MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021022	A	6	6	187726	187731	100 %	0 %	0 %	0 %	479176197
4002	NC_021022	TTC	2	6	187761	187766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176197
4003	NC_021022	GCG	2	6	187773	187778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176197
4004	NC_021022	TTC	2	6	187944	187949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176197
4005	NC_021022	CGG	2	6	187978	187983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176197
4006	NC_021022	T	8	8	188102	188109	0 %	100 %	0 %	0 %	479176197
4007	NC_021022	ATC	2	6	188157	188162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176197
4008	NC_021022	TCA	2	6	188195	188200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176197
4009	NC_021022	TGAC	2	8	188213	188220	25 %	25 %	25 %	25 %	479176197
4010	NC_021022	ATG	2	6	188419	188424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176197
4011	NC_021022	A	7	7	188493	188499	100 %	0 %	0 %	0 %	479176197
4012	NC_021022	AGA	2	6	188551	188556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176197
4013	NC_021022	CCT	2	6	188590	188595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_021022	T	6	6	188644	188649	0 %	100 %	0 %	0 %	479176198
4015	NC_021022	AG	3	6	188665	188670	50 %	0 %	50 %	0 %	479176198
4016	NC_021022	CTT	2	6	188673	188678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176198
4017	NC_021022	ATTT	2	8	188832	188839	25 %	75 %	0 %	0 %	479176198
4018	NC_021022	GTC	2	6	188851	188856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176198
4019	NC_021022	GC	3	6	188893	188898	0 %	0 %	50 %	50 %	479176198
4020	NC_021022	GAAA	2	8	188912	188919	75 %	0 %	25 %	0 %	479176198
4021	NC_021022	ATG	2	6	188977	188982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021022	ATATG	2	10	188991	189000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021022	AAC	2	6	189026	189031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_021022	CGG	2	6	189060	189065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_021022	GGA	2	6	189139	189144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021022	TATT	2	8	189159	189166	25 %	75 %	0 %	0 %	479176199
4027	NC_021022	ATC	2	6	189171	189176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176199
4028	NC_021022	CAA	2	6	189208	189213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176199
4029	NC_021022	GAA	2	6	189248	189253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176199
4030	NC_021022	GA	3	6	189283	189288	50 %	0 %	50 %	0 %	479176199
4031	NC_021022	GAT	2	6	189343	189348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176199
4032	NC_021022	TGT	2	6	189367	189372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176199
4033	NC_021022	TGGTA	2	10	189394	189403	20 %	40 %	40 %	0 %	479176199
4034	NC_021022	CGG	2	6	189556	189561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176199
4035	NC_021022	ATGT	2	8	189616	189623	25 %	50 %	25 %	0 %	479176199
4036	NC_021022	GCA	2	6	189632	189637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176199
4037	NC_021022	TGAAC	2	10	189706	189715	40 %	20 %	20 %	20 %	479176199
4038	NC_021022	CGAC	2	8	189836	189843	25 %	0 %	25 %	50 %	479176200
4039	NC_021022	A	6	6	189846	189851	100 %	0 %	0 %	0 %	479176200
4040	NC_021022	TGT	3	9	189950	189958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176200
4041	NC_021022	AGA	2	6	189959	189964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176200
4042	NC_021022	GCA	2	6	190002	190007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176200
4043	NC_021022	GGA	2	6	190013	190018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176200
4044	NC_021022	CGTC	2	8	190031	190038	0 %	25 %	25 %	50 %	479176200
4045	NC_021022	CGA	2	6	190120	190125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176200
4046	NC_021022	AC	3	6	190219	190224	50 %	0 %	0 %	50 %	479176200
4047	NC_021022	CT	3	6	190294	190299	0 %	50 %	0 %	50 %	479176200
4048	NC_021022	CCG	2	6	190311	190316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176200
4049	NC_021022	GAA	2	6	190317	190322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176200
4050	NC_021022	TGC	2	6	190401	190406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176200
4051	NC_021022	T	6	6	190491	190496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021022	A	6	6	190535	190540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021022	GC	3	6	190602	190607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_021022	TTCT	2	8	190766	190773	0 %	75 %	0 %	25 %	479176201
4055	NC_021022	ATTG	2	8	190798	190805	25 %	50 %	25 %	0 %	479176201
4056	NC_021022	A	6	6	190834	190839	100 %	0 %	0 %	0 %	479176201
4057	NC_021022	AGA	2	6	190906	190911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176201
4058	NC_021022	AT	4	8	191028	191035	50 %	50 %	0 %	0 %	479176201
4059	NC_021022	GGC	2	6	191042	191047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176201
4060	NC_021022	A	6	6	191057	191062	100 %	0 %	0 %	0 %	479176201
4061	NC_021022	GTG	2	6	191156	191161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176201
4062	NC_021022	GAA	2	6	191180	191185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176201
4063	NC_021022	A	6	6	191193	191198	100 %	0 %	0 %	0 %	479176201
4064	NC_021022	TGTCC	2	10	191242	191251	0 %	40 %	20 %	40 %	479176201
4065	NC_021022	GCA	2	6	191306	191311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176201
4066	NC_021022	TGC	2	6	191332	191337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176201
4067	NC_021022	AG	4	8	191361	191368	50 %	0 %	50 %	0 %	479176201
4068	NC_021022	GA	3	6	191444	191449	50 %	0 %	50 %	0 %	479176201
4069	NC_021022	GTC	2	6	191464	191469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176201
4070	NC_021022	CGA	2	6	191484	191489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176201
