MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021040	AAT	2	6	22060	22065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201847
502	NC_021040	TCT	2	6	22140	22145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201847
503	NC_021040	TGG	2	6	22190	22195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201847
504	NC_021040	TTA	2	6	22216	22221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201847
505	NC_021040	AAC	2	6	22277	22282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201847
506	NC_021040	T	6	6	22316	22321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021040	TAA	2	6	22394	22399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021040	GTG	2	6	22400	22405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021040	AGA	2	6	22445	22450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021040	A	6	6	22494	22499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021040	GA	3	6	22538	22543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021040	TGA	2	6	22585	22590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201848
513	NC_021040	TGGA	2	8	22592	22599	25 %	25 %	50 %	0 %	479201848
514	NC_021040	ATG	2	6	22661	22666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201848
515	NC_021040	AAGA	2	8	22727	22734	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
516	NC_021040	AAGA	2	8	22811	22818	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
517	NC_021040	GAAG	2	8	22942	22949	50 %	0 %	50 %	0 %	479201848
518	NC_021040	AAAG	2	8	22954	22961	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
519	NC_021040	AAG	2	6	23052	23057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021040	TGT	2	6	23087	23092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021040	TCT	2	6	23112	23117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021040	TA	3	6	23156	23161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021040	A	6	6	23197	23202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021040	GAA	2	6	23210	23215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021040	AACA	2	8	23216	23223	75 %	0 %	0 %	25 %	479201849
526	NC_021040	T	7	7	23230	23236	0 %	100 %	0 %	0 %	479201849
527	NC_021040	ATT	2	6	23265	23270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201849
528	NC_021040	ACTG	2	8	23279	23286	25 %	25 %	25 %	25 %	479201849
529	NC_021040	ATG	2	6	23356	23361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201849
530	NC_021040	ATG	2	6	23379	23384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201849
531	NC_021040	TGC	2	6	23407	23412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201849
532	NC_021040	ACA	2	6	23436	23441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201849
533	NC_021040	ATG	2	6	23565	23570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201849
534	NC_021040	TCTT	2	8	23615	23622	0 %	75 %	0 %	25 %	479201849
535	NC_021040	G	7	7	23650	23656	0 %	0 %	100 %	0 %	479201849
536	NC_021040	GAT	2	6	23738	23743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201849
537	NC_021040	A	8	8	23816	23823	100 %	0 %	0 %	0 %	479201849
538	NC_021040	TGG	2	6	23828	23833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201849
539	NC_021040	GA	3	6	23882	23887	50 %	0 %	50 %	0 %	479201849
540	NC_021040	GCA	2	6	23946	23951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201850
541	NC_021040	TGG	2	6	23953	23958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201850
542	NC_021040	TGA	2	6	23980	23985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201850
543	NC_021040	GTC	2	6	23991	23996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201850
544	NC_021040	TGG	2	6	24034	24039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201850
545	NC_021040	AAT	2	6	24051	24056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201850
546	NC_021040	GATG	2	8	24083	24090	25 %	25 %	50 %	0 %	479201850
547	NC_021040	ATT	2	6	24115	24120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201850
548	NC_021040	TGAT	2	8	24121	24128	25 %	50 %	25 %	0 %	479201850
549	NC_021040	GAC	2	6	24153	24158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201850
550	NC_021040	ATG	2	6	24199	24204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201850
551	NC_021040	TTAT	2	8	24217	24224	25 %	75 %	0 %	0 %	479201850
552	NC_021040	TAT	2	6	24309	24314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201850
553	NC_021040	CAG	2	6	24334	24339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201850
554	NC_021040	TTC	2	6	24427	24432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201850
555	NC_021040	GGA	2	6	24462	24467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201850
556	NC_021040	AAGA	2	8	24521	24528	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
557	NC_021040	GAA	2	6	24534	24539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201850
558	NC_021040	ATG	2	6	24577	24582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201850
559	NC_021040	AT	3	6	24601	24606	50 %	50 %	0 %	0 %	479201850
