MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021040	CAGAA	2	10	234078	234087	60 %	0 %	20 %	20 %	479202020
5003	NC_021040	GTA	2	6	234145	234150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202020
5004	NC_021040	A	6	6	234156	234161	100 %	0 %	0 %	0 %	479202020
5005	NC_021040	TGG	2	6	234203	234208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202020
5006	NC_021040	GGC	2	6	234324	234329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202020
5007	NC_021040	AGA	2	6	234378	234383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202020
5008	NC_021040	GTT	2	6	234418	234423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202020
5009	NC_021040	GAA	2	6	234457	234462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202020
5010	NC_021040	ATTT	2	8	234486	234493	25 %	75 %	0 %	0 %	479202020
5011	NC_021040	TGC	2	6	234515	234520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202020
5012	NC_021040	AGA	2	6	234582	234587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202020
5013	NC_021040	ATGT	2	8	234691	234698	25 %	50 %	25 %	0 %	479202020
5014	NC_021040	A	6	6	234707	234712	100 %	0 %	0 %	0 %	479202020
5015	NC_021040	CAGG	2	8	234718	234725	25 %	0 %	50 %	25 %	479202020
5016	NC_021040	ATCT	2	8	234744	234751	25 %	50 %	0 %	25 %	479202020
5017	NC_021040	ACC	2	6	234779	234784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202021
5018	NC_021040	AG	3	6	234888	234893	50 %	0 %	50 %	0 %	479202021
5019	NC_021040	GGA	2	6	234917	234922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202021
5020	NC_021040	AGC	2	6	235060	235065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202021
5021	NC_021040	CATG	2	8	235166	235173	25 %	25 %	25 %	25 %	479202021
5022	NC_021040	GCA	2	6	235215	235220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202021
5023	NC_021040	CAT	2	6	235233	235238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202021
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5025	NC_021040	CGG	2	6	235267	235272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202021
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5027	NC_021040	AGG	2	6	235406	235411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202021
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5029	NC_021040	ACA	2	6	235632	235637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202021
5030	NC_021040	A	6	6	235637	235642	100 %	0 %	0 %	0 %	479202021
5031	NC_021040	GGA	2	6	235709	235714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202021
5032	NC_021040	CGG	2	6	235867	235872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202021
5033	NC_021040	GAA	2	6	235883	235888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021040	A	6	6	235887	235892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021040	CAGG	2	8	235903	235910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_021040	AAT	2	6	235948	235953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021040	T	6	6	235953	235958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021040	CAG	2	6	235977	235982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202022
5039	NC_021040	A	6	6	235990	235995	100 %	0 %	0 %	0 %	479202022
5040	NC_021040	GGC	2	6	236013	236018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202022
5041	NC_021040	CGG	2	6	236080	236085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202022
5042	NC_021040	GAT	2	6	236118	236123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202022
5043	NC_021040	TGA	2	6	236144	236149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202022
5044	NC_021040	T	6	6	236174	236179	0 %	100 %	0 %	0 %	479202022
5045	NC_021040	TGG	2	6	236188	236193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202022
5046	NC_021040	TGC	2	6	236219	236224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202022
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5052	NC_021040	GGATTT	2	12	236655	236666	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479202022
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5054	NC_021040	CAGAT	2	10	236719	236728	40 %	20 %	20 %	20 %	479202022
5055	NC_021040	GCA	2	6	236778	236783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202022
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5057	NC_021040	GGA	2	6	236877	236882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202022
5058	NC_021040	CAG	2	6	236904	236909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202022
5059	NC_021040	TTG	2	6	236959	236964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202022
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5061	NC_021040	A	6	6	237013	237018	100 %	0 %	0 %	0 %	479202022
5062	NC_021040	CGGG	2	8	237066	237073	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_021040	TTA	2	6	237146	237151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021040	A	6	6	237166	237171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5074	NC_021040	CGG	2	6	237580	237585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202024
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5077	NC_021040	ATTG	2	8	237713	237720	25 %	50 %	25 %	0 %	479202024
5078	NC_021040	GAAC	2	8	237799	237806	50 %	0 %	25 %	25 %	479202024
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5081	NC_021040	GAA	2	6	238050	238055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202024
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5093	NC_021040	A	6	6	238826	238831	100 %	0 %	0 %	0 %	479202025
5094	NC_021040	ATC	2	6	238838	238843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202025
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5102	NC_021040	ACT	2	6	239381	239386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202026
