MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021908	GTT	2	6	186715	186720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832645
4502	NC_021908	CAC	2	6	186790	186795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832645
4503	NC_021908	GCC	2	6	186808	186813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832645
4504	NC_021908	TCGC	2	8	186840	186847	0 %	25 %	25 %	50 %	528832645
4505	NC_021908	CG	3	6	186881	186886	0 %	0 %	50 %	50 %	528832645
4506	NC_021908	CGCC	2	8	186932	186939	0 %	0 %	25 %	75 %	528832645
4507	NC_021908	CCG	2	6	186966	186971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832645
4508	NC_021908	CGA	2	6	186975	186980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832645
4509	NC_021908	GTAG	2	8	187012	187019	25 %	25 %	50 %	0 %	528832645
4510	NC_021908	A	7	7	187036	187042	100 %	0 %	0 %	0 %	528832645
4511	NC_021908	TCG	2	6	187046	187051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832645
4512	NC_021908	TCTT	2	8	187056	187063	0 %	75 %	0 %	25 %	528832645
4513	NC_021908	CT	3	6	187066	187071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_021908	GGT	2	6	187093	187098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021908	CGC	2	6	187113	187118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_021908	GC	3	6	187175	187180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_021908	CCA	2	6	187247	187252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_021908	GGA	2	6	187255	187260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021908	ACGT	2	8	187356	187363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_021908	CCG	2	6	187544	187549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832646
4521	NC_021908	CAC	2	6	187573	187578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832646
4522	NC_021908	TCC	2	6	187682	187687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832646
4523	NC_021908	CTT	2	6	187728	187733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832646
4524	NC_021908	TGA	2	6	187748	187753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832646
4525	NC_021908	ACG	2	6	187783	187788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832646
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4527	NC_021908	TCG	2	6	187865	187870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832646
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4530	NC_021908	CAG	2	6	188086	188091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832646
4531	NC_021908	CGG	2	6	188124	188129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832646
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4533	NC_021908	TCC	2	6	188263	188268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832646
4534	NC_021908	GCC	2	6	188274	188279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832646
4535	NC_021908	CCT	2	6	188289	188294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_021908	GCA	2	6	188312	188317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_021908	CCG	2	6	188352	188357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832647
4538	NC_021908	GC	3	6	188363	188368	0 %	0 %	50 %	50 %	528832647
4539	NC_021908	GCC	2	6	188395	188400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832647
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4542	NC_021908	GCC	2	6	188455	188460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832647
4543	NC_021908	GCAG	2	8	188489	188496	25 %	0 %	50 %	25 %	528832647
4544	NC_021908	CAG	2	6	188518	188523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832647
4545	NC_021908	GCA	2	6	188541	188546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832647
4546	NC_021908	CAGG	2	8	188601	188608	25 %	0 %	50 %	25 %	528832647
4547	NC_021908	GCG	2	6	188642	188647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832647
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4549	NC_021908	GAT	2	6	188737	188742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832647
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4551	NC_021908	AGC	2	6	188882	188887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832647
4552	NC_021908	GCGA	2	8	188888	188895	25 %	0 %	50 %	25 %	528832647
4553	NC_021908	CCGCGC	2	12	188908	188919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832647
4554	NC_021908	ATC	2	6	189008	189013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832647
4555	NC_021908	GGC	2	6	189097	189102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832647
4556	NC_021908	ATTG	2	8	189130	189137	25 %	50 %	25 %	0 %	528832647
4557	NC_021908	GC	3	6	189190	189195	0 %	0 %	50 %	50 %	528832647
4558	NC_021908	CGA	2	6	189207	189212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832647
4559	NC_021908	AGC	2	6	189215	189220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832647
4560	NC_021908	CCG	2	6	189233	189238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832647
4561	NC_021908	ACG	2	6	189269	189274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832647
4562	NC_021908	TCGG	2	8	189305	189312	0 %	25 %	50 %	25 %	528832647
4563	NC_021908	GTGC	2	8	189338	189345	0 %	25 %	50 %	25 %	528832647
4564	NC_021908	GGAG	2	8	189447	189454	25 %	0 %	75 %	0 %	528832647
4565	NC_021908	CGC	2	6	189456	189461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832647
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4569	NC_021908	CG	3	6	189558	189563	0 %	0 %	50 %	50 %	528832647
4570	NC_021908	CCA	2	6	189567	189572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832647
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4604	NC_021908	GCG	2	6	191040	191045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_021908	GTC	2	6	191115	191120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_021908	GCT	2	6	191206	191211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832648
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4613	NC_021908	CGATG	2	10	191568	191577	20 %	20 %	40 %	20 %	528832648
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4618	NC_021908	AGCC	2	8	191756	191763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_021908	CCGG	2	8	191937	191944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_021908	ACG	2	6	191965	191970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_021908	CG	3	6	191969	191974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_021908	CCGG	2	8	191975	191982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4624	NC_021908	CGCGC	2	10	192066	192075	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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4748	NC_021908	GCGA	2	8	197660	197667	25 %	0 %	50 %	25 %	528832656
4749	NC_021908	GGC	2	6	197674	197679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832656
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4752	NC_021908	GAC	2	6	197762	197767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832656
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4843	NC_021908	GTG	2	6	202623	202628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832660
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4858	NC_021908	GCA	2	6	203480	203485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832660
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4869	NC_021908	CGTG	2	8	204258	204265	0 %	25 %	50 %	25 %	528832661
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4990	NC_021908	GAT	2	6	210094	210099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832667
4991	NC_021908	CGG	2	6	210102	210107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832667
4992	NC_021908	ATC	2	6	210122	210127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832667
4993	NC_021908	CGTG	2	8	210159	210166	0 %	25 %	50 %	25 %	528832667
4994	NC_021908	CCT	2	6	210237	210242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832667
4995	NC_021908	AGA	2	6	210396	210401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832668
4996	NC_021908	CAGGAT	2	12	210407	210418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528832668
4997	NC_021908	GCCA	2	8	210500	210507	25 %	0 %	25 %	50 %	528832668
4998	NC_021908	CGC	2	6	210609	210614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832669
4999	NC_021908	GTTC	2	8	210627	210634	0 %	50 %	25 %	25 %	528832669
5000	NC_021908	AGCG	2	8	210654	210661	25 %	0 %	50 %	25 %	528832669

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