MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021040	AGT	2	6	257939	257944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202045
5502	NC_021040	CTT	2	6	257982	257987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202045
5503	NC_021040	A	6	6	258047	258052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_021040	GA	3	6	258071	258076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021040	ATC	2	6	258100	258105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202046
5506	NC_021040	ATAC	2	8	258114	258121	50 %	25 %	0 %	25 %	479202046
5507	NC_021040	A	6	6	258136	258141	100 %	0 %	0 %	0 %	479202046
5508	NC_021040	ATT	2	6	258177	258182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202046
5509	NC_021040	ATTG	2	8	258292	258299	25 %	50 %	25 %	0 %	479202046
5510	NC_021040	A	6	6	258333	258338	100 %	0 %	0 %	0 %	479202046
5511	NC_021040	GGC	2	6	258400	258405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202046
5512	NC_021040	GTA	2	6	258417	258422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202046
5513	NC_021040	AGTTTA	2	12	258438	258449	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479202046
5514	NC_021040	AAT	2	6	258452	258457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202046
5515	NC_021040	GA	3	6	258489	258494	50 %	0 %	50 %	0 %	479202046
5516	NC_021040	GA	3	6	258527	258532	50 %	0 %	50 %	0 %	479202046
5517	NC_021040	AAAGAA	2	12	258545	258556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479202046
5518	NC_021040	A	7	7	258560	258566	100 %	0 %	0 %	0 %	479202046
5519	NC_021040	AGGT	2	8	258606	258613	25 %	25 %	50 %	0 %	479202046
5520	NC_021040	GAA	2	6	258651	258656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_021040	ACAA	2	8	258667	258674	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_021040	GA	3	6	258691	258696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021040	GAA	2	6	258776	258781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202047
5524	NC_021040	AAT	2	6	258800	258805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202047
5525	NC_021040	GTTGTG	2	12	258823	258834	0 %	50 %	50 %	0 %	479202047
5526	NC_021040	CAAAA	2	10	258848	258857	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5527	NC_021040	CGGG	2	8	258899	258906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_021040	GGA	2	6	259041	259046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_021040	TCA	2	6	259099	259104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202048
5530	NC_021040	A	6	6	259170	259175	100 %	0 %	0 %	0 %	479202048
5531	NC_021040	GGA	2	6	259206	259211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202048
5532	NC_021040	AT	3	6	259255	259260	50 %	50 %	0 %	0 %	479202048
5533	NC_021040	GAT	2	6	259415	259420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202048
5534	NC_021040	CTA	2	6	259449	259454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202048
5535	NC_021040	A	6	6	259461	259466	100 %	0 %	0 %	0 %	479202048
5536	NC_021040	GTAT	2	8	259501	259508	25 %	50 %	25 %	0 %	479202048
5537	NC_021040	GAT	2	6	259511	259516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202048
5538	NC_021040	AG	3	6	259519	259524	50 %	0 %	50 %	0 %	479202048
5539	NC_021040	GAA	2	6	259553	259558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202048
5540	NC_021040	TAAA	2	8	259569	259576	75 %	25 %	0 %	0 %	479202048
5541	NC_021040	TGA	2	6	259582	259587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202048
5542	NC_021040	GGA	2	6	259772	259777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202048
5543	NC_021040	AAG	2	6	259813	259818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202048
5544	NC_021040	A	6	6	259860	259865	100 %	0 %	0 %	0 %	479202048
5545	NC_021040	ATA	2	6	259915	259920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021040	AGGG	2	8	259932	259939	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021040	TAAA	2	8	259959	259966	75 %	25 %	0 %	0 %	479202049
5548	NC_021040	GATT	2	8	259969	259976	25 %	50 %	25 %	0 %	479202049
5549	NC_021040	A	6	6	259994	259999	100 %	0 %	0 %	0 %	479202049
5550	NC_021040	A	6	6	260052	260057	100 %	0 %	0 %	0 %	479202049
5551	NC_021040	CAG	2	6	260149	260154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202049
5552	NC_021040	AGC	2	6	260217	260222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202049
5553	NC_021040	GTT	2	6	260224	260229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202049
5554	NC_021040	AGAC	2	8	260232	260239	50 %	0 %	25 %	25 %	479202049
5555	NC_021040	AAG	2	6	260241	260246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202049
5556	NC_021040	TGC	2	6	260251	260256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202049
5557	NC_021040	GA	3	6	260257	260262	50 %	0 %	50 %	0 %	479202049
5558	NC_021040	GAG	2	6	260320	260325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021040	ATTTT	2	10	260328	260337	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_021040	AAC	2	6	260338	260343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_021040	A	6	6	260344	260349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021040	AGG	2	6	260422	260427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021040	TTA	2	6	260461	260466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202050
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5571	NC_021040	CAG	3	9	260933	260941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202050
