MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021022	CGG	2	6	25261	25266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176068
502	NC_021022	ACG	2	6	25336	25341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
503	NC_021022	CAC	2	6	25351	25356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176068
504	NC_021022	AGA	2	6	25389	25394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176068
505	NC_021022	AGA	2	6	25402	25407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176068
506	NC_021022	TTG	2	6	25455	25460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176068
507	NC_021022	AGT	2	6	25478	25483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176068
508	NC_021022	ATG	2	6	25506	25511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176068
509	NC_021022	GGC	2	6	25520	25525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176068
510	NC_021022	A	6	6	25594	25599	100 %	0 %	0 %	0 %	479176068
511	NC_021022	CGA	2	6	25627	25632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
512	NC_021022	TGGA	2	8	25694	25701	25 %	25 %	50 %	0 %	479176068
513	NC_021022	GCA	2	6	25713	25718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
514	NC_021022	AAT	2	6	25730	25735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176068
515	NC_021022	AGA	2	6	25736	25741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176068
516	NC_021022	TGC	2	6	25760	25765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176068
517	NC_021022	A	6	6	25801	25806	100 %	0 %	0 %	0 %	479176068
518	NC_021022	AGC	2	6	25844	25849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
519	NC_021022	CA	3	6	25858	25863	50 %	0 %	0 %	50 %	479176068
520	NC_021022	TGACG	2	10	25870	25879	20 %	20 %	40 %	20 %	479176068
521	NC_021022	TCT	2	6	25881	25886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176068
522	NC_021022	TCG	2	6	25887	25892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176068
523	NC_021022	ACC	2	6	25967	25972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176068
524	NC_021022	GT	3	6	25979	25984	0 %	50 %	50 %	0 %	479176068
525	NC_021022	TGG	2	6	26047	26052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176068
526	NC_021022	GCC	2	6	26069	26074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176068
527	NC_021022	GCA	2	6	26128	26133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
528	NC_021022	CTG	2	6	26199	26204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176068
529	NC_021022	ACCG	2	8	26210	26217	25 %	0 %	25 %	50 %	479176068
530	NC_021022	AGC	2	6	26241	26246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
531	NC_021022	TGTCA	2	10	26261	26270	20 %	40 %	20 %	20 %	479176068
532	NC_021022	ATA	2	6	26288	26293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176068
533	NC_021022	T	6	6	26308	26313	0 %	100 %	0 %	0 %	479176068
534	NC_021022	TAT	2	6	26323	26328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176068
535	NC_021022	TG	3	6	26331	26336	0 %	50 %	50 %	0 %	479176068
536	NC_021022	CTT	2	6	26425	26430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176069
537	NC_021022	TCT	2	6	26514	26519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176069
538	NC_021022	T	6	6	26531	26536	0 %	100 %	0 %	0 %	479176069
539	NC_021022	CAT	2	6	26573	26578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176069
540	NC_021022	T	6	6	26611	26616	0 %	100 %	0 %	0 %	479176069
541	NC_021022	CTTTT	2	10	26621	26630	0 %	80 %	0 %	20 %	479176069
542	NC_021022	T	6	6	26643	26648	0 %	100 %	0 %	0 %	479176069
543	NC_021022	T	7	7	26674	26680	0 %	100 %	0 %	0 %	479176069
544	NC_021022	ACG	2	6	26733	26738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176069
545	NC_021022	TGC	2	6	26759	26764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176069
546	NC_021022	AGCG	2	8	26819	26826	25 %	0 %	50 %	25 %	479176069
547	NC_021022	GGC	2	6	26926	26931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176069
548	NC_021022	TCA	2	6	26935	26940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176069
549	NC_021022	ACA	2	6	26943	26948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176069
550	NC_021022	CTTT	2	8	27084	27091	0 %	75 %	0 %	25 %	479176069
551	NC_021022	GCCT	2	8	27128	27135	0 %	25 %	25 %	50 %	479176069
552	NC_021022	CGTT	2	8	27159	27166	0 %	50 %	25 %	25 %	479176069
553	NC_021022	TCT	2	6	27231	27236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176069
554	NC_021022	AAT	2	6	27257	27262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176069
555	NC_021022	AGG	2	6	27291	27296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176069
556	NC_021022	GA	3	6	27336	27341	50 %	0 %	50 %	0 %	479176069
557	NC_021022	TGA	2	6	27367	27372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
558	NC_021022	CCA	2	6	27384	27389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176069
559	NC_021022	ATT	2	6	27401	27406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176069
560	NC_021022	T	7	7	27522	27528	0 %	100 %	0 %	0 %	479176069
561	NC_021022	GTCA	2	8	27587	27594	25 %	25 %	25 %	25 %	479176069
562	NC_021022	GAT	2	6	27638	27643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
563	NC_021022	CTT	2	6	27658	27663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176069
564	NC_021022	GA	3	6	27665	27670	50 %	0 %	50 %	0 %	479176069
565	NC_021022	CTG	2	6	27673	27678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176069
