MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 72617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021015	TAA	2	6	231906	231911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155942
5002	NC_021015	AAC	2	6	231940	231945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155942
5003	NC_021015	A	6	6	231978	231983	100 %	0 %	0 %	0 %	479155942
5004	NC_021015	AAT	2	6	232000	232005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155942
5005	NC_021015	AAT	2	6	232018	232023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155942
5006	NC_021015	CAGT	2	8	232065	232072	25 %	25 %	25 %	25 %	479155942
5007	NC_021015	GTT	2	6	232085	232090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155942
5008	NC_021015	ATCA	2	8	232093	232100	50 %	25 %	0 %	25 %	479155942
5009	NC_021015	TTG	2	6	232122	232127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155942
5010	NC_021015	T	6	6	232180	232185	0 %	100 %	0 %	0 %	479155942
5011	NC_021015	TGA	2	6	232203	232208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021015	T	6	6	232254	232259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021015	TA	3	6	232282	232287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021015	TCC	2	6	232301	232306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_021015	A	7	7	232420	232426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021015	A	6	6	232433	232438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021015	GATT	2	8	232564	232571	25 %	50 %	25 %	0 %	479155943
5018	NC_021015	TTC	2	6	232572	232577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155943
5019	NC_021015	GTT	2	6	232595	232600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155943
5020	NC_021015	ACC	2	6	232670	232675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155943
5021	NC_021015	GTG	2	6	232699	232704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155943
5022	NC_021015	GAA	2	6	232747	232752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155943
5023	NC_021015	CGTTT	2	10	232762	232771	0 %	60 %	20 %	20 %	479155943
5024	NC_021015	T	6	6	232769	232774	0 %	100 %	0 %	0 %	479155943
5025	NC_021015	ATC	2	6	232853	232858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155943
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5028	NC_021015	TTC	2	6	233042	233047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155943
5029	NC_021015	GAA	2	6	233056	233061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155943
5030	NC_021015	AGGAG	2	10	233084	233093	40 %	0 %	60 %	0 %	479155943
5031	NC_021015	GAT	2	6	233177	233182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155943
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5033	NC_021015	CTTT	2	8	233241	233248	0 %	75 %	0 %	25 %	479155943
5034	NC_021015	TAA	2	6	233254	233259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155943
5035	NC_021015	TCG	2	6	233268	233273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155943
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5037	NC_021015	ATT	2	6	233288	233293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155943
5038	NC_021015	T	6	6	233402	233407	0 %	100 %	0 %	0 %	479155943
5039	NC_021015	AATGT	2	10	233426	233435	40 %	40 %	20 %	0 %	479155943
5040	NC_021015	AAG	2	6	233484	233489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155943
5041	NC_021015	AG	3	6	233488	233493	50 %	0 %	50 %	0 %	479155943
5042	NC_021015	TC	3	6	233503	233508	0 %	50 %	0 %	50 %	479155943
5043	NC_021015	AGC	2	6	233534	233539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155943
5044	NC_021015	TTG	3	9	233550	233558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155943
5045	NC_021015	TCT	2	6	233632	233637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155943
5046	NC_021015	TTCT	2	8	233648	233655	0 %	75 %	0 %	25 %	479155943
5047	NC_021015	AT	3	6	233793	233798	50 %	50 %	0 %	0 %	479155943
5048	NC_021015	GTG	2	6	233830	233835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155943
5049	NC_021015	GTA	2	6	233844	233849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155943
5050	NC_021015	T	6	6	233943	233948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021015	AAT	2	6	233983	233988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021015	TGTT	2	8	234070	234077	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021015	A	6	6	234078	234083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021015	TTA	2	6	234102	234107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021015	AAT	2	6	234120	234125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021015	TC	3	6	234151	234156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_021015	A	6	6	234173	234178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021015	GT	3	6	234202	234207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021015	T	6	6	234246	234251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021015	A	8	8	234258	234265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021015	TGT	2	6	234356	234361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021015	A	6	6	234373	234378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021015	AT	3	6	234394	234399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021015	GAA	2	6	234409	234414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021015	ATT	2	6	234422	234427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021015	A	6	6	234458	234463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021015	TTG	2	6	234485	234490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021015	TAT	2	6	234586	234591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021015	GAA	2	6	234645	234650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155944
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5073	NC_021015	GAA	2	6	234737	234742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155944
5074	NC_021015	AT	3	6	234765	234770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021015	TCT	2	6	234780	234785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021015	TGA	2	6	234838	234843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155945
