MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 1626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021039	AGAAA	2	10	2208	2217	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021039	TGCAG	2	10	3744	3753	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021039	CGGGG	2	10	4951	4960	0 %	0 %	80 %	20 %	479199286
4	NC_021039	GGCAG	2	10	5864	5873	20 %	0 %	60 %	20 %	479199286
5	NC_021039	ACGGC	2	10	6103	6112	20 %	0 %	40 %	40 %	479199286
6	NC_021039	TTGTA	2	10	6772	6781	20 %	60 %	20 %	0 %	479199286
7	NC_021039	CATGC	2	10	8985	8994	20 %	20 %	20 %	40 %	479199287
8	NC_021039	ACGCT	2	10	13594	13603	20 %	20 %	20 %	40 %	479199290
9	NC_021039	ATGAC	2	10	13885	13894	40 %	20 %	20 %	20 %	479199290
10	NC_021039	GCAGA	2	10	15249	15258	40 %	0 %	40 %	20 %	479199290
11	NC_021039	TGATC	2	10	15458	15467	20 %	40 %	20 %	20 %	479199290
12	NC_021039	GGACT	2	10	15867	15876	20 %	20 %	40 %	20 %	479199290
13	NC_021039	TGCTC	2	10	16147	16156	0 %	40 %	20 %	40 %	479199290
14	NC_021039	ATGGT	2	10	16742	16751	20 %	40 %	40 %	0 %	479199291
15	NC_021039	CTTTT	2	10	17380	17389	0 %	80 %	0 %	20 %	479199291
16	NC_021039	CTGTT	2	10	17542	17551	0 %	60 %	20 %	20 %	479199291
17	NC_021039	TAGGG	2	10	20080	20089	20 %	20 %	60 %	0 %	479199293
18	NC_021039	CGGTA	2	10	20099	20108	20 %	20 %	40 %	20 %	479199293
19	NC_021039	GGTAG	2	10	20216	20225	20 %	20 %	60 %	0 %	479199293
20	NC_021039	GAAAT	2	10	23915	23924	60 %	20 %	20 %	0 %	479199295
21	NC_021039	CTTCC	2	10	24097	24106	0 %	40 %	0 %	60 %	479199295
22	NC_021039	GTCCA	2	10	25747	25756	20 %	20 %	20 %	40 %	479199295
23	NC_021039	CCGAA	2	10	25758	25767	40 %	0 %	20 %	40 %	479199295
24	NC_021039	ACGCC	2	10	26083	26092	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_021039	ATACG	2	10	28082	28091	40 %	20 %	20 %	20 %	479199296
26	NC_021039	CTTTT	2	10	28337	28346	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021039	TCACA	2	10	29190	29199	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_021039	GATCC	2	10	30032	30041	20 %	20 %	20 %	40 %	479199298
29	NC_021039	CTGAT	2	10	31726	31735	20 %	40 %	20 %	20 %	479199298
30	NC_021039	TGCAT	2	10	33228	33237	20 %	40 %	20 %	20 %	479199298
31	NC_021039	GACAG	2	10	33362	33371	40 %	0 %	40 %	20 %	479199298
32	NC_021039	GCATT	2	10	35817	35826	20 %	40 %	20 %	20 %	479199300
33	NC_021039	GCTTG	2	10	35963	35972	0 %	40 %	40 %	20 %	479199300
34	NC_021039	GCTGC	2	10	37952	37961	0 %	20 %	40 %	40 %	479199304
35	NC_021039	GCAGT	2	10	41623	41632	20 %	20 %	40 %	20 %	479199307
36	NC_021039	GGGCG	2	10	43438	43447	0 %	0 %	80 %	20 %	479199309
37	NC_021039	TGCGG	2	10	44514	44523	0 %	20 %	60 %	20 %	479199310
38	NC_021039	GGTAT	2	10	46088	46097	20 %	40 %	40 %	0 %	479199312
39	NC_021039	AGTGC	2	10	46319	46328	20 %	20 %	40 %	20 %	479199312
40	NC_021039	GATCG	2	10	46397	46406	20 %	20 %	40 %	20 %	479199312
41	NC_021039	GCAGC	2	10	48625	48634	20 %	0 %	40 %	40 %	479199315
42	NC_021039	TCTGT	2	10	48968	48977	0 %	60 %	20 %	20 %	479199315
43	NC_021039	AGGAG	2	10	51152	51161	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021039	TGGGC	2	10	51539	51548	0 %	20 %	60 %	20 %	479199317
