MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021908	GAG	2	6	102852	102857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021908	GAT	2	6	102902	102907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832576
2503	NC_021908	GCC	2	6	102995	103000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832576
2504	NC_021908	GCC	2	6	103004	103009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832576
2505	NC_021908	CG	4	8	103043	103050	0 %	0 %	50 %	50 %	528832576
2506	NC_021908	GAA	2	6	103106	103111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832576
2507	NC_021908	CCG	2	6	103120	103125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832576
2508	NC_021908	CGG	2	6	103235	103240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832576
2509	NC_021908	CCGG	2	8	103241	103248	0 %	0 %	50 %	50 %	528832576
2510	NC_021908	GGC	2	6	103287	103292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832576
2511	NC_021908	CGC	2	6	103330	103335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832576
2512	NC_021908	GC	3	6	103456	103461	0 %	0 %	50 %	50 %	528832576
2513	NC_021908	CAT	2	6	103478	103483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832576
2514	NC_021908	GAC	2	6	103494	103499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2515	NC_021908	CGC	2	6	103522	103527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832576
2516	NC_021908	CGG	3	9	103529	103537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832576
2517	NC_021908	ACG	2	6	103566	103571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2518	NC_021908	GAA	2	6	103574	103579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832576
2519	NC_021908	CGA	2	6	103583	103588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2520	NC_021908	AGG	2	6	103612	103617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832576
2521	NC_021908	GCA	2	6	103691	103696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2522	NC_021908	GAA	2	6	103709	103714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832576
2523	NC_021908	CCG	2	6	103743	103748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832576
2524	NC_021908	CAT	2	6	103808	103813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832576
2525	NC_021908	TGC	2	6	103816	103821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2526	NC_021908	CCG	2	6	103939	103944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832576
2527	NC_021908	AGC	2	6	103960	103965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2528	NC_021908	TCG	2	6	103975	103980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2529	NC_021908	GC	3	6	103991	103996	0 %	0 %	50 %	50 %	528832576
2530	NC_021908	GGCCA	2	10	104103	104112	20 %	0 %	40 %	40 %	528832576
2531	NC_021908	TGAAC	2	10	104117	104126	40 %	20 %	20 %	20 %	528832576
2532	NC_021908	CGGG	2	8	104221	104228	0 %	0 %	75 %	25 %	528832576
2533	NC_021908	TTC	2	6	104231	104236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832576
2534	NC_021908	CTA	2	6	104270	104275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832576
2535	NC_021908	ACGG	2	8	104331	104338	25 %	0 %	50 %	25 %	528832576
2536	NC_021908	CGGC	2	8	104359	104366	0 %	0 %	50 %	50 %	528832576
2537	NC_021908	CGGC	2	8	104368	104375	0 %	0 %	50 %	50 %	528832576
2538	NC_021908	CAA	2	6	104405	104410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832576
2539	NC_021908	CGAC	2	8	104419	104426	25 %	0 %	25 %	50 %	528832576
2540	NC_021908	GTC	2	6	104445	104450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2541	NC_021908	TCA	2	6	104482	104487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832576
2542	NC_021908	GAC	2	6	104511	104516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2543	NC_021908	GTC	2	6	104570	104575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2544	NC_021908	GGT	2	6	104576	104581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832576
2545	NC_021908	AGC	2	6	104593	104598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832576
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2547	NC_021908	GAT	2	6	104646	104651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832576
2548	NC_021908	TCG	2	6	104683	104688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2549	NC_021908	CGT	2	6	104690	104695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832576
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2551	NC_021908	ACG	2	6	104706	104711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832576
2552	NC_021908	TGA	2	6	104740	104745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832576
2553	NC_021908	AGA	2	6	104755	104760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832576
2554	NC_021908	ATC	2	6	104814	104819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832576
2555	NC_021908	CGC	2	6	104909	104914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832576
2556	NC_021908	GCG	2	6	105036	105041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_021908	CG	3	6	105040	105045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_021908	TCCC	2	8	105054	105061	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2559	NC_021908	CG	3	6	105082	105087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2560	NC_021908	GC	4	8	105090	105097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_021908	CAA	2	6	105111	105116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_021908	GCCG	2	8	105117	105124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_021908	GGC	2	6	105143	105148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_021908	GTG	2	6	105229	105234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832577
2565	NC_021908	ATC	2	6	105244	105249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832577
2566	NC_021908	CCCG	2	8	105255	105262	0 %	0 %	25 %	75 %	528832577
2567	NC_021908	TA	3	6	105277	105282	50 %	50 %	0 %	0 %	528832577
2568	NC_021908	GCG	2	6	105305	105310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832577
2569	NC_021908	CCT	2	6	105311	105316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832577
2570	NC_021908	CGG	2	6	105402	105407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832577
2571	NC_021908	ACA	2	6	105446	105451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832577
2572	NC_021908	CGT	2	6	105465	105470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832577
2573	NC_021908	GCG	2	6	105556	105561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832577
2574	NC_021908	TCCT	2	8	105604	105611	0 %	50 %	0 %	50 %	528832577
2575	NC_021908	ATC	2	6	105646	105651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832577
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2579	NC_021908	GCG	2	6	105890	105895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832577
2580	NC_021908	GTG	2	6	105898	105903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832577
2581	NC_021908	TGCCG	2	10	105912	105921	0 %	20 %	40 %	40 %	528832577
