MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 10795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	ATTT	2	8	516	523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021040	TATT	2	8	546	553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021040	GAAA	2	8	822	829	75 %	0 %	25 %	0 %	479201825
4	NC_021040	TAAA	2	8	1316	1323	75 %	25 %	0 %	0 %	479201825
5	NC_021040	TGTC	2	8	1648	1655	0 %	50 %	25 %	25 %	479201826
6	NC_021040	TGAA	2	8	1717	1724	50 %	25 %	25 %	0 %	479201826
7	NC_021040	AGAT	2	8	2311	2318	50 %	25 %	25 %	0 %	479201826
8	NC_021040	AAAT	2	8	2610	2617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021040	ATAA	2	8	4535	4542	75 %	25 %	0 %	0 %	479201828
10	NC_021040	AGTT	2	8	4834	4841	25 %	50 %	25 %	0 %	479201828
11	NC_021040	CAAC	2	8	4863	4870	50 %	0 %	0 %	50 %	479201828
12	NC_021040	TAAA	2	8	5399	5406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021040	TAAA	2	8	6126	6133	75 %	25 %	0 %	0 %	479201829
14	NC_021040	GTTT	2	8	6394	6401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021040	TAGG	2	8	6561	6568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021040	GAAA	3	12	7030	7041	75 %	0 %	25 %	0 %	479201831
17	NC_021040	CATA	2	8	7179	7186	50 %	25 %	0 %	25 %	479201832
18	NC_021040	TATT	2	8	7298	7305	25 %	75 %	0 %	0 %	479201832
19	NC_021040	AACA	2	8	7703	7710	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021040	AAAT	2	8	8089	8096	75 %	25 %	0 %	0 %	479201835
21	NC_021040	TATT	2	8	8510	8517	25 %	75 %	0 %	0 %	479201835
22	NC_021040	TGTA	2	8	8637	8644	25 %	50 %	25 %	0 %	479201835
23	NC_021040	AGTA	2	8	8695	8702	50 %	25 %	25 %	0 %	479201835
24	NC_021040	ACAG	2	8	9215	9222	50 %	0 %	25 %	25 %	479201835
25	NC_021040	TGAG	2	8	9961	9968	25 %	25 %	50 %	0 %	479201836
26	NC_021040	AAGT	2	8	10430	10437	50 %	25 %	25 %	0 %	479201836
27	NC_021040	ATAA	2	8	10723	10730	75 %	25 %	0 %	0 %	479201837
28	NC_021040	TTTG	2	8	12965	12972	0 %	75 %	25 %	0 %	479201839
29	NC_021040	GAAG	2	8	13074	13081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021040	CAAT	2	8	13351	13358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021040	CAGC	2	8	13643	13650	25 %	0 %	25 %	50 %	479201840
32	NC_021040	ACAG	2	8	13712	13719	50 %	0 %	25 %	25 %	479201840
33	NC_021040	AATG	2	8	13843	13850	50 %	25 %	25 %	0 %	479201840
34	NC_021040	AGAC	2	8	14248	14255	50 %	0 %	25 %	25 %	479201840
35	NC_021040	TATG	2	8	14630	14637	25 %	50 %	25 %	0 %	479201840
36	NC_021040	TTGA	2	8	14742	14749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021040	CGTA	2	8	14767	14774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021040	AGTA	2	8	15024	15031	50 %	25 %	25 %	0 %	479201841
39	NC_021040	CCGT	2	8	16044	16051	0 %	25 %	25 %	50 %	479201843
40	NC_021040	ATTG	2	8	16090	16097	25 %	50 %	25 %	0 %	479201843
41	NC_021040	CAAT	2	8	16196	16203	50 %	25 %	0 %	25 %	479201843
42	NC_021040	TTAT	2	8	18159	18166	25 %	75 %	0 %	0 %	479201844
43	NC_021040	GTAT	2	8	18622	18629	25 %	50 %	25 %	0 %	479201844
44	NC_021040	GATA	2	8	18970	18977	50 %	25 %	25 %	0 %	479201844
45	NC_021040	AATA	2	8	19046	19053	75 %	25 %	0 %	0 %	479201844
46	NC_021040	CCAG	2	8	19294	19301	25 %	0 %	25 %	50 %	479201845
47	NC_021040	AAAG	2	8	20375	20382	75 %	0 %	25 %	0 %	479201845
48	NC_021040	GATG	2	8	20757	20764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021040	TGGC	2	8	21599	21606	0 %	25 %	50 %	25 %	479201846