45	NC_021039	AAAGG	2	10	53809	53818	60 %	0 %	40 %	0 %	479199318
46	NC_021039	GAGCA	2	10	56906	56915	40 %	0 %	40 %	20 %	479199322
47	NC_021039	CGGAT	2	10	57115	57124	20 %	20 %	40 %	20 %	479199322
48	NC_021039	GCATG	2	10	57680	57689	20 %	20 %	40 %	20 %	479199322
49	NC_021039	CAATG	2	10	57734	57743	40 %	20 %	20 %	20 %	479199322
50	NC_021039	GTTCA	2	10	59997	60006	20 %	40 %	20 %	20 %	479199325
51	NC_021039	GCTTT	2	10	60042	60051	0 %	60 %	20 %	20 %	479199325
52	NC_021039	AGCAC	2	10	60446	60455	40 %	0 %	20 %	40 %	479199325
53	NC_021039	TCCAG	2	10	62352	62361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_021039	TGCTC	2	10	63669	63678	0 %	40 %	20 %	40 %	479199329
55	NC_021039	TCGTG	2	10	66953	66962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021039	CTGAA	2	10	68080	68089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021039	GGGAG	2	10	68417	68426	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021039	TAAGA	2	10	70599	70608	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021039	CTGAT	2	10	71200	71209	20 %	40 %	20 %	20 %	479199330
60	NC_021039	ATCAT	2	10	76047	76056	40 %	40 %	0 %	20 %	479199332
61	NC_021039	ATATA	2	10	76427	76436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021039	GAAAA	2	10	76763	76772	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021039	AGATC	2	10	83239	83248	40 %	20 %	20 %	20 %	479199337
64	NC_021039	GCAGC	2	10	83604	83613	20 %	0 %	40 %	40 %	479199337
65	NC_021039	TCGGA	2	10	89956	89965	20 %	20 %	40 %	20 %	479199342
66	NC_021039	ACTGG	2	10	93207	93216	20 %	20 %	40 %	20 %	479199344
67	NC_021039	AGGAA	2	10	93917	93926	60 %	0 %	40 %	0 %	479199344
68	NC_021039	TGCGG	2	10	95822	95831	0 %	20 %	60 %	20 %	479199346
69	NC_021039	TGATG	2	10	97063	97072	20 %	40 %	40 %	0 %	479199347
70	NC_021039	GGCTG	2	10	97603	97612	0 %	20 %	60 %	20 %	479199348
71	NC_021039	TTTCA	2	10	97999	98008	20 %	60 %	0 %	20 %	479199348
72	NC_021039	CCAGC	2	10	98757	98766	20 %	0 %	20 %	60 %	479199349
73	NC_021039	GTCCT	2	10	102826	102835	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_021039	ATGCC	2	10	103291	103300	20 %	20 %	20 %	40 %	479199351
75	NC_021039	GTGGC	2	10	103896	103905	0 %	20 %	60 %	20 %	479199351
76	NC_021039	ATGCG	2	10	106466	106475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021039	GGAGG	2	10	107439	107448	20 %	0 %	80 %	0 %	479199354
78	NC_021039	ATGCC	2	10	107848	107857	20 %	20 %	20 %	40 %	479199356
79	NC_021039	CGTTT	2	10	109744	109753	0 %	60 %	20 %	20 %	479199357
80	NC_021039	GAAAA	2	10	110670	110679	80 %	0 %	20 %	0 %	479199358
81	NC_021039	GATCC	2	10	112082	112091	20 %	20 %	20 %	40 %	479199360
82	NC_021039	GCTGC	2	10	115336	115345	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021039	ATTCT	2	10	118140	118149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021039	GGATC	2	10	124662	124671	20 %	20 %	40 %	20 %	479199371
85	NC_021039	CAATG	2	10	126151	126160	40 %	20 %	20 %	20 %	479199372
86	NC_021039	GGGAT	2	10	126466	126475	20 %	20 %	60 %	0 %	479199372
