MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021040	TAT	2	6	68554	68559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201886
1502	NC_021040	GAA	2	6	68582	68587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201886
1503	NC_021040	GGT	2	6	68618	68623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201886
1504	NC_021040	TACAG	2	10	68714	68723	40 %	20 %	20 %	20 %	479201886
1505	NC_021040	GCAA	2	8	68786	68793	50 %	0 %	25 %	25 %	479201886
1506	NC_021040	GAA	2	6	68801	68806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201886
1507	NC_021040	CAA	2	6	68892	68897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201886
1508	NC_021040	AGG	2	6	69048	69053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201886
1509	NC_021040	TCC	2	6	69206	69211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201886
1510	NC_021040	GCA	2	6	69224	69229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201886
1511	NC_021040	GCA	2	6	69287	69292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201886
1512	NC_021040	TAT	2	6	69379	69384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201886
1513	NC_021040	ATC	2	6	69419	69424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201886
1514	NC_021040	GAA	2	6	69440	69445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201886
1515	NC_021040	GAA	2	6	69478	69483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201886
1516	NC_021040	ATTG	2	8	69532	69539	25 %	50 %	25 %	0 %	479201886
1517	NC_021040	TGA	2	6	69597	69602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201886
1518	NC_021040	TAT	2	6	69607	69612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201886
1519	NC_021040	TTG	2	6	69633	69638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201886
1520	NC_021040	TTCT	2	8	69658	69665	0 %	75 %	0 %	25 %	479201886
1521	NC_021040	GA	3	6	69679	69684	50 %	0 %	50 %	0 %	479201886
1522	NC_021040	AG	3	6	69709	69714	50 %	0 %	50 %	0 %	479201886
1523	NC_021040	AGA	2	6	69735	69740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201886
1524	NC_021040	GACTT	2	10	69837	69846	20 %	40 %	20 %	20 %	479201886
1525	NC_021040	GGA	2	6	69851	69856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201886
1526	NC_021040	ACT	2	6	69863	69868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201886
1527	NC_021040	AAG	2	6	69930	69935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201886
1528	NC_021040	CAAA	2	8	69960	69967	75 %	0 %	0 %	25 %	479201886
1529	NC_021040	AAC	2	6	69976	69981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201886
1530	NC_021040	AGA	2	6	70015	70020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201886
1531	NC_021040	TGA	2	6	70024	70029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201886
1532	NC_021040	AAT	2	6	70034	70039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201886
1533	NC_021040	CCA	2	6	70071	70076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201886
1534	NC_021040	GTG	2	6	70107	70112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201886
1535	NC_021040	TGCG	2	8	70116	70123	0 %	25 %	50 %	25 %	479201886
1536	NC_021040	TTA	2	6	70140	70145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201886
1537	NC_021040	CAA	2	6	70149	70154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201886
1538	NC_021040	ACG	2	6	70230	70235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201886
1539	NC_021040	ACGAT	2	10	70329	70338	40 %	20 %	20 %	20 %	479201886
1540	NC_021040	AAC	2	6	70465	70470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201886
1541	NC_021040	TAT	2	6	70474	70479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201886
1542	NC_021040	CTT	2	6	70496	70501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201886
1543	NC_021040	ATCT	2	8	70567	70574	25 %	50 %	0 %	25 %	479201886
1544	NC_021040	TGA	2	6	70599	70604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201886
1545	NC_021040	AAAAT	2	10	70620	70629	80 %	20 %	0 %	0 %	479201886
1546	NC_021040	GAA	2	6	70648	70653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021040	CGGG	2	8	70732	70739	0 %	0 %	75 %	25 %	479201887
1548	NC_021040	A	6	6	70809	70814	100 %	0 %	0 %	0 %	479201887
1549	NC_021040	TGG	2	6	70862	70867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201887
1550	NC_021040	TTA	2	6	70874	70879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201887
1551	NC_021040	AAG	2	6	70893	70898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201887
1552	NC_021040	AGAA	2	8	70926	70933	75 %	0 %	25 %	0 %	479201887
1553	NC_021040	GGC	2	6	70957	70962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201887
1554	NC_021040	ATGT	2	8	70984	70991	25 %	50 %	25 %	0 %	479201887
1555	NC_021040	TAA	2	6	71101	71106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201887
1556	NC_021040	A	7	7	71140	71146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021040	AT	3	6	71155	71160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021040	AAAG	2	8	71220	71227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021040	AAAT	2	8	71395	71402	75 %	25 %	0 %	0 %	479201888
1560	NC_021040	CGG	2	6	71434	71439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201888
1561	NC_021040	GT	3	6	71446	71451	0 %	50 %	50 %	0 %	479201888
1562	NC_021040	TGT	2	6	71455	71460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201888
