MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021907	GCG	2	6	150883	150888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
3502	NC_021907	GCT	2	6	150981	150986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3503	NC_021907	GCT	2	6	150999	151004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3504	NC_021907	CGG	2	6	151056	151061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
3505	NC_021907	CGC	2	6	151083	151088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831237
3506	NC_021907	GCA	2	6	151125	151130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3507	NC_021907	GCG	2	6	151143	151148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
3508	NC_021907	CAGA	2	8	151222	151229	50 %	0 %	25 %	25 %	528831237
3509	NC_021907	TCG	2	6	151271	151276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3510	NC_021907	ACG	2	6	151324	151329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3511	NC_021907	GC	3	6	151364	151369	0 %	0 %	50 %	50 %	528831237
3512	NC_021907	CCGA	2	8	151418	151425	25 %	0 %	25 %	50 %	528831237
3513	NC_021907	TCG	2	6	151442	151447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3514	NC_021907	CGC	2	6	151488	151493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831237
3515	NC_021907	GCT	2	6	151533	151538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3516	NC_021907	GCC	2	6	151603	151608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831237
3517	NC_021907	AGC	2	6	151656	151661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3518	NC_021907	CGT	2	6	151689	151694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3519	NC_021907	CGT	2	6	151737	151742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3520	NC_021907	GCG	3	9	151777	151785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
3521	NC_021907	TCG	2	6	151811	151816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3522	NC_021907	AGA	2	6	151817	151822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831237
3523	NC_021907	TCG	2	6	151850	151855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3524	NC_021907	GCGG	2	8	151900	151907	0 %	0 %	75 %	25 %	528831237
3525	NC_021907	TCG	2	6	151913	151918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3526	NC_021907	CGA	2	6	151926	151931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3527	NC_021907	CGA	2	6	151955	151960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3528	NC_021907	TGC	2	6	151974	151979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3529	NC_021907	GGCC	2	8	152023	152030	0 %	0 %	50 %	50 %	528831237
3530	NC_021907	GGA	2	6	152106	152111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831237
3531	NC_021907	TTC	2	6	152135	152140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831237
3532	NC_021907	AGG	2	6	152185	152190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831237
3533	NC_021907	ACG	2	6	152221	152226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831238
3534	NC_021907	CGG	2	6	152230	152235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831238
3535	NC_021907	GTC	2	6	152246	152251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831238
3536	NC_021907	TTC	2	6	152375	152380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831238
3537	NC_021907	GGC	2	6	152401	152406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831238
3538	NC_021907	CGG	2	6	152452	152457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831238
3539	NC_021907	CAA	2	6	152479	152484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831238
3540	NC_021907	GCG	3	9	152517	152525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831238
3541	NC_021907	ATC	2	6	152555	152560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831238
3542	NC_021907	GCC	2	6	152561	152566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831238
3543	NC_021907	GCCG	2	8	152737	152744	0 %	0 %	50 %	50 %	528831238
3544	NC_021907	GA	3	6	152756	152761	50 %	0 %	50 %	0 %	528831238
3545	NC_021907	CTG	2	6	152780	152785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831238
3546	NC_021907	GCC	2	6	152794	152799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831238
3547	NC_021907	GCA	2	6	152991	152996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021907	ATG	2	6	153015	153020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021907	CAC	2	6	153079	153084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_021907	AAG	2	6	153086	153091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021907	GCC	2	6	153154	153159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831239
3552	NC_021907	GGC	2	6	153182	153187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831239
3553	NC_021907	GCC	2	6	153237	153242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831239
3554	NC_021907	GCG	2	6	153253	153258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831239
3555	NC_021907	GCC	2	6	153288	153293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831239
3556	NC_021907	GCT	2	6	153349	153354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831239
3557	NC_021907	GCC	2	6	153393	153398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831239
3558	NC_021907	GAC	2	6	153504	153509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831239
3559	NC_021907	GTC	2	6	153510	153515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831239
3560	NC_021907	GC	3	6	153556	153561	0 %	0 %	50 %	50 %	528831239
3561	NC_021907	CGG	2	6	153599	153604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831239
3562	NC_021907	GCT	3	9	153647	153655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831239
3563	NC_021907	CGG	2	6	153686	153691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831239
3564	NC_021907	CGA	2	6	153695	153700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831239
3565	NC_021907	GAA	2	6	153773	153778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831239
3566	NC_021907	GAC	2	6	153783	153788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831239
3567	NC_021907	TCGAT	2	10	153811	153820	20 %	40 %	20 %	20 %	528831239
3568	NC_021907	ATC	2	6	153825	153830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831239
3569	NC_021907	CCGC	2	8	153847	153854	0 %	0 %	25 %	75 %	528831239
3570	NC_021907	CGC	2	6	153857	153862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831239
3571	NC_021907	CCG	2	6	153955	153960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831239
3572	NC_021907	ACA	2	6	154009	154014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831239
