MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021040	TG	3	6	141081	141086	0 %	50 %	50 %	0 %	479201937
3002	NC_021040	CGA	2	6	141101	141106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201937
3003	NC_021040	GCC	2	6	141195	141200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201937
3004	NC_021040	TCT	2	6	141218	141223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201937
3005	NC_021040	ATT	2	6	141271	141276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201937
3006	NC_021040	AGC	2	6	141337	141342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201937
3007	NC_021040	GGTTT	2	10	141379	141388	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021040	T	6	6	141408	141413	0 %	100 %	0 %	0 %	479201938
3009	NC_021040	A	6	6	141429	141434	100 %	0 %	0 %	0 %	479201938
3010	NC_021040	GTGG	2	8	141444	141451	0 %	25 %	75 %	0 %	479201938
3011	NC_021040	GCA	2	6	141462	141467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201938
3012	NC_021040	CA	3	6	141466	141471	50 %	0 %	0 %	50 %	479201938
3013	NC_021040	ATA	2	6	141510	141515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201938
3014	NC_021040	TG	3	6	141559	141564	0 %	50 %	50 %	0 %	479201938
3015	NC_021040	GGA	2	6	141584	141589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201938
3016	NC_021040	GAT	2	6	141624	141629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201938
3017	NC_021040	AAG	2	6	141736	141741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201938
3018	NC_021040	AAG	2	6	141800	141805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201938
3019	NC_021040	ATT	2	6	141850	141855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201938
3020	NC_021040	AATC	2	8	141859	141866	50 %	25 %	0 %	25 %	479201938
3021	NC_021040	A	8	8	141878	141885	100 %	0 %	0 %	0 %	479201938
3022	NC_021040	ACAGC	2	10	141927	141936	40 %	0 %	20 %	40 %	479201938
3023	NC_021040	ATT	2	6	141994	141999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201938
3024	NC_021040	TCG	2	6	142057	142062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201938
3025	NC_021040	A	6	6	142189	142194	100 %	0 %	0 %	0 %	479201938
3026	NC_021040	GAA	2	6	142236	142241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201938
3027	NC_021040	GTG	2	6	142284	142289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201938
3028	NC_021040	GTTT	2	8	142310	142317	0 %	75 %	25 %	0 %	479201938
3029	NC_021040	CGG	2	6	142408	142413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201938
3030	NC_021040	CAG	2	6	142414	142419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201938
3031	NC_021040	AC	3	6	142431	142436	50 %	0 %	0 %	50 %	479201938
3032	NC_021040	GCA	2	6	142620	142625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201938
3033	NC_021040	GTG	2	6	142626	142631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201938
3034	NC_021040	CGG	2	6	142720	142725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201938
3035	NC_021040	A	8	8	142766	142773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021040	TGC	2	6	142783	142788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021040	TAT	2	6	142833	142838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021040	ACA	2	6	142853	142858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021040	TTCA	2	8	142960	142967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_021040	CTG	2	6	143004	143009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_021040	GTA	2	6	143118	143123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_021040	AGA	2	6	143135	143140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021040	CGG	2	6	143179	143184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_021040	GA	3	6	143229	143234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021040	CGC	2	6	143428	143433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_021040	GAT	2	6	143475	143480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021040	ATGG	2	8	143483	143490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021040	GGT	2	6	143502	143507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021040	AGC	2	6	143623	143628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021040	GGT	2	6	143639	143644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021040	TCC	2	6	143655	143660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_021040	A	6	6	143729	143734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021040	GTT	2	6	143785	143790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021040	TCATAA	2	12	143857	143868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3055	NC_021040	CAAAAT	2	12	143925	143936	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3056	NC_021040	CAT	2	6	143944	143949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_021040	A	6	6	143980	143985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_021040	A	6	6	143997	144002	100 %	0 %	0 %	0 %	479201939
3059	NC_021040	TGC	2	6	144107	144112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201939
3060	NC_021040	GCT	2	6	144157	144162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201939
3061	NC_021040	TCA	2	6	144163	144168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201939
3062	NC_021040	AAT	2	6	144249	144254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201939
3063	NC_021040	T	7	7	144267	144273	0 %	100 %	0 %	0 %	479201939
3064	NC_021040	GGT	2	6	144324	144329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201939
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3066	NC_021040	CCG	2	6	144400	144405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201939
