MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021040	AATA	2	8	187544	187551	75 %	25 %	0 %	0 %	479201980
4002	NC_021040	AAT	2	6	187618	187623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021040	TAT	2	6	187712	187717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021040	GT	3	6	187721	187726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021040	TAAGCG	2	12	187802	187813	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4006	NC_021040	A	8	8	187827	187834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021040	TTGAC	2	10	187840	187849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4008	NC_021040	TTG	3	9	187872	187880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021040	AT	3	6	187917	187922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021040	ACA	2	6	187957	187962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_021040	AGA	2	6	188000	188005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_021040	CAAG	2	8	188011	188018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_021040	TACA	2	8	188025	188032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_021040	TAAAT	2	10	188054	188063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021040	AG	3	6	188090	188095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021040	TAG	2	6	188113	188118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021040	A	6	6	188184	188189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021040	AT	4	8	188283	188290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021040	GAA	2	6	188297	188302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021040	AAGGA	2	10	188311	188320	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021040	AT	3	6	188338	188343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021040	TGA	2	6	188491	188496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021040	AGA	2	6	188510	188515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021040	GAA	2	6	188558	188563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021040	ATG	2	6	188583	188588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201981
4026	NC_021040	GAA	2	6	188624	188629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201981
4027	NC_021040	GAA	2	6	188658	188663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201981
4028	NC_021040	AT	3	6	188688	188693	50 %	50 %	0 %	0 %	479201981
4029	NC_021040	TGT	2	6	188795	188800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201981
4030	NC_021040	TA	3	6	188923	188928	50 %	50 %	0 %	0 %	479201982
4031	NC_021040	AAAAG	2	10	188968	188977	80 %	0 %	20 %	0 %	479201982
4032	NC_021040	T	7	7	189129	189135	0 %	100 %	0 %	0 %	479201982
4033	NC_021040	GTT	2	6	189186	189191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201982
4034	NC_021040	ATA	2	6	189212	189217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201982
4035	NC_021040	TGG	2	6	189240	189245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201982
4036	NC_021040	TAA	2	6	189249	189254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201982
4037	NC_021040	ATTG	2	8	189256	189263	25 %	50 %	25 %	0 %	479201982
4038	NC_021040	AT	3	6	189311	189316	50 %	50 %	0 %	0 %	479201982
4039	NC_021040	GAAA	2	8	189321	189328	75 %	0 %	25 %	0 %	479201982
4040	NC_021040	GTTT	2	8	189335	189342	0 %	75 %	25 %	0 %	479201982
4041	NC_021040	TGA	2	6	189407	189412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201982
4042	NC_021040	GAG	2	6	189427	189432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201982
4043	NC_021040	A	6	6	189447	189452	100 %	0 %	0 %	0 %	479201982
4044	NC_021040	GT	3	6	189453	189458	0 %	50 %	50 %	0 %	479201982
4045	NC_021040	ATT	2	6	189503	189508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201982
4046	NC_021040	A	6	6	189636	189641	100 %	0 %	0 %	0 %	479201982
4047	NC_021040	GAT	2	6	189697	189702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201982
4048	NC_021040	TAA	2	6	189705	189710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201982
4049	NC_021040	AGAA	2	8	189734	189741	75 %	0 %	25 %	0 %	479201982
4050	NC_021040	TAA	2	6	189791	189796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201982
4051	NC_021040	AGAA	2	8	189810	189817	75 %	0 %	25 %	0 %	479201982
4052	NC_021040	GA	3	6	189818	189823	50 %	0 %	50 %	0 %	479201982
4053	NC_021040	AGTAA	2	10	189826	189835	60 %	20 %	20 %	0 %	479201982
4054	NC_021040	ATG	2	6	189953	189958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201982
4055	NC_021040	AGA	2	6	189973	189978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201982
4056	NC_021040	GAA	2	6	190027	190032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201982
4057	NC_021040	GATAC	2	10	190121	190130	40 %	20 %	20 %	20 %	479201982
4058	NC_021040	ATA	2	6	190150	190155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201982
4059	NC_021040	TGA	2	6	190251	190256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201982
4060	NC_021040	ATA	2	6	190313	190318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201982