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5106	NC_021040	GAG	2	6	239482	239487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202026
5107	NC_021040	GGC	3	9	239505	239513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202026
5108	NC_021040	CGG	2	6	239544	239549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202026
5109	NC_021040	CGC	2	6	239563	239568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202026
5110	NC_021040	TG	3	6	239572	239577	0 %	50 %	50 %	0 %	479202026
5111	NC_021040	A	6	6	239588	239593	100 %	0 %	0 %	0 %	479202026
5112	NC_021040	A	6	6	239595	239600	100 %	0 %	0 %	0 %	479202026
5113	NC_021040	GACGG	2	10	239739	239748	20 %	0 %	60 %	20 %	479202026
5114	NC_021040	TGC	2	6	239781	239786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202026
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5119	NC_021040	AGC	2	6	240065	240070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202026
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5121	NC_021040	CAT	2	6	240154	240159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202026
5122	NC_021040	TGA	2	6	240293	240298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202026
5123	NC_021040	CGG	2	6	240320	240325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202026
5124	NC_021040	CAATG	2	10	240363	240372	40 %	20 %	20 %	20 %	479202026
5125	NC_021040	TGG	2	6	240381	240386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202026
5126	NC_021040	ATTA	2	8	240459	240466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021040	AATGA	2	10	240496	240505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021040	GAAC	2	8	240539	240546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_021040	GTA	2	6	240607	240612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021040	AAAG	2	8	240761	240768	75 %	0 %	25 %	0 %	479202027
5131	NC_021040	GAA	2	6	240791	240796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202027
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5135	NC_021040	TGC	2	6	241005	241010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202027
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5152	NC_021040	GAA	2	6	241859	241864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202028
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5157	NC_021040	AAAT	2	8	242165	242172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_021040	ATG	3	9	242224	242232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_021040	AT	4	8	242236	242243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_021040	A	6	6	242269	242274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_021040	ATAA	2	8	242300	242307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_021040	GAAAA	2	10	242347	242356	80 %	0 %	20 %	0 %	479202029
5163	NC_021040	GAA	2	6	242374	242379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202029
5164	NC_021040	TG	5	10	242381	242390	0 %	50 %	50 %	0 %	479202029
5165	NC_021040	CAG	2	6	242454	242459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202029
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5181	NC_021040	ATC	2	6	243254	243259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202029
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5187	NC_021040	TGC	2	6	243446	243451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5202	NC_021040	AGG	2	6	244284	244289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5203	NC_021040	TGA	2	6	244294	244299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202031
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5230	NC_021040	T	6	6	245565	245570	0 %	100 %	0 %	0 %	479202032
5231	NC_021040	GTG	2	6	245590	245595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202032
5232	NC_021040	ATGC	2	8	245627	245634	25 %	25 %	25 %	25 %	479202032
5233	NC_021040	TGC	2	6	245735	245740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202032
5234	NC_021040	A	7	7	245762	245768	100 %	0 %	0 %	0 %	479202032
5235	NC_021040	GATC	2	8	245841	245848	25 %	25 %	25 %	25 %	479202032
5236	NC_021040	ATC	2	6	245936	245941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202032
5237	NC_021040	A	6	6	245980	245985	100 %	0 %	0 %	0 %	479202032
5238	NC_021040	TCT	2	6	245994	245999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202032
5239	NC_021040	GATC	2	8	246063	246070	25 %	25 %	25 %	25 %	479202032
5240	NC_021040	TGC	2	6	246137	246142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202032
5241	NC_021040	AAG	2	6	246170	246175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202032
5242	NC_021040	GAAA	2	8	246214	246221	75 %	0 %	25 %	0 %	479202032
5243	NC_021040	ATC	2	6	246236	246241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202032
5244	NC_021040	ATG	2	6	246302	246307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202032
5245	NC_021040	AAC	2	6	246324	246329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202032
5246	NC_021040	TAAAA	2	10	246376	246385	80 %	20 %	0 %	0 %	479202032
5247	NC_021040	TG	3	6	246434	246439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021040	TA	3	6	246440	246445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_021040	GA	3	6	246521	246526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_021040	GATAT	2	10	246533	246542	40 %	40 %	20 %	0 %	479202033
5251	NC_021040	CAT	2	6	246555	246560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202033
5252	NC_021040	GGTC	2	8	246573	246580	0 %	25 %	50 %	25 %	479202033
5253	NC_021040	GCT	2	6	246633	246638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202033
5254	NC_021040	GAA	2	6	246643	246648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202033
5255	NC_021040	AT	3	6	246664	246669	50 %	50 %	0 %	0 %	479202033
