MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 52302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	ATT	3	9	8	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021040	TGA	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021040	GAA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021040	TAT	2	6	71	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021040	ATT	2	6	150	155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021040	AGT	2	6	398	403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021040	CAA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021040	GAT	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021040	ATA	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021040	TAG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021040	GAA	2	6	594	599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021040	AAT	2	6	604	609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021040	TGA	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201825
14	NC_021040	TGC	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201825
15	NC_021040	GAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
16	NC_021040	GAA	2	6	868	873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
17	NC_021040	TAG	2	6	989	994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201825
18	NC_021040	GAA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
19	NC_021040	TGT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201825
20	NC_021040	TAT	2	6	1245	1250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201825
21	NC_021040	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
22	NC_021040	AGG	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201825
23	NC_021040	TAT	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
24	NC_021040	TAA	2	6	1399	1404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201826
25	NC_021040	ATT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
26	NC_021040	AGT	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
27	NC_021040	TAG	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
28	NC_021040	TAT	2	6	1584	1589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
29	NC_021040	TAT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
30	NC_021040	CAT	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201826
31	NC_021040	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201826
32	NC_021040	ATT	2	6	1921	1926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
33	NC_021040	AGC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201826
34	NC_021040	ATG	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
35	NC_021040	CAA	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201826
36	NC_021040	TTG	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201826
37	NC_021040	CTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201826
38	NC_021040	TTA	2	6	2373	2378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
39	NC_021040	GAT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
40	NC_021040	AAT	2	6	2475	2480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201826
41	NC_021040	TGG	2	6	2535	2540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201826
42	NC_021040	CTG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201826
43	NC_021040	ATG	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
44	NC_021040	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021040	TGC	2	6	2619	2624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021040	GAT	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021040	ATG	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021040	TGC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021040	GGA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201827
50	NC_021040	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201827
51	NC_021040	ATA	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201827
52	NC_021040	ATG	3	9	2984	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
53	NC_021040	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
54	NC_021040	CAG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201827
55	NC_021040	ATG	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
56	NC_021040	CAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201827
57	NC_021040	GTT	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201827
58	NC_021040	AAT	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201827
59	NC_021040	ATA	2	6	3437	3442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021040	ATA	2	6	4431	4436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021040	GGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021040	AAT	2	6	4543	4548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201828
63	NC_021040	GCA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201828
64	NC_021040	CAT	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201828
65	NC_021040	CAT	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201828
66	NC_021040	AAG	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201828
67	NC_021040	GGA	2	6	4769	4774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201828
68	NC_021040	GTG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201828
69	NC_021040	AGC	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201828
70	NC_021040	AGA	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201828
71	NC_021040	AAT	2	6	5066	5071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021040	GTT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021040	TAA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021040	GTA	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021040	TTG	2	6	5198	5203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021040	TTA	2	6	5206	5211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021040	GTT	3	9	5319	5327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021040	TAT	2	6	5366	5371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021040	TAA	2	6	5374	5379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021040	TAG	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021040	CTG	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021040	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201829
83	NC_021040	ATA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201829
84	NC_021040	ATT	2	6	5615	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
85	NC_021040	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
86	NC_021040	ACA	2	6	5689	5694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201829
87	NC_021040	AGA	2	6	5713	5718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201829
88	NC_021040	GTT	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201829
89	NC_021040	TGA	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201829
90	NC_021040	AAG	2	6	5994	5999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201829
91	NC_021040	ATT	2	6	6159	6164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
92	NC_021040	AGT	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201829
93	NC_021040	GAT	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021040	GAA	2	6	6325	6330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021040	ACA	2	6	6355	6360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021040	TGT	2	6	6402	6407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021040	ATA	2	6	6485	6490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021040	GAT	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201830
99	NC_021040	TCA	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201830
100	NC_021040	TAA	2	6	6787	6792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201830
101	NC_021040	AGG	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201830
102	NC_021040	ATG	2	6	6912	6917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201831
103	NC_021040	AGC	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201831
104	NC_021040	ATA	2	6	7042	7047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201831
105	NC_021040	GGT	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201832
106	NC_021040	GTT	2	6	7319	7324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201832
107	NC_021040	TAA	2	6	7479	7484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201832
108	NC_021040	ATT	2	6	7508	7513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201832
109	NC_021040	TTA	2	6	7550	7555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201832
110	NC_021040	TGC	2	6	7570	7575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201832
111	NC_021040	ACT	2	6	7576	7581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201832
112	NC_021040	AGG	2	6	7747	7752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021040	ATA	2	6	7756	7761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021040	TAT	2	6	7823	7828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201833
115	NC_021040	AGG	2	6	7865	7870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201833
116	NC_021040	TAA	2	6	7891	7896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201833
117	NC_021040	AAG	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201834
118	NC_021040	AAT	2	6	8033	8038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021040	TTG	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021040	AAC	2	6	8101	8106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201835
121	NC_021040	AGC	2	6	8170	8175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201835
122	NC_021040	GCA	2	6	8201	8206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201835
123	NC_021040	AAC	2	6	8278	8283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201835
124	NC_021040	AAT	2	6	8288	8293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201835
125	NC_021040	CAG	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201835
126	NC_021040	AAC	2	6	8473	8478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201835
127	NC_021040	ATT	2	6	8550	8555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201835
128	NC_021040	ATT	2	6	8631	8636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201835
129	NC_021040	ATT	2	6	8688	8693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201835
130	NC_021040	AGG	2	6	8767	8772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201835
131	NC_021040	CTA	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201835
132	NC_021040	CAA	2	6	8886	8891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201835
133	NC_021040	TGA	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201835
134	NC_021040	GTT	2	6	9134	9139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201835
135	NC_021040	TAA	2	6	9295	9300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201835
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262	NC_021040	TTG	2	6	19456	19461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201845
263	NC_021040	ATG	2	6	19582	19587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201845
264	NC_021040	GGT	2	6	19596	19601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201845
265	NC_021040	ATT	2	6	19758	19763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201845
266	NC_021040	AGC	2	6	19775	19780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201845
267	NC_021040	AAG	2	6	19884	19889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201845
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270	NC_021040	GCA	2	6	20023	20028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201845
271	NC_021040	TAT	2	6	20090	20095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201845
272	NC_021040	ATT	2	6	20105	20110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201845
273	NC_021040	TAT	2	6	20181	20186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201845
274	NC_021040	TTC	2	6	20239	20244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201845
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277	NC_021040	AAG	2	6	20433	20438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201845
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284	NC_021040	TTC	2	6	20603	20608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201845
285	NC_021040	ATC	2	6	20637	20642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201845
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287	NC_021040	TCT	2	6	20805	20810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_021040	GGA	2	6	20982	20987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021040	TGC	2	6	20990	20995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_021040	TGA	2	6	21150	21155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021040	GAT	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021040	GCA	2	6	21204	21209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_021040	AGG	2	6	21274	21279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_021040	ATC	2	6	21684	21689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201846
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386	NC_021040	GAT	2	6	28804	28809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_021040	GAA	2	6	28877	28882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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