4061	NC_021040	GA	3	6	190382	190387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021040	TTG	2	6	190425	190430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021040	TA	3	6	190436	190441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_021040	ATG	2	6	190456	190461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021040	TA	4	8	190462	190469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021040	AT	3	6	190493	190498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021040	T	7	7	190511	190517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021040	AT	3	6	190615	190620	50 %	50 %	0 %	0 %	479201983
4069	NC_021040	A	6	6	190663	190668	100 %	0 %	0 %	0 %	479201983
4070	NC_021040	A	7	7	190679	190685	100 %	0 %	0 %	0 %	479201983
4071	NC_021040	GAGATA	2	12	190691	190702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479201983
4072	NC_021040	ATTGA	2	10	190727	190736	40 %	40 %	20 %	0 %	479201983
4073	NC_021040	ATTT	2	8	190737	190744	25 %	75 %	0 %	0 %	479201983
4074	NC_021040	TAG	2	6	190857	190862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201983
4075	NC_021040	TGG	2	6	190916	190921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021040	AT	3	6	190953	190958	50 %	50 %	0 %	0 %	479201984
4077	NC_021040	A	6	6	191025	191030	100 %	0 %	0 %	0 %	479201984
4078	NC_021040	TGAT	2	8	191064	191071	25 %	50 %	25 %	0 %	479201984
4079	NC_021040	GAAT	2	8	191092	191099	50 %	25 %	25 %	0 %	479201984
4080	NC_021040	GTT	2	6	191186	191191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201984
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4085	NC_021040	AT	3	6	191269	191274	50 %	50 %	0 %	0 %	479201984
4086	NC_021040	A	7	7	191358	191364	100 %	0 %	0 %	0 %	479201984
4087	NC_021040	GATA	2	8	191434	191441	50 %	25 %	25 %	0 %	479201984
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4090	NC_021040	A	7	7	191539	191545	100 %	0 %	0 %	0 %	479201984
4091	NC_021040	T	6	6	191548	191553	0 %	100 %	0 %	0 %	479201984
4092	NC_021040	AAG	2	6	191558	191563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201984
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4094	NC_021040	TGA	2	6	191697	191702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201984
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4096	NC_021040	GAA	2	6	191765	191770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201984
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4098	NC_021040	G	6	6	191862	191867	0 %	0 %	100 %	0 %	479201984
4099	NC_021040	GAT	2	6	191918	191923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201984
4100	NC_021040	ATT	2	6	191931	191936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201984
4101	NC_021040	TAC	2	6	192016	192021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201984
4102	NC_021040	GGT	2	6	192023	192028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201984
4103	NC_021040	GAT	2	6	192121	192126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201984
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4106	NC_021040	ATG	2	6	192253	192258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201985
4107	NC_021040	ATATT	2	10	192277	192286	40 %	60 %	0 %	0 %	479201985
4108	NC_021040	GAT	2	6	192327	192332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201985
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4110	NC_021040	GAAA	2	8	192398	192405	75 %	0 %	25 %	0 %	479201985
4111	NC_021040	TAAA	2	8	192421	192428	75 %	25 %	0 %	0 %	479201985
4112	NC_021040	A	6	6	192438	192443	100 %	0 %	0 %	0 %	479201985
4113	NC_021040	ATG	2	6	192601	192606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201985
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4119	NC_021040	AG	3	6	192838	192843	50 %	0 %	50 %	0 %	479201985
4120	NC_021040	A	6	6	192869	192874	100 %	0 %	0 %	0 %	479201985
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4123	NC_021040	AT	3	6	193007	193012	50 %	50 %	0 %	0 %	479201985
4124	NC_021040	A	6	6	193019	193024	100 %	0 %	0 %	0 %	479201985
4125	NC_021040	TA	3	6	193120	193125	50 %	50 %	0 %	0 %	479201985
4126	NC_021040	TA	3	6	193176	193181	50 %	50 %	0 %	0 %	479201985
4127	NC_021040	GAA	2	6	193237	193242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201985
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4255	NC_021040	TAA	2	6	198168	198173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201989