3573	NC_021907	AGA	2	6	154066	154071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831239
3574	NC_021907	CGG	2	6	154076	154081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831239
3575	NC_021907	AGC	2	6	154147	154152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831239
3576	NC_021907	AAG	2	6	154188	154193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831239
3577	NC_021907	GCC	2	6	154257	154262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831239
3578	NC_021907	GATCGA	2	12	154295	154306	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528831239
3579	NC_021907	GGC	2	6	154380	154385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831239
3580	NC_021907	TC	3	6	154421	154426	0 %	50 %	0 %	50 %	528831239
3581	NC_021907	CGG	2	6	154429	154434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831239
3582	NC_021907	TGA	2	6	154502	154507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831239
3583	NC_021907	GCA	2	6	154531	154536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831239
3584	NC_021907	GAT	2	6	154541	154546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831239
3585	NC_021907	GGC	2	6	154560	154565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831239
3586	NC_021907	CTGG	2	8	154676	154683	0 %	25 %	50 %	25 %	528831239
3587	NC_021907	CGA	2	6	154722	154727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_021907	GAA	2	6	154742	154747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021907	TCC	2	6	154757	154762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_021907	TTGC	2	8	154849	154856	0 %	50 %	25 %	25 %	528831240
3591	NC_021907	ATT	2	6	154885	154890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831240
3592	NC_021907	CGG	2	6	154920	154925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831240
3593	NC_021907	CCA	2	6	154952	154957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831240
3594	NC_021907	CGC	2	6	154979	154984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831240
3595	NC_021907	GAGC	2	8	155109	155116	25 %	0 %	50 %	25 %	528831240
3596	NC_021907	ATC	2	6	155239	155244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831240
3597	NC_021907	TTC	2	6	155281	155286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831240
3598	NC_021907	CTG	2	6	155296	155301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831240
3599	NC_021907	CTT	2	6	155307	155312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831240
3600	NC_021907	TCG	2	6	155417	155422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831240
3601	NC_021907	ATG	2	6	155434	155439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831240
3602	NC_021907	GTC	2	6	155472	155477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831240
3603	NC_021907	CCG	2	6	155492	155497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831240
3604	NC_021907	CG	3	6	155521	155526	0 %	0 %	50 %	50 %	528831240
3605	NC_021907	CGC	2	6	155538	155543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831240
3606	NC_021907	ATC	2	6	155563	155568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831240
3607	NC_021907	GTC	2	6	155572	155577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831240
3608	NC_021907	CGT	4	12	155607	155618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831240
3609	NC_021907	GTG	2	6	155689	155694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831240
3610	NC_021907	ATC	2	6	155761	155766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831240
3611	NC_021907	GTC	2	6	155904	155909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831241
3612	NC_021907	CGA	2	6	155930	155935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831241
3613	NC_021907	GC	4	8	155995	156002	0 %	0 %	50 %	50 %	528831241
3614	NC_021907	ACG	2	6	156003	156008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831241
3615	NC_021907	TCG	2	6	156013	156018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831241
3616	NC_021907	CCG	2	6	156022	156027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831241
3617	NC_021907	CCA	2	6	156028	156033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831241
3618	NC_021907	CAT	2	6	156053	156058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831241
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3620	NC_021907	CG	3	6	156082	156087	0 %	0 %	50 %	50 %	528831241
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3864	NC_021907	GCT	2	6	165566	165571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831249
3865	NC_021907	GCT	2	6	165587	165592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831249
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3894	NC_021907	ATT	2	6	166777	166782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3895	NC_021907	GGA	2	6	166817	166822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3897	NC_021907	GGC	2	6	166854	166859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3981	NC_021907	TGA	2	6	170400	170405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831253
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3983	NC_021907	CGA	2	6	170589	170594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831253
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3985	NC_021907	TGCCG	2	10	170687	170696	0 %	20 %	40 %	40 %	528831253
3986	NC_021907	AGC	2	6	170702	170707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831253
3987	NC_021907	TCA	2	6	170853	170858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831253
3988	NC_021907	CGG	2	6	170862	170867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831253
3989	NC_021907	CGC	2	6	170880	170885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831253
3990	NC_021907	TGC	2	6	170907	170912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831253
3991	NC_021907	GGA	2	6	171160	171165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3992	NC_021907	GAA	2	6	171177	171182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831254
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3994	NC_021907	GTC	2	6	171280	171285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831254
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3997	NC_021907	CGC	2	6	171473	171478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831254
3998	NC_021907	CGG	2	6	171491	171496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831254
3999	NC_021907	GCT	3	9	171507	171515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831254
4000	NC_021907	ACC	2	6	171517	171522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831254

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