MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021040	TCT	2	6	282536	282541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021040	ACT	2	6	282587	282592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_021040	A	6	6	282598	282603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_021040	AAGA	2	8	282736	282743	75 %	0 %	25 %	0 %	479202073
6005	NC_021040	ATT	2	6	282754	282759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202073
6006	NC_021040	TGC	2	6	282800	282805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202073
6007	NC_021040	CTG	2	6	282847	282852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202073
6008	NC_021040	T	6	6	282945	282950	0 %	100 %	0 %	0 %	479202073
6009	NC_021040	AAG	2	6	282958	282963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202073
6010	NC_021040	AAC	2	6	282967	282972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202073
6011	NC_021040	GCTC	2	8	283011	283018	0 %	25 %	25 %	50 %	479202073
6012	NC_021040	TCA	2	6	283048	283053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202073
6013	NC_021040	TCT	2	6	283127	283132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202073
6014	NC_021040	TTG	2	6	283138	283143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202073
6015	NC_021040	AAC	2	6	283172	283177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202073
6016	NC_021040	AAT	2	6	283238	283243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202073
6017	NC_021040	AT	3	6	283254	283259	50 %	50 %	0 %	0 %	479202073
6018	NC_021040	TAA	2	6	283274	283279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202073
6019	NC_021040	AGA	2	6	283331	283336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202073
6020	NC_021040	ATCT	2	8	283381	283388	25 %	50 %	0 %	25 %	479202073
6021	NC_021040	TAA	2	6	283417	283422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202073
6022	NC_021040	ATTC	2	8	283475	283482	25 %	50 %	0 %	25 %	479202073
6023	NC_021040	TGAT	2	8	283558	283565	25 %	50 %	25 %	0 %	479202073
6024	NC_021040	GAT	3	9	283587	283595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202073
6025	NC_021040	ATC	2	6	283596	283601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202073
6026	NC_021040	TGA	2	6	283667	283672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202073
6027	NC_021040	GAA	2	6	283746	283751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202073
6028	NC_021040	TAA	2	6	283829	283834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202073
6029	NC_021040	GTT	2	6	283860	283865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202073
6030	NC_021040	AGG	2	6	283921	283926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202073
6031	NC_021040	AAG	2	6	283957	283962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202073
6032	NC_021040	GAT	2	6	284129	284134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202073
6033	NC_021040	TGT	2	6	284231	284236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202073
6034	NC_021040	GAA	2	6	284250	284255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202073
6035	NC_021040	A	6	6	284259	284264	100 %	0 %	0 %	0 %	479202073
6036	NC_021040	GCA	2	6	284280	284285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202073
6037	NC_021040	AGG	2	6	284333	284338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202073
6038	NC_021040	TCG	2	6	284373	284378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6039	NC_021040	AAT	3	9	284396	284404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202074
6040	NC_021040	GAT	2	6	284450	284455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202074
6041	NC_021040	ATGC	2	8	284536	284543	25 %	25 %	25 %	25 %	479202074
6042	NC_021040	GGA	2	6	284582	284587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202074
6043	NC_021040	ACA	2	6	284625	284630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202074
6044	NC_021040	GCT	2	6	284645	284650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6045	NC_021040	GCG	2	6	284663	284668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202074
6046	NC_021040	GCT	2	6	284675	284680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6047	NC_021040	ATC	2	6	284736	284741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202074
6048	NC_021040	CAG	2	6	284769	284774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6049	NC_021040	CTAT	2	8	284778	284785	25 %	50 %	0 %	25 %	479202074
6050	NC_021040	GCA	2	6	284799	284804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6051	NC_021040	ATT	2	6	284838	284843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202074
6052	NC_021040	TGGA	2	8	284862	284869	25 %	25 %	50 %	0 %	479202074
6053	NC_021040	TTC	2	6	284933	284938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
6054	NC_021040	TGG	2	6	284983	284988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202074
6055	NC_021040	AGC	2	6	285004	285009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6056	NC_021040	GGT	2	6	285017	285022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202074
6057	NC_021040	CTT	2	6	285092	285097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
6058	NC_021040	TCC	2	6	285127	285132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202074
6059	NC_021040	AAG	2	6	285143	285148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
6060	NC_021040	GA	3	6	285185	285190	50 %	0 %	50 %	0 %	479202074
6061	NC_021040	ATG	2	6	285218	285223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202074
6062	NC_021040	GAA	2	6	285224	285229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
6063	NC_021040	GCT	2	6	285239	285244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6064	NC_021040	GAT	2	6	285245	285250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202074
6065	NC_021040	ATC	2	6	285306	285311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202074
6066	NC_021040	TTC	2	6	285330	285335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
6067	NC_021040	TTC	2	6	285386	285391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
6068	NC_021040	GAA	2	6	285416	285421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
6069	NC_021040	ATG	2	6	285516	285521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202074
6070	NC_021040	CAG	2	6	285613	285618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6071	NC_021040	TTGA	2	8	285677	285684	25 %	50 %	25 %	0 %	479202074
6072	NC_021040	ATT	2	6	285717	285722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202074
6073	NC_021040	AAG	2	6	285761	285766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
6074	NC_021040	AC	3	6	285804	285809	50 %	0 %	0 %	50 %	479202074
6075	NC_021040	TCT	2	6	285838	285843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202074
6076	NC_021040	CAT	2	6	285914	285919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202074
6077	NC_021040	AAT	2	6	285923	285928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202074
6078	NC_021040	AAT	2	6	285965	285970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202074
6079	NC_021040	CCG	2	6	286112	286117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202074
6080	NC_021040	GAA	2	6	286126	286131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
6081	NC_021040	GAA	2	6	286246	286251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
6082	NC_021040	GTT	2	6	286265	286270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202074
6083	NC_021040	GA	3	6	286308	286313	50 %	0 %	50 %	0 %	479202074
6084	NC_021040	AG	3	6	286316	286321	50 %	0 %	50 %	0 %	479202074
