MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021908	GCC	2	6	60625	60630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832531
1502	NC_021908	CAT	2	6	60632	60637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832531
1503	NC_021908	GCC	2	6	60744	60749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832531
1504	NC_021908	ACG	2	6	60778	60783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832531
1505	NC_021908	CTGCCG	2	12	60894	60905	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528832531
1506	NC_021908	AAGG	2	8	60915	60922	50 %	0 %	50 %	0 %	528832531
1507	NC_021908	AGG	2	6	60981	60986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021908	GCG	2	6	61018	61023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832532
1509	NC_021908	CGC	2	6	61136	61141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832532
1510	NC_021908	GAT	2	6	61146	61151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832532
1511	NC_021908	TTC	2	6	61242	61247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832532
1512	NC_021908	AACC	2	8	61268	61275	50 %	0 %	0 %	50 %	528832532
1513	NC_021908	TGA	2	6	61276	61281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832532
1514	NC_021908	CGC	2	6	61312	61317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832532
1515	NC_021908	TGG	2	6	61342	61347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832532
1516	NC_021908	AAC	2	6	61395	61400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832532
1517	NC_021908	CAA	2	6	61433	61438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832532
1518	NC_021908	GC	3	6	61541	61546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_021908	GCC	2	6	61600	61605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_021908	AGC	2	6	61611	61616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021908	GCCTCC	2	12	61617	61628	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_021908	ACG	2	6	61712	61717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021908	GGTT	2	8	61719	61726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021908	ATC	2	6	61740	61745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021908	CGC	2	6	61754	61759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_021908	TGC	2	6	61779	61784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021908	GCC	2	6	61861	61866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_021908	TCT	2	6	61894	61899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_021908	AGC	2	6	61930	61935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021908	GCG	2	6	62198	62203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832533
1531	NC_021908	CGG	2	6	62227	62232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832533
1532	NC_021908	AGC	2	6	62236	62241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832533
1533	NC_021908	ATCC	2	8	62283	62290	25 %	25 %	0 %	50 %	528832533
1534	NC_021908	TCT	2	6	62366	62371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832533
1535	NC_021908	GGTC	2	8	62372	62379	0 %	25 %	50 %	25 %	528832533
1536	NC_021908	GCT	2	6	62397	62402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832533
1537	NC_021908	CGG	2	6	62456	62461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832533
1538	NC_021908	TCC	2	6	62485	62490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832533
1539	NC_021908	AGC	2	6	62518	62523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832533
1540	NC_021908	CGC	2	6	62570	62575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832533
1541	NC_021908	GCC	2	6	62610	62615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832533
1542	NC_021908	AGC	2	6	62623	62628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832533
1543	NC_021908	TCCT	2	8	62635	62642	0 %	50 %	0 %	50 %	528832533
1544	NC_021908	CGG	2	6	62735	62740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832533
1545	NC_021908	TCA	2	6	62750	62755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832533
1546	NC_021908	GAT	2	6	62756	62761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832533
1547	NC_021908	CG	3	6	62789	62794	0 %	0 %	50 %	50 %	528832533
1548	NC_021908	CAG	2	6	62811	62816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832533
1549	NC_021908	CG	3	6	62843	62848	0 %	0 %	50 %	50 %	528832533
1550	NC_021908	GC	3	6	62862	62867	0 %	0 %	50 %	50 %	528832533
1551	NC_021908	GGC	3	9	62876	62884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832533
1552	NC_021908	TC	4	8	62953	62960	0 %	50 %	0 %	50 %	528832534
1553	NC_021908	GCC	2	6	63048	63053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832534
1554	NC_021908	CGC	2	6	63074	63079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832534
1555	NC_021908	GGC	2	6	63092	63097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832534
1556	NC_021908	TGC	2	6	63145	63150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1557	NC_021908	GGCCG	2	10	63182	63191	0 %	0 %	60 %	40 %	528832534
1558	NC_021908	GCA	2	6	63220	63225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1559	NC_021908	TCG	2	6	63231	63236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1560	NC_021908	TCG	2	6	63243	63248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1561	NC_021908	GCC	2	6	63282	63287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832534
1562	NC_021908	GGC	2	6	63298	63303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832534
1563	NC_021908	CCT	2	6	63307	63312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832534
1564	NC_021908	CCGC	2	8	63375	63382	0 %	0 %	25 %	75 %	528832534
1565	NC_021908	GAT	2	6	63401	63406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832534
1566	NC_021908	CAG	2	6	63422	63427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1567	NC_021908	GAC	2	6	63431	63436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1568	NC_021908	GAAGG	2	10	63440	63449	40 %	0 %	60 %	0 %	528832534
1569	NC_021908	GTG	2	6	63465	63470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832534
1570	NC_021908	CGA	2	6	63484	63489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1571	NC_021908	CCG	2	6	63559	63564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832534
1572	NC_021908	GGCA	2	8	63610	63617	25 %	0 %	50 %	25 %	528832534
1573	NC_021908	CGT	2	6	63653	63658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1574	NC_021908	GCC	2	6	63737	63742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832534
1575	NC_021908	AAT	2	6	63751	63756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832534
1576	NC_021908	GCTT	2	8	63776	63783	0 %	50 %	25 %	25 %	528832534
1577	NC_021908	CGC	2	6	63820	63825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832534