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4072	NC_021022	GATG	2	8	191530	191537	25 %	25 %	50 %	0 %	479176201
4073	NC_021022	AGT	2	6	191551	191556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176201
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4076	NC_021022	GAA	3	9	191645	191653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021022	TTA	2	6	191661	191666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021022	AGG	2	6	191698	191703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021022	A	6	6	191715	191720	100 %	0 %	0 %	0 %	479176202
4080	NC_021022	CCGG	2	8	191817	191824	0 %	0 %	50 %	50 %	479176202
4081	NC_021022	T	7	7	191940	191946	0 %	100 %	0 %	0 %	479176202
4082	NC_021022	ATA	2	6	191954	191959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176202
4083	NC_021022	A	6	6	191959	191964	100 %	0 %	0 %	0 %	479176202
4084	NC_021022	GAT	2	6	192033	192038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176202
4085	NC_021022	CGA	2	6	192039	192044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176202
4086	NC_021022	CGA	2	6	192098	192103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176202
4087	NC_021022	ATA	2	6	192122	192127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176202
4088	NC_021022	A	6	6	192143	192148	100 %	0 %	0 %	0 %	479176202
4089	NC_021022	A	6	6	192164	192169	100 %	0 %	0 %	0 %	479176202
4090	NC_021022	AT	3	6	192175	192180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_021022	ATTT	2	8	192185	192192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021022	ATA	2	6	192215	192220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021022	CTT	2	6	192230	192235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_021022	AGG	2	6	192273	192278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_021022	GAA	2	6	192309	192314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176203
4096	NC_021022	GA	3	6	192329	192334	50 %	0 %	50 %	0 %	479176203
4097	NC_021022	GAA	3	9	192342	192350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176203
4098	NC_021022	CCG	2	6	192352	192357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176203
4099	NC_021022	CGG	2	6	192453	192458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176203
4100	NC_021022	TAT	2	6	192489	192494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176203
4101	NC_021022	GCT	2	6	192509	192514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176203
4102	NC_021022	TGAC	2	8	192516	192523	25 %	25 %	25 %	25 %	479176203
4103	NC_021022	TTA	2	6	192757	192762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176204
4104	NC_021022	GTC	2	6	192820	192825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176204
4105	NC_021022	TTA	2	6	192831	192836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176204
4106	NC_021022	AT	3	6	192956	192961	50 %	50 %	0 %	0 %	479176204
4107	NC_021022	AGA	2	6	192972	192977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176204
4108	NC_021022	ACT	2	6	193017	193022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176204
4109	NC_021022	AG	3	6	193040	193045	50 %	0 %	50 %	0 %	479176204
4110	NC_021022	GAT	2	6	193093	193098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176204
4111	NC_021022	TAT	2	6	193115	193120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176204
4112	NC_021022	ACGA	2	8	193134	193141	50 %	0 %	25 %	25 %	479176204
4113	NC_021022	CATG	2	8	193177	193184	25 %	25 %	25 %	25 %	479176204
4114	NC_021022	GTG	2	6	193325	193330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176204
4115	NC_021022	ATGTT	2	10	193350	193359	20 %	60 %	20 %	0 %	479176204
4116	NC_021022	ATCAGC	2	12	193400	193411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479176204
4117	NC_021022	ATGG	2	8	193422	193429	25 %	25 %	50 %	0 %	479176204
4118	NC_021022	T	6	6	193495	193500	0 %	100 %	0 %	0 %	479176204
4119	NC_021022	A	6	6	193501	193506	100 %	0 %	0 %	0 %	479176204
4120	NC_021022	GA	3	6	193524	193529	50 %	0 %	50 %	0 %	479176204
4121	NC_021022	ATT	2	6	193554	193559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176205
4122	NC_021022	GA	3	6	193598	193603	50 %	0 %	50 %	0 %	479176205
4123	NC_021022	AGC	2	6	193632	193637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176205
4124	NC_021022	GAA	2	6	193666	193671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176205
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4126	NC_021022	TA	3	6	193777	193782	50 %	50 %	0 %	0 %	479176205
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4255	NC_021022	GGCT	2	8	199922	199929	0 %	25 %	50 %	25 %	479176209
4256	NC_021022	CTGA	2	8	200082	200089	25 %	25 %	25 %	25 %	479176209
4257	NC_021022	CGA	2	6	200125	200130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176209
4258	NC_021022	TGT	2	6	200216	200221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176209
4259	NC_021022	GAG	2	6	200226	200231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176209
4260	NC_021022	CGT	2	6	200247	200252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176209
4261	NC_021022	GAA	2	6	200313	200318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176209
4262	NC_021022	TGA	2	6	200324	200329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176209
4263	NC_021022	AAGA	2	8	200354	200361	75 %	0 %	25 %	0 %	479176209
4264	NC_021022	GAAA	2	8	200435	200442	75 %	0 %	25 %	0 %	479176209
4265	NC_021022	GATG	2	8	200477	200484	25 %	25 %	50 %	0 %	479176209
4266	NC_021022	TTC	2	6	200502	200507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176209
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4268	NC_021022	AGAA	2	8	200668	200675	75 %	0 %	25 %	0 %	479176210
4269	NC_021022	TCA	2	6	200684	200689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176210
4270	NC_021022	GAT	2	6	200786	200791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176210
