MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021907	GAT	2	6	64496	64501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831161
1502	NC_021907	GAC	2	6	64550	64555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831161
1503	NC_021907	CT	3	6	64621	64626	0 %	50 %	0 %	50 %	528831161
1504	NC_021907	GAC	2	6	64649	64654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831161
1505	NC_021907	CCG	2	6	64741	64746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831161
1506	NC_021907	GCG	2	6	64754	64759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831161
1507	NC_021907	TTGA	2	8	64763	64770	25 %	50 %	25 %	0 %	528831161
1508	NC_021907	GC	3	6	64818	64823	0 %	0 %	50 %	50 %	528831161
1509	NC_021907	CCT	2	6	64828	64833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831161
1510	NC_021907	CGA	2	6	64840	64845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831161
1511	NC_021907	CCG	2	6	64872	64877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831161
1512	NC_021907	TCC	2	6	64881	64886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831161
1513	NC_021907	TCG	2	6	64956	64961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831161
1514	NC_021907	CGT	2	6	65006	65011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831161
1515	NC_021907	CTC	2	6	65061	65066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_021907	AT	3	6	65187	65192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021907	GAT	2	6	65209	65214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021907	CAA	2	6	65244	65249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831162
1519	NC_021907	TGC	2	6	65271	65276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831162
1520	NC_021907	CGT	2	6	65374	65379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831162
1521	NC_021907	GTT	2	6	65418	65423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831162
1522	NC_021907	GGCGA	2	10	65425	65434	20 %	0 %	60 %	20 %	528831162
1523	NC_021907	ACG	2	6	65462	65467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831162
1524	NC_021907	CCTATC	2	12	65502	65513	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	528831163
1525	NC_021907	GCA	3	9	65524	65532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831163
1526	NC_021907	TCGTG	2	10	65569	65578	0 %	40 %	40 %	20 %	528831163
1527	NC_021907	CAC	2	6	65632	65637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831163
1528	NC_021907	ATC	2	6	65726	65731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831163
1529	NC_021907	ATG	2	6	65748	65753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831163
1530	NC_021907	ATG	2	6	65819	65824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831163
1531	NC_021907	GCC	2	6	65831	65836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831163
1532	NC_021907	CCT	2	6	65906	65911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831164
1533	NC_021907	CCG	2	6	65913	65918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831164
1534	NC_021907	GAA	2	6	65961	65966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831164
1535	NC_021907	CAG	2	6	66027	66032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1536	NC_021907	CGG	2	6	66052	66057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831164
1537	NC_021907	GGC	2	6	66072	66077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831164
1538	NC_021907	TCG	2	6	66091	66096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1539	NC_021907	GGC	2	6	66121	66126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831164
1540	NC_021907	CGG	2	6	66137	66142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831164
1541	NC_021907	TGC	2	6	66147	66152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1542	NC_021907	CGG	2	6	66193	66198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831164
1543	NC_021907	CGG	3	9	66200	66208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831164
1544	NC_021907	CG	3	6	66312	66317	0 %	0 %	50 %	50 %	528831164
1545	NC_021907	GGC	2	6	66329	66334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831164
1546	NC_021907	TTGG	2	8	66338	66345	0 %	50 %	50 %	0 %	528831164
1547	NC_021907	GC	3	6	66359	66364	0 %	0 %	50 %	50 %	528831164
1548	NC_021907	GAA	2	6	66366	66371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831164
1549	NC_021907	CTTG	2	8	66389	66396	0 %	50 %	25 %	25 %	528831164
1550	NC_021907	CGA	2	6	66416	66421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1551	NC_021907	GCCG	2	8	66437	66444	0 %	0 %	50 %	50 %	528831164
1552	NC_021907	CAG	2	6	66451	66456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1553	NC_021907	ATG	2	6	66457	66462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831164
1554	NC_021907	GAT	2	6	66471	66476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831164
1555	NC_021907	GCC	2	6	66510	66515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831164
1556	NC_021907	TCG	2	6	66574	66579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1557	NC_021907	AGCGC	2	10	66596	66605	20 %	0 %	40 %	40 %	528831164
1558	NC_021907	GCA	2	6	66638	66643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1559	NC_021907	AGC	2	6	66655	66660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1560	NC_021907	GC	4	8	66684	66691	0 %	0 %	50 %	50 %	528831164
1561	NC_021907	GAA	2	6	66699	66704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831164
1562	NC_021907	TCG	2	6	66706	66711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1563	NC_021907	GCA	2	6	66721	66726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1564	NC_021907	GCCA	2	8	66730	66737	25 %	0 %	25 %	50 %	528831164
