MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021908	A	7	7	3502	3508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021908	C	6	6	17223	17228	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_021908	A	7	7	18823	18829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021908	C	6	6	22663	22668	0 %	0 %	0 %	100 %	528832502
5	NC_021908	A	6	6	24271	24276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021908	T	6	6	30033	30038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021908	T	6	6	30305	30310	0 %	100 %	0 %	0 %	528832509
8	NC_021908	G	6	6	31523	31528	0 %	0 %	100 %	0 %	528832509
9	NC_021908	C	6	6	33956	33961	0 %	0 %	0 %	100 %	528832511
10	NC_021908	T	6	6	40292	40297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021908	G	6	6	51844	51849	0 %	0 %	100 %	0 %	528832525
12	NC_021908	T	6	6	57487	57492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021908	A	6	6	64603	64608	100 %	0 %	0 %	0 %	528832534
14	NC_021908	T	6	6	64758	64763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021908	T	7	7	76698	76704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021908	A	6	6	79393	79398	100 %	0 %	0 %	0 %	528832553
17	NC_021908	T	8	8	80853	80860	0 %	100 %	0 %	0 %	528832555
18	NC_021908	C	6	6	83999	84004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_021908	G	6	6	84033	84038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021908	C	6	6	84108	84113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_021908	G	6	6	84142	84147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021908	G	6	6	88359	88364	0 %	0 %	100 %	0 %	528832560
23	NC_021908	C	6	6	110611	110616	0 %	0 %	0 %	100 %	528832581
24	NC_021908	C	6	6	114579	114584	0 %	0 %	0 %	100 %	528832585
25	NC_021908	G	6	6	116795	116800	0 %	0 %	100 %	0 %	528832586
26	NC_021908	C	6	6	117219	117224	0 %	0 %	0 %	100 %	528832587
27	NC_021908	A	6	6	125957	125962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021908	A	6	6	128944	128949	100 %	0 %	0 %	0 %	528832597
29	NC_021908	A	6	6	135070	135075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021908	T	7	7	136170	136176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021908	T	6	6	136194	136199	0 %	100 %	0 %	0 %	528832604
32	NC_021908	C	6	6	136228	136233	0 %	0 %	0 %	100 %	528832604
33	NC_021908	T	6	6	142562	142567	0 %	100 %	0 %	0 %	528832607
34	NC_021908	T	7	7	142957	142963	0 %	100 %	0 %	0 %	528832607
35	NC_021908	T	6	6	146268	146273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021908	T	6	6	146312	146317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021908	T	6	6	148967	148972	0 %	100 %	0 %	0 %	528832611
38	NC_021908	T	6	6	153018	153023	0 %	100 %	0 %	0 %	528832616
39	NC_021908	A	6	6	153740	153745	100 %	0 %	0 %	0 %	528832616
40	NC_021908	A	6	6	156701	156706	100 %	0 %	0 %	0 %	528832618
41	NC_021908	G	6	6	158062	158067	0 %	0 %	100 %	0 %	528832618
42	NC_021908	T	6	6	163570	163575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021908	T	6	6	184609	184614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021908	T	7	7	184802	184808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021908	C	6	6	186555	186560	0 %	0 %	0 %	100 %	528832645
46	NC_021908	A	7	7	187036	187042	100 %	0 %	0 %	0 %	528832645
47	NC_021908	C	6	6	188024	188029	0 %	0 %	0 %	100 %	528832646
48	NC_021908	C	6	6	189915	189920	0 %	0 %	0 %	100 %	528832647
49	NC_021908	G	6	6	190711	190716	0 %	0 %	100 %	0 %	528832647
50	NC_021908	T	6	6	196259	196264	0 %	100 %	0 %	0 %	528832655
51	NC_021908	A	6	6	198756	198761	100 %	0 %	0 %	0 %	528832657
52	NC_021908	A	7	7	202923	202929	100 %	0 %	0 %	0 %	528832660
53	NC_021908	T	6	6	215372	215377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021908	G	6	6	216672	216677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021908	T	6	6	218301	218306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021908	T	7	7	219995	220001	0 %	100 %	0 %	0 %	528832677
57	NC_021908	A	6	6	220875	220880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021908	T	6	6	225404	225409	0 %	100 %	0 %	0 %	528832679
59	NC_021908	A	7	7	226875	226881	100 %	0 %	0 %	0 %	528832680
60	NC_021908	A	6	6	237519	237524	100 %	0 %	0 %	0 %	528832689
61	NC_021908	T	7	7	237783	237789	0 %	100 %	0 %	0 %	528832689
62	NC_021908	T	6	6	238760	238765	0 %	100 %	0 %	0 %	528832690
63	NC_021908	A	6	6	245125	245130	100 %	0 %	0 %	0 %	528832696
64	NC_021908	A	6	6	246807	246812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021908	G	6	6	247118	247123	0 %	0 %	100 %	0 %	528832698
66	NC_021908	A	6	6	249895	249900	100 %	0 %	0 %	0 %	528832700
