MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021908	GAA	2	6	481913	481918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832930
11502	NC_021908	AAGC	2	8	481930	481937	50 %	0 %	25 %	25 %	528832930
11503	NC_021908	ATC	2	6	481989	481994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832930
11504	NC_021908	CGG	2	6	482037	482042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832930
11505	NC_021908	TCG	3	9	482046	482054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832930
11506	NC_021908	ATCG	2	8	482096	482103	25 %	25 %	25 %	25 %	528832930
11507	NC_021908	CAGC	2	8	482144	482151	25 %	0 %	25 %	50 %	528832930
11508	NC_021908	CGT	2	6	482159	482164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832930
11509	NC_021908	CCT	2	6	482179	482184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832930
11510	NC_021908	CTT	2	6	482225	482230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832930
11511	NC_021908	CG	3	6	482251	482256	0 %	0 %	50 %	50 %	528832930
11512	NC_021908	CGA	2	6	482284	482289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832930
11513	NC_021908	CGA	2	6	482320	482325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832930
11514	NC_021908	GCC	2	6	482326	482331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832930
11515	NC_021908	GAC	2	6	482378	482383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832930
11516	NC_021908	GCC	2	6	482455	482460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832930
11517	NC_021908	CGA	3	9	482503	482511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832930
11518	NC_021908	GCA	2	6	482537	482542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832930
11519	NC_021908	GGC	2	6	482621	482626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832930
11520	NC_021908	ATCC	2	8	482659	482666	25 %	25 %	0 %	50 %	528832930
11521	NC_021908	TCC	2	6	482731	482736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11522	NC_021908	CGGC	2	8	482768	482775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11523	NC_021908	GCCG	2	8	482781	482788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_021908	GCC	2	6	482816	482821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832931
11525	NC_021908	GTAG	2	8	482849	482856	25 %	25 %	50 %	0 %	528832931
11526	NC_021908	GCCGA	2	10	482900	482909	20 %	0 %	40 %	40 %	528832931
11527	NC_021908	GGCG	2	8	482920	482927	0 %	0 %	75 %	25 %	528832931
11528	NC_021908	GGC	2	6	482933	482938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832931
11529	NC_021908	CAT	2	6	482947	482952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832931
11530	NC_021908	GC	3	6	482964	482969	0 %	0 %	50 %	50 %	528832931
11531	NC_021908	GGAC	2	8	482984	482991	25 %	0 %	50 %	25 %	528832931
11532	NC_021908	CGG	2	6	483046	483051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832931
11533	NC_021908	CCG	2	6	483076	483081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832931
11534	NC_021908	TGA	2	6	483148	483153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832931
11535	NC_021908	GCA	2	6	483184	483189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832931
11536	NC_021908	CGA	2	6	483328	483333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832931
11537	NC_021908	GCCG	2	8	483446	483453	0 %	0 %	50 %	50 %	528832931
11538	NC_021908	GCC	3	9	483462	483470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832931
11539	NC_021908	GGCC	2	8	483490	483497	0 %	0 %	50 %	50 %	528832931
11540	NC_021908	TGA	2	6	483502	483507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832931
11541	NC_021908	TGTCA	2	10	483533	483542	20 %	40 %	20 %	20 %	528832931
11542	NC_021908	ATGC	2	8	483574	483581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11543	NC_021908	TC	3	6	483642	483647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11544	NC_021908	GCCTC	2	10	483682	483691	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11545	NC_021908	CTG	2	6	483696	483701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_021908	TTTTCC	2	12	483773	483784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_021908	AGG	2	6	483821	483826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_021908	CGA	2	6	483840	483845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832932
11549	NC_021908	GCT	2	6	483897	483902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832932
11550	NC_021908	ACGCC	2	10	484100	484109	20 %	0 %	20 %	60 %	528832932
11551	NC_021908	ATC	2	6	484148	484153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832932
11552	NC_021908	GCC	2	6	484174	484179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832932
11553	NC_021908	CAG	2	6	484192	484197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832932
11554	NC_021908	CGA	2	6	484293	484298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832932
11555	NC_021908	GAT	3	9	484308	484316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832932
11556	NC_021908	GC	3	6	484327	484332	0 %	0 %	50 %	50 %	528832932
11557	NC_021908	GAT	2	6	484404	484409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832932
11558	NC_021908	CGC	2	6	484479	484484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832932
11559	NC_021908	AGA	2	6	484559	484564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832932
11560	NC_021908	CCG	2	6	484565	484570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832932
11561	NC_021908	GCT	2	6	484581	484586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832932