560	NC_021040	AAC	2	6	24649	24654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201850
561	NC_021040	AGAA	2	8	24734	24741	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
562	NC_021040	GAAAT	2	10	24837	24846	60 %	20 %	20 %	0 %	479201850
563	NC_021040	GAA	2	6	24879	24884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201850
564	NC_021040	TGG	2	6	24886	24891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201850
565	NC_021040	GCAG	2	8	24956	24963	25 %	0 %	50 %	25 %	479201850
566	NC_021040	AAAG	2	8	25064	25071	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
567	NC_021040	GAT	2	6	25101	25106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201850
568	NC_021040	AGA	3	9	25121	25129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201850
569	NC_021040	CGG	2	6	25146	25151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201850
570	NC_021040	GAG	2	6	25174	25179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201850
571	NC_021040	AGGC	2	8	25258	25265	25 %	0 %	50 %	25 %	479201850
572	NC_021040	AAT	2	6	25324	25329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021040	A	6	6	25336	25341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021040	TAA	2	6	25352	25357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021040	TAA	2	6	25363	25368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021040	A	6	6	25425	25430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021040	GGA	2	6	25431	25436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021040	AG	3	6	25448	25453	50 %	0 %	50 %	0 %	479201851
579	NC_021040	GAA	2	6	25545	25550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201851
580	NC_021040	A	6	6	25572	25577	100 %	0 %	0 %	0 %	479201851
581	NC_021040	ATT	2	6	25657	25662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201851
582	NC_021040	A	7	7	25668	25674	100 %	0 %	0 %	0 %	479201851
583	NC_021040	AAG	2	6	25777	25782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201851
584	NC_021040	TAACTG	2	12	25799	25810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479201851
585	NC_021040	GAA	2	6	25815	25820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201851
586	NC_021040	ATT	2	6	25829	25834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201851
587	NC_021040	GAT	2	6	25879	25884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201851
588	NC_021040	A	6	6	25900	25905	100 %	0 %	0 %	0 %	479201851
589	NC_021040	CAGT	2	8	25923	25930	25 %	25 %	25 %	25 %	479201851
590	NC_021040	AGAA	2	8	25971	25978	75 %	0 %	25 %	0 %	479201851
591	NC_021040	AAC	2	6	25980	25985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201851
592	NC_021040	TGTACA	2	12	26038	26049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479201851
593	NC_021040	A	6	6	26068	26073	100 %	0 %	0 %	0 %	479201851
594	NC_021040	GTA	2	6	26074	26079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201851
595	NC_021040	TA	3	6	26078	26083	50 %	50 %	0 %	0 %	479201851
596	NC_021040	GAT	4	12	26101	26112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201851
597	NC_021040	GAT	3	9	26119	26127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201851
598	NC_021040	GAT	2	6	26134	26139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201851
599	NC_021040	TAT	2	6	26143	26148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201851
600	NC_021040	A	6	6	26213	26218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021040	TTTG	2	8	26252	26259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021040	AG	3	6	26307	26312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021040	ATCA	2	8	26314	26321	50 %	25 %	0 %	25 %	479201852
604	NC_021040	GAA	2	6	26363	26368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201852
605	NC_021040	TGA	2	6	26376	26381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201852
606	NC_021040	GAG	2	6	26576	26581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201852
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608	NC_021040	GGC	2	6	26722	26727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201852
609	NC_021040	GCA	2	6	26783	26788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201852
610	NC_021040	GA	3	6	26834	26839	50 %	0 %	50 %	0 %	479201852
611	NC_021040	AAG	2	6	26883	26888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201852
612	NC_021040	TCT	2	6	26909	26914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201852
613	NC_021040	AGA	2	6	27130	27135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201852
614	NC_021040	GT	3	6	27138	27143	0 %	50 %	50 %	0 %	479201852
615	NC_021040	TGGA	2	8	27201	27208	25 %	25 %	50 %	0 %	479201852
616	NC_021040	ACT	2	6	27215	27220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201852
617	NC_021040	CAT	2	6	27236	27241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201852
618	NC_021040	GAG	2	6	27263	27268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201852
619	NC_021040	A	6	6	27283	27288	100 %	0 %	0 %	0 %	479201852
