MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021908	GTC	2	6	380895	380900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832837
9002	NC_021908	CG	3	6	380932	380937	0 %	0 %	50 %	50 %	528832837
9003	NC_021908	AGC	2	6	381007	381012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832837
9004	NC_021908	GCT	2	6	381032	381037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832837
9005	NC_021908	CAA	2	6	381044	381049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832837
9006	NC_021908	CGG	2	6	381052	381057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832837
9007	NC_021908	ATC	2	6	381060	381065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832837
9008	NC_021908	GGC	2	6	381210	381215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832837
9009	NC_021908	GTGCCG	2	12	381249	381260	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528832837
9010	NC_021908	TCGAT	2	10	381310	381319	20 %	40 %	20 %	20 %	528832837
9011	NC_021908	GAAG	2	8	381413	381420	50 %	0 %	50 %	0 %	528832837
9012	NC_021908	GCC	3	9	381486	381494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832837
9013	NC_021908	GCA	2	6	381499	381504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832837
9014	NC_021908	GCG	2	6	381606	381611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832837
9015	NC_021908	GCC	3	9	381612	381620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832837
9016	NC_021908	AAG	2	6	381621	381626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832837
9017	NC_021908	GCC	2	6	381664	381669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832837
9018	NC_021908	GCC	2	6	381702	381707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832837
9019	NC_021908	GGT	2	6	381746	381751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832837
9020	NC_021908	GCTC	2	8	381847	381854	0 %	25 %	25 %	50 %	528832837
9021	NC_021908	TGG	2	6	381873	381878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832837
9022	NC_021908	GAA	2	6	381932	381937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832837
9023	NC_021908	AAG	2	6	382089	382094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832837
9024	NC_021908	CGC	2	6	382102	382107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9025	NC_021908	TGA	2	6	382175	382180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832838
9026	NC_021908	TCC	2	6	382190	382195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832838
9027	NC_021908	TCG	2	6	382214	382219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9028	NC_021908	TCG	2	6	382229	382234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9029	NC_021908	GCC	2	6	382279	382284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832838
9030	NC_021908	CGC	2	6	382307	382312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832838
9031	NC_021908	TAT	2	6	382375	382380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832838
9032	NC_021908	GCT	2	6	382389	382394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9033	NC_021908	GCT	2	6	382446	382451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9034	NC_021908	GCCGA	2	10	382459	382468	20 %	0 %	40 %	40 %	528832838
9035	NC_021908	CTT	2	6	382470	382475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832838
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9037	NC_021908	GGC	2	6	382566	382571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832838
9038	NC_021908	ACG	2	6	382573	382578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832838
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9040	NC_021908	TTC	2	6	382636	382641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832838
9041	NC_021908	GCCGG	2	10	382678	382687	0 %	0 %	60 %	40 %	528832838
9042	NC_021908	GTAT	2	8	382706	382713	25 %	50 %	25 %	0 %	528832838
9043	NC_021908	GAT	2	6	382804	382809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832838
9044	NC_021908	GC	4	8	382822	382829	0 %	0 %	50 %	50 %	528832838
9045	NC_021908	GAA	2	6	382872	382877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832838
9046	NC_021908	CGG	3	9	382913	382921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832838
9047	NC_021908	CGT	2	6	382938	382943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9048	NC_021908	TCG	2	6	382982	382987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9049	NC_021908	TGC	2	6	382997	383002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9050	NC_021908	GCT	2	6	383031	383036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9051	NC_021908	CGC	2	6	383043	383048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832838
9052	NC_021908	CTG	2	6	383089	383094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832838
9053	NC_021908	GA	4	8	383145	383152	50 %	0 %	50 %	0 %	528832839
9054	NC_021908	GCA	2	6	383155	383160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832839
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9056	NC_021908	GCC	2	6	383170	383175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832839
9057	NC_021908	CTG	2	6	383205	383210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832839
9058	NC_021908	TGC	2	6	383227	383232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832839
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9062	NC_021908	CGA	2	6	383330	383335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832839
9063	NC_021908	TCT	2	6	383350	383355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832839
9064	NC_021908	GCCG	2	8	383370	383377	0 %	0 %	50 %	50 %	528832839
9065	NC_021908	GCT	2	6	383384	383389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832839
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9068	NC_021908	CGATG	2	10	383492	383501	20 %	20 %	40 %	20 %	528832839
9069	NC_021908	CTG	2	6	383520	383525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832839
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9073	NC_021908	GGC	2	6	383660	383665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832839
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9081	NC_021908	AT	3	6	383858	383863	50 %	50 %	0 %	0 %	528832839
9082	NC_021908	TC	3	6	383909	383914	0 %	50 %	0 %	50 %	528832839
9083	NC_021908	GA	3	6	383948	383953	50 %	0 %	50 %	0 %	528832839
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9085	NC_021908	CGC	2	6	384073	384078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832840
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9090	NC_021908	CG	3	6	384213	384218	0 %	0 %	50 %	50 %	528832840
9091	NC_021908	TGCA	2	8	384234	384241	25 %	25 %	25 %	25 %	528832840
9092	NC_021908	CGA	2	6	384268	384273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832840
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9101	NC_021908	TCG	2	6	384534	384539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832840
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9108	NC_021908	CCT	2	6	384836	384841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832841
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9110	NC_021908	GAA	2	6	384930	384935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832841
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9112	NC_021908	CGG	2	6	385005	385010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832841
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9225	NC_021908	GA	3	6	389126	389131	50 %	0 %	50 %	0 %	528832844
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9240	NC_021908	GCGCT	2	10	389623	389632	0 %	20 %	40 %	40 %	528832845
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9244	NC_021908	TCG	2	6	389759	389764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832845
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9255	NC_021908	TCG	2	6	390035	390040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832845
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9262	NC_021908	ACTG	2	8	390247	390254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9263	NC_021908	CGAA	2	8	390276	390283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9264	NC_021908	GGC	2	6	390373	390378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9357	NC_021908	GC	3	6	394102	394107	0 %	0 %	50 %	50 %	528832848
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9484	NC_021908	CCGG	2	8	399860	399867	0 %	0 %	50 %	50 %	528832853
9485	NC_021908	GAG	2	6	399873	399878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832853
9486	NC_021908	TGC	2	6	399950	399955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832853
9487	NC_021908	CAA	2	6	400025	400030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832853
9488	NC_021908	TGC	2	6	400075	400080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832853
9489	NC_021908	GTGA	2	8	400140	400147	25 %	25 %	50 %	0 %	528832853
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9491	NC_021908	GC	3	6	400195	400200	0 %	0 %	50 %	50 %	528832853
9492	NC_021908	CATC	2	8	400241	400248	25 %	25 %	0 %	50 %	528832853
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9495	NC_021908	GAC	2	6	400515	400520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832853
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9497	NC_021908	ATC	2	6	400570	400575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832853
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9499	NC_021908	CCTC	2	8	400726	400733	0 %	25 %	0 %	75 %	528832854
9500	NC_021908	GCC	2	6	400759	400764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832854

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