MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 4321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021906	TCG	2	6	41241	41246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830967
1002	NC_021906	CGA	2	6	41281	41286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830967
1003	NC_021906	CGG	3	9	41311	41319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830967
1004	NC_021906	TCC	2	6	41337	41342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830967
1005	NC_021906	GGC	2	6	41424	41429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830967
1006	NC_021906	G	6	6	41452	41457	0 %	0 %	100 %	0 %	528830967
1007	NC_021906	TTC	2	6	41490	41495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830967
1008	NC_021906	GGC	2	6	41503	41508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830967
1009	NC_021906	CCG	2	6	41579	41584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830968
1010	NC_021906	GCT	2	6	41638	41643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830968
1011	NC_021906	CGG	2	6	41656	41661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830968
1012	NC_021906	CCG	2	6	41669	41674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830968
1013	NC_021906	GC	3	6	41750	41755	0 %	0 %	50 %	50 %	528830968
1014	NC_021906	GGCA	2	8	41791	41798	25 %	0 %	50 %	25 %	528830968
1015	NC_021906	GC	3	6	41808	41813	0 %	0 %	50 %	50 %	528830968
1016	NC_021906	GCT	2	6	41874	41879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830968
1017	NC_021906	GCC	3	9	41906	41914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830968
1018	NC_021906	CGC	2	6	41920	41925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830968
1019	NC_021906	AGA	2	6	41952	41957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830968
1020	NC_021906	CCA	2	6	41995	42000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830968
1021	NC_021906	CACCG	2	10	42005	42014	20 %	0 %	20 %	60 %	528830968
1022	NC_021906	CAA	2	6	42055	42060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528830968
1023	NC_021906	TCGA	2	8	42077	42084	25 %	25 %	25 %	25 %	528830968
1024	NC_021906	GCAT	2	8	42111	42118	25 %	25 %	25 %	25 %	528830968
1025	NC_021906	CT	3	6	42128	42133	0 %	50 %	0 %	50 %	528830968
1026	NC_021906	GAT	2	6	42215	42220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830968
1027	NC_021906	TGA	2	6	42231	42236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830968
1028	NC_021906	GGT	2	6	42305	42310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021906	GCG	2	6	42312	42317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_021906	GGTC	2	8	42327	42334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_021906	CGA	2	6	42402	42407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021906	GCT	2	6	42440	42445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021906	CCG	2	6	42453	42458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_021906	GGC	2	6	42479	42484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830969
1035	NC_021906	CGA	2	6	42521	42526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830969
1036	NC_021906	ATCGT	2	10	42601	42610	20 %	40 %	20 %	20 %	528830969
1037	NC_021906	GCCG	2	8	42687	42694	0 %	0 %	50 %	50 %	528830969
1038	NC_021906	TGT	2	6	42775	42780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021906	TATT	2	8	42803	42810	25 %	75 %	0 %	0 %	528830970
1040	NC_021906	TTC	2	6	42814	42819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830970
1041	NC_021906	GCC	2	6	42860	42865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830970
1042	NC_021906	TCG	2	6	42893	42898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830970
1043	NC_021906	TTG	2	6	42962	42967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528830970
1044	NC_021906	TCG	2	6	42971	42976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830970
1045	NC_021906	TGG	2	6	43094	43099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830970
1046	NC_021906	CTG	2	6	43111	43116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830970
1047	NC_021906	TCG	2	6	43136	43141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830970
1048	NC_021906	TCGC	2	8	43184	43191	0 %	25 %	25 %	50 %	528830970
1049	NC_021906	CCT	2	6	43197	43202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830970
1050	NC_021906	TGA	2	6	43203	43208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830970
1051	NC_021906	TCC	2	6	43211	43216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830970
1052	NC_021906	CGT	2	6	43391	43396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021906	TG	3	6	43407	43412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021906	CAT	2	6	43526	43531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830971
1055	NC_021906	CCGTT	2	10	43569	43578	0 %	40 %	20 %	40 %	528830971
1056	NC_021906	CCGG	2	8	43580	43587	0 %	0 %	50 %	50 %	528830971
1057	NC_021906	CGA	2	6	43622	43627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1058	NC_021906	TTC	2	6	43641	43646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830971
1059	NC_021906	GAG	2	6	43662	43667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830971
1060	NC_021906	CTT	2	6	43734	43739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830971
1061	NC_021906	TCG	2	6	43855	43860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1062	NC_021906	GGC	2	6	43863	43868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830971
1063	NC_021906	ATG	2	6	43918	43923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830971
1064	NC_021906	GAG	2	6	43950	43955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830971
