MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum FQY_4 megaplasmid

Total Repeats: 55647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021745	GCC	2	6	37516	37521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_021745	TGCA	2	8	37528	37535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_021745	TTG	2	6	37563	37568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021745	CTT	2	6	37598	37603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021745	TTG	2	6	37613	37618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021745	GC	4	8	37623	37630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_021745	ACA	2	6	37633	37638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021745	CGC	2	6	37764	37769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710993
1009	NC_021745	GCCG	2	8	37791	37798	0 %	0 %	50 %	50 %	525710993
1010	NC_021745	CCG	2	6	37814	37819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710993
1011	NC_021745	GCG	2	6	37895	37900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710993
1012	NC_021745	GACT	2	8	37919	37926	25 %	25 %	25 %	25 %	525710993
1013	NC_021745	CAG	2	6	37929	37934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710993
1014	NC_021745	GCCG	2	8	37972	37979	0 %	0 %	50 %	50 %	525710993
1015	NC_021745	GA	5	10	38000	38009	50 %	0 %	50 %	0 %	525710993
1016	NC_021745	GACC	2	8	38011	38018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_021745	CAG	2	6	38025	38030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710994
1018	NC_021745	CGC	2	6	38048	38053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710994
1019	NC_021745	GCA	2	6	38089	38094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710994
1020	NC_021745	CGC	2	6	38114	38119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710994
1021	NC_021745	GCC	2	6	38157	38162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710994
1022	NC_021745	GCA	2	6	38183	38188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710994
1023	NC_021745	GAG	2	6	38196	38201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525710994
1024	NC_021745	ACG	2	6	38226	38231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710994
1025	NC_021745	CGC	2	6	38270	38275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710994
1026	NC_021745	CG	3	6	38298	38303	0 %	0 %	50 %	50 %	525710994
1027	NC_021745	ATC	2	6	38304	38309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525710994
1028	NC_021745	GCAG	2	8	38321	38328	25 %	0 %	50 %	25 %	525710994
1029	NC_021745	CAC	2	6	38396	38401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525710994
1030	NC_021745	GTTCGA	2	12	38594	38605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525710994
1031	NC_021745	GCG	2	6	38631	38636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710994
1032	NC_021745	GAACG	2	10	38721	38730	40 %	0 %	40 %	20 %	525710994
1033	NC_021745	CA	4	8	38741	38748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_021745	GTCG	2	8	38856	38863	0 %	25 %	50 %	25 %	525710995
1035	NC_021745	GCA	2	6	38915	38920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710995
1036	NC_021745	CCG	2	6	38941	38946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710995
1037	NC_021745	CCCAC	2	10	39010	39019	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1038	NC_021745	GAAT	2	8	39032	39039	50 %	25 %	25 %	0 %	525710996
1039	NC_021745	GCCG	2	8	39077	39084	0 %	0 %	50 %	50 %	525710996
1040	NC_021745	GTG	2	6	39163	39168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710996
1041	NC_021745	AGC	2	6	39184	39189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710996
1042	NC_021745	GCCG	2	8	39220	39227	0 %	0 %	50 %	50 %	525710996
1043	NC_021745	CGC	2	6	39268	39273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_021745	CGG	3	9	39276	39284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_021745	T	7	7	39439	39445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021745	CGG	2	6	39475	39480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_021745	CGGG	2	8	39483	39490	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_021745	GCG	2	6	39572	39577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_021745	CCA	2	6	39598	39603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_021745	CGC	2	6	39686	39691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_021745	CTCG	2	8	39707	39714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_021745	GCT	2	6	39731	39736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021745	CGC	2	6	39743	39748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_021745	GGC	2	6	39763	39768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021745	CCGC	2	8	39786	39793	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1056	NC_021745	CGCT	2	8	39820	39827	0 %	25 %	25 %	50 %	525710997
1057	NC_021745	GC	3	6	39935	39940	0 %	0 %	50 %	50 %	525710997
1058	NC_021745	GCG	2	6	39958	39963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710997
1059	NC_021745	TGCT	2	8	39979	39986	0 %	50 %	25 %	25 %	525710997
1060	NC_021745	CTG	2	6	40033	40038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710997
1061	NC_021745	CAA	2	6	40051	40056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525710997
1062	NC_021745	G	6	6	40097	40102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021745	GC	3	6	40132	40137	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1064	NC_021745	GCG	2	6	40206	40211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710998
1065	NC_021745	CAC	2	6	40235	40240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525710998
1066	NC_021745	ACCG	2	8	40241	40248	25 %	0 %	25 %	50 %	525710998
