MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021040	CTA	2	6	44667	44672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201867
1003	NC_021040	CAA	3	9	44727	44735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201867
1004	NC_021040	AG	3	6	44904	44909	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
1005	NC_021040	GGA	2	6	44922	44927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201867
1006	NC_021040	CTG	2	6	45024	45029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201867
1007	NC_021040	CT	3	6	45156	45161	0 %	50 %	0 %	50 %	479201867
1008	NC_021040	TAA	2	6	45186	45191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201867
1009	NC_021040	AGA	2	6	45245	45250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201867
1010	NC_021040	AGGA	2	8	45383	45390	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
1011	NC_021040	TTC	2	6	45430	45435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201867
1012	NC_021040	CAA	2	6	45467	45472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201867
1013	NC_021040	GCT	2	6	45516	45521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201867
1014	NC_021040	TGA	2	6	45600	45605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201867
1015	NC_021040	AGA	2	6	45637	45642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201867
1016	NC_021040	AT	3	6	45693	45698	50 %	50 %	0 %	0 %	479201867
1017	NC_021040	GAT	2	6	45744	45749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201867
1018	NC_021040	GTT	2	6	45901	45906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201867
1019	NC_021040	GCCA	2	8	45947	45954	25 %	0 %	25 %	50 %	479201867
1020	NC_021040	ATGT	2	8	45964	45971	25 %	50 %	25 %	0 %	479201867
1021	NC_021040	ATC	2	6	46009	46014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201867
1022	NC_021040	GAA	2	6	46032	46037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201867
1023	NC_021040	CAGT	2	8	46214	46221	25 %	25 %	25 %	25 %	479201867
1024	NC_021040	GAT	2	6	46222	46227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201867
1025	NC_021040	GAA	2	6	46240	46245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201867
1026	NC_021040	ATA	2	6	46295	46300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201867
1027	NC_021040	AGGA	2	8	46346	46353	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
1028	NC_021040	CAT	2	6	46485	46490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201867
1029	NC_021040	A	6	6	46606	46611	100 %	0 %	0 %	0 %	479201867
1030	NC_021040	CAA	2	6	46641	46646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201868
1031	NC_021040	TTA	2	6	46655	46660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201868
1032	NC_021040	A	6	6	46680	46685	100 %	0 %	0 %	0 %	479201868
1033	NC_021040	CAG	2	6	46717	46722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201868
1034	NC_021040	TGA	2	6	46767	46772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201868
1035	NC_021040	TAT	2	6	46822	46827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201868
1036	NC_021040	CAA	2	6	46863	46868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201868
1037	NC_021040	TGA	2	6	46932	46937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201868
1038	NC_021040	TGG	2	6	46974	46979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201868
1039	NC_021040	AGA	2	6	47078	47083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201868
1040	NC_021040	CGG	2	6	47181	47186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201868
1041	NC_021040	GGA	2	6	47208	47213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201868
1042	NC_021040	CAG	2	6	47473	47478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201868
1043	NC_021040	A	6	6	47524	47529	100 %	0 %	0 %	0 %	479201868
1044	NC_021040	CAT	2	6	47530	47535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201868
1045	NC_021040	GAT	2	6	47536	47541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201868
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1049	NC_021040	GAG	2	6	47776	47781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201868
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1051	NC_021040	GCA	2	6	47896	47901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201868
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1053	NC_021040	CAA	3	9	47994	48002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201868
1054	NC_021040	CA	3	6	48015	48020	50 %	0 %	0 %	50 %	479201868
1055	NC_021040	CTT	2	6	48049	48054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201868
1056	NC_021040	A	6	6	48139	48144	100 %	0 %	0 %	0 %	479201868
1057	NC_021040	CAG	2	6	48148	48153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201868
1058	NC_021040	AT	3	6	48198	48203	50 %	50 %	0 %	0 %	479201868
1059	NC_021040	CATGT	2	10	48301	48310	20 %	40 %	20 %	20 %	479201868
1060	NC_021040	GCA	3	9	48382	48390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201868
1061	NC_021040	CAA	2	6	48426	48431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201868
1062	NC_021040	CAA	2	6	48447	48452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201868
1063	NC_021040	TATT	2	8	48485	48492	25 %	75 %	0 %	0 %	479201868
1064	NC_021040	ATCG	2	8	48507	48514	25 %	25 %	25 %	25 %	479201868
1065	NC_021040	GCA	2	6	48532	48537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201868
1066	NC_021040	GATG	2	8	48630	48637	25 %	25 %	50 %	0 %	479201868
1067	NC_021040	TCG	2	6	48653	48658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201868
1068	NC_021040	ATTT	2	8	48681	48688	25 %	75 %	0 %	0 %	479201868
1069	NC_021040	GAAA	2	8	48721	48728	75 %	0 %	25 %	0 %	479201868
1070	NC_021040	TCA	2	6	48794	48799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201868
1071	NC_021040	GAT	2	6	49042	49047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201868
1072	NC_021040	GCAG	2	8	49118	49125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_021040	ATA	2	6	49187	49192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021040	T	7	7	49196	49202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_021040	TAA	2	6	49524	49529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021040	A	6	6	49564	49569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021040	A	7	7	49577	49583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021040	T	7	7	49637	49643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021040	ATA	2	6	49675	49680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021040	AGG	2	6	49686	49691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_021040	CA	3	6	49836	49841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1094	NC_021040	ATG	2	6	50017	50022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201870
1095	NC_021040	ATGG	2	8	50029	50036	25 %	25 %	50 %	0 %	479201870
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1097	NC_021040	GC	3	6	50185	50190	0 %	0 %	50 %	50 %	479201870
1098	NC_021040	AAC	2	6	50224	50229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201870
1099	NC_021040	TGAA	2	8	50285	50292	50 %	25 %	25 %	0 %	479201870
1100	NC_021040	TGGA	2	8	50312	50319	25 %	25 %	50 %	0 %	479201870
1101	NC_021040	TGA	2	6	50366	50371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201870
1102	NC_021040	CGG	2	6	50393	50398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201870
1103	NC_021040	GA	3	6	50496	50501	50 %	0 %	50 %	0 %	479201870
1104	NC_021040	GGT	2	6	50517	50522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201870
1105	NC_021040	CAG	2	6	50577	50582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_021040	TTC	2	6	50586	50591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_021040	T	6	6	50611	50616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021040	AATC	2	8	50629	50636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_021040	AGC	2	6	50668	50673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021040	ATCAGA	2	12	50760	50771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1111	NC_021040	ATG	2	6	50877	50882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021040	GATG	2	8	50896	50903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021040	CAGT	2	8	50911	50918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_021040	A	6	6	50922	50927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021040	GATT	2	8	50938	50945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021040	ACA	2	6	50987	50992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_021040	AG	3	6	51001	51006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021040	AAC	2	6	51039	51044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021040	CTG	2	6	51113	51118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021040	GCG	2	6	51135	51140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021040	TGA	2	6	51316	51321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021040	GAA	2	6	51323	51328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021040	ATT	2	6	51330	51335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021040	TGT	2	6	51391	51396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021040	T	6	6	51416	51421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021040	A	6	6	51431	51436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021040	ATG	2	6	51456	51461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021040	ATG	2	6	51609	51614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021040	TACT	2	8	51627	51634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1131	NC_021040	A	7	7	51766	51772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_021040	GAG	2	6	57614	57619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201876
1265	NC_021040	ATC	2	6	57647	57652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201876
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1267	NC_021040	CAT	2	6	57763	57768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201876
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