67	NC_021908	T	6	6	261430	261435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021908	C	6	6	270691	270696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_021908	T	6	6	271053	271058	0 %	100 %	0 %	0 %	528832724
70	NC_021908	T	6	6	273495	273500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021908	A	6	6	273594	273599	100 %	0 %	0 %	0 %	528832727
72	NC_021908	A	6	6	281199	281204	100 %	0 %	0 %	0 %	528832737
73	NC_021908	T	6	6	283206	283211	0 %	100 %	0 %	0 %	528832738
74	NC_021908	C	6	6	287464	287469	0 %	0 %	0 %	100 %	528832743
75	NC_021908	A	6	6	288315	288320	100 %	0 %	0 %	0 %	528832743
76	NC_021908	T	6	6	295143	295148	0 %	100 %	0 %	0 %	528832748
77	NC_021908	T	7	7	298295	298301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021908	T	6	6	301876	301881	0 %	100 %	0 %	0 %	528832755
79	NC_021908	C	6	6	303345	303350	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_021908	T	6	6	313938	313943	0 %	100 %	0 %	0 %	528832766
81	NC_021908	C	6	6	314515	314520	0 %	0 %	0 %	100 %	528832767
82	NC_021908	A	6	6	315778	315783	100 %	0 %	0 %	0 %	528832769
83	NC_021908	T	8	8	320333	320340	0 %	100 %	0 %	0 %	528832774
84	NC_021908	G	6	6	322626	322631	0 %	0 %	100 %	0 %	528832776
85	NC_021908	C	7	7	334688	334694	0 %	0 %	0 %	100 %	528832787
86	NC_021908	C	6	6	340834	340839	0 %	0 %	0 %	100 %	528832795
87	NC_021908	A	6	6	340907	340912	100 %	0 %	0 %	0 %	528832795
88	NC_021908	A	7	7	346404	346410	100 %	0 %	0 %	0 %	528832799
89	NC_021908	G	6	6	348057	348062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021908	G	6	6	348341	348346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021908	A	6	6	355270	355275	100 %	0 %	0 %	0 %	528832809
92	NC_021908	T	6	6	358171	358176	0 %	100 %	0 %	0 %	528832812
93	NC_021908	A	8	8	361685	361692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021908	A	6	6	361726	361731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021908	G	6	6	367598	367603	0 %	0 %	100 %	0 %	528832822
96	NC_021908	T	6	6	375479	375484	0 %	100 %	0 %	0 %	528832830
97	NC_021908	T	6	6	376245	376250	0 %	100 %	0 %	0 %	528832831
98	NC_021908	G	6	6	376960	376965	0 %	0 %	100 %	0 %	528832832
99	NC_021908	T	7	7	379512	379518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021908	G	6	6	394463	394468	0 %	0 %	100 %	0 %	528832848
101	NC_021908	A	6	6	397103	397108	100 %	0 %	0 %	0 %	528832851
102	NC_021908	A	6	6	402335	402340	100 %	0 %	0 %	0 %	528832855
103	NC_021908	A	6	6	403357	403362	100 %	0 %	0 %	0 %	528832856
104	NC_021908	A	6	6	407992	407997	100 %	0 %	0 %	0 %	528832860
105	NC_021908	A	6	6	415846	415851	100 %	0 %	0 %	0 %	528832867
106	NC_021908	A	6	6	416818	416823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021908	T	6	6	421011	421016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021908	T	6	6	421304	421309	0 %	100 %	0 %	0 %	528832874
109	NC_021908	T	6	6	434077	434082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021908	T	6	6	443864	443869	0 %	100 %	0 %	0 %	528832896
111	NC_021908	A	6	6	449723	449728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021908	T	6	6	452755	452760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021908	C	6	6	453904	453909	0 %	0 %	0 %	100 %	528832904
114	NC_021908	A	6	6	454065	454070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021908	G	6	6	456321	456326	0 %	0 %	100 %	0 %	528832906
116	NC_021908	T	6	6	463896	463901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021908	A	6	6	473446	473451	100 %	0 %	0 %	0 %	528832922
118	NC_021908	T	6	6	473593	473598	0 %	100 %	0 %	0 %	528832922
119	NC_021908	T	6	6	473764	473769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021908	C	6	6	474562	474567	0 %	0 %	0 %	100 %	528832923
121	NC_021908	A	6	6	475340	475345	100 %	0 %	0 %	0 %	528832924
122	NC_021908	A	6	6	480447	480452	100 %	0 %	0 %	0 %	528832928
123	NC_021908	C	6	6	485628	485633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_021908	T	6	6	485654	485659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021908	T	6	6	494153	494158	0 %	100 %	0 %	0 %	528832942
126	NC_021908	T	6	6	496342	496347	0 %	100 %	0 %	0 %	528832944
127	NC_021908	C	7	7	503971	503977	0 %	0 %	0 %	100 %	528832952
128	NC_021908	T	6	6	506469	506474	0 %	100 %	0 %	0 %	528832956
129	NC_021908	A	6	6	510696	510701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021908	A	6	6	510824	510829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021908	A	6	6	511567	511572	100 %	0 %	0 %	0 %	528832960

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.