2582	NC_021908	CGT	2	6	105954	105959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832577
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2585	NC_021908	TCG	2	6	106103	106108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832577
2586	NC_021908	ATC	2	6	106114	106119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832577
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2589	NC_021908	GGA	2	6	106165	106170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832577
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2591	NC_021908	ACC	2	6	106211	106216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832578
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2593	NC_021908	TCCTGA	2	12	106326	106337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528832578
2594	NC_021908	TTC	2	6	106355	106360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832578
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2598	NC_021908	GAG	2	6	106478	106483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832578
2599	NC_021908	TCG	2	6	106509	106514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832578
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2602	NC_021908	CTT	2	6	106603	106608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832578
2603	NC_021908	CGAC	2	8	106614	106621	25 %	0 %	25 %	50 %	528832578
2604	NC_021908	CG	3	6	106674	106679	0 %	0 %	50 %	50 %	528832578
2605	NC_021908	CAT	2	6	106681	106686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832578
2606	NC_021908	TGA	2	6	106704	106709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832578
2607	NC_021908	GTC	2	6	106721	106726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832578
2608	NC_021908	ACG	2	6	106748	106753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832578
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2610	NC_021908	TCG	2	6	106809	106814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832578
2611	NC_021908	GCG	2	6	107000	107005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832578
2612	NC_021908	CAT	3	9	107032	107040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832578
2613	NC_021908	TGA	2	6	107061	107066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832578
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2615	NC_021908	TCCT	2	8	107120	107127	0 %	50 %	0 %	50 %	528832578
2616	NC_021908	GCC	2	6	107152	107157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832578
2617	NC_021908	TGC	2	6	107178	107183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832578
2618	NC_021908	TGAT	2	8	107317	107324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_021908	CGCCC	2	10	107351	107360	0 %	0 %	20 %	80 %	528832579
2620	NC_021908	ATG	2	6	107374	107379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832579
2621	NC_021908	ATC	2	6	107397	107402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832579
2622	NC_021908	CCATCG	2	12	107494	107505	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528832579
2623	NC_021908	TCCGGC	2	12	107514	107525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528832579
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2625	NC_021908	GCT	2	6	107555	107560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832579
2626	NC_021908	GC	3	6	107567	107572	0 %	0 %	50 %	50 %	528832579
2627	NC_021908	CGT	2	6	107573	107578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832579
2628	NC_021908	GCA	2	6	107608	107613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832579
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2641	NC_021908	GCA	2	6	108074	108079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832579
2642	NC_021908	GCA	2	6	108128	108133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832579
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2644	NC_021908	ATC	2	6	108204	108209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832579
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2731	NC_021908	GCAT	2	8	112468	112475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2741	NC_021908	GAT	2	6	113013	113018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832583
2742	NC_021908	CATC	2	8	113102	113109	25 %	25 %	0 %	50 %	528832583
2743	NC_021908	CCG	2	6	113117	113122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832583
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2748	NC_021908	CTT	2	6	113238	113243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832583
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2762	NC_021908	TGT	2	6	113929	113934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832584
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2833	NC_021908	C	6	6	117219	117224	0 %	0 %	0 %	100 %	528832587
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2855	NC_021908	TG	3	6	118223	118228	0 %	50 %	50 %	0 %	528832588
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2861	NC_021908	GAG	2	6	118637	118642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832588
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2863	NC_021908	TGC	2	6	118776	118781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832588
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2872	NC_021908	CGA	2	6	119149	119154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2983	NC_021908	AGT	2	6	124941	124946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832593
2984	NC_021908	CAAC	2	8	125194	125201	50 %	0 %	0 %	50 %	528832593
2985	NC_021908	GCA	2	6	125271	125276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832593
2986	NC_021908	GCTT	2	8	125309	125316	0 %	50 %	25 %	25 %	528832593
2987	NC_021908	GAC	2	6	125409	125414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832593
2988	NC_021908	TCCT	2	8	125484	125491	0 %	50 %	0 %	50 %	528832593
2989	NC_021908	GCA	2	6	125500	125505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832593
2990	NC_021908	CAT	2	6	125534	125539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832593
2991	NC_021908	GCA	2	6	125612	125617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832593
2992	NC_021908	GCAGC	2	10	125667	125676	20 %	0 %	40 %	40 %	528832593
2993	NC_021908	TGC	2	6	125692	125697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832593
2994	NC_021908	TCC	2	6	125756	125761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832594
2995	NC_021908	CAGCTG	2	12	125771	125782	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528832594
2996	NC_021908	CGG	2	6	125802	125807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832594
2997	NC_021908	CGC	2	6	125824	125829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832594
2998	NC_021908	CCG	2	6	125896	125901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832594
2999	NC_021908	A	6	6	125957	125962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_021908	CA	3	6	125984	125989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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