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5078	NC_021015	TCAG	2	8	234878	234885	25 %	25 %	25 %	25 %	479155945
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5080	NC_021015	TA	3	6	234930	234935	50 %	50 %	0 %	0 %	479155945
5081	NC_021015	CGAA	2	8	234940	234947	50 %	0 %	25 %	25 %	479155945
5082	NC_021015	AAG	2	6	234981	234986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155945
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5090	NC_021015	GAT	2	6	235223	235228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155946
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5093	NC_021015	AGG	2	6	235415	235420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155946
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5095	NC_021015	ATT	2	6	235569	235574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155947
5096	NC_021015	ATT	2	6	235584	235589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155947
5097	NC_021015	TGA	2	6	235597	235602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155947
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5099	NC_021015	A	6	6	235677	235682	100 %	0 %	0 %	0 %	479155947
5100	NC_021015	GAAA	2	8	235690	235697	75 %	0 %	25 %	0 %	479155947
5101	NC_021015	ATG	2	6	235710	235715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155947
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5104	NC_021015	AAGC	2	8	235936	235943	50 %	0 %	25 %	25 %	479155947
5105	NC_021015	ATT	2	6	235972	235977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155947
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5107	NC_021015	ATC	2	6	236184	236189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155947
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5109	NC_021015	GCA	2	6	236385	236390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155947
5110	NC_021015	CAG	2	6	236403	236408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155947
5111	NC_021015	CAA	2	6	236417	236422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155947
5112	NC_021015	TGA	2	6	236444	236449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155947
5113	NC_021015	GAT	2	6	236450	236455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155947
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5116	NC_021015	CAA	3	9	236530	236538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155947
5117	NC_021015	AGAA	2	8	236593	236600	75 %	0 %	25 %	0 %	479155947
5118	NC_021015	CAG	2	6	236619	236624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155947
5119	NC_021015	CAG	2	6	236694	236699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155947
5120	NC_021015	AGA	2	6	236717	236722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155947
5121	NC_021015	A	7	7	236740	236746	100 %	0 %	0 %	0 %	479155947
5122	NC_021015	A	6	6	236754	236759	100 %	0 %	0 %	0 %	479155947
5123	NC_021015	GGA	2	6	236826	236831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021015	GTA	2	6	236845	236850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155948
5125	NC_021015	TGA	2	6	236873	236878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155948
5126	NC_021015	GCAG	2	8	236981	236988	25 %	0 %	50 %	25 %	479155948
5127	NC_021015	AGA	2	6	237000	237005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5128	NC_021015	AGA	2	6	237032	237037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5129	NC_021015	GTA	2	6	237042	237047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155948
5130	NC_021015	GAA	2	6	237048	237053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5131	NC_021015	AAG	2	6	237072	237077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5132	NC_021015	AGC	2	6	237101	237106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155948
5133	NC_021015	AGAAA	2	10	237110	237119	80 %	0 %	20 %	0 %	479155948
5134	NC_021015	GCT	2	6	237138	237143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155948
5135	NC_021015	AAG	2	6	237163	237168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5136	NC_021015	AAGA	2	8	237183	237190	75 %	0 %	25 %	0 %	479155948
5137	NC_021015	AGA	2	6	237233	237238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5138	NC_021015	CATGGA	2	12	237263	237274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479155948
5139	NC_021015	GATC	2	8	237293	237300	25 %	25 %	25 %	25 %	479155948
5140	NC_021015	AG	3	6	237358	237363	50 %	0 %	50 %	0 %	479155948
5141	NC_021015	AAG	2	6	237464	237469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5142	NC_021015	AGA	2	6	237470	237475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5143	NC_021015	AGA	2	6	237525	237530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5144	NC_021015	GA	3	6	237561	237566	50 %	0 %	50 %	0 %	479155948
5145	NC_021015	ATC	2	6	237570	237575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155948
5146	NC_021015	TGA	2	6	237604	237609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155948
5147	NC_021015	CA	3	6	237610	237615	50 %	0 %	0 %	50 %	479155948
5148	NC_021015	GTT	2	6	237642	237647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155948
5149	NC_021015	GAA	2	6	237656	237661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155948
5150	NC_021015	ATA	2	6	237662	237667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155948
5151	NC_021015	T	6	6	237736	237741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_021015	ATG	2	6	237754	237759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_021015	TA	3	6	237904	237909	50 %	50 %	0 %	0 %	479155949
5154	NC_021015	GAAA	2	8	237914	237921	75 %	0 %	25 %	0 %	479155949
5155	NC_021015	ATGG	2	8	237966	237973	25 %	25 %	50 %	0 %	479155949
5156	NC_021015	TGT	2	6	238073	238078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155949
5157	NC_021015	CAGC	2	8	238241	238248	25 %	0 %	25 %	50 %	479155949
5158	NC_021015	GAA	2	6	238262	238267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155949
5159	NC_021015	ATT	2	6	238293	238298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155949
5160	NC_021015	GAT	2	6	238329	238334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155949
