MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021908	CGGC	2	8	41387	41394	0 %	0 %	50 %	50 %	528832517
1002	NC_021908	GC	3	6	41393	41398	0 %	0 %	50 %	50 %	528832517
1003	NC_021908	TCA	2	6	41419	41424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832517
1004	NC_021908	TAA	2	6	41468	41473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832517
1005	NC_021908	ACG	2	6	41479	41484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832517
1006	NC_021908	TCA	2	6	41491	41496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832517
1007	NC_021908	TCG	2	6	41547	41552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832517
1008	NC_021908	TGC	2	6	41582	41587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832517
1009	NC_021908	CTGG	2	8	41606	41613	0 %	25 %	50 %	25 %	528832517
1010	NC_021908	TGG	2	6	41635	41640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832517
1011	NC_021908	TCG	2	6	41674	41679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832517
1012	NC_021908	CTA	2	6	41681	41686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832517
1013	NC_021908	GGC	2	6	41714	41719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832517
1014	NC_021908	CAG	2	6	41766	41771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_021908	GTATC	2	10	41805	41814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1016	NC_021908	GAA	2	6	41815	41820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021908	CCG	2	6	41826	41831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_021908	TTG	2	6	41846	41851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832518
1019	NC_021908	GTT	2	6	41852	41857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832518
1020	NC_021908	CGA	2	6	41887	41892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832518
1021	NC_021908	CAC	2	6	41978	41983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832518
1022	NC_021908	GTC	2	6	42136	42141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832518
1023	NC_021908	GCC	2	6	42217	42222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832518
1024	NC_021908	GCAA	2	8	42270	42277	50 %	0 %	25 %	25 %	528832518
1025	NC_021908	GCG	2	6	42379	42384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021908	CGGC	2	8	42388	42395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_021908	GCCG	3	12	42396	42407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_021908	CGA	2	6	42459	42464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021908	TCA	2	6	42531	42536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_021908	GCC	2	6	42573	42578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_021908	GCT	2	6	42616	42621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832519
1032	NC_021908	CGC	2	6	42623	42628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832519
1033	NC_021908	CCGCG	2	10	42629	42638	0 %	0 %	40 %	60 %	528832519
1034	NC_021908	GGT	2	6	42650	42655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832519
1035	NC_021908	AGC	2	6	42717	42722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832519
1036	NC_021908	GCA	2	6	42748	42753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832519
1037	NC_021908	GC	3	6	42771	42776	0 %	0 %	50 %	50 %	528832519
1038	NC_021908	CGTG	2	8	42785	42792	0 %	25 %	50 %	25 %	528832519
1039	NC_021908	CGA	2	6	42820	42825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832519
1040	NC_021908	GCCG	2	8	42860	42867	0 %	0 %	50 %	50 %	528832519
1041	NC_021908	GAG	2	6	42870	42875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832519
1042	NC_021908	GAT	2	6	42878	42883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832519
1043	NC_021908	GA	3	6	42897	42902	50 %	0 %	50 %	0 %	528832519
1044	NC_021908	GGC	2	6	42911	42916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832519
1045	NC_021908	GCA	2	6	43036	43041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832519
1046	NC_021908	TC	3	6	43053	43058	0 %	50 %	0 %	50 %	528832519
1047	NC_021908	CGC	2	6	43146	43151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_021908	CGC	2	6	43235	43240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832520
1049	NC_021908	GAT	2	6	43299	43304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832520
1050	NC_021908	CCTT	2	8	43318	43325	0 %	50 %	0 %	50 %	528832520
1051	NC_021908	GAT	2	6	43338	43343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832520
1052	NC_021908	TGATC	2	10	43352	43361	20 %	40 %	20 %	20 %	528832520
1053	NC_021908	GCC	2	6	43476	43481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832520
1054	NC_021908	ATG	2	6	43555	43560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832520
1055	NC_021908	CTG	2	6	43587	43592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1056	NC_021908	CGT	2	6	43655	43660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1057	NC_021908	CAG	2	6	43749	43754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1058	NC_021908	GAT	2	6	43797	43802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832520
1059	NC_021908	CTC	2	6	43812	43817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832520
1060	NC_021908	GGCGT	2	10	43819	43828	0 %	20 %	60 %	20 %	528832520
1061	NC_021908	GCG	2	6	43836	43841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832520
1062	NC_021908	GTC	2	6	43881	43886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1063	NC_021908	GCT	2	6	43904	43909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1064	NC_021908	GAA	2	6	43911	43916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832520
1065	NC_021908	GAT	2	6	43919	43924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832520
1066	NC_021908	CGG	2	6	43926	43931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832520
1067	NC_021908	GCT	2	6	44018	44023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1068	NC_021908	GGC	2	6	44037	44042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832520
1069	NC_021908	CGG	2	6	44047	44052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832520
1070	NC_021908	TCA	2	6	44057	44062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832520
1071	NC_021908	ACCG	2	8	44097	44104	25 %	0 %	25 %	50 %	528832520
1072	NC_021908	ACG	2	6	44140	44145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1073	NC_021908	TCG	2	6	44161	44166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1074	NC_021908	GC	3	6	44188	44193	0 %	0 %	50 %	50 %	528832520
1075	NC_021908	AGCGC	2	10	44246	44255	20 %	0 %	40 %	40 %	528832520
1076	NC_021908	CCGG	2	8	44297	44304	0 %	0 %	50 %	50 %	528832520
1077	NC_021908	GAG	2	6	44313	44318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832520
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1081	NC_021908	TCG	2	6	44440	44445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1082	NC_021908	ATC	2	6	44458	44463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832520
