MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 100380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021905	GC	3	6	130197	130202	0 %	0 %	50 %	50 %	528826972
3002	NC_021905	TCG	2	6	130221	130226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826972
3003	NC_021905	ATG	2	6	130266	130271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826972
3004	NC_021905	CGA	2	6	130336	130341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826972
3005	NC_021905	GAT	2	6	130471	130476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826972
3006	NC_021905	ATCG	2	8	130484	130491	25 %	25 %	25 %	25 %	528826972
3007	NC_021905	CTT	2	6	130531	130536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826972
3008	NC_021905	TCG	2	6	130588	130593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826972
3009	NC_021905	CGA	2	6	130642	130647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826972
3010	NC_021905	GAT	2	6	130658	130663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826972
3011	NC_021905	GCG	2	6	130745	130750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_021905	CTC	2	6	130751	130756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_021905	TAA	2	6	130786	130791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021905	A	6	6	130790	130795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021905	TCA	2	6	130820	130825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_021905	AT	3	6	130947	130952	50 %	50 %	0 %	0 %	528826973
3017	NC_021905	TCG	2	6	131001	131006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3018	NC_021905	TACC	2	8	131030	131037	25 %	25 %	0 %	50 %	528826973
3019	NC_021905	CGG	2	6	131072	131077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826973
3020	NC_021905	GGTG	2	8	131090	131097	0 %	25 %	75 %	0 %	528826973
3021	NC_021905	GAT	2	6	131105	131110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826973
3022	NC_021905	GAC	2	6	131111	131116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3023	NC_021905	GGA	2	6	131129	131134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826973
3024	NC_021905	CGC	2	6	131220	131225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826973
3025	NC_021905	ATG	2	6	131250	131255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826973
3026	NC_021905	GCT	3	9	131312	131320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3027	NC_021905	CTT	2	6	131321	131326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826973
3028	NC_021905	CAA	2	6	131357	131362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826973
3029	NC_021905	CCT	2	6	131365	131370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826973
3030	NC_021905	CG	3	6	131398	131403	0 %	0 %	50 %	50 %	528826973
3031	NC_021905	CGG	2	6	131474	131479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826973
3032	NC_021905	GGC	2	6	131489	131494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826973
3033	NC_021905	TGC	2	6	131501	131506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3034	NC_021905	CTG	2	6	131556	131561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3035	NC_021905	CG	3	6	131596	131601	0 %	0 %	50 %	50 %	528826973
3036	NC_021905	CTG	2	6	131682	131687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3037	NC_021905	GTC	2	6	131727	131732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3038	NC_021905	CGG	2	6	131750	131755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826973
3039	NC_021905	GGT	2	6	131805	131810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826973
3040	NC_021905	CGC	2	6	131900	131905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826973
3041	NC_021905	CCG	2	6	131932	131937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826973
3042	NC_021905	GCT	2	6	131939	131944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3043	NC_021905	CTG	2	6	131957	131962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3044	NC_021905	CGC	2	6	132007	132012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826973
3045	NC_021905	GGT	2	6	132017	132022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826973
3046	NC_021905	CG	3	6	132027	132032	0 %	0 %	50 %	50 %	528826973
3047	NC_021905	CGG	2	6	132059	132064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826973
3048	NC_021905	CGG	2	6	132071	132076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826973
3049	NC_021905	GCC	2	6	132096	132101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826973
3050	NC_021905	GCT	2	6	132125	132130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3051	NC_021905	TCA	2	6	132135	132140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826973
3052	NC_021905	TGC	2	6	132148	132153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3053	NC_021905	CTTCG	2	10	132191	132200	0 %	40 %	20 %	40 %	528826973
3054	NC_021905	CGC	2	6	132256	132261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826973
3055	NC_021905	GAC	3	9	132303	132311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3056	NC_021905	GCC	2	6	132343	132348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826973
3057	NC_021905	GCATCC	2	12	132349	132360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528826973
3058	NC_021905	AT	3	6	132449	132454	50 %	50 %	0 %	0 %	528826973
3059	NC_021905	GCG	2	6	132467	132472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826973
3060	NC_021905	GC	4	8	132506	132513	0 %	0 %	50 %	50 %	528826973
3061	NC_021905	GCCC	2	8	132529	132536	0 %	0 %	25 %	75 %	528826973
3062	NC_021905	CGA	2	6	132578	132583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826973
3063	NC_021905	CGAT	2	8	132601	132608	25 %	25 %	25 %	25 %	528826973
3064	NC_021905	CAT	2	6	132612	132617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826973
3065	NC_021905	AGC	2	6	132622	132627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_021905	CGCC	2	8	132646	132653	0 %	0 %	25 %	75 %	528826974
3067	NC_021905	CGC	2	6	132664	132669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826974
