MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021908	CAT	3	9	255167	255175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832706
6002	NC_021908	GGC	2	6	255179	255184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832706
6003	NC_021908	GAC	3	9	255200	255208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832706
6004	NC_021908	TGG	2	6	255210	255215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832706
6005	NC_021908	ATC	2	6	255216	255221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832706
6006	NC_021908	TCA	2	6	255229	255234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832706
6007	NC_021908	CGG	2	6	255265	255270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832706
6008	NC_021908	CAG	2	6	255281	255286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832706
6009	NC_021908	GGA	2	6	255319	255324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832706
6010	NC_021908	CAG	2	6	255359	255364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832706
6011	NC_021908	AAGGG	2	10	255426	255435	40 %	0 %	60 %	0 %	528832706
6012	NC_021908	AGC	2	6	255438	255443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832706
6013	NC_021908	CAC	2	6	255449	255454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832706
6014	NC_021908	GCGA	2	8	255483	255490	25 %	0 %	50 %	25 %	528832706
6015	NC_021908	GCC	2	6	255629	255634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832706
6016	NC_021908	GAT	2	6	255695	255700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832706
6017	NC_021908	CTG	2	6	255701	255706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832706
6018	NC_021908	CAG	2	6	255778	255783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832707
6019	NC_021908	CGA	2	6	255837	255842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832707
6020	NC_021908	CAGC	2	8	255847	255854	25 %	0 %	25 %	50 %	528832707
6021	NC_021908	AGC	2	6	255860	255865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832707
6022	NC_021908	CGA	2	6	255881	255886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832707
6023	NC_021908	ACC	2	6	255930	255935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832707
6024	NC_021908	AGC	2	6	255968	255973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832707
6025	NC_021908	CGA	3	9	256011	256019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832707
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6027	NC_021908	AGG	3	9	256049	256057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832707
6028	NC_021908	TCG	2	6	256092	256097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832707
6029	NC_021908	CAG	2	6	256135	256140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832707
6030	NC_021908	TCG	2	6	256182	256187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832708
6031	NC_021908	CGG	2	6	256294	256299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832708
6032	NC_021908	TGC	2	6	256305	256310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832708
6033	NC_021908	ATC	2	6	256341	256346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832708
6034	NC_021908	GGGT	2	8	256401	256408	0 %	25 %	75 %	0 %	528832708
6035	NC_021908	GGC	2	6	256465	256470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_021908	CGA	2	6	256483	256488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_021908	ATG	2	6	256508	256513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832709
6038	NC_021908	GGAAG	2	10	256537	256546	40 %	0 %	60 %	0 %	528832709
6039	NC_021908	TCG	2	6	256548	256553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832709
6040	NC_021908	CGCC	2	8	256561	256568	0 %	0 %	25 %	75 %	528832709
6041	NC_021908	TCA	2	6	256621	256626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832709
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6043	NC_021908	GAAG	2	8	256647	256654	50 %	0 %	50 %	0 %	528832709
6044	NC_021908	CCA	2	6	256693	256698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832709
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6046	NC_021908	CAG	2	6	256772	256777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832709
6047	NC_021908	ATG	2	6	256823	256828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832709
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6049	NC_021908	TGA	2	6	256854	256859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832709
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6051	NC_021908	CGC	2	6	256894	256899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832709
6052	NC_021908	CGT	2	6	256900	256905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832709
6053	NC_021908	TGG	2	6	256915	256920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832709
6054	NC_021908	TTC	2	6	256995	257000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832709
6055	NC_021908	CGA	2	6	257065	257070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832709
6056	NC_021908	TCG	2	6	257073	257078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832709
6057	NC_021908	GAC	2	6	257153	257158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832709
6058	NC_021908	GAT	2	6	257213	257218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832709
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6060	NC_021908	GC	3	6	257254	257259	0 %	0 %	50 %	50 %	528832709
6061	NC_021908	GCGCT	2	10	257320	257329	0 %	20 %	40 %	40 %	528832709
6062	NC_021908	ACCC	2	8	257342	257349	25 %	0 %	0 %	75 %	528832709
6063	NC_021908	CGA	2	6	257389	257394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832709
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6065	NC_021908	CGA	2	6	257470	257475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832709
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6067	NC_021908	GAT	2	6	257489	257494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832709
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6072	NC_021908	CGA	2	6	257668	257673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832709
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6074	NC_021908	CGA	2	6	257761	257766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832709
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6077	NC_021908	CGG	2	6	257986	257991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6079	NC_021908	TCC	2	6	258054	258059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_021908	GCT	2	6	258091	258096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6085	NC_021908	CGAAC	2	10	258355	258364	40 %	0 %	20 %	40 %	528832710
6086	NC_021908	TCG	2	6	258402	258407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832710
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6088	NC_021908	CACC	2	8	258485	258492	25 %	0 %	0 %	75 %	528832710
6089	NC_021908	TGG	2	6	258510	258515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832710
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6091	NC_021908	GATGGC	2	12	258577	258588	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528832710
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6093	NC_021908	CGAT	2	8	258642	258649	25 %	25 %	25 %	25 %	528832710
6094	NC_021908	AGC	2	6	258656	258661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832710
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6096	NC_021908	GCAACG	2	12	258758	258769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832710
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6100	NC_021908	ACCA	2	8	258874	258881	50 %	0 %	0 %	50 %	528832710