4271	NC_021022	CAA	2	6	200792	200797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176210
4272	NC_021022	TCTG	2	8	200812	200819	0 %	50 %	25 %	25 %	479176210
4273	NC_021022	GGA	2	6	200834	200839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176210
4274	NC_021022	GAA	2	6	200859	200864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176210
4275	NC_021022	GAA	2	6	200880	200885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176210
4276	NC_021022	ATA	2	6	201000	201005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4277	NC_021022	A	9	9	201009	201017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4278	NC_021022	AGAC	2	8	201039	201046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4279	NC_021022	GTCT	2	8	201075	201082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4280	NC_021022	T	6	6	201082	201087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4281	NC_021022	A	6	6	201126	201131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4282	NC_021022	AGAA	2	8	201161	201168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4283	NC_021022	TAT	2	6	201202	201207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_021022	A	6	6	201220	201225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4285	NC_021022	GCG	2	6	201311	201316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4286	NC_021022	AAG	2	6	201401	201406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4287	NC_021022	GCA	3	9	201468	201476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4288	NC_021022	CAA	2	6	201621	201626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4289	NC_021022	A	7	7	201625	201631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4290	NC_021022	AGA	2	6	201672	201677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4291	NC_021022	AAGA	2	8	201703	201710	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4292	NC_021022	CTG	2	6	201762	201767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4293	NC_021022	CA	3	6	201780	201785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4294	NC_021022	AG	3	6	201866	201871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4295	NC_021022	CAG	2	6	201947	201952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4296	NC_021022	TGG	2	6	202010	202015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4297	NC_021022	TTC	2	6	202064	202069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4298	NC_021022	ATG	2	6	202076	202081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4299	NC_021022	TGC	2	6	202141	202146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4300	NC_021022	TGAAT	2	10	202194	202203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4302	NC_021022	GGT	2	6	202335	202340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4314	NC_021022	ATA	2	6	203215	203220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176211
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4316	NC_021022	CAGA	2	8	203237	203244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4317	NC_021022	AGA	2	6	203262	203267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4331	NC_021022	ACCTGT	2	12	204008	204019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479176212
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4350	NC_021022	TG	3	6	205127	205132	0 %	50 %	50 %	0 %	479176213
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4353	NC_021022	TAT	2	6	205220	205225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4356	NC_021022	AAG	2	6	205301	205306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4357	NC_021022	TAA	2	6	205321	205326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4360	NC_021022	T	6	6	205382	205387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_021022	AGTAA	2	10	205410	205419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4362	NC_021022	TGC	2	6	205432	205437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4363	NC_021022	A	6	6	205490	205495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_021022	TAT	2	6	205693	205698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_021022	T	7	7	205752	205758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_021022	GCG	2	6	205759	205764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4367	NC_021022	CCA	2	6	205769	205774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4368	NC_021022	CAAA	2	8	205823	205830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4369	NC_021022	TAT	2	6	205836	205841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_021022	CATT	2	8	205865	205872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4371	NC_021022	TGT	2	6	205900	205905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_021022	A	6	6	205925	205930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_021022	AGAA	2	8	205997	206004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_021022	CAG	2	6	206038	206043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4375	NC_021022	CTT	2	6	206078	206083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4376	NC_021022	GCA	2	6	206157	206162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4377	NC_021022	A	7	7	206288	206294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4378	NC_021022	CTT	2	6	206343	206348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4379	NC_021022	AG	3	6	206378	206383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4380	NC_021022	GAA	2	6	206426	206431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4381	NC_021022	TCT	2	6	206467	206472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4382	NC_021022	AGGC	2	8	206493	206500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4384	NC_021022	GGA	2	6	206572	206577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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