5161	NC_021015	AGG	2	6	238375	238380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155949
5162	NC_021015	CAG	2	6	238381	238386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155949
5163	NC_021015	GATC	2	8	238394	238401	25 %	25 %	25 %	25 %	479155949
5164	NC_021015	TGAT	2	8	238414	238421	25 %	50 %	25 %	0 %	479155949
5165	NC_021015	GAT	2	6	238428	238433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155949
5166	NC_021015	GACT	2	8	238594	238601	25 %	25 %	25 %	25 %	479155949
5167	NC_021015	CAGA	2	8	238632	238639	50 %	0 %	25 %	25 %	479155949
5168	NC_021015	A	6	6	238651	238656	100 %	0 %	0 %	0 %	479155949
5169	NC_021015	TTA	2	6	238699	238704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155949
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5173	NC_021015	TTTGA	2	10	238755	238764	20 %	60 %	20 %	0 %	479155949
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5178	NC_021015	TC	3	6	238958	238963	0 %	50 %	0 %	50 %	479155949
5179	NC_021015	GA	4	8	239021	239028	50 %	0 %	50 %	0 %	479155949
5180	NC_021015	GAA	2	6	239033	239038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155949
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5183	NC_021015	GATG	2	8	239093	239100	25 %	25 %	50 %	0 %	479155949
5184	NC_021015	ATG	2	6	239198	239203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155950
5185	NC_021015	GGA	2	6	239332	239337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155950
5186	NC_021015	AG	3	6	239359	239364	50 %	0 %	50 %	0 %	479155950
5187	NC_021015	GA	3	6	239381	239386	50 %	0 %	50 %	0 %	479155950
5188	NC_021015	CA	3	6	239685	239690	50 %	0 %	0 %	50 %	479155950
5189	NC_021015	GATT	2	8	239805	239812	25 %	50 %	25 %	0 %	479155950
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5192	NC_021015	CTG	2	6	239904	239909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155950
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5195	NC_021015	TCGA	2	8	240016	240023	25 %	25 %	25 %	25 %	479155950
5196	NC_021015	TCA	2	6	240057	240062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155950
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5199	NC_021015	GCT	2	6	240319	240324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155950
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5202	NC_021015	TGAT	2	8	240419	240426	25 %	50 %	25 %	0 %	479155950
5203	NC_021015	AG	3	6	240441	240446	50 %	0 %	50 %	0 %	479155950
5204	NC_021015	CGTAT	2	10	240455	240464	20 %	40 %	20 %	20 %	479155950
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5219	NC_021015	CTT	2	6	241021	241026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155950
5220	NC_021015	TAAA	2	8	241041	241048	75 %	25 %	0 %	0 %	479155950
5221	NC_021015	GTTA	2	8	241052	241059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5222	NC_021015	TAA	2	6	241089	241094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5223	NC_021015	TTG	2	6	241120	241125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_021015	AAT	2	6	241142	241147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_021015	GA	3	6	241166	241171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5226	NC_021015	AC	3	6	241172	241177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5227	NC_021015	A	6	6	241202	241207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5228	NC_021015	AGC	2	6	241235	241240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5229	NC_021015	TAT	2	6	241252	241257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_021015	TGA	2	6	241283	241288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_021015	ATG	2	6	241310	241315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_021015	TGAT	2	8	241388	241395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_021015	CTT	2	6	241462	241467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5234	NC_021015	GAA	2	6	241510	241515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_021015	AGA	2	6	241554	241559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5236	NC_021015	AG	3	6	241582	241587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_021015	TGAG	2	8	241634	241641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_021015	GAA	3	9	241702	241710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_021015	TTG	2	6	241805	241810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_021015	A	7	7	241815	241821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_021015	AGG	2	6	241895	241900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_021015	TTG	2	6	241948	241953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_021015	AGA	2	6	241989	241994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_021015	A	7	7	242002	242008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_021015	TG	3	6	242048	242053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_021015	A	6	6	242094	242099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_021015	ATG	2	6	242101	242106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021015	TTC	2	6	242145	242150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5249	NC_021015	GTT	2	6	242213	242218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_021015	GAAG	2	8	242248	242255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_021015	AAT	2	6	242310	242315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_021015	ATTTA	2	10	242328	242337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_021015	GAA	2	6	242348	242353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_021015	TG	3	6	242417	242422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_021015	TAA	2	6	242473	242478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_021015	TAC	2	6	242576	242581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5263	NC_021015	T	6	6	242714	242719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5272	NC_021015	GA	3	6	243051	243056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_021015	ATA	2	6	253194	253199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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