1067	NC_021745	GGCG	2	8	40306	40313	0 %	0 %	75 %	25 %	525710998
1068	NC_021745	GCA	2	6	40333	40338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710998
1069	NC_021745	GCT	2	6	40378	40383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710998
1070	NC_021745	GCCG	2	8	40408	40415	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1071	NC_021745	GCCG	2	8	40508	40515	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1072	NC_021745	GCC	2	6	40536	40541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710998
1073	NC_021745	GC	3	6	40557	40562	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1074	NC_021745	GCCG	2	8	40594	40601	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1075	NC_021745	CGG	2	6	40615	40620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710998
1076	NC_021745	GC	3	6	40642	40647	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1077	NC_021745	GCG	2	6	40655	40660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710998
1078	NC_021745	CG	3	6	40659	40664	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1079	NC_021745	TGG	2	6	40665	40670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710998
1080	NC_021745	CGCC	2	8	40762	40769	0 %	0 %	25 %	75 %	525710998
1081	NC_021745	GTCG	2	8	40822	40829	0 %	25 %	50 %	25 %	525710998
1082	NC_021745	TGC	2	6	40832	40837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710998
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1085	NC_021745	TGC	2	6	40987	40992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710998
1086	NC_021745	CTG	2	6	41019	41024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710998
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1088	NC_021745	CCGC	2	8	41118	41125	0 %	0 %	25 %	75 %	525710998
1089	NC_021745	GCG	2	6	41128	41133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710998
1090	NC_021745	GCG	3	9	41166	41174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710998
1091	NC_021745	CGC	2	6	41192	41197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710998
1092	NC_021745	GCC	2	6	41206	41211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710998
1093	NC_021745	GAC	2	6	41288	41293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710998
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1095	NC_021745	ACGGC	2	10	41397	41406	20 %	0 %	40 %	40 %	525710998
1096	NC_021745	CAGC	2	8	41410	41417	25 %	0 %	25 %	50 %	525710998
1097	NC_021745	GTG	2	6	41512	41517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710998
1098	NC_021745	GC	3	6	41581	41586	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1099	NC_021745	GC	3	6	41600	41605	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1100	NC_021745	TCG	2	6	41619	41624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710998
1101	NC_021745	TGGCG	2	10	41628	41637	0 %	20 %	60 %	20 %	525710998
1102	NC_021745	CGG	2	6	41638	41643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710998
1103	NC_021745	GGC	2	6	41650	41655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710998
1104	NC_021745	TAC	2	6	41705	41710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525710998
1105	NC_021745	CG	3	6	41724	41729	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1106	NC_021745	CGC	3	9	41788	41796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710998
1107	NC_021745	GC	3	6	41820	41825	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1108	NC_021745	GCAG	2	8	41866	41873	25 %	0 %	50 %	25 %	525710998
1109	NC_021745	GGGC	2	8	41880	41887	0 %	0 %	75 %	25 %	525710998
1110	NC_021745	CTG	2	6	41897	41902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710998
1111	NC_021745	GACC	2	8	41956	41963	25 %	0 %	25 %	50 %	525710998
1112	NC_021745	CCG	3	9	41965	41973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525710998
1113	NC_021745	TGGGA	2	10	42003	42012	20 %	20 %	60 %	0 %	525710998
1114	NC_021745	GC	3	6	42126	42131	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1115	NC_021745	GTCG	2	8	42199	42206	0 %	25 %	50 %	25 %	525710998
1116	NC_021745	TCC	2	6	42222	42227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525710998
1117	NC_021745	TGAGCC	2	12	42327	42338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525710998
1118	NC_021745	ACGA	2	8	42353	42360	50 %	0 %	25 %	25 %	525710998
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1124	NC_021745	GACG	2	8	42502	42509	25 %	0 %	50 %	25 %	525710998
1125	NC_021745	TGT	2	6	42546	42551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525710998
1126	NC_021745	GCCG	2	8	42563	42570	0 %	0 %	50 %	50 %	525710998
1127	NC_021745	CTG	2	6	42586	42591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525710998
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1130	NC_021745	GTG	2	6	42752	42757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525710998
1131	NC_021745	GCA	2	6	42760	42765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525710998
1132	NC_021745	GGC	2	6	42826	42831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525710998
