	25 %	25 %	25 %	528834311
4537	NC_021909	GAA	2	6	224169	224174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834311
4538	NC_021909	CT	3	6	224178	224183	0 %	50 %	0 %	50 %	528834311
4539	NC_021909	CCG	2	6	224226	224231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834311
4540	NC_021909	TCA	2	6	224235	224240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834311
4541	NC_021909	ATC	2	6	224246	224251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834311
4542	NC_021909	TGG	2	6	224265	224270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834311
4543	NC_021909	CAT	2	6	224271	224276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834311
4544	NC_021909	CAG	2	6	224442	224447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4545	NC_021909	CG	3	6	224466	224471	0 %	0 %	50 %	50 %	528834311
4546	NC_021909	TG	3	6	224485	224490	0 %	50 %	50 %	0 %	528834311
4547	NC_021909	TCG	2	6	224537	224542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4548	NC_021909	AAT	2	6	224551	224556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834311
4549	NC_021909	GCT	2	6	224583	224588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4550	NC_021909	CGAT	2	8	224660	224667	25 %	25 %	25 %	25 %	528834311
4551	NC_021909	GC	3	6	224674	224679	0 %	0 %	50 %	50 %	528834311
4552	NC_021909	CAT	2	6	224739	224744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834311
4553	NC_021909	CGC	2	6	224976	224981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834311
4554	NC_021909	TCG	2	6	225017	225022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4555	NC_021909	AGA	2	6	225066	225071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834311
4556	NC_021909	CAT	2	6	225076	225081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834311
4557	NC_021909	CGCAT	2	10	225096	225105	20 %	20 %	20 %	40 %	528834311
4558	NC_021909	TTC	3	9	225155	225163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834311
4559	NC_021909	TGA	2	6	225227	225232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834311
4560	NC_021909	GCA	2	6	225240	225245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4561	NC_021909	GAT	2	6	225304	225309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834311
4562	NC_021909	GGA	2	6	225366	225371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834311
4563	NC_021909	GTC	2	6	225483	225488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4564	NC_021909	TCGATC	2	12	225554	225565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528834311
4565	NC_021909	CGG	2	6	225592	225597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834311
4566	NC_021909	TGC	2	6	225640	225645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4567	NC_021909	AAGCT	2	10	225665	225674	40 %	20 %	20 %	20 %	528834311
4568	NC_021909	AGC	2	6	225704	225709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4569	NC_021909	GAT	2	6	225792	225797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834311
4570	NC_021909	GC	3	6	225814	225819	0 %	0 %	50 %	50 %	528834311
4571	NC_021909	TGC	2	6	225906	225911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834311
4572	NC_021909	CCAG	2	8	225980	225987	25 %	0 %	25 %	50 %	528834311
4573	NC_021909	GCG	2	6	226061	226066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834311
4574	NC_021909	TCA	2	6	226098	226103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834311
4575	NC_021909	CAG	2	6	226145	226150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834312
4576	NC_021909	CCA	2	6	226168	226173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834312
4577	NC_021909	CCG	2	6	226192	226197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834312
4578	NC_021909	CAT	2	6	226265	226270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834312
4579	NC_021909	CCTTCT	2	12	226271	226282	0 %	50 %	0 %	50 %	528834312
4580	NC_021909	CTC	2	6	226304	226309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834312
4581	NC_021909	TTC	2	6	226513	226518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834312
4582	NC_021909	TCG	2	6	226547	226552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834312
4583	NC_021909	CCGCGG	2	12	226592	226603	0 %	0 %	50 %	50 %	528834312
4584	NC_021909	CA	3	6	226620	226625	50 %	0 %	0 %	50 %	528834312
4585	NC_021909	CCT	2	6	226644	226649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_021909	GCCA	2	8	226703	226710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_021909	ATC	2	6	226736	226741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_021909	CACGCG	2	12	226800	226811	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_021909	CGA	2	6	226852	226857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_021909	TGG	2	6	226868	226873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_021909	GA	3	6	226892	226897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_021909	CTC	2	6	226956	226961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_021909	AAC	2	6	226990	226995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_021909	GCCG	2	8	227010	227017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_021909	CG	3	6	227016	227021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_021909	ACT	2	6	227149	227154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_021909	AGCA	2	8	227378	227385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_021909	GCT	2	6	227430	227435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_021909	ACG	2	6	227446	227451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_021909	GGC	2	6	227468	227473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_021909	GCG	2	6	227513	227518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_021909	T	7	7	227525	227531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_021909	ATG	2	6	227595	227600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021909	TGC	2	6	227622	227627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_021909	CCA	2	6	227725	227730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_021909	GGC	2	6	227797	227802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_021909	GCAC	2	8	228018	228025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_021909	CGT	2	6	228040	228045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_021909	CA	3	6	228071	228076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_021909	GCC	2	6	228111	228116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_021909	AAG	3	9	228209	228217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_021909	CCGG	2	8	228269	228276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_021909	GCT	2	6	228298	228303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_021909	A	6	6	228342	228347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021909	CCGA	2	8	228438	228445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_021909	TCG	2	6	228456	228461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_021909	CAT	2	6	228472	228477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_021909	CG	3	6	228508	228513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_021909	GAC	2	6	228604	228609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_021909	TCT	2	6	228624	228629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_021909	CTCG	2	8	228641	228648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_021909	GGT	2	6	228653	228658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021909	CAC	2	6	228681	228686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_021909	GTC	2	6	228698	228703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_021909	AGC	2	6	228751	228756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_021909	TCC	2	6	228860	228865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_021909	TGC	2	6	228931	228936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_021909	TGT	2	6	229155	229160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834313
4629	NC_021909	AAT	2	6	229161	229166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834313
4630	NC_021909	TCA	2	6	229189	229194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834313
4631	NC_021909	CGT	2	6	229215	229220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834313
4632	NC_021909	CCT	2	6	229268	229273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834313
4633	NC_021909	TTG	2	6	229313	229318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834313
4634	NC_021909	CAT	2	6	229418	229423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834313
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4636	NC_021909	CGC	3	9	229566	229574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834313
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4642	NC_021909	CCT	2	6	229921	229926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4643	NC_021909	CT	3	6	230007	230012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4644	NC_021909	GCC	2	6	230019	230024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4645	NC_021909	GCA	2	6	230067	230072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4646	NC_021909	GCC	2	6	230110	230115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4647	NC_021909	AGC	2	6	230144	230149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4648	NC_021909	ATT	2	6	230150	230155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4649	NC_021909	TA	3	6	230169	230174	50 %	50 %	0 %	0 %	528834314
4650	NC_021909	GAC	2	6	230364	230369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834314
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4653	NC_021909	GTCC	2	8	230479	230486	0 %	25 %	25 %	50 %	528834314
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4667	NC_021909	TCC	2	6	231144	231149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4668	NC_021909	GCC	2	6	231161	231166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4669	NC_021909	GCTC	2	8	231199	231206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4673	NC_021909	T	7	7	231302	231308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4676	NC_021909	TGG	2	6	231418	231423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4677	NC_021909	CA	3	6	231610	231615	50 %	0 %	0 %	50 %	528834315
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4680	NC_021909	TGC	2	6	231750	231755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834315
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4851	NC_021909	GC	3	6	239242	239247	0 %	0 %	50 %	50 %	528834322
4852	NC_021909	G	6	6	239310	239315	0 %	0 %	100 %	0 %	528834322
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4861	NC_021909	CCG	2	6	239972	239977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834324
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4864	NC_021909	AGC	2	6	240145	240150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834324
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4874	NC_021909	GCG	2	6	240716	240721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834324
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