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5578	NC_021040	TTATG	2	10	261119	261128	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_021040	TGT	2	6	261208	261213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021040	AAAT	2	8	261217	261224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_021040	A	6	6	261259	261264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_021040	GAAT	2	8	261402	261409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_021040	GA	3	6	261441	261446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_021040	GAA	2	6	261480	261485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202051
5585	NC_021040	A	6	6	261517	261522	100 %	0 %	0 %	0 %	479202051
5586	NC_021040	TAC	2	6	261532	261537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202051
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5588	NC_021040	GATT	2	8	261631	261638	25 %	50 %	25 %	0 %	479202051
5589	NC_021040	AGATG	2	10	261694	261703	40 %	20 %	40 %	0 %	479202051
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5593	NC_021040	GTTC	2	8	261866	261873	0 %	50 %	25 %	25 %	479202051
5594	NC_021040	AAT	2	6	261908	261913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202051
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5597	NC_021040	GAA	2	6	262040	262045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202051
5598	NC_021040	GGC	3	9	262132	262140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202051
5599	NC_021040	TAT	2	6	262159	262164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202051
5600	NC_021040	AGGA	2	8	262244	262251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021040	GGC	2	6	262290	262295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202052
5602	NC_021040	T	7	7	262313	262319	0 %	100 %	0 %	0 %	479202052
5603	NC_021040	GGAAA	2	10	262327	262336	60 %	0 %	40 %	0 %	479202052
5604	NC_021040	T	6	6	262345	262350	0 %	100 %	0 %	0 %	479202052
5605	NC_021040	GAA	2	6	262362	262367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202052
5606	NC_021040	GCA	2	6	262403	262408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202052
5607	NC_021040	AAG	3	9	262453	262461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202052
5608	NC_021040	TCTGGA	2	12	262473	262484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479202052
5609	NC_021040	CAG	2	6	262506	262511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202052
5610	NC_021040	TCCAT	2	10	262561	262570	20 %	40 %	0 %	40 %	479202052
5611	NC_021040	ATT	2	6	262589	262594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202052
5612	NC_021040	ATG	2	6	262652	262657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202052
5613	NC_021040	AATA	2	8	262741	262748	75 %	25 %	0 %	0 %	479202052
5614	NC_021040	GAA	2	6	262777	262782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202052
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5618	NC_021040	GGCG	2	8	263032	263039	0 %	0 %	75 %	25 %	479202052
5619	NC_021040	TTG	2	6	263053	263058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202052
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5621	NC_021040	CAG	2	6	263146	263151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202052
5622	NC_021040	TGA	2	6	263220	263225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202052
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5625	NC_021040	GCT	2	6	263524	263529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202052
5626	NC_021040	AACAA	2	10	263539	263548	80 %	0 %	0 %	20 %	479202052
5627	NC_021040	GGC	2	6	263706	263711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202052
5628	NC_021040	TAT	2	6	263786	263791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202052
5629	NC_021040	TAA	2	6	263834	263839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202053
5630	NC_021040	ATGC	2	8	263854	263861	25 %	25 %	25 %	25 %	479202053
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5634	NC_021040	GAA	2	6	263990	263995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202053
5635	NC_021040	CGGA	2	8	264026	264033	25 %	0 %	50 %	25 %	479202053
5636	NC_021040	GGA	2	6	264060	264065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202053
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5641	NC_021040	GGA	2	6	264465	264470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202053
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5647	NC_021040	GAT	2	6	264883	264888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202053
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5649	NC_021040	TA	3	6	264986	264991	50 %	50 %	0 %	0 %	479202053
5650	NC_021040	GGC	2	6	265000	265005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202053
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5652	NC_021040	GGGA	2	8	265268	265275	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5653	NC_021040	TTAC	2	8	265298	265305	25 %	50 %	0 %	25 %	479202054
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5662	NC_021040	ATG	2	6	265928	265933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202055
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5666	NC_021040	A	6	6	266158	266163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5683	NC_021040	GACA	2	8	266979	266986	50 %	0 %	25 %	25 %	479202056
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5689	NC_021040	A	6	6	267400	267405	100 %	0 %	0 %	0 %	479202057
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5699	NC_021040	CTG	2	6	268407	268412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5736	NC_021040	AGAT	2	8	270857	270864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5737	NC_021040	A	7	7	270901	270907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5742	NC_021040	A	6	6	271066	271071	100 %	0 %	0 %	0 %	479202061
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6000	NC_021040	GTT	2	6	282506	282511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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