4256	NC_021040	TCC	2	6	198220	198225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4257	NC_021040	TGT	2	6	198243	198248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_021040	T	6	6	198325	198330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_021040	TTA	2	6	198477	198482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_021040	ATT	2	6	198588	198593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_021040	A	6	6	198629	198634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_021040	GCAG	2	8	198653	198660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4263	NC_021040	TGGA	2	8	198661	198668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_021040	A	6	6	198671	198676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_021040	A	7	7	198679	198685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_021040	AGAA	2	8	198701	198708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_021040	GATG	2	8	198753	198760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_021040	AAC	2	6	198826	198831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4269	NC_021040	TGA	2	6	198923	198928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_021040	GGC	2	6	198940	198945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4271	NC_021040	CTT	2	6	199033	199038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4272	NC_021040	GGA	2	6	199122	199127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_021040	CTG	2	6	199186	199191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4274	NC_021040	AAAAT	2	10	199279	199288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4275	NC_021040	ATA	2	6	199299	199304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4276	NC_021040	AGCGA	2	10	199314	199323	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4277	NC_021040	A	7	7	199372	199378	100 %	0 %	0 %	0 %	479201990
4278	NC_021040	A	6	6	199384	199389	100 %	0 %	0 %	0 %	479201990
4279	NC_021040	AT	3	6	199436	199441	50 %	50 %	0 %	0 %	479201990
4280	NC_021040	AGG	2	6	199492	199497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4281	NC_021040	AGC	2	6	199545	199550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201991
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4285	NC_021040	AT	3	6	199806	199811	50 %	50 %	0 %	0 %	479201991
4286	NC_021040	CAG	2	6	199826	199831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201991
4287	NC_021040	ATG	2	6	199880	199885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201991
4288	NC_021040	TCT	2	6	199899	199904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201991
4289	NC_021040	GGAG	2	8	199908	199915	25 %	0 %	75 %	0 %	479201991
4290	NC_021040	TGC	2	6	199998	200003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201992
4291	NC_021040	CCG	2	6	200049	200054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201992
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4293	NC_021040	CAGTA	2	10	200237	200246	40 %	20 %	20 %	20 %	479201992
4294	NC_021040	CGA	2	6	200257	200262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201992
4295	NC_021040	TCAGGT	2	12	200278	200289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479201992
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4297	NC_021040	TCA	2	6	200422	200427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4298	NC_021040	AATA	2	8	200432	200439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4299	NC_021040	GGAA	2	8	200517	200524	50 %	0 %	50 %	0 %	479201993
4300	NC_021040	TTC	2	6	200528	200533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201993
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4328	NC_021040	AAAATT	2	12	202178	202189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4329	NC_021040	A	6	6	202228	202233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4330	NC_021040	CAT	2	6	202259	202264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4331	NC_021040	A	6	6	202324	202329	100 %	0 %	0 %	0 %	479201994
4332	NC_021040	CAA	2	6	202400	202405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201994
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4335	NC_021040	GTA	2	6	202476	202481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201994
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4350	NC_021040	AAG	2	6	203215	203220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4351	NC_021040	ATA	2	6	203257	203262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4352	NC_021040	ATA	2	6	203299	203304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_021040	GAA	2	6	203307	203312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4354	NC_021040	A	7	7	203348	203354	100 %	0 %	0 %	0 %	479201996
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4371	NC_021040	TTA	2	6	203931	203936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_021040	AAATG	2	10	203948	203957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_021040	ATGA	2	8	204077	204084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_021040	GAT	2	6	204088	204093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_021040	CGCC	2	8	204115	204122	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4376	NC_021040	TGCA	2	8	204157	204164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4377	NC_021040	TCAT	2	8	204177	204184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4378	NC_021040	GAA	2	6	204205	204210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_021040	CA	3	6	204237	204242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4381	NC_021040	ATT	2	6	204278	204283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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