1563	NC_021040	AG	3	6	71474	71479	50 %	0 %	50 %	0 %	479201888
1564	NC_021040	CGG	2	6	71608	71613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201888
1565	NC_021040	AC	3	6	71621	71626	50 %	0 %	0 %	50 %	479201888
1566	NC_021040	AGA	2	6	71713	71718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201888
1567	NC_021040	GAT	2	6	71743	71748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201888
1568	NC_021040	ATGC	2	8	71811	71818	25 %	25 %	25 %	25 %	479201888
1569	NC_021040	CACAAC	2	12	71908	71919	50 %	0 %	0 %	50 %	479201888
1570	NC_021040	AC	3	6	71918	71923	50 %	0 %	0 %	50 %	479201888
1571	NC_021040	AGG	2	6	72066	72071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201888
1572	NC_021040	CAG	2	6	72098	72103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201888
1573	NC_021040	CGG	2	6	72169	72174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201888
1574	NC_021040	TTG	2	6	72195	72200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201888
1575	NC_021040	CAA	2	6	72268	72273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201888
1576	NC_021040	ATG	2	6	72398	72403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201888
1577	NC_021040	AGG	2	6	72408	72413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201888
1578	NC_021040	GA	3	6	72476	72481	50 %	0 %	50 %	0 %	479201888
1579	NC_021040	AGAAT	2	10	72488	72497	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021040	TAA	2	6	72504	72509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021040	A	6	6	72515	72520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021040	T	7	7	72550	72556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021040	CAT	2	6	72581	72586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201889
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1585	NC_021040	TATTTT	2	12	72623	72634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479201889
1586	NC_021040	ATA	2	6	72670	72675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201889
1587	NC_021040	AGTA	2	8	72704	72711	50 %	25 %	25 %	0 %	479201889
1588	NC_021040	AGT	2	6	72725	72730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201889
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1590	NC_021040	T	6	6	72787	72792	0 %	100 %	0 %	0 %	479201889
1591	NC_021040	GAA	2	6	72826	72831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201889
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1594	NC_021040	T	6	6	73035	73040	0 %	100 %	0 %	0 %	479201889
1595	NC_021040	TA	3	6	73061	73066	50 %	50 %	0 %	0 %	479201889
1596	NC_021040	GAAAGT	2	12	73138	73149	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479201889
1597	NC_021040	T	6	6	73201	73206	0 %	100 %	0 %	0 %	479201889
1598	NC_021040	TAA	2	6	73264	73269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201889
1599	NC_021040	GCA	2	6	73306	73311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201889
1600	NC_021040	TAA	2	6	73335	73340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201889
1601	NC_021040	AAT	2	6	73387	73392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201889
1602	NC_021040	TCC	2	6	73406	73411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_021040	ATT	2	6	73418	73423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201890
1604	NC_021040	AATA	2	8	73442	73449	75 %	25 %	0 %	0 %	479201890
1605	NC_021040	GCA	2	6	73507	73512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201890
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1607	NC_021040	TGT	2	6	73589	73594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201890
1608	NC_021040	CTT	2	6	73613	73618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201890
1609	NC_021040	GTG	2	6	73636	73641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201890
1610	NC_021040	T	7	7	73649	73655	0 %	100 %	0 %	0 %	479201890
1611	NC_021040	T	6	6	73698	73703	0 %	100 %	0 %	0 %	479201890
1612	NC_021040	CTT	2	6	73724	73729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201890
1613	NC_021040	T	6	6	73765	73770	0 %	100 %	0 %	0 %	479201890
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1615	NC_021040	GTTT	2	8	73799	73806	0 %	75 %	25 %	0 %	479201890
1616	NC_021040	T	8	8	73850	73857	0 %	100 %	0 %	0 %	479201890
1617	NC_021040	GTAT	2	8	73891	73898	25 %	50 %	25 %	0 %	479201891
1618	NC_021040	GTA	2	6	73910	73915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201891
1619	NC_021040	T	6	6	73928	73933	0 %	100 %	0 %	0 %	479201891
1620	NC_021040	CTG	2	6	73949	73954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201891
1621	NC_021040	GTG	2	6	74048	74053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201891
1622	NC_021040	CTT	2	6	74176	74181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_021040	A	6	6	74252	74257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021040	G	6	6	74379	74384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021040	AGA	2	6	74387	74392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021040	A	6	6	74392	74397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021040	GCCT	2	8	74408	74415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_021040	AT	3	6	74438	74443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1630	NC_021040	ATA	2	6	74500	74505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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