MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021907	GCC	2	6	22633	22638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831126
502	NC_021907	TAT	2	6	22735	22740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831126
503	NC_021907	CGC	2	6	22810	22815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831126
504	NC_021907	CGT	2	6	22827	22832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831126
505	NC_021907	CAGC	2	8	22854	22861	25 %	0 %	25 %	50 %	528831126
506	NC_021907	CGC	2	6	22896	22901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831126
507	NC_021907	TGG	2	6	22913	22918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831126
508	NC_021907	AGGC	2	8	22976	22983	25 %	0 %	50 %	25 %	528831126
509	NC_021907	CGT	2	6	22995	23000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831126
510	NC_021907	CAT	2	6	23004	23009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831126
511	NC_021907	CCT	2	6	23024	23029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831126
512	NC_021907	GGC	2	6	23034	23039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831126
513	NC_021907	CGG	2	6	23079	23084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831126
514	NC_021907	CGT	2	6	23103	23108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831126
515	NC_021907	CGG	2	6	23151	23156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831126
516	NC_021907	GCC	2	6	23200	23205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831126
517	NC_021907	CGC	2	6	23229	23234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831126
518	NC_021907	TCG	2	6	23270	23275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831126
519	NC_021907	TCG	2	6	23297	23302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831126
520	NC_021907	GCT	2	6	23304	23309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831126
521	NC_021907	GGC	2	6	23319	23324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831126
522	NC_021907	GC	3	6	23339	23344	0 %	0 %	50 %	50 %	528831126
523	NC_021907	CCA	2	6	23378	23383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831126
524	NC_021907	CAG	2	6	23389	23394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831126
525	NC_021907	GA	3	6	23416	23421	50 %	0 %	50 %	0 %	528831126
526	NC_021907	TCGA	2	8	23422	23429	25 %	25 %	25 %	25 %	528831126
527	NC_021907	GCG	2	6	23432	23437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831126
528	NC_021907	TAT	2	6	23479	23484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831126
529	NC_021907	CGA	2	6	23492	23497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831126
530	NC_021907	CGA	2	6	23508	23513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831126
531	NC_021907	TTC	2	6	23542	23547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831126
532	NC_021907	CGT	2	6	23562	23567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831126
533	NC_021907	CCGAGG	2	12	23579	23590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528831126
534	NC_021907	TGA	2	6	23669	23674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831126
535	NC_021907	CGG	2	6	23739	23744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831126
536	NC_021907	GGC	2	6	23773	23778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831126
537	NC_021907	CGA	2	6	23832	23837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831126
538	NC_021907	TGA	2	6	23858	23863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831126
539	NC_021907	GAA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831127
540	NC_021907	GTC	2	6	23933	23938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831127
541	NC_021907	GAA	2	6	23942	23947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831127
542	NC_021907	AGA	2	6	23961	23966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831127
543	NC_021907	CTT	2	6	23992	23997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831127
544	NC_021907	ATC	2	6	24023	24028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831127
545	NC_021907	GAC	2	6	24053	24058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831127
546	NC_021907	CGCGA	2	10	24059	24068	20 %	0 %	40 %	40 %	528831127
547	NC_021907	TC	3	6	24171	24176	0 %	50 %	0 %	50 %	528831127
548	NC_021907	GC	3	6	24188	24193	0 %	0 %	50 %	50 %	528831127
549	NC_021907	CGG	2	6	24268	24273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831128
550	NC_021907	TCT	2	6	24322	24327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831128
551	NC_021907	GGC	2	6	24362	24367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831128
552	NC_021907	CGT	2	6	24404	24409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831128
553	NC_021907	CGAC	2	8	24421	24428	25 %	0 %	25 %	50 %	528831128
554	NC_021907	GTC	2	6	24477	24482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831128
555	NC_021907	GCC	2	6	24501	24506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831128
556	NC_021907	ATT	2	6	24589	24594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831128
557	NC_021907	TAT	2	6	24609	24614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831128
558	NC_021907	ATGCCG	2	12	24634	24645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528831128
559	NC_021907	GCG	2	6	24744	24749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831128
560	NC_021907	TGCC	2	8	24766	24773	0 %	25 %	25 %	50 %	528831128
561	NC_021907	AAG	2	6	24810	24815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831128
562	NC_021907	TGG	2	6	24843	24848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831128
563	NC_021907	GCG	2	6	24853	24858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831128
564	NC_021907	GCA	2	6	24866	24871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831128
565	NC_021907	CCG	2	6	24883	24888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831128
566	NC_021907	GCG	2	6	24933	24938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831128
567	NC_021907	CCT	2	6	24958	24963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831128
568	NC_021907	CCG	3	9	24979	24987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831128
569	NC_021907	TCG	2	6	24994	24999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831128
570	NC_021907	GC	3	6	25009	25014	0 %	0 %	50 %	50 %	528831128
571	NC_021907	CAG	2	6	25161	25166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831128