87	NC_021039	CTACC	2	10	126476	126485	20 %	20 %	0 %	60 %	479199372
88	NC_021039	GCTGT	2	10	126738	126747	0 %	40 %	40 %	20 %	479199372
89	NC_021039	CGGCA	2	10	126994	127003	20 %	0 %	40 %	40 %	479199372
90	NC_021039	CATGG	2	10	127068	127077	20 %	20 %	40 %	20 %	479199372
91	NC_021039	AGTGA	2	10	127400	127409	40 %	20 %	40 %	0 %	479199372
92	NC_021039	GCAGA	2	10	128580	128589	40 %	0 %	40 %	20 %	479199375
93	NC_021039	CGCTG	2	10	129053	129062	0 %	20 %	40 %	40 %	479199375
94	NC_021039	GCTGG	2	10	130478	130487	0 %	20 %	60 %	20 %	479199377
95	NC_021039	CCAGC	2	10	132071	132080	20 %	0 %	20 %	60 %	479199379
96	NC_021039	GACCA	2	10	135152	135161	40 %	0 %	20 %	40 %	479199381
97	NC_021039	ATGGA	2	10	135821	135830	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021039	CAAAA	2	10	137044	137053	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021039	GCAAG	2	10	138125	138134	40 %	0 %	40 %	20 %	479199385
100	NC_021039	AATGA	2	10	139975	139984	60 %	20 %	20 %	0 %	479199386
101	NC_021039	CCCCA	2	10	140122	140131	20 %	0 %	0 %	80 %	479199386
102	NC_021039	GAAAG	2	10	140382	140391	60 %	0 %	40 %	0 %	479199387
103	NC_021039	GAAAA	2	10	142501	142510	80 %	0 %	20 %	0 %	479199390
104	NC_021039	GAAGG	2	10	144144	144153	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021039	GTCGA	2	10	144812	144821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021039	GTGTC	2	10	147268	147277	0 %	40 %	40 %	20 %	479199391
107	NC_021039	ATCCG	2	10	148039	148048	20 %	20 %	20 %	40 %	479199393
108	NC_021039	ATTAT	2	10	148791	148800	40 %	60 %	0 %	0 %	479199393
109	NC_021039	AAGGA	2	10	149883	149892	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021039	CAAGG	2	10	149933	149942	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021039	GAACA	2	10	151412	151421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021039	GAAAA	2	10	152511	152520	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021039	ATGCA	2	10	154726	154735	40 %	20 %	20 %	20 %	479199397
114	NC_021039	CGTTT	2	10	157534	157543	0 %	60 %	20 %	20 %	479199399
115	NC_021039	GTATG	2	10	159777	159786	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021039	TTTTC	2	10	160169	160178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021039	CAAAG	2	10	161017	161026	60 %	0 %	20 %	20 %	479199403
118	NC_021039	AATCC	2	10	162070	162079	40 %	20 %	0 %	40 %	479199404
119	NC_021039	TCCGT	2	10	162807	162816	0 %	40 %	20 %	40 %	479199405
120	NC_021039	AATTG	2	10	162822	162831	40 %	40 %	20 %	0 %	479199405
121	NC_021039	ATGAT	2	10	165971	165980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021039	ATACT	2	10	166510	166519	40 %	40 %	0 %	20 %	479199409
123	NC_021039	GGTGT	2	10	170462	170471	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021039	TCATT	2	10	173691	173700	20 %	60 %	0 %	20 %	479199411
125	NC_021039	AAGAT	2	10	179476	179485	60 %	20 %	20 %	0 %	479199417
126	NC_021039	TGGTG	2	10	180490	180499	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021039	ACTGC	2	10	180566	180575	20 %	20 %	20 %	40 %	479199421
128	NC_021039	CTGTT	2	10	180975	180984	0 %	60 %	20 %	20 %	479199422
