MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021040	CTT	2	6	118063	118068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201921
2502	NC_021040	T	6	6	118107	118112	0 %	100 %	0 %	0 %	479201921
2503	NC_021040	CAG	2	6	118151	118156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201921
2504	NC_021040	TCTT	2	8	118206	118213	0 %	75 %	0 %	25 %	479201921
2505	NC_021040	TC	3	6	118215	118220	0 %	50 %	0 %	50 %	479201921
2506	NC_021040	GCA	2	6	118273	118278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201921
2507	NC_021040	CAA	2	6	118301	118306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201921
2508	NC_021040	CAT	2	6	118313	118318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201921
2509	NC_021040	CAG	2	6	118442	118447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201921
2510	NC_021040	CAG	2	6	118451	118456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201921
2511	NC_021040	TAT	2	6	118508	118513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201921
2512	NC_021040	CTG	2	6	118526	118531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201921
2513	NC_021040	TGC	2	6	118551	118556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201921
2514	NC_021040	T	6	6	118599	118604	0 %	100 %	0 %	0 %	479201921
2515	NC_021040	T	6	6	118628	118633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_021040	ATG	2	6	118708	118713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_021040	A	7	7	118748	118754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021040	AAC	2	6	118761	118766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_021040	GAAA	2	8	118806	118813	75 %	0 %	25 %	0 %	479201922
2520	NC_021040	TTC	2	6	118823	118828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201922
2521	NC_021040	CA	3	6	118883	118888	50 %	0 %	0 %	50 %	479201922
2522	NC_021040	T	6	6	118943	118948	0 %	100 %	0 %	0 %	479201922
2523	NC_021040	AGT	2	6	118963	118968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201922
2524	NC_021040	AGA	2	6	119007	119012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201922
2525	NC_021040	ACA	2	6	119031	119036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201922
2526	NC_021040	TCG	2	6	119088	119093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201922
2527	NC_021040	TACA	2	8	119101	119108	50 %	25 %	0 %	25 %	479201922
2528	NC_021040	TTTC	2	8	119211	119218	0 %	75 %	0 %	25 %	479201922
2529	NC_021040	AGCG	2	8	119387	119394	25 %	0 %	50 %	25 %	479201922
2530	NC_021040	TCA	2	6	119520	119525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201922
2531	NC_021040	GA	3	6	119562	119567	50 %	0 %	50 %	0 %	479201922
2532	NC_021040	CGG	2	6	119596	119601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201922
2533	NC_021040	ATT	2	6	119618	119623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201922
2534	NC_021040	AAG	2	6	119643	119648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201922
2535	NC_021040	GAT	2	6	119692	119697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201922
2536	NC_021040	A	7	7	119819	119825	100 %	0 %	0 %	0 %	479201922
2537	NC_021040	A	7	7	119880	119886	100 %	0 %	0 %	0 %	479201922
2538	NC_021040	ATA	2	6	119945	119950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201922
2539	NC_021040	CTG	2	6	119972	119977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201922
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2541	NC_021040	TGC	2	6	120100	120105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201923
2542	NC_021040	TTG	2	6	120174	120179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201923
2543	NC_021040	AGTAA	2	10	120195	120204	60 %	20 %	20 %	0 %	479201923
2544	NC_021040	A	7	7	120209	120215	100 %	0 %	0 %	0 %	479201923
2545	NC_021040	TAAA	2	8	120256	120263	75 %	25 %	0 %	0 %	479201923
2546	NC_021040	CATGC	2	10	120270	120279	20 %	20 %	20 %	40 %	479201923
2547	NC_021040	AT	3	6	120347	120352	50 %	50 %	0 %	0 %	479201923
2548	NC_021040	A	6	6	120435	120440	100 %	0 %	0 %	0 %	479201923
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2551	NC_021040	TGCA	2	8	120466	120473	25 %	25 %	25 %	25 %	479201923
2552	NC_021040	TACAG	2	10	120503	120512	40 %	20 %	20 %	20 %	479201923
2553	NC_021040	CTG	2	6	120587	120592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201923
2554	NC_021040	CGG	2	6	120593	120598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201923
2555	NC_021040	A	6	6	120683	120688	100 %	0 %	0 %	0 %	479201923
2556	NC_021040	ATA	2	6	120696	120701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201923
2557	NC_021040	ATA	2	6	120777	120782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_021040	ATGC	2	8	120802	120809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2559	NC_021040	TAAAA	2	10	120838	120847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_021040	GA	3	6	120872	120877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_021040	A	6	6	120935	120940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_021040	A	6	6	120966	120971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_021040	T	6	6	120972	120977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_021040	CA	4	8	120978	120985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2565	NC_021040	A	6	6	121004	121009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_021040	ACT	2	6	121024	121029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_021040	GGC	2	6	121030	121035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_021040	TTC	2	6	121062	121067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_021040	AGA	2	6	121111	121116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_021040	AAC	2	6	121126	121131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_021040	CAG	2	6	121175	121180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_021040	ACAG	2	8	121192	121199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_021040	ACA	2	6	121253	121258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_021040	