5256	NC_021040	TTCC	2	8	246678	246685	0 %	50 %	0 %	50 %	479202033
5257	NC_021040	GAT	2	6	246751	246756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202033
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5259	NC_021040	GCG	2	6	246962	246967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202033
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5264	NC_021040	GC	3	6	247361	247366	0 %	0 %	50 %	50 %	479202034
5265	NC_021040	GATGCG	2	12	247386	247397	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479202034
5266	NC_021040	ATG	2	6	247402	247407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202034
5267	NC_021040	GAT	2	6	247454	247459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202034
5268	NC_021040	ATGC	2	8	247543	247550	25 %	25 %	25 %	25 %	479202034
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5275	NC_021040	TCTGCG	2	12	247749	247760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202034
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5277	NC_021040	GGC	2	6	247791	247796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202034
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5280	NC_021040	CGTG	2	8	247888	247895	0 %	25 %	50 %	25 %	479202034
5281	NC_021040	CGG	2	6	247933	247938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202034
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5288	NC_021040	AC	3	6	248173	248178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5289	NC_021040	TGAC	2	8	248180	248187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5290	NC_021040	T	7	7	248219	248225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5291	NC_021040	TTG	2	6	248261	248266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5292	NC_021040	GTTA	2	8	248291	248298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5293	NC_021040	ACCA	2	8	248323	248330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5294	NC_021040	GAAA	2	8	248366	248373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5295	NC_021040	CCA	2	6	248378	248383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5301	NC_021040	TA	3	6	248577	248582	50 %	50 %	0 %	0 %	479202035
5302	NC_021040	T	6	6	248654	248659	0 %	100 %	0 %	0 %	479202035
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5360	NC_021040	GCA	2	6	251013	251018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202038
5361	NC_021040	A	6	6	251130	251135	100 %	0 %	0 %	0 %	479202038
5362	NC_021040	TG	3	6	251261	251266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_021040	A	6	6	251267	251272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_021040	A	6	6	251280	251285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_021040	ATGC	2	8	251339	251346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5366	NC_021040	TGC	2	6	251373	251378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202039
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5368	NC_021040	GT	4	8	251518	251525	0 %	50 %	50 %	0 %	479202039
5369	NC_021040	GACA	2	8	251615	251622	50 %	0 %	25 %	25 %	479202039
5370	NC_021040	GCC	2	6	251635	251640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202039
5371	NC_021040	CAC	2	6	251685	251690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202039
5372	NC_021040	CTG	2	6	251706	251711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202039
5373	NC_021040	TGACC	2	10	251721	251730	20 %	20 %	20 %	40 %	479202039
5374	NC_021040	GTT	2	6	251752	251757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202039
5375	NC_021040	CGAA	2	8	251788	251795	50 %	0 %	25 %	25 %	479202039
5376	NC_021040	TCA	2	6	251823	251828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202039
5377	NC_021040	GTC	2	6	251839	251844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202039
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5381	NC_021040	TACA	2	8	251962	251969	50 %	25 %	0 %	25 %	479202039
5382	NC_021040	TG	3	6	251974	251979	0 %	50 %	50 %	0 %	479202039
5383	NC_021040	CCG	2	6	252038	252043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202039
5384	NC_021040	CCG	2	6	252125	252130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202039
5385	NC_021040	GGA	2	6	252149	252154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202039
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5387	NC_021040	CAT	2	6	252351	252356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202039
5388	NC_021040	GTA	2	6	252376	252381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202039
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5392	NC_021040	A	6	6	252729	252734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_021040	AATT	2	8	252807	252814	50 %	50 %	0 %	0 %	479202040
5394	NC_021040	CGG	2	6	252846	252851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202040
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5401	NC_021040	T	7	7	253499	253505	0 %	100 %	0 %	0 %	479202040
5402	NC_021040	CGTC	2	8	253531	253538	0 %	25 %	25 %	50 %	479202040
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5417	NC_021040	TATT	2	8	253935	253942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5452	NC_021040	AT	3	6	255744	255749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5460	NC_021040	TA	3	6	255971	255976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5461	NC_021040	ACA	2	6	255984	255989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5462	NC_021040	TA	3	6	256002	256007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5495	NC_021040	AAAATA	2	12	257790	257801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479202045
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5498	NC_021040	A	6	6	257849	257854	100 %	0 %	0 %	0 %	479202045
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