3068	NC_021905	TGA	2	6	132688	132693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826974
3069	NC_021905	GCC	2	6	132704	132709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826974
3070	NC_021905	CG	3	6	132736	132741	0 %	0 %	50 %	50 %	528826974
3071	NC_021905	TC	3	6	132745	132750	0 %	50 %	0 %	50 %	528826974
3072	NC_021905	GCT	2	6	132784	132789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826974
3073	NC_021905	GTC	2	6	132818	132823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826974
3074	NC_021905	TTC	2	6	132843	132848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826974
3075	NC_021905	GCGT	2	8	132891	132898	0 %	25 %	50 %	25 %	528826974
3076	NC_021905	GC	3	6	132930	132935	0 %	0 %	50 %	50 %	528826974
3077	NC_021905	TCG	2	6	133047	133052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826974
3078	NC_021905	TTC	2	6	133146	133151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826975
3079	NC_021905	CCG	2	6	133206	133211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826975
3080	NC_021905	GGC	2	6	133247	133252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826975
3081	NC_021905	GCA	2	6	133264	133269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826975
3082	NC_021905	GCC	2	6	133304	133309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826975
3083	NC_021905	GTT	2	6	133364	133369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528826975
3084	NC_021905	TGA	2	6	133378	133383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826975
3085	NC_021905	CGGC	3	12	133422	133433	0 %	0 %	50 %	50 %	528826975
3086	NC_021905	CAT	2	6	133439	133444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826975
3087	NC_021905	CGAG	2	8	133501	133508	25 %	0 %	50 %	25 %	528826975
3088	NC_021905	CCT	2	6	133543	133548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826975
3089	NC_021905	CTT	2	6	133613	133618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826975
3090	NC_021905	GCCGTC	2	12	133679	133690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528826975
3091	NC_021905	CGC	2	6	133786	133791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826975
3092	NC_021905	GCC	2	6	133809	133814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826975
3093	NC_021905	TCT	2	6	133963	133968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826975
3094	NC_021905	CTT	2	6	134027	134032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826975
3095	NC_021905	TCTGCT	2	12	134083	134094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	528826975
3096	NC_021905	CGG	3	9	134099	134107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826975
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3098	NC_021905	TCT	2	6	134176	134181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826975
3099	NC_021905	CCGC	2	8	134190	134197	0 %	0 %	25 %	75 %	528826975
3100	NC_021905	GAGGG	2	10	134277	134286	20 %	0 %	80 %	0 %	528826975
3101	NC_021905	GCC	2	6	134295	134300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826975
3102	NC_021905	CGC	2	6	134322	134327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826975
3103	NC_021905	GCC	3	9	134366	134374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826976
3104	NC_021905	CGC	2	6	134403	134408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826976
3105	NC_021905	GAT	2	6	134515	134520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826976
3106	NC_021905	TCA	2	6	134576	134581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826976
3107	NC_021905	GCC	2	6	134611	134616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826976
3108	NC_021905	GGC	2	6	134629	134634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826976
3109	NC_021905	CGCC	2	8	134643	134650	0 %	0 %	25 %	75 %	528826976
3110	NC_021905	CGA	3	9	134682	134690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826976
3111	NC_021905	TGA	2	6	134691	134696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826976
3112	NC_021905	CTT	3	9	134830	134838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826976
3113	NC_021905	GCC	2	6	134852	134857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826976
3114	NC_021905	CGG	2	6	134858	134863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826976
3115	NC_021905	GGCT	2	8	135041	135048	0 %	25 %	50 %	25 %	528826977
3116	NC_021905	GCC	2	6	135082	135087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826977
3117	NC_021905	TGA	2	6	135098	135103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826977
3118	NC_021905	GGC	2	6	135154	135159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826977
3119	NC_021905	TGG	2	6	135202	135207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826977
3120	NC_021905	GCA	2	6	135210	135215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826977
3121	NC_021905	GCC	2	6	135221	135226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826977
3122	NC_021905	CGC	2	6	135363	135368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826977
3123	NC_021905	GAT	2	6	135372	135377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826977
3124	NC_021905	TCA	2	6	135437	135442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826977
3125	NC_021905	TGTT	2	8	135485	135492	0 %	75 %	25 %	0 %	528826977
3126	NC_021905	GA	3	6	135494	135499	50 %	0 %	50 %	0 %	528826977
3127	NC_021905	TGA	2	6	135518	135523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826977
3128	NC_021905	CGGC	2	8	135531	135538	0 %	0 %	50 %	50 %	528826977
3129	NC_021905	CG	4	8	135556	135563	0 %	0 %	50 %	50 %	528826977
3130	NC_021905	GCT	2	6	135571	135576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826977
3131	NC_021905	TTCG	2	8	135761	135768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_021905	GAA	2	6	135851	135856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021905	CGGG	2	8	135912	135919	0 %	0 %	75 %	25 %	528826978
3134	NC_021905	CGG	2	6	135930	135935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826978
3135	NC_021905	CGG	2	6	135954	135959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826978