1083	NC_021908	GAA	3	9	44511	44519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832520
1084	NC_021908	GCG	2	6	44544	44549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832520
1085	NC_021908	CGTC	2	8	44584	44591	0 %	25 %	25 %	50 %	528832520
1086	NC_021908	CGA	2	6	44672	44677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1087	NC_021908	CGA	2	6	44720	44725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1088	NC_021908	GGCG	2	8	44726	44733	0 %	0 %	75 %	25 %	528832520
1089	NC_021908	GTC	2	6	44739	44744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
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1092	NC_021908	CTG	2	6	44859	44864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832520
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1095	NC_021908	TGA	2	6	45047	45052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832520
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1097	NC_021908	CGA	2	6	45176	45181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
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1099	NC_021908	GAC	2	6	45267	45272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1100	NC_021908	CGA	2	6	45284	45289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
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1104	NC_021908	GGGC	2	8	45368	45375	0 %	0 %	75 %	25 %	528832520
1105	NC_021908	GCC	2	6	45399	45404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832520
1106	NC_021908	TGG	2	6	45431	45436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832520
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1108	NC_021908	GCA	2	6	45482	45487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1109	NC_021908	GCA	2	6	45518	45523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832520
1110	NC_021908	CAC	2	6	45582	45587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832520
1111	NC_021908	GAA	2	6	45651	45656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832520
1112	NC_021908	ATC	2	6	45793	45798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832520
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1115	NC_021908	TTC	2	6	45844	45849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832520
1116	NC_021908	CGGGA	2	10	45926	45935	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_021908	CCG	2	6	45968	45973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_021908	GCGA	2	8	46065	46072	25 %	0 %	50 %	25 %	528832521
1119	NC_021908	ATC	2	6	46080	46085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832521
1120	NC_021908	ATG	2	6	46092	46097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832521
1121	NC_021908	TCT	2	6	46105	46110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832521
1122	NC_021908	CGAG	2	8	46126	46133	25 %	0 %	50 %	25 %	528832521
1123	NC_021908	CGC	2	6	46270	46275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832521
1124	NC_021908	CGA	2	6	46279	46284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
1125	NC_021908	GC	3	6	46400	46405	0 %	0 %	50 %	50 %	528832521
1126	NC_021908	CAG	2	6	46478	46483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
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1132	NC_021908	CGG	3	9	46604	46612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832521
1133	NC_021908	CGA	2	6	46615	46620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
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1142	NC_021908	CGA	2	6	47020	47025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832521
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1165	NC_021908	CCT	2	6	47862	47867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832522
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1167	NC_021908	GGC	2	6	48123	48128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832522
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1183	NC_021908	GCA	3	9	48639	48647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
1184	NC_021908	CGA	2	6	48651	48656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832523
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1215	NC_021908	AAC	2	6	49832	49837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832524
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1220	NC_021908	AGGCCG	2	12	49935	49946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832524
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1222	NC_021908	TCG	2	6	49993	49998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1223	NC_021908	GGC	2	6	50038	50043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832524
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1231	NC_021908	CCAT	2	8	50230	50237	25 %	25 %	0 %	50 %	528832524
1232	NC_021908	GCA	2	6	50260	50265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1233	NC_021908	CGC	2	6	50299	50304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832524
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1235	NC_021908	TGCG	2	8	50386	50393	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
1236	NC_021908	CGGT	2	8	50430	50437	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
1237	NC_021908	GCC	2	6	50456	50461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832524
1238	NC_021908	AGATG	2	10	50473	50482	40 %	20 %	40 %	0 %	528832524
1239	NC_021908	CGA	2	6	50494	50499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832524
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1241	NC_021908	AGA	2	6	50530	50535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832524
1242	NC_021908	CGT	2	6	50551	50556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1243	NC_021908	CGGT	2	8	50562	50569	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
1244	NC_021908	ATCGAG	2	12	50588	50599	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528832524
1245	NC_021908	TGC	2	6	50605	50610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1246	NC_021908	CGA	2	6	50629	50634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832524
1247	NC_021908	GAA	2	6	50648	50653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832524
1248	NC_021908	GCG	3	9	50665	50673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832524
1249	NC_021908	ATC	2	6	50736	50741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832524
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1497	NC_021908	TGTCA	2	10	60341	60350	20 %	40 %	20 %	20 %	528832530
1498	NC_021908	GCT	2	6	60375	60380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1499	NC_021908	TCA	2	6	60450	60455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_021908	GCC	2	6	60475	60480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832531

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