MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 4321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021906	TGCTC	2	10	63237	63246	0 %	40 %	20 %	40 %	528830991
1502	NC_021906	TGA	2	6	63314	63319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830991
1503	NC_021906	CGC	2	6	63419	63424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830991
1504	NC_021906	GAT	2	6	63450	63455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830991
1505	NC_021906	CTG	2	6	63481	63486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830991
1506	NC_021906	GCC	2	6	63508	63513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830991
1507	NC_021906	TCC	2	6	63515	63520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830991
1508	NC_021906	CGA	2	6	63527	63532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830991
1509	NC_021906	GC	3	6	63630	63635	0 %	0 %	50 %	50 %	528830991
1510	NC_021906	TGC	2	6	63659	63664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830991
1511	NC_021906	GCCG	2	8	63667	63674	0 %	0 %	50 %	50 %	528830991
1512	NC_021906	CGG	2	6	63843	63848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830991
1513	NC_021906	GATG	2	8	63861	63868	25 %	25 %	50 %	0 %	528830991
1514	NC_021906	GAT	2	6	63939	63944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830991
1515	NC_021906	GAT	2	6	63997	64002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830991
1516	NC_021906	CGG	2	6	64012	64017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830991
1517	NC_021906	CG	3	6	64030	64035	0 %	0 %	50 %	50 %	528830991
1518	NC_021906	CGG	2	6	64166	64171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830991
1519	NC_021906	GAT	2	6	64220	64225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830992
1520	NC_021906	GA	3	6	64288	64293	50 %	0 %	50 %	0 %	528830992
1521	NC_021906	TGT	2	6	64358	64363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528830992
1522	NC_021906	CGC	2	6	64502	64507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830992
1523	NC_021906	GAA	2	6	64719	64724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830992
1524	NC_021906	GCC	2	6	64800	64805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830992
1525	NC_021906	CCA	2	6	64810	64815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830992
1526	NC_021906	TGC	2	6	64852	64857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830992
1527	NC_021906	CGAG	2	8	64889	64896	25 %	0 %	50 %	25 %	528830992
1528	NC_021906	GCC	2	6	64909	64914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830992
1529	NC_021906	CGG	2	6	64920	64925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830992
1530	NC_021906	GCC	3	9	64940	64948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830992
1531	NC_021906	TCC	2	6	65032	65037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830993
1532	NC_021906	TCT	2	6	65041	65046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830993
1533	NC_021906	TGC	2	6	65141	65146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830993
1534	NC_021906	CCT	2	6	65158	65163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830993
1535	NC_021906	G	6	6	65201	65206	0 %	0 %	100 %	0 %	528830993
1536	NC_021906	GGTC	2	8	65287	65294	0 %	25 %	50 %	25 %	528830993
1537	NC_021906	TC	3	6	65326	65331	0 %	50 %	0 %	50 %	528830993
1538	NC_021906	AGC	2	6	65338	65343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830993
1539	NC_021906	ATT	2	6	65344	65349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528830993
1540	NC_021906	GC	4	8	65444	65451	0 %	0 %	50 %	50 %	528830993
1541	NC_021906	CGG	2	6	65484	65489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830993
1542	NC_021906	GCT	2	6	65507	65512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830993
1543	NC_021906	TTC	2	6	65514	65519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830993
1544	NC_021906	GGA	2	6	65535	65540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830993
1545	NC_021906	CTC	2	6	65615	65620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830993
1546	NC_021906	CGG	2	6	65663	65668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830993
1547	NC_021906	CGT	2	6	65807	65812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830993
1548	NC_021906	CGG	2	6	65821	65826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830993
1549	NC_021906	GCC	2	6	65876	65881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830993
1550	NC_021906	CCAT	2	8	65894	65901	25 %	25 %	0 %	50 %	528830993
1551	NC_021906	TTC	2	6	65931	65936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_021906	GGC	2	6	65955	65960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830994
1553	NC_021906	CGA	2	6	66044	66049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830994
1554	NC_021906	CGG	2	6	66056	66061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830994
1555	NC_021906	TTG	2	6	66064	66069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528830994
1556	NC_021906	GA	3	6	66106	66111	50 %	0 %	50 %	0 %	528830994
1557	NC_021906	CGC	2	6	66113	66118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830994
1558	NC_021906	CGG	2	6	66178	66183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830994
1559	NC_021906	CCG	2	6	66227	66232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830994
1560	NC_021906	GCC	2	6	66280	66285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830994
1561	NC_021906	TCA	2	6	66293	66298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830994