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3068	NC_021040	CGG	2	6	144496	144501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201939
3069	NC_021040	CGG	2	6	144656	144661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201939
3070	NC_021040	GTG	2	6	144730	144735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201939
3071	NC_021040	GGAAAC	2	12	144792	144803	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479201939
3072	NC_021040	CTTT	2	8	144837	144844	0 %	75 %	0 %	25 %	479201940
3073	NC_021040	CCG	2	6	144872	144877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201940
3074	NC_021040	ACGA	2	8	144878	144885	50 %	0 %	25 %	25 %	479201940
3075	NC_021040	CGG	2	6	144897	144902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201940
3076	NC_021040	GA	3	6	144915	144920	50 %	0 %	50 %	0 %	479201940
3077	NC_021040	GCC	2	6	144961	144966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201940
3078	NC_021040	CAT	2	6	144999	145004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201940
3079	NC_021040	GCC	2	6	145014	145019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201940
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3081	NC_021040	GAC	2	6	145072	145077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201940
3082	NC_021040	GTGA	2	8	145121	145128	25 %	25 %	50 %	0 %	479201940
3083	NC_021040	GC	3	6	145147	145152	0 %	0 %	50 %	50 %	479201940
3084	NC_021040	GCAATA	2	12	145214	145225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479201940
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3086	NC_021040	A	6	6	145414	145419	100 %	0 %	0 %	0 %	479201940
3087	NC_021040	CAG	2	6	145423	145428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201940
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3090	NC_021040	CAGA	2	8	145751	145758	50 %	0 %	25 %	25 %	479201940
3091	NC_021040	TTCC	2	8	145819	145826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_021040	A	6	6	145850	145855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021040	GGT	2	6	145908	145913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021040	AAC	3	9	145922	145930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_021040	ATA	2	6	145939	145944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021040	A	6	6	145944	145949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021040	TAA	2	6	145966	145971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021040	A	6	6	145988	145993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021040	AT	3	6	146012	146017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021040	T	6	6	146138	146143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021040	A	7	7	146158	146164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021040	TGG	2	6	146204	146209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021040	TAT	2	6	146225	146230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021040	CAA	2	6	146246	146251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_021040	A	6	6	146250	146255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021040	GAAA	2	8	146276	146283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021040	AGC	2	6	146309	146314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_021040	ATG	2	6	146362	146367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021040	CCG	2	6	146373	146378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_021040	AGGAAA	2	12	146399	146410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021040	GTT	2	6	146415	146420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021040	GGT	2	6	146443	146448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021040	TAA	2	6	146538	146543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021040	AC	3	6	146633	146638	50 %	0 %	0 %	50 %	479201941
3115	NC_021040	ACA	2	6	146668	146673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201941
3116	NC_021040	AC	3	6	146683	146688	50 %	0 %	0 %	50 %	479201941
3117	NC_021040	TGG	2	6	146768	146773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201941
3118	NC_021040	GGA	2	6	146781	146786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201941
3119	NC_021040	TGC	3	9	146801	146809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201941
3120	NC_021040	AC	3	6	146907	146912	50 %	0 %	0 %	50 %	479201941
3121	NC_021040	TCAT	2	8	146930	146937	25 %	50 %	0 %	25 %	479201941
3122	NC_021040	CAT	2	6	146946	146951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201941
3123	NC_021040	AACA	2	8	146989	146996	75 %	0 %	0 %	25 %	479201941
3124	NC_021040	GAA	2	6	147058	147063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021040	TTA	2	6	147074	147079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021040	T	6	6	147087	147092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021040	A	7	7	147139	147145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021040	A	6	6	147194	147199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021040	CAT	2	6	147215	147220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3131	NC_021040	TAA	2	6	147304	147309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021040	TAT	2	6	147311	147316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3134	NC_021040	TA	3	6	147434	147439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_021040	TATT	2	8	147832	147839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_021040	ATCAT	2	10	147887	147896	40 %	40 %	0 %	20 %	479201943
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