1065	NC_021906	CCG	2	6	44008	44013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830971
1066	NC_021906	TAA	2	6	44029	44034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528830971
1067	NC_021906	GCAA	2	8	44047	44054	50 %	0 %	25 %	25 %	528830971
1068	NC_021906	GCG	2	6	44068	44073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830971
1069	NC_021906	GTC	2	6	44103	44108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1070	NC_021906	CAG	2	6	44121	44126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1071	NC_021906	CCG	2	6	44147	44152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830971
1072	NC_021906	CGGCC	2	10	44183	44192	0 %	0 %	40 %	60 %	528830971
1073	NC_021906	CGG	2	6	44252	44257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830971
1074	NC_021906	GATC	2	8	44298	44305	25 %	25 %	25 %	25 %	528830971
1075	NC_021906	TGT	2	6	44312	44317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528830971
1076	NC_021906	GAACC	2	10	44334	44343	40 %	0 %	20 %	40 %	528830971
1077	NC_021906	CAGC	2	8	44385	44392	25 %	0 %	25 %	50 %	528830971
1078	NC_021906	CGG	2	6	44448	44453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830971
1079	NC_021906	CCG	2	6	44492	44497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830971
1080	NC_021906	CCA	2	6	44525	44530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830971
1081	NC_021906	CG	3	6	44571	44576	0 %	0 %	50 %	50 %	528830971
1082	NC_021906	GGC	2	6	44655	44660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830971
1083	NC_021906	GTC	2	6	44670	44675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1084	NC_021906	TTC	2	6	44688	44693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830971
1085	NC_021906	TCC	2	6	44725	44730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830971
1086	NC_021906	GCC	2	6	44749	44754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830971
1087	NC_021906	GAA	2	6	44805	44810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830971
1088	NC_021906	CGC	2	6	44813	44818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830971
1089	NC_021906	TCC	3	9	44824	44832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830971
1090	NC_021906	ATG	2	6	44857	44862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830971
1091	NC_021906	GCT	2	6	44873	44878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1092	NC_021906	GCC	2	6	44906	44911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830971
1093	NC_021906	GGC	2	6	44937	44942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830971
1094	NC_021906	TGA	2	6	45128	45133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830971
1095	NC_021906	AACCGG	2	12	45146	45157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1096	NC_021906	CAT	2	6	45182	45187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830971
1097	NC_021906	ATC	2	6	45205	45210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830971
1098	NC_021906	CGA	2	6	45215	45220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1099	NC_021906	TGTC	2	8	45237	45244	0 %	50 %	25 %	25 %	528830971
1100	NC_021906	CGAT	2	8	45251	45258	25 %	25 %	25 %	25 %	528830971
1101	NC_021906	CTC	2	6	45282	45287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830971
1102	NC_021906	CGA	2	6	45299	45304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830971
1103	NC_021906	CG	3	6	45311	45316	0 %	0 %	50 %	50 %	528830971
1104	NC_021906	CATGA	2	10	45366	45375	40 %	20 %	20 %	20 %	528830971
1105	NC_021906	CCA	2	6	45380	45385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830971
1106	NC_021906	GTT	2	6	45455	45460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021906	TGGGCT	2	12	45481	45492	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1108	NC_021906	GC	3	6	45537	45542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_021906	TGA	2	6	45575	45580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021906	CGT	2	6	45592	45597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021906	GGC	2	6	45613	45618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021906	GGC	2	6	45687	45692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021906	CCGA	2	8	45942	45949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_021906	TTG	2	6	45957	45962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021906	AAG	2	6	46053	46058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830972
1116	NC_021906	TCG	2	6	46198	46203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1117	NC_021906	CTG	2	6	46206	46211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1118	NC_021906	GCC	2	6	46245	46250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830972
1119	NC_021906	CGA	2	6	46255	46260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1120	NC_021906	GGC	2	6	46263	46268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830972
1121	NC_021906	GTG	2	6	46275	46280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830972
1122	NC_021906	GCA	2	6	46323	46328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1123	NC_021906	TGA	2	6	46330	46335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830972
1124	NC_021906	CT	3	6	46426	46431	0 %	50 %	0 %	50 %	528830972
1125	NC_021906	TCG	3	9	46435	46443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1126	NC_021906	TCA	2	6	46519	46524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830972
1127	NC_021906	CGT	2	6	46589	46594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1128	NC_021906	GCT	2	6	46640	46645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1129	NC_021906	ATGC	2	8	46647	46654	25 %	25 %	25 %	25 %	528830972