6085	NC_021040	GTTC	2	8	286328	286335	0 %	50 %	25 %	25 %	479202074
6086	NC_021040	GTG	2	6	286368	286373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202074
6087	NC_021040	GCAT	2	8	286397	286404	25 %	25 %	25 %	25 %	479202074
6088	NC_021040	AAT	2	6	286415	286420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202074
6089	NC_021040	AAG	2	6	286421	286426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
6090	NC_021040	TGAT	2	8	286455	286462	25 %	50 %	25 %	0 %	479202074
6091	NC_021040	AT	3	6	286472	286477	50 %	50 %	0 %	0 %	479202074
6092	NC_021040	GGT	2	6	286601	286606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202074
6093	NC_021040	AT	3	6	286627	286632	50 %	50 %	0 %	0 %	479202074
6094	NC_021040	TAT	2	6	286682	286687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202074
6095	NC_021040	GAG	2	6	286715	286720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202074
6096	NC_021040	GCT	2	6	286732	286737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202074
6097	NC_021040	AGG	2	6	286744	286749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202074
6098	NC_021040	AAG	2	6	286764	286769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202074
6099	NC_021040	AAG	2	6	286777	286782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_021040	TCC	2	6	286813	286818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_021040	AGC	2	6	286940	286945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_021040	GGA	2	6	286952	286957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_021040	TCAG	2	8	287036	287043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_021040	ACTG	2	8	287078	287085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_021040	N	338	338	287197	287534	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_021040	GAT	2	6	287582	287587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_021040	A	8	8	287739	287746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_021040	TC	4	8	287760	287767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_021040	AAAT	2	8	287778	287785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021040	GAAT	2	8	287808	287815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_021040	TCC	2	6	287926	287931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_021040	TCC	2	6	288001	288006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_021040	GCAT	2	8	288209	288216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_021040	ATG	2	6	288282	288287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_021040	ATG	3	9	288366	288374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_021040	GAG	2	6	288407	288412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_021040	AAT	2	6	288413	288418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_021040	GCA	2	6	288487	288492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_021040	TGAA	2	8	288549	288556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021040	AAAG	2	8	288562	288569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_021040	AAG	2	6	288643	288648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202075
6122	NC_021040	GAA	2	6	288684	288689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202075
6123	NC_021040	TGT	2	6	288757	288762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202075
6124	NC_021040	GTC	2	6	288766	288771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202075
6125	NC_021040	GCT	2	6	288792	288797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202075
6126	NC_021040	AGATA	2	10	288854	288863	60 %	20 %	20 %	0 %	479202075
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6128	NC_021040	ATG	2	6	288895	288900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202075
6129	NC_021040	CTG	2	6	288928	288933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202075
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6133	NC_021040	TGA	2	6	289079	289084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202075
6134	NC_021040	TGC	2	6	289103	289108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202075
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6142	NC_021040	T	6	6	289516	289521	0 %	100 %	0 %	0 %	479202076
6143	NC_021040	ATGA	2	8	289544	289551	50 %	25 %	25 %	0 %	479202076
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6153	NC_021040	TC	3	6	289944	289949	0 %	50 %	0 %	50 %	479202077
6154	NC_021040	GCAA	2	8	290036	290043	50 %	0 %	25 %	25 %	479202077
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6219	NC_021040	ACTT	2	8	293100	293107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6220	NC_021040	GCA	2	6	293126	293131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6221	NC_021040	CTG	2	6	293208	293213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6223	NC_021040	GAA	2	6	293255	293260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6224	NC_021040	ATT	2	6	293262	293267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6225	NC_021040	AT	3	6	293314	293319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6226	NC_021040	CTG	2	6	293325	293330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6227	NC_021040	T	7	7	293353	293359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6228	NC_021040	ACA	2	6	293492	293497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6229	NC_021040	TAAT	2	8	293574	293581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6230	NC_021040	ATT	2	6	293589	293594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6231	NC_021040	TGA	2	6	293689	293694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6232	NC_021040	ATA	2	6	293742	293747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_021040	TGG	2	6	293771	293776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6234	NC_021040	GGCA	2	8	293784	293791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6235	NC_021040	TCT	2	6	293829	293834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6236	NC_021040	GAG	2	6	293900	293905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6237	NC_021040	TAT	2	6	293977	293982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6238	NC_021040	GGT	2	6	294045	294050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6239	NC_021040	GCT	2	6	294100	294105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6240	NC_021040	TCA	2	6	294136	294141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6241	NC_021040	TTTA	2	8	294149	294156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_021040	CGA	2	6	294157	294162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6243	NC_021040	TGT	2	6	294169	294174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_021040	CTC	2	6	294210	294215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6245	NC_021040	GGAG	2	8	294220	294227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_021040	GA	3	6	294250	294255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_021040	TGC	2	6	294269	294274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6249	NC_021040	TAT	2	6	294323	294328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6379	NC_021040	ATG	2	6	300748	300753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6380	NC_021040	GA	3	6	300778	300783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6381	NC_021040	GTT	2	6	300891	300896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6386	NC_021040	TAC	3	9	300991	300999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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