11562	NC_021908	GTC	2	6	484600	484605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832932
11563	NC_021908	GAG	2	6	484626	484631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_021908	AAT	2	6	484650	484655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_021908	GGA	3	9	484694	484702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_021908	CAT	2	6	484730	484735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832933
11567	NC_021908	GGCGC	2	10	484820	484829	0 %	0 %	60 %	40 %	528832933
11568	NC_021908	ACG	2	6	484839	484844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832933
11569	NC_021908	GACC	2	8	484892	484899	25 %	0 %	25 %	50 %	528832933
11570	NC_021908	CT	3	6	484907	484912	0 %	50 %	0 %	50 %	528832933
11571	NC_021908	GAG	2	6	484965	484970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832933
11572	NC_021908	GCC	2	6	484980	484985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832933
11573	NC_021908	CCG	2	6	485027	485032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832933
11574	NC_021908	TGC	2	6	485035	485040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832933
11575	NC_021908	ACA	2	6	485083	485088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832933
11576	NC_021908	CGG	2	6	485099	485104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832933
11577	NC_021908	GGCC	2	8	485144	485151	0 %	0 %	50 %	50 %	528832933
11578	NC_021908	GCG	2	6	485206	485211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832933
11579	NC_021908	CGCC	2	8	485267	485274	0 %	0 %	25 %	75 %	528832933
11580	NC_021908	CGT	2	6	485303	485308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832933
11581	NC_021908	GTC	2	6	485394	485399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832933
11582	NC_021908	CGG	3	9	485429	485437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832933
11583	NC_021908	GCA	2	6	485479	485484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832933
11584	NC_021908	GCT	2	6	485504	485509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832933
11585	NC_021908	CCG	2	6	485583	485588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11586	NC_021908	GAT	2	6	485619	485624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_021908	C	6	6	485628	485633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11588	NC_021908	T	6	6	485654	485659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_021908	GCT	3	9	485660	485668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_021908	GAC	2	6	485699	485704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_021908	TG	3	6	485729	485734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_021908	CGTGTC	2	12	485777	485788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_021908	AGG	2	6	485792	485797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_021908	AGA	2	6	485811	485816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832934
11595	NC_021908	CGCA	2	8	485819	485826	25 %	0 %	25 %	50 %	528832934
11596	NC_021908	CTG	2	6	485866	485871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832934
11597	NC_021908	CAG	2	6	485920	485925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832934
11598	NC_021908	GC	3	6	485987	485992	0 %	0 %	50 %	50 %	528832934
11599	NC_021908	GAC	2	6	486019	486024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832934
11600	NC_021908	CG	3	6	486083	486088	0 %	0 %	50 %	50 %	528832934
11601	NC_021908	GCG	2	6	486106	486111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832934
11602	NC_021908	TTC	2	6	486112	486117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832934
11603	NC_021908	AAG	2	6	486142	486147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832934
11604	NC_021908	ACGG	2	8	486236	486243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11605	NC_021908	CGAT	2	8	486259	486266	25 %	25 %	25 %	25 %	528832935
11606	NC_021908	TGC	2	6	486311	486316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832935
11607	NC_021908	GAC	2	6	486378	486383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832935
11608	NC_021908	GCA	2	6	486386	486391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832935
11609	NC_021908	CCT	3	9	486440	486448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832935
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11611	NC_021908	CAC	2	6	486556	486561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11612	NC_021908	CAT	2	6	486564	486569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_021908	TCG	2	6	486686	486691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832936
11614	NC_021908	CG	3	6	486716	486721	0 %	0 %	50 %	50 %	528832936
11615	NC_021908	TTGCGT	2	12	486725	486736	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	528832936
11616	NC_021908	GCG	2	6	486758	486763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832936
11617	NC_021908	AGG	2	6	486764	486769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832936
11618	NC_021908	CGCGG	2	10	486774	486783	0 %	0 %	60 %	40 %	528832936
11619	NC_021908	TCG	2	6	486800	486805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832936
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11621	NC_021908	CGC	2	6	486888	486893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832936
11622	NC_021908	ATCG	2	8	486907	486914	25 %	25 %	25 %	25 %	528832936
11623	NC_021908	CAGC	2	8	486949	486956	25 %	0 %	25 %	50 %	528832936
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