1562	NC_021906	CGG	2	6	66317	66322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021906	GCG	2	6	66341	66346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830995
1564	NC_021906	GCC	2	6	66413	66418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830995
1565	NC_021906	TA	3	6	66422	66427	50 %	50 %	0 %	0 %	528830995
1566	NC_021906	GGCA	2	8	66433	66440	25 %	0 %	50 %	25 %	528830995
1567	NC_021906	TGC	2	6	66464	66469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830995
1568	NC_021906	CCA	2	6	66631	66636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830995
1569	NC_021906	GCG	2	6	66684	66689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830995
1570	NC_021906	GCG	2	6	66701	66706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830995
1571	NC_021906	AGG	2	6	66713	66718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830995
1572	NC_021906	ATGCC	2	10	66724	66733	20 %	20 %	20 %	40 %	528830995
1573	NC_021906	CGC	2	6	66739	66744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830995
1574	NC_021906	GCA	2	6	66750	66755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830995
1575	NC_021906	CGT	2	6	66757	66762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830995
1576	NC_021906	CCCG	2	8	66824	66831	0 %	0 %	25 %	75 %	528830995
1577	NC_021906	CCG	2	6	66867	66872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830995
1578	NC_021906	GCG	2	6	66894	66899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830995
1579	NC_021906	GA	3	6	66972	66977	50 %	0 %	50 %	0 %	528830995
1580	NC_021906	GCG	2	6	66983	66988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830995
1581	NC_021906	CCAG	2	8	66996	67003	25 %	0 %	25 %	50 %	528830995
1582	NC_021906	GAT	2	6	67052	67057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830995
1583	NC_021906	GCG	2	6	67110	67115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830995
1584	NC_021906	GAC	2	6	67275	67280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830996
1585	NC_021906	CAGG	2	8	67353	67360	25 %	0 %	50 %	25 %	528830996
1586	NC_021906	TGA	2	6	67388	67393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830996
1587	NC_021906	GAT	2	6	67425	67430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830996
1588	NC_021906	TCG	2	6	67444	67449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830996
1589	NC_021906	CG	3	6	67570	67575	0 %	0 %	50 %	50 %	528830996
1590	NC_021906	AGC	2	6	67606	67611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830996
1591	NC_021906	GCG	2	6	67667	67672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830996
1592	NC_021906	ACG	2	6	67696	67701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830996
1593	NC_021906	CCA	2	6	67808	67813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830996
1594	NC_021906	TCC	2	6	67833	67838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830997
1595	NC_021906	ATG	2	6	67935	67940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830997
1596	NC_021906	GGC	2	6	67952	67957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830997
1597	NC_021906	CTG	2	6	68022	68027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830997
1598	NC_021906	CCG	2	6	68039	68044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830997
1599	NC_021906	CG	3	6	68101	68106	0 %	0 %	50 %	50 %	528830997
1600	NC_021906	ACC	2	6	68112	68117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830997
1601	NC_021906	AGGGGG	2	12	68138	68149	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	528830997
1602	NC_021906	GCCG	2	8	68195	68202	0 %	0 %	50 %	50 %	528830997
1603	NC_021906	GCGCA	2	10	68222	68231	20 %	0 %	40 %	40 %	528830997
1604	NC_021906	CCG	2	6	68253	68258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830997
1605	NC_021906	CGC	2	6	68334	68339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830997
1606	NC_021906	A	6	6	68373	68378	100 %	0 %	0 %	0 %	528830997
1607	NC_021906	CAT	2	6	68435	68440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830997
1608	NC_021906	GCC	2	6	68498	68503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830997
1609	NC_021906	CGA	3	9	68527	68535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830997
1610	NC_021906	CCA	2	6	68575	68580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830997
1611	NC_021906	GCC	2	6	68594	68599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830997
1612	NC_021906	TGA	2	6	68611	68616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830997
1613	NC_021906	AGC	2	6	68634	68639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830997
1614	NC_021906	GCCA	2	8	68676	68683	25 %	0 %	25 %	50 %	528830997
1615	NC_021906	CGG	2	6	68701	68706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830997
1616	NC_021906	GCT	2	6	68741	68746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830997
1617	NC_021906	GGCC	2	8	68761	68768	0 %	0 %	50 %	50 %	528830997
1618	NC_021906	GA	3	6	68799	68804	50 %	0 %	50 %	0 %	528830997
1619	NC_021906	GAT	2	6	68909	68914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830997
1620	NC_021906	GAA	2	6	68933	68938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830997
1621	NC_021906	TGC	2	6	68949	68954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830997
1622	NC_021906	ACG	2	6	69150	69155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830997
1623	NC_021906	ATC	2	6	69192	69197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830997
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1625	NC_021906	CGAGGG	2	12	69286	69297	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	528830997
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