CGGA	2	8	121269	121276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2575	NC_021040	GGA	2	6	121279	121284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_021040	TTCT	2	8	121356	121363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2577	NC_021040	TAT	2	6	121385	121390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_021040	GGC	2	6	121502	121507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_021040	GAC	2	6	121522	121527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_021040	GCGT	2	8	121542	121549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2581	NC_021040	AG	3	6	121690	121695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_021040	GA	3	6	121828	121833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_021040	GCA	2	6	121916	121921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_021040	GCA	2	6	122009	122014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_021040	TA	3	6	122046	122051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_021040	CTT	2	6	122061	122066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_021040	GAT	2	6	122120	122125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_021040	GAT	2	6	122333	122338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_021040	CTT	2	6	122409	122414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_021040	TGT	2	6	122533	122538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_021040	A	6	6	122561	122566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_021040	GAT	2	6	122792	122797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_021040	CAG	2	6	122964	122969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_021040	N	429	429	122981	123409	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_021040	ACC	2	6	123428	123433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201924
2596	NC_021040	CGA	2	6	123453	123458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201924
2597	NC_021040	GAT	2	6	123539	123544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201924
2598	NC_021040	TGA	2	6	123569	123574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201924
2599	NC_021040	TGTT	2	8	123591	123598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_021040	TTTA	2	8	123630	123637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_021040	GTG	2	6	123658	123663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201925
2602	NC_021040	GCA	2	6	123664	123669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201925
2603	NC_021040	AG	3	6	123838	123843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_021040	ATG	2	6	123865	123870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201926
2605	NC_021040	T	7	7	123875	123881	0 %	100 %	0 %	0 %	479201926
2606	NC_021040	T	6	6	123999	124004	0 %	100 %	0 %	0 %	479201926
2607	NC_021040	GGCT	2	8	124011	124018	0 %	25 %	50 %	25 %	479201926
2608	NC_021040	GGC	2	6	124029	124034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201926
2609	NC_021040	GGT	2	6	124082	124087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201926
2610	NC_021040	TATT	2	8	124153	124160	25 %	75 %	0 %	0 %	479201926
2611	NC_021040	ATG	2	6	124215	124220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201926
2612	NC_021040	ATG	2	6	124278	124283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201926
2613	NC_021040	TCG	2	6	124288	124293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201926
2614	NC_021040	CTG	2	6	124331	124336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201926
2615	NC_021040	GC	3	6	124416	124421	0 %	0 %	50 %	50 %	479201926
2616	NC_021040	GA	3	6	124487	124492	50 %	0 %	50 %	0 %	479201926
2617	NC_021040	ATG	2	6	124522	124527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201926
2618	NC_021040	TCC	2	6	124587	124592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201926
2619	NC_021040	A	6	6	124625	124630	100 %	0 %	0 %	0 %	479201926
2620	NC_021040	GGT	2	6	124652	124657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201926
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2622	NC_021040	AGA	2	6	124805	124810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201926
2623	NC_021040	GCA	2	6	124875	124880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201926
2624	NC_021040	CTT	2	6	124954	124959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201926
2625	NC_021040	TAT	2	6	124967	124972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201926
2626	NC_021040	GAT	2	6	125009	125014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201926
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2628	NC_021040	GA	3	6	125119	125124	50 %	0 %	50 %	0 %	479201926
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2755	NC_021040	ATTT	2	8	131112	131119	25 %	75 %	0 %	0 %	479201931
2756	NC_021040	TGC	2	6	131144	131149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201931
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2774	NC_021040	AAC	2	6	131931	131936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2865	NC_021040	TG	3	6	136028	136033	0 %	50 %	50 %	0 %	479201934
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2869	NC_021040	GGTGA	2	10	136165	136174	20 %	20 %	60 %	0 %	479201934
2870	NC_021040	CCGG	2	8	136185	136192	0 %	0 %	50 %	50 %	479201934
2871	NC_021040	A	6	6	136203	136208	100 %	0 %	0 %	0 %	479201934
2872	NC_021040	ACCTAT	2	12	136222	136233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201934
2873	NC_021040	GGA	2	6	136263	136268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201934
2874	NC_021040	A	7	7	136304	136310	100 %	0 %	0 %	0 %	479201934
2875	NC_021040	AGTG	2	8	136342	136349	25 %	25 %	50 %	0 %	479201934
2876	NC_021040	CAG	2	6	136408	136413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201934
2877	NC_021040	ATG	2	6	136463	136468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201934
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