1130	NC_021906	GTTC	2	8	46711	46718	0 %	50 %	25 %	25 %	528830972
1131	NC_021906	CGG	2	6	46787	46792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830972
1132	NC_021906	GCC	2	6	46797	46802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830972
1133	NC_021906	GCC	2	6	46878	46883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830972
1134	NC_021906	CTA	2	6	46904	46909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830972
1135	NC_021906	TCG	2	6	46963	46968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1136	NC_021906	GCC	2	6	46995	47000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830972
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1139	NC_021906	ACT	2	6	47362	47367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830972
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1141	NC_021906	ATG	2	6	47506	47511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830972
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1145	NC_021906	GCC	2	6	47627	47632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830972
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1147	NC_021906	CTG	2	6	47775	47780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830972
1148	NC_021906	CAGGG	2	10	47789	47798	20 %	0 %	60 %	20 %	528830972
1149	NC_021906	CGG	2	6	47825	47830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830972
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1156	NC_021906	GCGA	2	8	48076	48083	25 %	0 %	50 %	25 %	528830973
1157	NC_021906	GGC	2	6	48094	48099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830973
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1165	NC_021906	CGG	2	6	48319	48324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830974
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1173	NC_021906	CGC	2	6	48517	48522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1174	NC_021906	CCG	2	6	48530	48535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1193	NC_021906	GAAG	2	8	49388	49395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1194	NC_021906	TGA	2	6	49498	49503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830976
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1245	NC_021906	CAT	2	6	52119	52124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830979
1246	NC_021906	GACCA	2	10	52154	52163	40 %	0 %	20 %	40 %	528830979
1247	NC_021906	TCGG	2	8	52166	52173	0 %	25 %	50 %	25 %	528830979
1248	NC_021906	GC	3	6	52213	52218	0 %	0 %	50 %	50 %	528830979
1249	NC_021906	GTC	2	6	52231	52236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830979
1250	NC_021906	GGA	2	6	52258	52263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830979
1251	NC_021906	CTTCGA	2	12	52323	52334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528830979
1252	NC_021906	GC	3	6	52369	52374	0 %	0 %	50 %	50 %	528830979
1253	NC_021906	CGA	2	6	52482	52487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830979
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1256	NC_021906	GGACA	2	10	52686	52695	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1257	NC_021906	CGT	2	6	52739	52744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_021906	GC	3	6	52756	52761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1259	NC_021906	GGA	2	6	52790	52795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830980
1260	NC_021906	GCT	2	6	52943	52948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830980
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1265	NC_021906	GCCT	2	8	53123	53130	0 %	25 %	25 %	50 %	528830981
1266	NC_021906	GAC	2	6	53194	53199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830981
1267	NC_021906	CGT	2	6	53246	53251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830982
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1270	NC_021906	ATCA	2	8	53382	53389	50 %	25 %	0 %	25 %	528830982
1271	NC_021906	CCGCGA	2	12	53422	53433	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528830983
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1274	NC_021906	TCG	2	6	53514	53519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830983
1275	NC_021906	G	6	6	53519	53524	0 %	0 %	100 %	0 %	528830983
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1282	NC_021906	GTT	2	6	53744	53749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528830983
1283	NC_021906	CCCG	2	8	53762	53769	0 %	0 %	25 %	75 %	528830983
1284	NC_021906	CGTTA	2	10	53783	53792	20 %	40 %	20 %	20 %	528830983
1285	NC_021906	CGA	2	6	53830	53835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830983
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1317	NC_021906	AAG	2	6	55463	55468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1363	NC_021906	ATGCCG	2	12	57348	57359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528830986
1364	NC_021906	GGCGC	2	10	57415	57424	0 %	0 %	60 %	40 %	528830986
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1366	NC_021906	ATC	2	6	57534	57539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830986
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1370	NC_021906	ATC	2	6	57665	57670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830986
1371	NC_021906	CGG	2	6	57676	57681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830986
1372	NC_021906	TCA	2	6	57738	57743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830986
1373	NC_021906	TC	3	6	57781	57786	0 %	50 %	0 %	50 %	528830986
1374	NC_021906	GGCG	2	8	57806	57813	0 %	0 %	75 %	25 %	528830986
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