1578	NC_021908	CCGGGC	2	12	63872	63883	0 %	0 %	50 %	50 %	528832534
1579	NC_021908	GAC	3	9	63884	63892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1580	NC_021908	GAG	2	6	63893	63898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832534
1581	NC_021908	GC	3	6	63930	63935	0 %	0 %	50 %	50 %	528832534
1582	NC_021908	AGG	2	6	64021	64026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832534
1583	NC_021908	CGCCAG	2	12	64088	64099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528832534
1584	NC_021908	CAG	3	9	64097	64105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1585	NC_021908	CGGT	2	8	64127	64134	0 %	25 %	50 %	25 %	528832534
1586	NC_021908	CAC	2	6	64190	64195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832534
1587	NC_021908	GGCG	2	8	64198	64205	0 %	0 %	75 %	25 %	528832534
1588	NC_021908	GCT	2	6	64231	64236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1589	NC_021908	TCG	2	6	64254	64259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1590	NC_021908	GATC	2	8	64303	64310	25 %	25 %	25 %	25 %	528832534
1591	NC_021908	AGC	2	6	64314	64319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1592	NC_021908	CAG	2	6	64325	64330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1593	NC_021908	GCG	2	6	64376	64381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832534
1594	NC_021908	GC	3	6	64392	64397	0 %	0 %	50 %	50 %	528832534
1595	NC_021908	GTG	2	6	64440	64445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832534
1596	NC_021908	CGG	3	9	64492	64500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832534
1597	NC_021908	GCA	2	6	64537	64542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1598	NC_021908	GAAAAT	2	12	64547	64558	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	528832534
1599	NC_021908	A	6	6	64603	64608	100 %	0 %	0 %	0 %	528832534
1600	NC_021908	GTC	2	6	64626	64631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832534
1601	NC_021908	ATTC	2	8	64632	64639	25 %	50 %	0 %	25 %	528832534
1602	NC_021908	CG	3	6	64659	64664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_021908	T	6	6	64758	64763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021908	CG	3	6	64764	64769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_021908	AGCG	2	8	64772	64779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_021908	GTCT	2	8	64794	64801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_021908	GCT	2	6	64893	64898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1608	NC_021908	GAGGTC	2	12	64927	64938	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528832535
1609	NC_021908	GGC	2	6	64974	64979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832535
1610	NC_021908	TTA	2	6	65076	65081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832535
1611	NC_021908	CCG	2	6	65141	65146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832535
1612	NC_021908	CCT	2	6	65150	65155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832535
1613	NC_021908	TCA	2	6	65190	65195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832535
1614	NC_021908	TCG	2	6	65201	65206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1615	NC_021908	GCGG	2	8	65220	65227	0 %	0 %	75 %	25 %	528832535
1616	NC_021908	CGCCGG	2	12	65342	65353	0 %	0 %	50 %	50 %	528832535
1617	NC_021908	TGA	2	6	65366	65371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832535
1618	NC_021908	GAT	2	6	65379	65384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832535
1619	NC_021908	CGA	2	6	65442	65447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1620	NC_021908	GCG	2	6	65612	65617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832535
1621	NC_021908	GCC	2	6	65650	65655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832535
1622	NC_021908	CGT	2	6	65664	65669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1623	NC_021908	CAG	2	6	65681	65686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1624	NC_021908	GGT	2	6	65697	65702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832535
1625	NC_021908	GCT	2	6	65721	65726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832535
1626	NC_021908	CGC	2	6	65745	65750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832535
1627	NC_021908	GCTGC	2	10	65767	65776	0 %	20 %	40 %	40 %	528832535
1628	NC_021908	CGA	2	6	65778	65783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832535
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1633	NC_021908	GGC	2	6	65853	65858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832535
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1635	NC_021908	GCC	2	6	65964	65969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832536
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1650	NC_021908	TGG	2	6	66478	66483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832536
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1653	NC_021908	CGA	2	6	66524	66529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832536
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1658	NC_021908	CGG	2	6	66634	66639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832536
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1665	NC_021908	GGC	3	9	67013	67021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832537
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1669	NC_021908	CCAG	2	8	67290	67297	25 %	0 %	25 %	50 %	528832537
1670	NC_021908	GCA	3	9	67446	67454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832537
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1672	NC_021908	ATG	2	6	67514	67519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832537
1673	NC_021908	GGC	2	6	67534	67539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832537
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1690	NC_021908	GGGC	2	8	68484	68491	0 %	0 %	75 %	25 %	528832539
1691	NC_021908	TGA	2	6	68492	68497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832539
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1701	NC_021908	AGC	2	6	68896	68901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1702	NC_021908	GAA	3	9	68953	68961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1703	NC_021908	TGGT	2	8	69010	69017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1731	NC_021908	GCC	2	6	70248	70253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1732	NC_021908	AATG	2	8	70438	70445	50 %	25 %	25 %	0 %	528832541
1733	NC_021908	ATC	2	6	70479	70484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832541
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1752	NC_021908	CGA	2	6	71166	71171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832542
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