MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021908	CG	3	6	22348	22353	0 %	0 %	50 %	50 %	528832502
502	NC_021908	GCT	2	6	22484	22489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832502
503	NC_021908	GCC	2	6	22578	22583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832502
504	NC_021908	CTG	3	9	22587	22595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832502
505	NC_021908	CGC	3	9	22643	22651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832502
506	NC_021908	C	6	6	22663	22668	0 %	0 %	0 %	100 %	528832502
507	NC_021908	GCG	2	6	22716	22721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832502
508	NC_021908	GCC	2	6	22731	22736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832502
509	NC_021908	TCGG	2	8	22743	22750	0 %	25 %	50 %	25 %	528832502
510	NC_021908	CGG	2	6	22757	22762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832502
511	NC_021908	TCG	2	6	22765	22770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832502
512	NC_021908	GCA	2	6	22807	22812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832502
513	NC_021908	TTC	2	6	22827	22832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832502
514	NC_021908	GCC	2	6	22836	22841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832502
515	NC_021908	CGGC	2	8	22849	22856	0 %	0 %	50 %	50 %	528832502
516	NC_021908	TCT	2	6	22867	22872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832502
517	NC_021908	GCG	2	6	22905	22910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832502
518	NC_021908	TGG	2	6	23040	23045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832503
519	NC_021908	TGCG	2	8	23123	23130	0 %	25 %	50 %	25 %	528832503
520	NC_021908	CGA	2	6	23148	23153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832503
521	NC_021908	GAT	2	6	23233	23238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832503
522	NC_021908	ATC	2	6	23258	23263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832503
523	NC_021908	GGCC	2	8	23274	23281	0 %	0 %	50 %	50 %	528832503
524	NC_021908	GGA	2	6	23401	23406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832503
525	NC_021908	CCG	2	6	23425	23430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832503
526	NC_021908	CGA	2	6	23442	23447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832503
527	NC_021908	CGC	2	6	23457	23462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832503
528	NC_021908	GC	3	6	23461	23466	0 %	0 %	50 %	50 %	528832503
529	NC_021908	ATCC	2	8	23488	23495	25 %	25 %	0 %	50 %	528832503
530	NC_021908	GCC	2	6	23506	23511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832503
531	NC_021908	CGGT	2	8	23573	23580	0 %	25 %	50 %	25 %	528832503
532	NC_021908	GAT	2	6	23596	23601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832503
533	NC_021908	CGA	2	6	23610	23615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832503
534	NC_021908	GGC	2	6	23616	23621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832503
535	NC_021908	GC	3	6	23620	23625	0 %	0 %	50 %	50 %	528832503
536	NC_021908	TCA	2	6	23660	23665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832503
537	NC_021908	GGGCA	2	10	23666	23675	20 %	0 %	60 %	20 %	528832503
538	NC_021908	GAA	2	6	23737	23742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832503
539	NC_021908	GTC	2	6	23743	23748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832503
540	NC_021908	CTC	2	6	23851	23856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832503
541	NC_021908	GGC	3	9	23857	23865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832503
542	NC_021908	CCG	2	6	23872	23877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832503
543	NC_021908	TCC	2	6	23989	23994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_021908	CTT	2	6	24017	24022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021908	GGTA	2	8	24068	24075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021908	CGG	2	6	24080	24085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021908	GAC	2	6	24100	24105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021908	CGGT	2	8	24158	24165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_021908	GCT	2	6	24167	24172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021908	CGC	2	6	24263	24268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_021908	A	6	6	24271	24276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021908	GCC	2	6	24318	24323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832504
553	NC_021908	CGC	2	6	24440	24445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832504
554	NC_021908	GCC	2	6	24453	24458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832504
555	NC_021908	CGC	2	6	24476	24481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832504
556	NC_021908	GAT	2	6	24486	24491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832504
557	NC_021908	CCGG	2	8	24492	24499	0 %	0 %	50 %	50 %	528832504
558	NC_021908	TGA	2	6	24511	24516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832504
559	NC_021908	CG	3	6	24523	24528	0 %	0 %	50 %	50 %	528832504
560	NC_021908	CAA	2	6	24551	24556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832504
561	NC_021908	GCC	2	6	24559	24564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832504
562	NC_021908	GCT	2	6	24576	24581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832504
563	NC_021908	ATT	2	6	24583	24588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832504
564	NC_021908	AGG	2	6	24629	24634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021908	GCA	2	6	24643	24648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_021908	GTTC	2	8	24657	24664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_021908	CGT	2	6	24729	24734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832505
568	NC_021908	TCG	2	6	24760	24765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832505
569	NC_021908	TTC	2	6	24811	24816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832505
570	NC_021908	CGC	2	6	24833	24838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832505
571	NC_021908	GAT	2	6	24843	24848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832505
572	NC_021908	GCA	2	6	24860	24865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
573	NC_021908	ATG	2	6	24868	24873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832505
574	NC_021908	TCG	2	6	24890	24895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832505
575	NC_021908	AGC	2	6	24934	24939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
576	NC_021908	TCG	2	6	24997	25002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832505
577	NC_021908	CCA	2	6	25025	25030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832505
578	NC_021908	GCTGGC	2	12	25052	25063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528832505