1565	NC_021907	TCG	2	6	66812	66817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831164
1566	NC_021907	GCC	2	6	66827	66832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831164
1567	NC_021907	CCT	2	6	66848	66853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831164
1568	NC_021907	CTG	2	6	66978	66983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_021907	GGA	2	6	66996	67001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021907	GGA	2	6	67018	67023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021907	CGG	3	9	67064	67072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831165
1572	NC_021907	GCG	2	6	67086	67091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831165
1573	NC_021907	GC	3	6	67095	67100	0 %	0 %	50 %	50 %	528831165
1574	NC_021907	CTC	2	6	67104	67109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831165
1575	NC_021907	GGCG	2	8	67151	67158	0 %	0 %	75 %	25 %	528831165
1576	NC_021907	AGC	2	6	67229	67234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831165
1577	NC_021907	TGGCG	2	10	67292	67301	0 %	20 %	60 %	20 %	528831165
1578	NC_021907	GCAC	2	8	67353	67360	25 %	0 %	25 %	50 %	528831165
1579	NC_021907	GCC	3	9	67404	67412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831165
1580	NC_021907	GGC	2	6	67505	67510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831165
1581	NC_021907	GCC	2	6	67515	67520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831165
1582	NC_021907	GGC	2	6	67535	67540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831165
1583	NC_021907	ATCG	2	8	67592	67599	25 %	25 %	25 %	25 %	528831165
1584	NC_021907	GAT	2	6	67622	67627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831165
1585	NC_021907	GCCG	2	8	67637	67644	0 %	0 %	50 %	50 %	528831165
1586	NC_021907	GCA	2	6	67653	67658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831165
1587	NC_021907	CCG	2	6	67680	67685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831165
1588	NC_021907	CGGC	3	12	67691	67702	0 %	0 %	50 %	50 %	528831165
1589	NC_021907	GC	4	8	67789	67796	0 %	0 %	50 %	50 %	528831165
1590	NC_021907	AGG	2	6	67812	67817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021907	ATCGTC	2	12	67840	67851	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528831166
1592	NC_021907	GGCGC	2	10	67852	67861	0 %	0 %	60 %	40 %	528831166
1593	NC_021907	AGG	2	6	67895	67900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831166
1594	NC_021907	GAG	2	6	67975	67980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831166
1595	NC_021907	TGC	2	6	67997	68002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831166
1596	NC_021907	CGG	2	6	68003	68008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1597	NC_021907	GGC	2	6	68034	68039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1598	NC_021907	CAC	2	6	68073	68078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831166
1599	NC_021907	CAA	2	6	68082	68087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831166
1600	NC_021907	ATG	2	6	68116	68121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831166
1601	NC_021907	CGC	2	6	68136	68141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831166
1602	NC_021907	GGC	2	6	68167	68172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1603	NC_021907	CGG	2	6	68217	68222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1604	NC_021907	GGA	2	6	68274	68279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831166
1605	NC_021907	GGA	2	6	68316	68321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831166
1606	NC_021907	CG	3	6	68345	68350	0 %	0 %	50 %	50 %	528831166
1607	NC_021907	CGGTCA	2	12	68435	68446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528831166
1608	NC_021907	CGA	2	6	68478	68483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831166
1609	NC_021907	GC	3	6	68711	68716	0 %	0 %	50 %	50 %	528831166
1610	NC_021907	GGC	2	6	68802	68807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1611	NC_021907	CGATCT	2	12	68814	68825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528831166
1612	NC_021907	CGG	2	6	68850	68855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1613	NC_021907	GGC	2	6	68890	68895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1614	NC_021907	GCT	2	6	68910	68915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831166
1615	NC_021907	GGC	2	6	68952	68957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1616	NC_021907	CGG	3	9	68967	68975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831166
1617	NC_021907	CAG	2	6	69048	69053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831167
1618	NC_021907	GGC	2	6	69101	69106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831167
1619	NC_021907	TGA	2	6	69137	69142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831167
1620	NC_021907	GCT	2	6	69167	69172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831167
1621	NC_021907	GGC	2	6	69198	69203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831167
1622	NC_021907	CGT	2	6	69215	69220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831167
1623	NC_021907	GAG	2	6	69240	69245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831167
1624	NC_021907	CGA	2	6	69271	69276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831167
1625	NC_021907	TG	3	6	69303	69308	0 %	50 %	50 %	0 %	528831167
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1633	NC_021907	CGAC	2	8	69637	69644	25 %	0 %	25 %	50 %	528831167
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1642	NC_021907	GGA	2	6	70203	70208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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