MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021022	GCACAG	2	12	304783	304794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176303
6502	NC_021022	GGA	2	6	304891	304896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176303
6503	NC_021022	GCAG	2	8	304944	304951	25 %	0 %	50 %	25 %	479176303
6504	NC_021022	GAT	2	6	305016	305021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176303
6505	NC_021022	A	6	6	305071	305076	100 %	0 %	0 %	0 %	479176303
6506	NC_021022	A	6	6	305149	305154	100 %	0 %	0 %	0 %	479176303
6507	NC_021022	GAA	2	6	305175	305180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176303
6508	NC_021022	ACAG	2	8	305243	305250	50 %	0 %	25 %	25 %	479176303
6509	NC_021022	GAA	2	6	305254	305259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176303
6510	NC_021022	AGA	2	6	305300	305305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176303
6511	NC_021022	AT	3	6	305376	305381	50 %	50 %	0 %	0 %	479176303
6512	NC_021022	ATG	2	6	305402	305407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176303
6513	NC_021022	GAG	2	6	305419	305424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176303
6514	NC_021022	AG	3	6	305474	305479	50 %	0 %	50 %	0 %	479176303
6515	NC_021022	GAT	2	6	305517	305522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176303
6516	NC_021022	ATT	2	6	305525	305530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176303
6517	NC_021022	GACA	2	8	305575	305582	50 %	0 %	25 %	25 %	479176303
6518	NC_021022	AAAG	2	8	305613	305620	75 %	0 %	25 %	0 %	479176303
6519	NC_021022	AGG	2	6	305741	305746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176303
6520	NC_021022	AGC	2	6	305799	305804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_021022	AC	3	6	305816	305821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_021022	TGA	2	6	305849	305854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176304
6523	NC_021022	GCAG	2	8	305861	305868	25 %	0 %	50 %	25 %	479176304
6524	NC_021022	GTACAG	2	12	305934	305945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479176304
6525	NC_021022	CAG	2	6	305979	305984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176304
6526	NC_021022	GAA	2	6	306012	306017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176304
6527	NC_021022	CAG	2	6	306018	306023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176304
6528	NC_021022	GATC	2	8	306047	306054	25 %	25 %	25 %	25 %	479176304
6529	NC_021022	AGA	3	9	306097	306105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176304
6530	NC_021022	TGA	2	6	306119	306124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176304
6531	NC_021022	AGT	2	6	306182	306187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176304
6532	NC_021022	GAA	3	9	306213	306221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176304
6533	NC_021022	CTT	2	6	306236	306241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176304
6534	NC_021022	CAA	2	6	306254	306259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176304
6535	NC_021022	AGC	2	6	306328	306333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176304
6536	NC_021022	GAT	2	6	306362	306367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176304
6537	NC_021022	CAGG	2	8	306423	306430	25 %	0 %	50 %	25 %	479176304
6538	NC_021022	GCA	2	6	306519	306524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176304
6539	NC_021022	AAC	2	6	306630	306635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176304
6540	NC_021022	ATG	2	6	306642	306647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176304
6541	NC_021022	A	6	6	306652	306657	100 %	0 %	0 %	0 %	479176304
6542	NC_021022	TTG	2	6	306850	306855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176304
6543	NC_021022	AGA	2	6	306871	306876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176304
6544	NC_021022	GAT	2	6	306903	306908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176304
6545	NC_021022	TGA	2	6	306910	306915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176304
6546	NC_021022	AG	3	6	306922	306927	50 %	0 %	50 %	0 %	479176304
6547	NC_021022	AG	3	6	306933	306938	50 %	0 %	50 %	0 %	479176304
6548	NC_021022	CTG	2	6	306996	307001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176304
6549	NC_021022	AT	3	6	307016	307021	50 %	50 %	0 %	0 %	479176304
6550	NC_021022	GA	3	6	307072	307077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_021022	CGG	2	6	307130	307135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176305
6552	NC_021022	AGA	2	6	307178	307183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176305
6553	NC_021022	ATC	2	6	307236	307241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176305
6554	NC_021022	CGA	2	6	307255	307260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176305
6555	NC_021022	AGC	2	6	307265	307270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176305
6556	NC_021022	A	6	6	307290	307295	100 %	0 %	0 %	0 %	479176305
6557	NC_021022	GCA	2	6	307350	307355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176305
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6559	NC_021022	TAT	2	6	307562	307567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176305
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6561	NC_021022	TCT	2	6	307608	307613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176305
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6563	NC_021022	ATC	2	6	307663	307668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176305
6564	NC_021022	CAG	2	6	307723	307728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176305
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6567	NC_021022	TGATC	2	10	307898	307907	20 %	40 %	20 %	20 %	479176305
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6572	NC_021022	AAG	2	6	308073	308078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176305
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6581	NC_021022	TGA	2	6	308519	308524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6583	NC_021022	GAAT	2	8	308620	308627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6585	NC_021022	AAGT	2	8	308663	308670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6589	NC_021022	GAA	2	6	308766	308771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_021022	A	6	6	308796	308801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_021022	CAGAAA	2	12	308826	308837	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6592	NC_021022	AAAG	2	8	308846	308853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_021022	GAG	2	6	308860	308865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_021022	CGAT	2	8	308935	308942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6595	NC_021022	TTA	2	6	308974	308979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_021022	A	6	6	309025	309030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_021022	GAA	2	6	309125	309130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_021022	ACTGC	2	10	309272	309281	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6599	NC_021022	ATGG	2	8	309300	309307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_021022	GT	3	6	309434	309439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_021022	TGA	2	6	309491	309496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_021022	AGC	2	6	309694	309699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_021022	CA	3	6	309796	309801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_021022	TAT	2	6	309824	309829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_021022	ATC	3	9	309964	309972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_021022	ATG	2	6	310051	310056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_021022	AATT	2	8	310154	310161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_021022	CGT	3	9	310200	310208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_021022	TTC	2	6	310297	310302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_021022	A	7	7	310446	310452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_021022	A	6	6	310476	310481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_021022	GGA	2	6	310520	310525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_021022	CCG	2	6	310535	310540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6614	NC_021022	ATT	2	6	310542	310547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_021022	ACG	2	6	310602	310607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_021022	GAA	2	6	310608	310613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_021022	GAA	2	6	310620	310625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_021022	AGA	2	6	310652	310657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_021022	TCA	2	6	310663	310668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_021022	ACAA	2	8	310674	310681	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6621	NC_021022	TCC	2	6	310730	310735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6622	NC_021022	TAA	2	6	310778	310783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_021022	AGA	2	6	310823	310828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_021022	ATT	2	6	310854	310859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_021022	ATT	2	6	310884	310889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6627	NC_021022	GCA	2	6	310965	310970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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