6101	NC_021908	TCAG	2	8	258961	258968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_021908	GCCG	2	8	259072	259079	0 %	0 %	50 %	50 %	528832711
6103	NC_021908	CGA	2	6	259156	259161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832711
6104	NC_021908	CT	3	6	259204	259209	0 %	50 %	0 %	50 %	528832711
6105	NC_021908	GCG	2	6	259234	259239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832711
6106	NC_021908	GCC	2	6	259244	259249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832711
6107	NC_021908	CG	3	6	259276	259281	0 %	0 %	50 %	50 %	528832711
6108	NC_021908	GAAC	2	8	259393	259400	50 %	0 %	25 %	25 %	528832711
6109	NC_021908	CGCC	2	8	259408	259415	0 %	0 %	25 %	75 %	528832711
6110	NC_021908	TC	3	6	259489	259494	0 %	50 %	0 %	50 %	528832711
6111	NC_021908	GAA	2	6	259499	259504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832711
6112	NC_021908	ACTG	2	8	259516	259523	25 %	25 %	25 %	25 %	528832711
6113	NC_021908	GC	3	6	259606	259611	0 %	0 %	50 %	50 %	528832711
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6118	NC_021908	GAA	2	6	259844	259849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832711
6119	NC_021908	GGC	2	6	259850	259855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832711
6120	NC_021908	CCT	2	6	259880	259885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832712
6121	NC_021908	CG	3	6	259963	259968	0 %	0 %	50 %	50 %	528832712
6122	NC_021908	GCCA	2	8	260064	260071	25 %	0 %	25 %	50 %	528832712
6123	NC_021908	AGC	2	6	260116	260121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832712
6124	NC_021908	GCGCAG	2	12	260140	260151	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832712
6125	NC_021908	TGG	2	6	260206	260211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832712
6126	NC_021908	CGAAA	2	10	260239	260248	60 %	0 %	20 %	20 %	528832712
6127	NC_021908	CCT	2	6	260300	260305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832712
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6129	NC_021908	TCC	2	6	260434	260439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832712
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6134	NC_021908	GAC	2	6	260676	260681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832712
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6142	NC_021908	CAG	2	6	260961	260966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832712
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6144	NC_021908	AAT	2	6	261051	261056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832712
6145	NC_021908	TCA	2	6	261083	261088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832712
6146	NC_021908	GTA	2	6	261126	261131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832712
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6149	NC_021908	TCTG	2	8	261164	261171	0 %	50 %	25 %	25 %	528832712
6150	NC_021908	GC	3	6	261345	261350	0 %	0 %	50 %	50 %	528832712
6151	NC_021908	GAA	2	6	261379	261384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_021908	T	6	6	261430	261435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_021908	CGA	2	6	261485	261490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832713
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6155	NC_021908	TTC	2	6	261527	261532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832713
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6157	NC_021908	TCA	2	6	261619	261624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832713
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6159	NC_021908	CAT	2	6	261699	261704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832713
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6165	NC_021908	GTC	2	6	262059	262064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6167	NC_021908	CTGC	2	8	262132	262139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6195	NC_021908	TTAG	2	8	263234	263241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6198	NC_021908	GGT	2	6	263352	263357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6222	NC_021908	CTGC	2	8	264433	264440	0 %	25 %	25 %	50 %	528832717
6223	NC_021908	CCCG	2	8	264454	264461	0 %	0 %	25 %	75 %	528832717
6224	NC_021908	CGT	2	6	264489	264494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832717
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6231	NC_021908	GCAGC	2	10	264713	264722	20 %	0 %	40 %	40 %	528832717
6232	NC_021908	TGGA	2	8	264757	264764	25 %	25 %	50 %	0 %	528832717
6233	NC_021908	CG	3	6	264836	264841	0 %	0 %	50 %	50 %	528832717
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6238	NC_021908	GGTGCG	2	12	265048	265059	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	528832717
6239	NC_021908	CGCC	2	8	265101	265108	0 %	0 %	25 %	75 %	528832717
6240	NC_021908	CCG	2	6	265122	265127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832717
6241	NC_021908	CAA	2	6	265146	265151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832717
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6243	NC_021908	CAG	2	6	265243	265248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832717
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6245	NC_021908	TGC	2	6	265271	265276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832717
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6254	NC_021908	ATC	2	6	265932	265937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832718
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6352	NC_021908	GGC	2	6	270307	270312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6353	NC_021908	GC	3	6	270354	270359	0 %	0 %	50 %	50 %	528832723
6354	NC_021908	GAAG	3	12	270370	270381	50 %	0 %	50 %	0 %	528832723
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6358	NC_021908	GCT	2	6	270574	270579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6361	NC_021908	CAA	2	6	270788	270793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6362	NC_021908	GAC	2	6	270858	270863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832724
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6485	NC_021908	CGC	2	6	275546	275551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6486	NC_021908	CGA	2	6	275555	275560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6487	NC_021908	GCG	2	6	275654	275659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832730
6488	NC_021908	TTCG	2	8	275686	275693	0 %	50 %	25 %	25 %	528832730
6489	NC_021908	CGT	2	6	275764	275769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832730
6490	NC_021908	TGG	3	9	275791	275799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832730
6491	NC_021908	CCG	2	6	275877	275882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832730
6492	NC_021908	ACG	2	6	275976	275981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6493	NC_021908	AGG	2	6	276076	276081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832731
6494	NC_021908	GCA	2	6	276160	276165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832731
6495	NC_021908	GTA	2	6	276203	276208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832731
6496	NC_021908	CGA	2	6	276214	276219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832731
6497	NC_021908	CGG	2	6	276220	276225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832731
6498	NC_021908	CGG	2	6	276244	276249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832731
6499	NC_021908	CGC	2	6	276258	276263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832731
6500	NC_021908	CGG	2	6	276271	276276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832731

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