MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 74455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021905	CGC	2	6	56	61	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021905	GAG	2	6	228	233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021905	CGA	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021905	CGC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021905	CAT	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021905	CCG	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826862
7	NC_021905	CGA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826862
8	NC_021905	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826862
9	NC_021905	TGA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826862
10	NC_021905	GAC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826862
11	NC_021905	GAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826862
12	NC_021905	GTC	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826862
13	NC_021905	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826862
14	NC_021905	CAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826862
15	NC_021905	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826862
16	NC_021905	GAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826862
17	NC_021905	GGA	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826862
18	NC_021905	CGC	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826862
19	NC_021905	CGG	2	6	1254	1259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826862
20	NC_021905	TTG	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528826862
21	NC_021905	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021905	TCG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826863
23	NC_021905	TCT	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826863
24	NC_021905	CGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826863
25	NC_021905	ACC	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826863
26	NC_021905	ATT	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528826863
27	NC_021905	GAT	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826863
28	NC_021905	CCT	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826864
29	NC_021905	CCA	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826864
30	NC_021905	CGG	2	6	2309	2314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826864
31	NC_021905	CGG	2	6	2328	2333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826864
32	NC_021905	CGT	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826864
33	NC_021905	GCG	2	6	2536	2541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826864
34	NC_021905	CGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826864
35	NC_021905	TGC	3	9	2669	2677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826864
36	NC_021905	CGT	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826864
37	NC_021905	GCC	2	6	2971	2976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826865
38	NC_021905	CAG	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826865
39	NC_021905	GCT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826865
40	NC_021905	GTC	3	9	3150	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826865
41	NC_021905	ATC	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826865
42	NC_021905	ATC	2	6	3388	3393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826866
43	NC_021905	ACC	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826866
44	NC_021905	ATC	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826866
45	NC_021905	CGG	2	6	3447	3452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826866
46	NC_021905	CGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826866
47	NC_021905	CGA	2	6	3600	3605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826866
48	NC_021905	CTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826866
49	NC_021905	GAT	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826866
50	NC_021905	CGG	2	6	3879	3884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826866
51	NC_021905	GGC	2	6	3930	3935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826866
52	NC_021905	TTC	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826867
53	NC_021905	ATC	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826867
54	NC_021905	GCG	2	6	4246	4251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826867
55	NC_021905	GAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826867
56	NC_021905	GCA	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826867
57	NC_021905	CGC	2	6	4375	4380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826867
58	NC_021905	TCG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826867
59	NC_021905	TCG	2	6	4603	4608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826867
60	NC_021905	TGT	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528826867
61	NC_021905	GCC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021905	TCC	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826868
63	NC_021905	ACC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826868
64	NC_021905	GAC	3	9	4883	4891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
65	NC_021905	CGG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826868
66	NC_021905	GAT	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826868
67	NC_021905	AGC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
68	NC_021905	CAG	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
69	NC_021905	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
70	NC_021905	CGA	3	9	5170	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
71	NC_021905	GCA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
72	NC_021905	ATC	2	6	5308	5313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021905	CGG	2	6	5356	5361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021905	TCA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826869
75	NC_021905	ATT	2	6	5397	5402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528826869
76	NC_021905	TGG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826869
77	NC_021905	CGG	2	6	5414	5419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826869
78	NC_021905	TCT	2	6	5426	5431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826869
79	NC_021905	GCC	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826869
80	NC_021905	CGA	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826869
81	NC_021905	GCG	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826869
82	NC_021905	GGC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826869
83	NC_021905	TCG	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826869
84	NC_021905	GAT	3	9	6137	6145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826870
85	NC_021905	ATG	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826870
86	NC_021905	CGG	2	6	6179	6184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826870
87	NC_021905	GGA	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826870
88	NC_021905	CTT	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826870
89	NC_021905	CGT	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826870
90	NC_021905	GCG	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826870
91	NC_021905	GAC	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826870
92	NC_021905	CGC	2	6	6551	6556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826870
93	NC_021905	TCT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826870
94	NC_021905	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826870
95	NC_021905	CTG	2	6	6734	6739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826870
96	NC_021905	TTC	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826870
97	NC_021905	GCG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826870
98	NC_021905	GCC	2	6	6902	6907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826870
99	NC_021905	CTT	2	6	6917	6922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826870
100	NC_021905	GAT	2	6	7007	7012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826870
101	NC_021905	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826870
102	NC_021905	GCC	3	9	7169	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826870
103	NC_021905	GCA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826871
104	NC_021905	CGC	2	6	7364	7369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826871
105	NC_021905	CAT	2	6	7420	7425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826871