579	NC_021908	GCC	2	6	25077	25082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832505
580	NC_021908	ATG	2	6	25123	25128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832505
581	NC_021908	CGC	2	6	25152	25157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832505
582	NC_021908	CG	3	6	25172	25177	0 %	0 %	50 %	50 %	528832505
583	NC_021908	GCA	2	6	25241	25246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
584	NC_021908	GC	3	6	25259	25264	0 %	0 %	50 %	50 %	528832505
585	NC_021908	GCAC	2	8	25285	25292	25 %	0 %	25 %	50 %	528832505
586	NC_021908	GCC	2	6	25299	25304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832505
587	NC_021908	CTG	2	6	25320	25325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832505
588	NC_021908	CGT	2	6	25328	25333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832505
589	NC_021908	CG	3	6	25499	25504	0 %	0 %	50 %	50 %	528832505
590	NC_021908	GC	3	6	25585	25590	0 %	0 %	50 %	50 %	528832505
591	NC_021908	GAA	2	6	25632	25637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832505
592	NC_021908	CGA	2	6	25661	25666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
593	NC_021908	GCC	2	6	25704	25709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832505
594	NC_021908	GAC	2	6	25710	25715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
595	NC_021908	CGA	2	6	25751	25756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
596	NC_021908	CGC	2	6	25782	25787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832505
597	NC_021908	GTC	2	6	25821	25826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832505
598	NC_021908	CCTG	2	8	25847	25854	0 %	25 %	25 %	50 %	528832505
599	NC_021908	GC	3	6	25870	25875	0 %	0 %	50 %	50 %	528832505
600	NC_021908	GCA	2	6	25991	25996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
601	NC_021908	CAG	2	6	26007	26012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
602	NC_021908	AGC	2	6	26059	26064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
603	NC_021908	CCGA	2	8	26074	26081	25 %	0 %	25 %	50 %	528832505
604	NC_021908	GA	3	6	26080	26085	50 %	0 %	50 %	0 %	528832505
605	NC_021908	GCC	2	6	26144	26149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832505
606	NC_021908	GATGGC	2	12	26289	26300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528832505
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608	NC_021908	GCC	2	6	26337	26342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832505
609	NC_021908	GAT	2	6	26373	26378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832505
610	NC_021908	TCG	2	6	26399	26404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832505
611	NC_021908	CGA	2	6	26420	26425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832505
612	NC_021908	TCC	2	6	26512	26517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832505
613	NC_021908	CGATG	2	10	26519	26528	20 %	20 %	40 %	20 %	528832505
614	NC_021908	CGG	2	6	26547	26552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832505
615	NC_021908	GCG	2	6	26553	26558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832505
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617	NC_021908	TCC	2	6	26613	26618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_021908	TGG	2	6	26635	26640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021908	CG	3	6	26643	26648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_021908	TC	3	6	26778	26783	0 %	50 %	0 %	50 %	528832506
621	NC_021908	GC	3	6	26806	26811	0 %	0 %	50 %	50 %	528832506
622	NC_021908	TCG	2	6	26820	26825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832506
623	NC_021908	CCG	2	6	26865	26870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832506
624	NC_021908	CGA	2	6	26902	26907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832506
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626	NC_021908	GCAT	2	8	26940	26947	25 %	25 %	25 %	25 %	528832506
627	NC_021908	CGA	2	6	26968	26973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832506
628	NC_021908	CGG	2	6	26989	26994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832506
629	NC_021908	GCG	2	6	26999	27004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832506
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632	NC_021908	CCG	2	6	27046	27051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832506
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756	NC_021908	TGA	2	6	32308	32313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832510
757	NC_021908	ATC	2	6	32315	32320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832510
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759	NC_021908	CG	4	8	32392	32399	0 %	0 %	50 %	50 %	528832510
760	NC_021908	CGT	2	6	32464	32469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832510
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763	NC_021908	CAA	2	6	32644	32649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832510
764	NC_021908	CTG	2	6	32651	32656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832510
765	NC_021908	TC	3	6	32707	32712	0 %	50 %	0 %	50 %	528832510
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777	NC_021908	GGA	2	6	33022	33027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832510
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780	NC_021908	TTC	2	6	33140	33145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832510
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787	NC_021908	GAC	2	6	33371	33376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832510
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793	NC_021908	GGC	2	6	33709	33714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
794	NC_021908	TCG	2	6	33752	33757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832511
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821	NC_021908	AGT	2	6	34911	34916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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845	NC_021908	GCG	2	6	35763	35768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
846	NC_021908	GCC	3	9	35771	35779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
847	NC_021908	TCA	2	6	35789	35794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832513
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873	NC_021908	CGG	2	6	36639	36644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832514
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881	NC_021908	CGG	2	6	36938	36943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832515
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972	NC_021908	TGA	3	9	40321	40329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
973	NC_021908	GAG	2	6	40412	40417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_021908	CAT	2	6	41354	41359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832517

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