620	NC_021040	GCC	2	6	27400	27405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201852
621	NC_021040	CAGAAA	2	12	27472	27483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479201852
622	NC_021040	AGC	2	6	27505	27510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201852
623	NC_021040	AGC	2	6	27517	27522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201852
624	NC_021040	A	6	6	27523	27528	100 %	0 %	0 %	0 %	479201852
625	NC_021040	GGA	2	6	27551	27556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201852
626	NC_021040	CATATG	2	12	27596	27607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479201852
627	NC_021040	TGG	2	6	27739	27744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201852
628	NC_021040	TGAA	2	8	27807	27814	50 %	25 %	25 %	0 %	479201852
629	NC_021040	AG	3	6	27868	27873	50 %	0 %	50 %	0 %	479201852
630	NC_021040	AGC	2	6	27875	27880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201852
631	NC_021040	TAC	2	6	27914	27919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201852
632	NC_021040	ACA	2	6	27920	27925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201852
633	NC_021040	A	6	6	27932	27937	100 %	0 %	0 %	0 %	479201852
634	NC_021040	TACC	2	8	27979	27986	25 %	25 %	0 %	50 %	479201852
635	NC_021040	GAA	2	6	28151	28156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201852
636	NC_021040	GACA	2	8	28210	28217	50 %	0 %	25 %	25 %	479201852
637	NC_021040	GAA	2	6	28268	28273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201852
638	NC_021040	TGC	2	6	28275	28280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201852
639	NC_021040	CAG	2	6	28327	28332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201852
640	NC_021040	GAT	2	6	28379	28384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201852
641	NC_021040	AG	3	6	28406	28411	50 %	0 %	50 %	0 %	479201852
642	NC_021040	ATGA	2	8	28445	28452	50 %	25 %	25 %	0 %	479201852
643	NC_021040	TAT	2	6	28469	28474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201852
644	NC_021040	G	6	6	28609	28614	0 %	0 %	100 %	0 %	479201852
645	NC_021040	ATAA	2	8	28718	28725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_021040	AAAT	2	8	28752	28759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_021040	GAT	2	6	28804	28809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
648	NC_021040	CGA	2	6	28846	28851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_021040	GAA	2	6	28877	28882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_021040	A	6	6	28881	28886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_021040	AT	3	6	28895	28900	50 %	50 %	0 %	0 %	479201853
652	NC_021040	AGA	2	6	28919	28924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201853
653	NC_021040	AGC	2	6	28942	28947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201853
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655	NC_021040	CAT	2	6	29054	29059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201853
656	NC_021040	GATG	2	8	29063	29070	25 %	25 %	50 %	0 %	479201853
657	NC_021040	GAAAT	2	10	29073	29082	60 %	20 %	20 %	0 %	479201853
658	NC_021040	ATGG	2	8	29085	29092	25 %	25 %	50 %	0 %	479201853
659	NC_021040	GGA	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201853
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664	NC_021040	TAT	2	6	29340	29345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201853
665	NC_021040	CA	3	6	29376	29381	50 %	0 %	0 %	50 %	479201853
666	NC_021040	ACA	2	6	29400	29405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201853
667	NC_021040	GAA	2	6	29424	29429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201853
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670	NC_021040	AGC	2	6	29530	29535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201853
671	NC_021040	GC	3	6	29550	29555	0 %	0 %	50 %	50 %	479201853
672	NC_021040	A	6	6	29556	29561	100 %	0 %	0 %	0 %	479201853
673	NC_021040	GAA	2	6	29571	29576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201853
674	NC_021040	ATG	2	6	29606	29611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201853
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704	NC_021040	TTGA	2	8	31009	31016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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753	NC_021040	AGATG	2	10	33404	33413	40 %	20 %	40 %	0 %	479201856
754	NC_021040	TAT	2	6	33483	33488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201856
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757	NC_021040	AT	3	6	33563	33568	50 %	50 %	0 %	0 %	479201856
758	NC_021040	AAAC	2	8	33595	33602	75 %	0 %	0 %	25 %	479201856
759	NC_021040	AAG	2	6	33682	33687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201856
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761	NC_021040	TGA	2	6	33776	33781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201856
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881	NC_021040	A	6	6	38478	38483	100 %	0 %	0 %	0 %	479201862
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