572	NC_021907	CCT	2	6	25299	25304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_021907	GCG	2	6	25308	25313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021907	CGC	2	6	25333	25338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_021907	TCT	2	6	25473	25478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831129
576	NC_021907	CTG	3	9	25499	25507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831129
577	NC_021907	CTG	3	9	25703	25711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831129
578	NC_021907	CTG	2	6	25727	25732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831129
579	NC_021907	TGC	3	9	25755	25763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831129
580	NC_021907	CGGAC	2	10	25766	25775	20 %	0 %	40 %	40 %	528831129
581	NC_021907	TCA	2	6	25776	25781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831129
582	NC_021907	GATC	2	8	25807	25814	25 %	25 %	25 %	25 %	528831129
583	NC_021907	CAA	2	6	25831	25836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831129
584	NC_021907	CAT	2	6	25867	25872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831129
585	NC_021907	TCA	2	6	25881	25886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831129
586	NC_021907	AAG	2	6	25910	25915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831129
587	NC_021907	GGC	2	6	25936	25941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831129
588	NC_021907	GCG	2	6	25950	25955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831129
589	NC_021907	CTG	2	6	25985	25990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831129
590	NC_021907	GGC	2	6	26011	26016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831129
591	NC_021907	CTT	2	6	26069	26074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831129
592	NC_021907	GGC	2	6	26075	26080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831129
593	NC_021907	ATG	2	6	26090	26095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831129
594	NC_021907	GCG	2	6	26148	26153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831129
595	NC_021907	CGG	2	6	26154	26159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831129
596	NC_021907	TGG	2	6	26172	26177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831129
597	NC_021907	TTC	2	6	26210	26215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831129
598	NC_021907	TGG	2	6	26271	26276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831130
599	NC_021907	CTG	2	6	26286	26291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831130
600	NC_021907	CTG	3	9	26319	26327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831130
601	NC_021907	CTC	2	6	26360	26365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831130
602	NC_021907	CCG	2	6	26382	26387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831130
603	NC_021907	CTGG	2	8	26389	26396	0 %	25 %	50 %	25 %	528831130
604	NC_021907	TGC	2	6	26494	26499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831130
605	NC_021907	GTTC	2	8	26533	26540	0 %	50 %	25 %	25 %	528831130
606	NC_021907	GTT	2	6	26564	26569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831130
607	NC_021907	GAT	2	6	26579	26584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831130
608	NC_021907	CTT	2	6	26621	26626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831130
609	NC_021907	GGC	2	6	26643	26648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831130
610	NC_021907	TCGA	2	8	26739	26746	25 %	25 %	25 %	25 %	528831130
611	NC_021907	GCG	2	6	26764	26769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831130
612	NC_021907	CCT	2	6	26854	26859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831130
613	NC_021907	GGT	3	9	26867	26875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831130
614	NC_021907	GCA	2	6	26964	26969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831130
615	NC_021907	ATC	2	6	26994	26999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831130
616	NC_021907	CGT	2	6	27017	27022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831130
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618	NC_021907	ACG	2	6	27176	27181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831131
619	NC_021907	GCT	2	6	27244	27249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831131
620	NC_021907	GGTG	2	8	27319	27326	0 %	25 %	75 %	0 %	528831131
621	NC_021907	TGC	2	6	27396	27401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831131
622	NC_021907	CAG	3	9	27458	27466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831131
623	NC_021907	CCG	2	6	27500	27505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831131
624	NC_021907	AAG	2	6	27542	27547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831131
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626	NC_021907	CCA	2	6	27583	27588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831131
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723	NC_021907	CTC	2	6	31461	31466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
724	NC_021907	GAG	2	6	31467	31472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
725	NC_021907	CTCC	2	8	31506	31513	0 %	25 %	0 %	75 %	528831136
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749	NC_021907	GAG	2	6	32555	32560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831137
750	NC_021907	GTA	2	6	32654	32659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831137
751	NC_021907	GAC	2	6	32699	32704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831137
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753	NC_021907	CAG	2	6	32729	32734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831137
754	NC_021907	ACC	2	6	32742	32747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831137
755	NC_021907	GAA	2	6	32750	32755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831137
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758	NC_021907	CG	3	6	32803	32808	0 %	0 %	50 %	50 %	528831137
759	NC_021907	GA	3	6	32850	32855	50 %	0 %	50 %	0 %	528831137
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762	NC_021907	CGG	2	6	32942	32947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831137
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766	NC_021907	CG	3	6	33109	33114	0 %	0 %	50 %	50 %	528831137
767	NC_021907	CGA	2	6	33127	33132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831137
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