566	NC_021022	TGA	2	6	27766	27771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
567	NC_021022	TGA	2	6	27856	27861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
568	NC_021022	TGG	2	6	27916	27921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176069
569	NC_021022	TGA	2	6	27943	27948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
570	NC_021022	GTG	2	6	27960	27965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176069
571	NC_021022	GAT	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
572	NC_021022	ACG	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176069
573	NC_021022	T	7	7	28163	28169	0 %	100 %	0 %	0 %	479176069
574	NC_021022	CTG	2	6	28216	28221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176069
575	NC_021022	TCA	2	6	28237	28242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176069
576	NC_021022	GTT	2	6	28260	28265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176069
577	NC_021022	AGC	2	6	28322	28327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176069
578	NC_021022	AAAAT	2	10	28334	28343	80 %	20 %	0 %	0 %	479176069
579	NC_021022	CAT	2	6	28346	28351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176069
580	NC_021022	GCG	2	6	28365	28370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176069
581	NC_021022	TGA	2	6	28519	28524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
582	NC_021022	ATG	2	6	28527	28532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
583	NC_021022	AGC	2	6	28596	28601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176069
584	NC_021022	CAT	2	6	28610	28615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176069
585	NC_021022	CTT	2	6	28708	28713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176069
586	NC_021022	TTG	2	6	28740	28745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176069
587	NC_021022	TGAG	2	8	28753	28760	25 %	25 %	50 %	0 %	479176069
588	NC_021022	GCCT	2	8	28769	28776	0 %	25 %	25 %	50 %	479176069
589	NC_021022	TGA	2	6	28789	28794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176069
590	NC_021022	TTCC	2	8	28813	28820	0 %	50 %	0 %	50 %	479176069
591	NC_021022	GCAG	2	8	28904	28911	25 %	0 %	50 %	25 %	479176069
592	NC_021022	CCT	2	6	28953	28958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_021022	TTC	2	6	28972	28977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021022	TGC	2	6	28997	29002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021022	TCA	2	6	29010	29015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021022	CG	3	6	29062	29067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_021022	TG	3	6	29272	29277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021022	GCA	2	6	29287	29292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021022	TTA	2	6	29369	29374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021022	TGAGTG	2	12	29408	29419	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021022	ATT	2	6	29421	29426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021022	ATG	2	6	29449	29454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021022	TGA	2	6	29459	29464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021022	AT	3	6	29467	29472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021022	GA	3	6	29514	29519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021022	TCA	2	6	29555	29560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021022	AGTG	2	8	29564	29571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021022	GA	3	6	29588	29593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021022	TGG	2	6	29627	29632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021022	CCCGAT	2	12	29779	29790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479176070
611	NC_021022	CGG	2	6	29820	29825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176070
612	NC_021022	GAA	2	6	29872	29877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176070
613	NC_021022	CGGC	2	8	29895	29902	0 %	0 %	50 %	50 %	479176070
614	NC_021022	ATG	2	6	29906	29911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176070
615	NC_021022	AG	4	8	29925	29932	50 %	0 %	50 %	0 %	479176070
616	NC_021022	AGA	2	6	29995	30000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176070
617	NC_021022	GAT	2	6	30019	30024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176070
618	NC_021022	CGG	2	6	30042	30047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176070
619	NC_021022	TGG	2	6	30063	30068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176070
620	NC_021022	GAT	2	6	30106	30111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176070
621	NC_021022	GTA	2	6	30268	30273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176070
622	NC_021022	CAC	2	6	30286	30291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176070
623	NC_021022	GCC	2	6	30308	30313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176070
624	NC_021022	TGC	2	6	30394	30399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176070
625	NC_021022	TGGA	2	8	30412	30419	25 %	25 %	50 %	0 %	479176070
626	NC_021022	GCA	2	6	30515	30520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176070
627	NC_021022	ATC	2	6	30560	30565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176070
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629	NC_021022	TGG	2	6	30669	30674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176070
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