1133	NC_021745	GCG	2	6	42986	42991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_021745	CGA	2	6	42992	42997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021745	GCA	2	6	43005	43010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021745	CTG	2	6	43044	43049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_021745	AGG	2	6	43065	43070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_021745	A	6	6	43078	43083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_021745	ATGC	2	8	43132	43139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1140	NC_021745	GCC	2	6	43195	43200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1141	NC_021745	CTTTT	3	15	43207	43221	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1142	NC_021745	T	6	6	43218	43223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_021745	AAAGAG	2	12	43236	43247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_021745	AAAG	2	8	43248	43255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_021745	TG	3	6	43428	43433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_021745	GCG	2	6	43554	43559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1147	NC_021745	GGCC	2	8	43571	43578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1152	NC_021745	TTG	2	6	43784	43789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525710999
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1155	NC_021745	T	6	6	43992	43997	0 %	100 %	0 %	0 %	525710999
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1161	NC_021745	GGC	2	6	44388	44393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1162	NC_021745	TCG	2	6	44409	44414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1164	NC_021745	AGCG	2	8	44483	44490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1165	NC_021745	TGG	2	6	44499	44504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_021745	GCTTG	2	10	44595	44604	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1167	NC_021745	GGAT	2	8	44617	44624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_021745	GCA	2	6	44633	44638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1169	NC_021745	GCG	2	6	44663	44668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1170	NC_021745	CG	3	6	44667	44672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1171	NC_021745	GCC	2	6	44745	44750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1172	NC_021745	GC	3	6	44836	44841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1173	NC_021745	GT	3	6	44890	44895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1174	NC_021745	C	6	6	44919	44924	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1175	NC_021745	CTG	2	6	45002	45007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1176	NC_021745	AGA	2	6	45024	45029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1250	NC_021745	ATCG	2	8	47726	47733	25 %	25 %	25 %	25 %	525711002
1251	NC_021745	GCTGGC	2	12	47777	47788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525711002
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1253	NC_021745	CGG	2	6	47872	47877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525711002
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1256	NC_021745	GCTG	2	8	47912	47919	0 %	25 %	50 %	25 %	525711002
1257	NC_021745	CTCG	2	8	47927	47934	0 %	25 %	25 %	50 %	525711002
1258	NC_021745	CGA	2	6	47966	47971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525711002
1259	NC_021745	CGG	2	6	47979	47984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525711002
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1263	NC_021745	GCC	2	6	48060	48065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525711002
1264	NC_021745	CTCG	2	8	48080	48087	0 %	25 %	25 %	50 %	525711002
1265	NC_021745	GCC	2	6	48132	48137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525711002
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1279	NC_021745	GGC	2	6	48754	48759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1280	NC_021745	CCG	2	6	48779	48784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1281	NC_021745	GACC	2	8	48810	48817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1282	NC_021745	GGC	3	9	48834	48842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1283	NC_021745	GGGA	2	8	48852	48859	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1284	NC_021745	GCGGCC	2	12	48908	48919	0 %	0 %	50 %	50 %	525711003
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1287	NC_021745	GGCG	2	8	49081	49088	0 %	0 %	75 %	25 %	525711003
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1291	NC_021745	GTTG	2	8	49195	49202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1292	NC_021745	T	7	7	49325	49331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1293	NC_021745	CCG	2	6	49381	49386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1300	NC_021745	GATT	2	8	49745	49752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1301	NC_021745	CTG	2	6	49755	49760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1302	NC_021745	GC	3	6	49768	49773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1304	NC_021745	CG	3	6	49812	49817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1305	NC_021745	CG	3	6	49876	49881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1306	NC_021745	CGG	2	6	49911	49916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1307	NC_021745	GGCCG	2	10	49920	49929	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1331	NC_021745	GCC	2	6	50959	50964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1376	NC_021745	TTG	2	6	52563	52568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1377	NC_021745	GCTC	2	8	52636	52643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1378	NC_021745	AACTA	2	10	52691	52700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1379	NC_021745	CAT	2	6	52722	52727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1380	NC_021745	CGG	3	9	52758	52766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525711007
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1382	NC_021745	CTG	2	6	52789	52794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525711007
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