129	NC_021039	TGATA	2	10	181786	181795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021039	TTTCC	2	10	181896	181905	0 %	60 %	0 %	40 %	479199424
131	NC_021039	AATCA	2	10	183412	183421	60 %	20 %	0 %	20 %	479199425
132	NC_021039	AAAAC	2	10	184727	184736	80 %	0 %	0 %	20 %	479199427
133	NC_021039	TGTAT	2	10	186353	186362	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021039	ACGAT	2	10	188765	188774	40 %	20 %	20 %	20 %	479199429
135	NC_021039	AAAGC	2	10	191527	191536	60 %	0 %	20 %	20 %	479199430
136	NC_021039	CAAAT	2	10	194065	194074	60 %	20 %	0 %	20 %	479199430
137	NC_021039	TGGAA	2	10	194460	194469	40 %	20 %	40 %	0 %	479199430
138	NC_021039	TTCCG	2	10	194946	194955	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_021039	GAAAA	2	10	197193	197202	80 %	0 %	20 %	0 %	479199431
140	NC_021039	AAAAG	2	10	198097	198106	80 %	0 %	20 %	0 %	479199432
141	NC_021039	TAGTT	2	10	200325	200334	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_021039	GTTAT	3	15	215676	215690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021039	CTGTT	2	10	216687	216696	0 %	60 %	20 %	20 %	479199448
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176	NC_021039	GCATC	2	10	261786	261795	20 %	20 %	20 %	40 %	479199484
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184	NC_021039	GGGAG	2	10	283462	283471	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_021039	GATCA	2	10	386660	386669	40 %	20 %	20 %	20 %	479199581
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242	NC_021039	GTGCC	2	10	399230	399239	0 %	20 %	40 %	40 %	479199591
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249	NC_021039	TTGCC	2	10	416717	416726	0 %	40 %	20 %	40 %	479199605
250	NC_021039	TGATC	2	10	418469	418478	20 %	40 %	20 %	20 %	479199606
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252	NC_021039	GGGCT	2	10	424940	424949	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
253	NC_021039	GCACC	2	10	427379	427388	20 %	0 %	20 %	60 %	479199611
254	NC_021039	AAAAG	2	10	430500	430509	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_021039	GGAGC	2	10	431088	431097	20 %	0 %	60 %	20 %	479199614
256	NC_021039	TTTCC	2	10	432671	432680	0 %	60 %	0 %	40 %	479199614
257	NC_021039	TTATT	2	10	434520	434529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021039	TATGT	2	10	434585	434594	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021039	CAGTC	2	10	437884	437893	20 %	20 %	20 %	40 %	479199619
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261	NC_021039	ACAGC	2	10	441406	441415	40 %	0 %	20 %	40 %	479199621
262	NC_021039	TGCTC	2	10	445438	445447	0 %	40 %	20 %	40 %	479199623
263	NC_021039	CCATT	2	10	445947	445956	20 %	40 %	0 %	40 %	479199624
264	NC_021039	CGGAT	2	10	446561	446570	20 %	20 %	40 %	20 %	479199624
265	NC_021039	GGAGA	2	10	447844	447853	40 %	0 %	60 %	0 %	479199624
266	NC_021039	GCGGA	2	10	453991	454000	20 %	0 %	60 %	20 %	479199630
267	NC_021039	TATCA	2	10	455726	455735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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