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3137	NC_021905	GAC	2	6	136090	136095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826978
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3139	NC_021905	GCCTT	2	10	136115	136124	0 %	40 %	20 %	40 %	528826978
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3142	NC_021905	TTG	2	6	136227	136232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_021905	GTC	2	6	136250	136255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826979
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3146	NC_021905	CGG	2	6	136295	136300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826979
3147	NC_021905	CTT	3	9	136312	136320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826979
3148	NC_021905	CGCACG	2	12	136335	136346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528826979
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3153	NC_021905	GGCTGA	2	12	136474	136485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528826979
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3157	NC_021905	GCCG	2	8	136576	136583	0 %	0 %	50 %	50 %	528826979
3158	NC_021905	CGAA	2	8	136602	136609	50 %	0 %	25 %	25 %	528826979
3159	NC_021905	GGCT	2	8	136749	136756	0 %	25 %	50 %	25 %	528826979
3160	NC_021905	GC	3	6	136767	136772	0 %	0 %	50 %	50 %	528826979
3161	NC_021905	GC	3	6	136822	136827	0 %	0 %	50 %	50 %	528826979
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3199	NC_021905	A	6	6	138303	138308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3238	NC_021905	TGC	2	6	140046	140051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826982
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3241	NC_021905	CGC	2	6	140207	140212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826982
3242	NC_021905	CAT	3	9	140254	140262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826982
3243	NC_021905	CAT	2	6	140311	140316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826982
3244	NC_021905	GCT	2	6	140413	140418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3245	NC_021905	CAG	2	6	140431	140436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_021905	TTA	2	6	140443	140448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_021905	CCGCG	2	10	140466	140475	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3248	NC_021905	ATGG	2	8	140771	140778	25 %	25 %	50 %	0 %	528826983
3249	NC_021905	CTG	2	6	140879	140884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_021905	GCA	2	6	140895	140900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_021905	GA	3	6	140902	140907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_021905	CGG	2	6	140976	140981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826984
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3254	NC_021905	TCG	2	6	141042	141047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826984
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3261	NC_021905	GA	3	6	141306	141311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_021905	CTC	2	6	141396	141401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826985
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3265	NC_021905	TCG	2	6	141518	141523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826985
3266	NC_021905	GGT	2	6	141582	141587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826985
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3272	NC_021905	GCC	2	6	141775	141780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826985
3273	NC_021905	CCG	2	6	141782	141787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826985
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3282	NC_021905	CGC	2	6	142214	142219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826986
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3303	NC_021905	GCT	2	6	143130	143135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826987
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3334	NC_021905	TCC	2	6	144786	144791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3337	NC_021905	A	7	7	144886	144892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3342	NC_021905	C	6	6	145200	145205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3343	NC_021905	ATC	2	6	145256	145261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826989
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3485	NC_021905	GAC	2	6	151165	151170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3486	NC_021905	CAG	2	6	151263	151268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826996
3487	NC_021905	GTC	2	6	151269	151274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826996
3488	NC_021905	CTG	2	6	151332	151337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826996
3489	NC_021905	ATG	2	6	151432	151437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826996
3490	NC_021905	GGT	2	6	151452	151457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826996
3491	NC_021905	CAT	2	6	151605	151610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826996
3492	NC_021905	A	6	6	151717	151722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_021905	GAA	2	6	151783	151788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826997
3494	NC_021905	AGA	2	6	151837	151842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826997
3495	NC_021905	AGT	2	6	151862	151867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826997
3496	NC_021905	GATCTG	2	12	151903	151914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	528826997
3497	NC_021905	GCA	2	6	151944	151949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826997
3498	NC_021905	TGCCCT	2	12	151956	151967	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	528826997
3499	NC_021905	CCG	2	6	152054	152059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826997
3500	NC_021905	AGC	2	6	152062	152067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826997

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