106	NC_021905	GTC	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826871
107	NC_021905	CTC	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826871
108	NC_021905	GCC	2	6	7690	7695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826871
109	NC_021905	CAT	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826871
110	NC_021905	CGG	2	6	7738	7743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826871
111	NC_021905	CTG	2	6	7899	7904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826872
112	NC_021905	CAT	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826872
113	NC_021905	TCC	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826872
114	NC_021905	GTC	2	6	7986	7991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826872
115	NC_021905	GCC	2	6	8009	8014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826872
116	NC_021905	CGG	2	6	8046	8051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826872
117	NC_021905	GGC	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826872
118	NC_021905	GAA	2	6	8207	8212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021905	CGC	3	9	8233	8241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021905	ACA	2	6	8248	8253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021905	CGA	2	6	8390	8395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826873
122	NC_021905	GTC	2	6	8427	8432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
123	NC_021905	CGA	2	6	8444	8449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826873
124	NC_021905	GCG	2	6	8551	8556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
125	NC_021905	TCA	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826873
126	NC_021905	GGC	2	6	8601	8606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
127	NC_021905	CGG	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
128	NC_021905	CGT	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
129	NC_021905	CCG	2	6	8702	8707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826873
130	NC_021905	AGC	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826873
131	NC_021905	GAA	2	6	8946	8951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826873
132	NC_021905	CGG	2	6	8963	8968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
133	NC_021905	AAG	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826873
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153	NC_021905	GGC	2	6	10127	10132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
154	NC_021905	CAT	2	6	10217	10222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826873
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161	NC_021905	CAA	2	6	10719	10724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_021905	CCG	2	6	10730	10735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_021905	CGG	2	6	10744	10749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_021905	CGA	2	6	10781	10786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826874
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257	NC_021905	TCG	2	6	17024	17029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826880
258	NC_021905	GTC	3	9	17032	17040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826880
259	NC_021905	CCG	2	6	17186	17191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826880
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261	NC_021905	CGG	2	6	17349	17354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826880
262	NC_021905	CGG	2	6	17489	17494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826880
263	NC_021905	CGG	2	6	17594	17599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826881
264	NC_021905	GAA	2	6	17646	17651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826881
265	NC_021905	CGG	2	6	17765	17770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826881
266	NC_021905	GAG	2	6	17793	17798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826881
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268	NC_021905	ATC	2	6	17877	17882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826881
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270	NC_021905	GCT	2	6	18011	18016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826881
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272	NC_021905	GCC	2	6	18213	18218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826881
273	NC_021905	GCC	2	6	18223	18228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826881
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275	NC_021905	CGG	3	9	18254	18262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826881
276	NC_021905	CGA	2	6	18296	18301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826881
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278	NC_021905	CGG	2	6	18332	18337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826881
279	NC_021905	CGA	2	6	18353	18358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826881
280	NC_021905	CCG	2	6	18376	18381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826881
281	NC_021905	CAT	2	6	18593	18598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826881
282	NC_021905	TCA	2	6	18634	18639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826881
283	NC_021905	ATC	2	6	18669	18674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826881
284	NC_021905	TGA	2	6	18676	18681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826881
285	NC_021905	GCG	2	6	18826	18831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
286	NC_021905	CAT	2	6	18857	18862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826882
287	NC_021905	CAT	2	6	18890	18895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826882
288	NC_021905	GGC	2	6	18972	18977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
289	NC_021905	GAA	2	6	18986	18991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826882
290	NC_021905	GGC	2	6	19004	19009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
291	NC_021905	TGA	2	6	19045	19050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826882
292	NC_021905	GAT	2	6	19098	19103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826882
293	NC_021905	CGC	2	6	19109	19114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826882
294	NC_021905	TCG	3	9	19132	19140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826882
295	NC_021905	GCC	2	6	19145	19150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826882
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298	NC_021905	CTA	2	6	19274	19279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826882
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301	NC_021905	GGC	2	6	19422	19427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
302	NC_021905	CGT	3	9	19439	19447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826882
303	NC_021905	CAA	2	6	19474	19479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826882
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313	NC_021905	GTC	2	6	20217	20222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826883
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317	NC_021905	TGG	2	6	20410	20415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826883
318	NC_021905	ACG	2	6	20491	20496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826883
319	NC_021905	GGC	2	6	20519	20524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826883
320	NC_021905	GCA	2	6	20595	20600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
321	NC_021905	GGT	2	6	20711	20716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826884
322	NC_021905	CGG	2	6	20780	20785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826884
323	NC_021905	CGC	2	6	20809	20814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826884
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327	NC_021905	TGC	2	6	20999	21004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826884
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330	NC_021905	CCA	2	6	21040	21045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826884
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351	NC_021905	GCT	2	6	22312	22317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
352	NC_021905	GGA	2	6	22323	22328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
353	NC_021905	GCG	2	6	22498	22503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826886
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