50	NC_021040	ATCT	2	8	21621	21628	25 %	50 %	0 %	25 %	479201846
51	NC_021040	TTGT	2	8	21729	21736	0 %	75 %	25 %	0 %	479201846
52	NC_021040	TGGA	2	8	22592	22599	25 %	25 %	50 %	0 %	479201848
53	NC_021040	AAGA	2	8	22727	22734	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
54	NC_021040	AAGA	2	8	22811	22818	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
55	NC_021040	GAAG	2	8	22942	22949	50 %	0 %	50 %	0 %	479201848
56	NC_021040	AAAG	2	8	22954	22961	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
57	NC_021040	AACA	2	8	23216	23223	75 %	0 %	0 %	25 %	479201849
58	NC_021040	ACTG	2	8	23279	23286	25 %	25 %	25 %	25 %	479201849
59	NC_021040	TCTT	2	8	23615	23622	0 %	75 %	0 %	25 %	479201849
60	NC_021040	GATG	2	8	24083	24090	25 %	25 %	50 %	0 %	479201850
61	NC_021040	TGAT	2	8	24121	24128	25 %	50 %	25 %	0 %	479201850
62	NC_021040	TTAT	2	8	24217	24224	25 %	75 %	0 %	0 %	479201850
63	NC_021040	AAGA	2	8	24521	24528	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
64	NC_021040	AGAA	2	8	24734	24741	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
65	NC_021040	GCAG	2	8	24956	24963	25 %	0 %	50 %	25 %	479201850
66	NC_021040	AAAG	2	8	25064	25071	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
67	NC_021040	AGGC	2	8	25258	25265	25 %	0 %	50 %	25 %	479201850
68	NC_021040	CAGT	2	8	25923	25930	25 %	25 %	25 %	25 %	479201851
69	NC_021040	AGAA	2	8	25971	25978	75 %	0 %	25 %	0 %	479201851
70	NC_021040	TTTG	2	8	26252	26259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021040	ATCA	2	8	26314	26321	50 %	25 %	0 %	25 %	479201852
72	NC_021040	TGGA	2	8	27201	27208	25 %	25 %	50 %	0 %	479201852
73	NC_021040	TGAA	2	8	27807	27814	50 %	25 %	25 %	0 %	479201852
74	NC_021040	TACC	2	8	27979	27986	25 %	25 %	0 %	50 %	479201852
75	NC_021040	GACA	2	8	28210	28217	50 %	0 %	25 %	25 %	479201852
76	NC_021040	ATGA	2	8	28445	28452	50 %	25 %	25 %	0 %	479201852
77	NC_021040	ATAA	2	8	28718	28725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021040	AAAT	2	8	28752	28759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021040	AATA	2	8	29031	29038	75 %	25 %	0 %	0 %	479201853
80	NC_021040	GATG	2	8	29063	29070	25 %	25 %	50 %	0 %	479201853
81	NC_021040	ATGG	2	8	29085	29092	25 %	25 %	50 %	0 %	479201853
82	NC_021040	ACGG	2	8	29502	29509	25 %	0 %	50 %	25 %	479201853
83	NC_021040	GCAT	2	8	29666	29673	25 %	25 %	25 %	25 %	479201854
84	NC_021040	TTAT	2	8	29675	29682	25 %	75 %	0 %	0 %	479201854
85	NC_021040	GGCA	2	8	29719	29726	25 %	0 %	50 %	25 %	479201854
86	NC_021040	ATTT	2	8	29786	29793	25 %	75 %	0 %	0 %	479201854
87	NC_021040	TTGA	2	8	31009	31016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021040	GGCA	2	8	31048	31055	25 %	0 %	50 %	25 %	479201855
89	NC_021040	GCAT	2	8	31368	31375	25 %	25 %	25 %	25 %	479201856
90	NC_021040	ACTG	2	8	31760	31767	25 %	25 %	25 %	25 %	479201856
91	NC_021040	CAGA	2	8	32031	32038	50 %	0 %	25 %	25 %	479201856
92	NC_021040	TTGT	2	8	32056	32063	0 %	75 %	25 %	0 %	479201856
93	NC_021040	ATCC	2	8	32221	32228	25 %	25 %	0 %	50 %	479201856
94	NC_021040	CAAT	2	8	32707	32714	50 %	25 %	0 %	25 %	479201856
95	NC_021040	CAAC	2	8	32905	32912	50 %	0 %	0 %	50 %	479201856
96	NC_021040	CATC	2	8	33283	33290	25 %	25 %	0 %	50 %	479201856
97	NC_021040	CTTT	2	8	33372	33379	0 %	75 %	0 %	25 %	479201856
98	NC_021040	AAAC	2	8	33595	33602	75 %	0 %	0 %	25 %	479201856
99	NC_021040	CTTC	2	8	33709	33716	0 %	50 %	0 %	50 %	479201856
100	NC_021040	ACCA	2	8	33897	33904	50 %	0 %	0 %	50 %	479201856
101	NC_021040	GTAA	2	8	34304	34311	50 %	25 %	25 %	0 %	479201857
102	NC_021040	ATTT	2	8	34899	34906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021040	CTTT	2	8	35476	35483	0 %	75 %	0 %	25 %	479201858
104	NC_021040	CTTT	2	8	35491	35498	0 %	75 %	0 %	25 %	479201858
105	NC_021040	ATAA	2	8	35574	35581	75 %	25 %	0 %	0 %	479201858
106	NC_021040	AATG	2	8	35947	35954	50 %	25 %	25 %	0 %	479201859
107	NC_021040	GATC	2	8	36047	36054	25 %	25 %	25 %	25 %	479201859
108	NC_021040	CAGA	2	8	36195	36202	50 %	0 %	25 %	25 %	479201859
109	NC_021040	CTAT	2	8	36232	36239	25 %	50 %	0 %	25 %	479201859
110	NC_021040	GGAC	2	8	36407	36414	25 %	0 %	50 %	25 %	479201859
111	NC_021040	GATC	2	8	36491	36498	25 %	25 %	25 %	25 %	479201859
112	NC_021040	AATG	2	8	36632	36639	50 %	25 %	25 %	0 %	479201859
113	NC_021040	GCAG	2	8	36939	36946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021040	CCTG	2	8	36970	36977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021040	AGGA	2	8	37072	37079	50 %	0 %	50 %	0 %	479201860
116	NC_021040	TCAG	2	8	37084	37091	25 %	25 %	25 %	25 %	479201860
117	NC_021040	TGTT	2	8	38550	38557	0 %	75 %	25 %	0 %	479201862
118	NC_021040	TCCG	2	8	38712	38719	0 %	25 %	25 %	50 %	479201862
119	NC_021040	TGTT	2	8	38787	38794	0 %	75 %	25 %	0 %	479201862
120	NC_021040	TCCG	2	8	38865	38872	0 %	25 %	25 %	50 %	479201862
121	NC_021040	GCAC	2	8	39563	39570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021040	AGAA	2	8	39688	39695	75 %	0 %	25 %	0 %	479201863
123	NC_021040	GCAG	2	8	39855	39862	25 %	0 %	50 %	25 %	479201864
124	NC_021040	AGAC	2	8	40026	40033	50 %	0 %	25 %	25 %	479201864
125	NC_021040	GCAG	2	8	40071	40078	25 %	0 %	50 %	25 %	479201864
126	NC_021040	ATCA	2	8	40753	40760	50 %	25 %	0 %	25 %	479201864
127	NC_021040	TGAA	2	8	41108	41115	50 %	25 %	25 %	0 %	479201864
128	NC_021040	AAAT	2	8	41242	41249	75 %	25 %	0 %	0 %	479201864
129	NC_021040	ATGG	2	8	41331	41338	25 %	25 %	50 %	0 %	479201865
130	NC_021040	TGCT	2	8	42666	42673	0 %	50 %	25 %	25 %	479201866
131	NC_021040	AAGG	2	8	43537	43544	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
132	NC_021040	TTAC	2	8	43877	43884	25 %	50 %	0 %	25 %	479201867
133	NC_021040	AAAG	2	8	44553	44560	75 %	0 %	25 %	0 %	479201867
134	NC_021040	AGGA	2	8	45383	45390	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
135	NC_021040	GCCA	2	8	45947	45954	25 %	0 %	25 %	50 %	479201867
136	NC_021040	ATGT	2	8	45964	45971	25 %	50 %	25 %	0 %	479201867
137	NC_021040	CAGT	2	8	46214	46221	25 %	25 %	25 %	25 %	479201867
138	NC_021040	AGGA	2	8	46346	46353	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
139	NC_021040	ACCA	2	8	47689	47696	50 %	0 %	0 %	50 %	479201868
140	NC_021040	TATC	2	8	47760	47767	25 %	50 %	0 %	25 %	479201868
141	NC_021040	ATTT	2	8	47793	47800	25 %	75 %	0 %	0 %	479201868
142	NC_021040	TATT	2	8	48485	48492	25 %	75 %	0 %	0 %	479201868
143	NC_021040	ATCG	2	8	48507	48514	25 %	25 %	25 %	25 %	479201868
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161	NC_021040	ATGG	2	8	52992	52999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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